Gene detail

Detail information of Am09G009390.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am09G009390.1	ARM repeat superfamily protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am09G009390.1	mRNA	Chr09	38623531	38631101	-

Sequences

CDS:

>Am09G009390.1
ATGGCAACCGATCCAAACCAAACCCAAATTCAACTATCCCTAATTCTAGGACCAGATTCAACCCATTTAGAATCCCTAATTTCAAACCTCACATCTTCCATCAATGAACAACGTTCACCGGCTGAAACCCTATTCAATGTCTGTAAACAAACTCAACCTGATTTGTTAATTCTCAAACTCGCTCAACTTCTCCATAATTCACCTAACCAAGAAACTCGTACCATGTGTACCATTCTTCTCCGCCGCCACCTCACTCGCCACCACGATGATTCATTCCTCTGGCCACATCTTTCTCCTTCTACCCGTGCCTCTCTTCGTTCTCTTCTTCTTTCTTCCCTCCATAAAGAGCCCATCAAATCGATTGTTAAGAAGTTATGTGATACAGTTTCTGAACTCGCTTCTGCTCTTCTCTCTGATGACTCCGATGACTGGCCTGACCTACTACCTCTTCTTTTTCAATGGGTTACTTCTCCTGATCCTAGGCTTCAGGAAATTTCGCTTCTCATCTTTGCTCAATTGGCTCATTACATTGGTGAAACCCTACTTCCTCAATTGGCTACTCTCCACTCTGTGTTTCTCCGATGCCTTAGCGCCGCCACGTCATCTGATGTTCGTATTGCTGCCCTAGCTGCCAGTATCAACTTCGTTCAGTGCCTATCCAATCCCTCCGACCGCGACAGGTTCCAAGATTTGCTGCCACTGATGATGCAGACATTAACAGAGGCATTGAATTCTGGCCAGGAGGCTACTGCACAAGAGGCGCTTGAACTTCTTATTGAGCTTGCTGGGACTGAGCCTCGATTCCTGCGAAAGCAGATTGTTGATGTGGTTGGCTCTATGCTGCAGGTTGCTGAGGCCGAGTCCTTAGAAGAAGGGACTCGCCATTTGGCTATTGAATTTGTCGTGACACTTGCGGAGGCGAGGGAGCGAGCTCCTGGAATGATGAGGAAGTTGCCGCAGTTTGTGAGCAAGTTATTTGGTGTGTTAATGAATTTGTTGCTGGATGTTGAGGATGACCCTGCGTGGCATACGGCGGAGACGGAAGATGAGGATGCTGGTGAGACTAGTAACTATGGATTTGGACAGGAGTGTTTGGATAGACTTTCAATTTCTTTGGGTGGAAACACGATAGTGCCGGTTGCATCCGAGGTGTTGCCAACTTACTTGGCTGCACCTGAATGGCAAAAGCATCATGCTGCACTTATTGCACTTGCACAAATTGCGGAGGGTTGTTCAAAGGTGATGATAAAGAATCTGGAGCCAGTATTATCAATGATTTTGAGTTCATTTCATGATCCTCATCCCCGAGTGCGGTGGGCGGCAATAAATGCAGTTGGGCAATTGTCTACGGATTTAGGGCCAGACTTGCAGAAAAAATATCACCACTTAGTGCTTCCGGCATTAGCTGGAGCCATGGATGATTTTCAAAATCCCCGAGTACAGGCTCATGCCGCTTCTGCAGTGCTAAATTTCACTGAAAATTGTACCCCAGATATTCTAATACCTTATTTGGATGGGATTGTCAGCAAACTTCTTGTTCTCCTGCAGACTGGAAAGCAAATGGTTCAAGAAGGGGCTTTGACAGCTTTAGCTTCAGTTGCAGATTCTTCACAGGAACAATTTCAGAAGTATTATGATGCTGTGATGCCATACTTAAAAGCTATTTTGATGAATGCAAACGATAAATCTAATCGCATACTTCGTGCCAAAGCAATGGAGTGCATTAGTTTGGTAGGAATGGCAGTTGGAAAGGAAAAGTTCCGAGATGATGCCAAACAGGTTATGGATGTCTTGATGTCGCTGCAGCAATCTCAACTTGATGCTGATGATCCAACTGCAAGTTACATGTTACAAGCATGGGCGCGGCTTTGCAAGTGCCTGGGGCAAGATTTTCTCCCATACATGGGTTTTGTCATGCCTCCCTTGTTGCAGTCTGCACAACTTAAGCCTGATGTGACGATTACATCAGCTGATTCTGATGCTGAATTGGATGAAGATGATGACAGCATTGAGACCATCACTCTCGGGGATAAAAGAATAGGTATTAAGACCAGTGTCTTGGAGGAGAAGGCTACAGCTTGTAACATGTTATGTTGCTATGCTGATGAGTTGAAGGAGGGATTTTTTCCTTGGATTGACCAGGTTGCTTCCACATTAGTTCCTCTTCTTAAATTTTACTTCCATGAAGAAGTTAGGAAGGCAGCAGTTTCAGCTATGCCAGAACTGTTGTTATCAGCGAAATCAGCTGTAGAGAAGGGACAATCACAAGGCCGTGATGCGACTTACATAAAACAGTTGTCTGATTATATAGTACCAAACTTGGTGGAAGCTTTACACAAGGAGCCAGAGGTAGAAATTTGTGCAAGCATGTTGGACGCTCTGAATGAGTGCATACAGGTCTCTGGACCACATTTAGATGAGAAGCAAGTAAGGAGCATTGTTGATGAGATTAAACAAGTCATCATGGCCAGTTCATCAAGGAAACATGAAAGAGCGGAGAGAGCCAAAGAAGAGGACTTTGATGCTGATGAAATAGAATTACTCAAGGAAGAAAATGAACAAGAAGAAGAACTTTTTGATCAAGTTGGTGATTGCTTGGGGACTTTGATTAAAACATTCAGAGGATCTTTTTTGCCTTTCTTTGATGAGCTTTTGTCGTATCTAACACCTATGTTTGGCAAAGACAAAACCTCAGAGGAAAGGAGAATTGCCATTTGTATATTTGATGATATTGCTGAGCACTGCCGTGAAGCAGCTCTTAAATATTATGATTCATATCTTCCATTCTTGCTTGAAGCTTGCAATGATGAATGTCCAGATGTTCGACAGGCAGCGGTTTATGGGGTTGGTGTCTGTGCCGAGTTTGGTGGATCTGTTTTCAAACTCCTTGTTGGAGAGGCACTTTCAAGGCTAAATGCTGTGATAACACACCCAAATGCACATCATTCTGATAACGTAATGGCATATGACAATGCTGTTTCTGCTCTTGGAAAAATATGCCAGTTCCATCGTGATAGCATAAATGCCGCGCAGGTTGTTCCTGCCTGGCTAAGTTGCTTGCCCATTAAAGGTGATTTAATTGAGGCTAAGGTTGTGCATGACCAACTTTGTTCAATGGTTGAAAGATCAGATAAAGAAGTTATAGGTCATAACAATCAATATCTCCCCAAGATTATTGCAGTTTTTGCCGAGATTTTATGCGCGGGAAATGATCTGGCAAGTGAACAAACCGTCAGTAGGATGATTAATTTATTGAGACAACTTCAACAGACTTTGCCACCTTCCACCCTTGCTTCAACCTGGTCATCTTTGCACCCTCAGCAACAGCTTGCACTTCAAACAATCCTATCATCGTAG

Protein:

>Am09G009390.1
MATDPNQTQIQLSLILGPDSTHLESLISNLTSSINEQRSPAETLFNVCKQTQPDLLILKLAQLLHNSPNQETRTMCTILLRRHLTRHHDDSFLWPHLSPSTRASLRSLLLSSLHKEPIKSIVKKLCDTVSELASALLSDDSDDWPDLLPLLFQWVTSPDPRLQEISLLIFAQLAHYIGETLLPQLATLHSVFLRCLSAATSSDVRIAALAASINFVQCLSNPSDRDRFQDLLPLMMQTLTEALNSGQEATAQEALELLIELAGTEPRFLRKQIVDVVGSMLQVAEAESLEEGTRHLAIEFVVTLAEARERAPGMMRKLPQFVSKLFGVLMNLLLDVEDDPAWHTAETEDEDAGETSNYGFGQECLDRLSISLGGNTIVPVASEVLPTYLAAPEWQKHHAALIALAQIAEGCSKVMIKNLEPVLSMILSSFHDPHPRVRWAAINAVGQLSTDLGPDLQKKYHHLVLPALAGAMDDFQNPRVQAHAASAVLNFTENCTPDILIPYLDGIVSKLLVLLQTGKQMVQEGALTALASVADSSQEQFQKYYDAVMPYLKAILMNANDKSNRILRAKAMECISLVGMAVGKEKFRDDAKQVMDVLMSLQQSQLDADDPTASYMLQAWARLCKCLGQDFLPYMGFVMPPLLQSAQLKPDVTITSADSDAELDEDDDSIETITLGDKRIGIKTSVLEEKATACNMLCCYADELKEGFFPWIDQVASTLVPLLKFYFHEEVRKAAVSAMPELLLSAKSAVEKGQSQGRDATYIKQLSDYIVPNLVEALHKEPEVEICASMLDALNECIQVSGPHLDEKQVRSIVDEIKQVIMASSSRKHERAERAKEEDFDADEIELLKEENEQEEELFDQVGDCLGTLIKTFRGSFLPFFDELLSYLTPMFGKDKTSEERRIAICIFDDIAEHCREAALKYYDSYLPFLLEACNDECPDVRQAAVYGVGVCAEFGGSVFKLLVGEALSRLNAVITHPNAHHSDNVMAYDNAVSALGKICQFHRDSINAAQVVPAWLSCLPIKGDLIEAKVVHDQLCSMVERSDKEVIGHNNQYLPKIIAVFAEILCAGNDLASEQTVSRMINLLRQLQQTLPPSTLASTWSSLHPQQQLALQTILSS*

Promoter(3k):

>AM09G009390.1
GCCAATGTTCTGTACCGAGCAGCTTTTTGGCCGGCTGCTGTTGGTAGGTCCCTTGCTGTCCTGGCAGGAGGTCAGTGAGCTCCCGGGGGGGGGGGGGGGGGTACCTGCAAGTCACTCCGACGCTCGAGTCAGTATATAGAATATAAGAGTGAAGCTACTAAGGATTAGAGAGTCAACCTTTCTTTGGGCAATGTTTGCCTGTATTTATAGGAAATCGTGCCCTCTCGTGGATCGTTTGATGGGTAGAGTCGATCTTGACCGTCCAAGCATGTTGGGCTCGCATGAGGTGGATATGGACTGAATCTGTTGGGCTGACCCGTATCACTTGCTAAGCGCACCTCCTGGTTTTGCTAATGAGACCCCCTGGTTGACTCCAGAACAACCATATTGCCCTTATTCCGTTTTATCCGGCTAACGATCTTGAGACAACCAATAATTAACTTTAGCACTCAATAAATTTACCAATCAAGTACTAAATTAATTCAATTGAGTTAACATCCAAATAATTCGATTTATTATTTTGGGGATGTTACAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATGTGATAATGACAAAATTACCTTTATGACAACTATATTTTATTTGTTAAAAAATTAAGTTATATAAAAAAAAGAAGACTTAATGACTATTTAAACTACTAATTAATATTTAAAACAAATATTTCTTATTGATAATCTACTATCTAACTTTTACTATCTACTATAATCTACTAATCAACTAAAATAATCAATTGAAACTACGAGATAACTGCACTGATATATACAAAAACACGGAATAACTGCAATATTAATGATATATAAAAAAATACGGGATTAATATTTGCCATTGATAATTATAATTTTTGAAGACGGCTATAAACCTACTATCTAAAAAACAAGAAGACTTAGTGACTGTTTAAAGTGATTAATATTTAAAAGACACCTAACAAATATTTGTTACTAATACCTAAAAAAGGACAAATAATTGTCACTGATATATAAAAAACTCGGGATAAATATTTCCTATTAATAATCTACTATCTATCTTTTACTATCTACTATAATCTACTAATCAACTCAAATAATCAATTTAAACTATGAGATAACTGCACTGATACATAAAAAAACATGGGATAACTTCACTGATATATAAAAAAATATGGGGATAACTGCAATGTTATATATAAAAACACGGGATAGCTGCACTGATATATAAATAAACACGGGATAACATTACTGGTATATAAAAAAACACTGCACTGATATATAAAAAAACACGGGATAAATGCACATATTGTTTTTAAATGATACTTTTATATTTTTTATTTGAAACTCCTTTTTTATCTACTTTAAATTTGTCTTTATTTTCACGGGGTAATGTTCAGACTATTTAATTACTGTCCAAGTTGATTCATAAAATGAACACAACGACACCGTGCACTCGTGCTTCGACATTGTAAAATTTATTTTTACACTATTAACAATCAGAAATTATGGTATGTGTGACTTTAAGATAATTTAAAGATAAAAGCCAGATATTTTTATGACGTTAAAACTTTTAAGAGTTTAATTTATGAACACATATAGTGTATAAGCTTTTACAACCACAACCAATAACAATTCATTGAAAGGTTGACATATAAGGTGGTTACCAATTCACTAACTTTTTTTAATGACGTGTCAACTTGTAATTGGTAGATAGTGTAAACTGAGAAGCCCTGATACTCCAAAACAGATCAAGTATCAGTATCTGACATGTATCCGATACCGATACTTGTCTGATACATCGGGATACGTACCCATGGTGGAATTTTTATTTACTTTTTTAAAAGAAAAATGTTCGATATGTGGGAGATACACGACCGATACTCATGGGATACAACTGGCTCATACAGATACACCCAAGATACAACTGACTTATACGGATACACACGTATACAACATGTGGGCCTCTTTCTTTTTTTGACAACCAATATGACTCCTTTATGAGTGTTTTTAATTTATATCCTAAAAATAAACTATAATAAAATATTAAGTTCTAAAAGGGGTTACTACATATGTCAATTATCAATTTTTCCTAAAAGCGGTTACTACCTTCTGGATAAACTACAGGATAAACTACAGCCTTTTTTGTTCCTGTTTTTTGTGTGCGATTTTTTTTTCCTATTTTGAACAATTGTCAATTAATAAACTAATTATCTCTTTACTATTTTCTTTAGTTATGTTTGTATTTTATGATTTTATTTTTATATATTTGAATTTTAATTTAATTTTTATTAAAGTATTTAGGCCGTATCGTATCTTGATTTTCAAATTTTTCTGTATCGTGTCGTATTCCGTATCGTATATCATATCCGGGCTTCATATACATCTATTGTGTATATATATTAAATCCAACTTTTAATTTGTTGATACAGCAAGATATTATTAAGCTAATGATATTTATTAATATTAATTAATTTTTTTGATTCAATATTTATTAAAATTTAAGACCTATAAATAATTATAAATAATTAGTAGTAGTAAGCATATCATATTGTAAGTAATTACCCTCGAGACACCTACAACGAACAAATGATTAGTCACTGTTATCCGTGCACTGAATACCCGAGTTTACCAAAAAAAAATATCGTAACTAATTACTAGATAAGAAGAATTGTAGATAGGTTTTGTGAGAAATCTTAAAAAAACGGTAGGATAAGGAACCTTTGTAGTAGGGAGCAGCATATGCCCGCCATTTAAAATCCCTTAACAAAACACAAACCCTTATTCGCTTCTCTCTCTGTTTCGAGTTTGGAATTTGGAGCCACTCTTCCCTCCCTTTCTCCTCCTCCTTCTCCTTCTCTTTCTCTATCCATTCCAACAACACTCAACCCTCTTCCTCCCACCAATTCACAACC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF18808.4	Importin_rep_4	288	379	1.70E-25
PF18829.4	Importin_rep_6	787	890	1.70E-21
PF13646.9	HEAT_2	388	487	3.50E-19

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005737	cytoplasm	Cellular Component
GO:0031267	small GTPase binding	Molecular Function
GO:2000636	positive regulation of primary miRNA processing	Biological Process
GO:0048229	gametophyte development	Biological Process
GO:0090069	regulation of ribosome biogenesis	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR034085	TOG domain
IPR001494	Importin-beta, N-terminal domain
IPR041389	Importin repeat 6
IPR041653	Importin repeat 4
IPR040122	Importin beta family
IPR021133	HEAT, type 2
IPR000357	HEAT repeat
IPR016024	Armadillo-type fold
IPR011989	Armadillo-like helical

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XR06	_

SwissProt

SwissProt term	Description
IPO5_HUMAN	Importin-5

KEGG

KO	Description	Enzyme
K20222	importin-5

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G19820	ARM repeat superfamily protein
Medicago sativa L.	MsG0780040180.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os07g38760.1	HEAT repeat family protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa020205	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur001427s00032577.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr08_32550T	_
Arachis hypogaea L.	AH16G27390.1	Importin-5 like

Expression pattern