Gene detail

Detail information of Am09G001030.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am09G001030.1	receptor like protein 13

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am09G001030.1	mRNA	Chr09	5989284	5994210	-

Sequences

CDS:

>Am09G001030.1
ATGAAGAGCGTTGGGGTGTTTTTGTTGGTTTTGGTTTTATTGGAAGTGATGTGTTGTGAAGGGTGTTTGAAGGAAGAGAGAGATGCACTTCTCGCTCTAAAATCCCAAGTAAGCAACACCTTATACAACCCTTTGCTTCATTGGCGCCAAGACAACACTGATTGTTGTCTATGGGAAGAAGTTGTGTGCAACACCACCACAGGGAGAGTGGCTGAACTCCACCTTTTCTTTATTAATGACGGCTTGCATAATTGGCATCTTAATCATTCGGATTTTACAGTCTTCAAAGATTTGAAGACTCTCGACTTGTCATTTAATGAAATAGTCGGTTGTGCAAAAATCGATCAAGGGTTAGAAAATCTGGAAGTCCTTTACTTGAGTGGCAATCATTTTGATAATGCTACAAGCATGCTATCTTGTTTGAATGGACTTTCTTCTCTTAAGTCTCTATCGTTATCTGAGTCGATCTATATAAGCTCATTCGACGACGTTTTTGAGACGTTGTCATCAAAGTTGCCGCATCTGGAGATCCTTGACATAAGTTACAACCGCAACATAACAAATGATATTCTGCCATCACTCATGGGATTCACATCTTTGAAGAAACTGTATTTGTATGAAATTGGATTGGACTCAGATCTTCATATTCAAGGTTTATGCGCCGTGTTGAAGAATCTTGAGGTCTTAGACATCTCTTTTAACAACTTCAATGACACTGATATCACATCTGCTCTTACTGGCCTTCCGTCCCTCAAGTCTTTATACTTATTTGATAGTCAAATTACTCAGAGATCAATTCACAATATATCAAGACTGAGTTCTTTGGAGATCCTATACTTAGGTGGCAACAACTTGGATATCCTATGGCCTCCAGGTAATGATGGATTTGCATGGCCGATCAATTTACAAGAACTTCATCTGAGCGGTAACAATTTCCGTAACTACAAGATTCTTTCATCCCTAAGTGGGCTTCGAAGTCTCAAATCTCTTGATTTAAGTGGCAACAAATTGAACCAATCCCTGGATTTTAGTGATTTGTTTAAGCTTAAGAAGCTAGAAGAGTTGGATCTATCCAATAATGAATTTGTGGGGCCGCTTCCCTCGTCTTTTGCTAACATGACTTCTCTTCGAACGTTGAGACTTGATTGGAATCACTTCACTGGTGGTATTGGTTCTAACCTAGCAAGTCTTACTTCACTTGAATATCTTAGTTTTGAAAGAAACCAACTTGAAGTCCCTATTTCATTCACACCATTTGCCAATCATTCAAACCTCAAGTTCATCCACGGCAATGGGAACAAAGTCATCATCGACTCACACTCAACTTTGGAAACATGGATTCCCAAATTTCAACTACAAGAGCTTGAATTGTCTTCAACAACTGAATCCAATTCCATTCCCATTCCAAAGTTTCTTTTTTACCAACACAATTTGACTTCTGTGGACTTCACTAGTTGTAAACTAAGAGGAGCGTTTCCAAAATGGTTGTTGGAAAACAACACAAAATTGCAAAAGCTTCATCTTGAAAATTGTTCCTTTACAGGGAACTTCCAGTTGCCATCTCGTCCTCATATCAGCATAATGGCCATTGAGGTGTCTAGAAATACAATATCAAGTTTAATGTCTAGCGGTAATATTAGTTCAACTTTTCCCAATTTGAATTATCTACACATGTCTGCAAATGTAATCCAAGGTTCAATTCCTCATGAGCTAAGCCGGATGAGATCATTAGATACATTGGATCTTTCAGATAATCAATTTTCGGGAGAAATACCATACAACTTAACTGGGGATGGGCATCAACTTGGATTCTCGAGTCTTTCGAGGGTGTTATTGAATGGTAATAGCCTTTCGGGTAGCATCCCAAGTGGCATTTTTAACTCATCCATGTTGGAAGAATTGGACATTAGTAATAATCGTTTGACTGGAAAAATCCCAAACAACTTTAAACACAACGCAAGATTATTGAAACTTCAAATGTCCAATAATCACTTTGAAGGATCTATTCCATCAGAGTTGGCGGAACAAGAAAGTATCATTTATCTAGATCTTTCAAAAAATAATTTGACAGGTTGTATTCCGTCTTTTGCAAATTCTTCCGTGAAGTTTATCCATTTGAACAACAATCATTTAAGTGGGTTTTCCAAAAGAGTGTTCGATGGAAATTCTTCTTTGGTGATGGTAGACCTTAGCTACAATGAACTAACCAATGGCATTCAAGATCTGATACATGACCTCCATTATACAAAGTTGAACATTCTCCTTATCAAAGGGAATCATTTCACAGGGAATATACCAGAGCAATTATGCCAACTAAGTGATTTAAGTATATTGGATCTTTCTTGTAACAGTTTTTCTGGGGAAATACCCAGTTGCTTGGGAAAAATGCCTTTTGAGGGGGTCCGTCCCGACTTTTGGGATTTATTCCGAGGTATTTTAGCTATCGGTCAGCATAATTTTTTCATGCATTTTGAATCAGAGAAAGCAAACTTTACTTCAAAGAAAAGACCTGAAACTTATACAGGGATTGTTCTTTTTTATATGTCTGGAATTGACTTGTCCCAGAATAAACTTAATGGGAACATCCCATTTGAACTTGGAAACCTGACAGGAATTCGAGCATTGAACTTCTCTCACAATTATCTGACCGGGCAAATTCCAGCGACATTCTCTCATTTGGTACAACTTGAAAGTTTGGATCTTTCATATAATATGTTGAATGGCCGAATTCCTTCTCAACTAACTGGGTTGACCTCCCTTGCGGTGCTTAGTGTGGCACACAACAACTTATCTGGTGCAATGCCTGAAATGAAAGGACAGTTTTCCACATTTGATGAAAGCAGCTATGAGGGTAATCCATTTCTTTGTGGACCTCCACTGCCAAAAAGTTGTAATGCTAATGGACAAGCACCTGCTAAATTACCAAGTATTCTGAACACAGATGAAGACAATGATGATTGGATGGATATGTATGTTTTCCGTGTGAGCTTTGCCGTGGCATACACATCAATATTGTTGGTAATTACGGCAGTTTTGTACATCAATCCTTATTGGAGGCAGGCATGGTTTTACTATACAAAATTGGTGGGCATGAATTGCTACTACTTCATCGAGGACCATTTGTATAAGTTTTTCTGA

Protein:

>Am09G001030.1
MKSVGVFLLVLVLLEVMCCEGCLKEERDALLALKSQVSNTLYNPLLHWRQDNTDCCLWEEVVCNTTTGRVAELHLFFINDGLHNWHLNHSDFTVFKDLKTLDLSFNEIVGCAKIDQGLENLEVLYLSGNHFDNATSMLSCLNGLSSLKSLSLSESIYISSFDDVFETLSSKLPHLEILDISYNRNITNDILPSLMGFTSLKKLYLYEIGLDSDLHIQGLCAVLKNLEVLDISFNNFNDTDITSALTGLPSLKSLYLFDSQITQRSIHNISRLSSLEILYLGGNNLDILWPPGNDGFAWPINLQELHLSGNNFRNYKILSSLSGLRSLKSLDLSGNKLNQSLDFSDLFKLKKLEELDLSNNEFVGPLPSSFANMTSLRTLRLDWNHFTGGIGSNLASLTSLEYLSFERNQLEVPISFTPFANHSNLKFIHGNGNKVIIDSHSTLETWIPKFQLQELELSSTTESNSIPIPKFLFYQHNLTSVDFTSCKLRGAFPKWLLENNTKLQKLHLENCSFTGNFQLPSRPHISIMAIEVSRNTISSLMSSGNISSTFPNLNYLHMSANVIQGSIPHELSRMRSLDTLDLSDNQFSGEIPYNLTGDGHQLGFSSLSRVLLNGNSLSGSIPSGIFNSSMLEELDISNNRLTGKIPNNFKHNARLLKLQMSNNHFEGSIPSELAEQESIIYLDLSKNNLTGCIPSFANSSVKFIHLNNNHLSGFSKRVFDGNSSLVMVDLSYNELTNGIQDLIHDLHYTKLNILLIKGNHFTGNIPEQLCQLSDLSILDLSCNSFSGEIPSCLGKMPFEGVRPDFWDLFRGILAIGQHNFFMHFESEKANFTSKKRPETYTGIVLFYMSGIDLSQNKLNGNIPFELGNLTGIRALNFSHNYLTGQIPATFSHLVQLESLDLSYNMLNGRIPSQLTGLTSLAVLSVAHNNLSGAMPEMKGQFSTFDESSYEGNPFLCGPPLPKSCNANGQAPAKLPSILNTDEDNDDWMDMYVFRVSFAVAYTSILLVITAVLYINPYWRQAWFYYTKLVGMNCYYFIEDHLYKFF*

Promoter(3k):

>AM09G001030.1
AGTATAAGCCGTGTCATGTGTGGTCCCGCAATGGATGGAAATTGGGAGAGTACAAAAGTTAAGAGGTTTCAAGGAAGCTTCATGCCACAAAAAACCAATTTGACTCCCAAGTCAAATCGTGCTCTCCTTTCTCTAATTACTACATTACTACTCTATCAAATCAAGTGTCATTGATGATATTTGCTCAAATTTGAGATGAATGTAAAACTTATTAGACATATACTATATGTTAAGTAAAAATAATGTCATAATTATGTAATTACATAATACAATAATATATAAAGAGGTGCTTTACGTGTTACCCAGTTCTTTGGACACTTTGTGTACTTTTCTTCGACCCTCAAATTTTTTTGGTGTACTAATATTTCACTATTCTTTTCCTTTTATCTCGTTAAATTTTCTTTATTCGAAATTCACTCTAACTAAACAAAGATAGAGTTTTGGTAAAAAAAAACAAAGATAGAGTATGGGATAAAAAATTGAAGAGGTGGTAATCTCTTTTTGTCAATAGCAAATAATGTTTTATTTTCTCTTGAAAATTGTTCGTAATATCAAAGCAAAGTAAAGTGATTTCTAGGAAGCTTCATGGCTTCGTGCCATAAAAATCGTGTTGACTACAAAGTCACTCTGAAAACAAAGATAGAGTGTAGAATAAAATATCTTCGAGGGAAAATCTCTTTTTGCTAATACTAAATAGTGAGAGTTCAAAAGAGGAGTATAAGACGTGTGTACGTTTGGTTTAGCAGTTGATGGAAATCCAGAGAGTAAATGTAAAATCATTTATAGGAAGCTTTTTGCCACAAAAATCAAGTTGACTACAAAGTCAAGTCTCATTTCCTTTCTCAAACTACCAGCGAAATACCGGTACATGCGAACAAGTGTGGTGTCGTGCTATTTTCGTAAAGTAGTCTCAAACCGAAGTTGTAATATAGTTATTAACTTATGAATTGTAGATGATGTTTGTAAATTAATTATCTATCATTCGAATTTTAATATTTCAACAATTTAATTATTAAATAACTAATTGAAAATGTGTTTAATTAAATTATATGATATCAGATATTCTAAAAATAATTTTGAATATTAAAACTAATTTATACGCTTTTAGTCAAATATCTTTATAATATTTTAAGATAAAAATCAAAGATTTTATAACGTTTTATTAGTAATGAAATTATACCAACAACTTGTAATGTTTCCAAAAACATGTAATGTTTTCTCATCTTGACTCAAAAACAAAATAATTATTGAGAAAATTTAAAGACATTCGTGAAGATAAAGTACGAAAAACAATTATTCCAACAACGCGTAATGTTTCTATATAAATATAAGTTTACAAAACAATTCAGTTTCATCCAAGGTATAAAACTTAAATCATAACTACAACTGAGTAAACATAATGTTATTATGTAATTATATAATAATTTGTGTCCCCAAATAAGGAGGTATGGATAAGCGATACCGAGTTCTTTGGAGACTCTATGTACCTTTTATTCAATAATTTTTTGATGCATTAGGACTTCATTACAATTTCCATTTATATCCTTTTCCCCCAATCTATACTAAAATAATGATTCACTTTCCTTTTAAAATTTGTTCATATTAGAGAGCTCAAAAGAATTCATTTAGAAACATATGAATAGGAGTATAAGGCGTGTCATTTGGTTTAGAAATTGGTGAGAATCTGGATATAGTACAAAAGTATATAAAGTCATTTTTAGGAAGTTTCATGCCGAAAAATCAAGTTGACTACCAAGTAAAATCAAATTATCCTCTAATTTTCTCTAACTACTACATACTTCTATATCAAATTTACAAAGCAAGTGTCATGCAAGATATTCACTTAAAATTGAGATGAATATAAAACTTAAACTGCAGAGACCATTTTAGGTGTAGGTGGATTGGCTCTCACTTGATCCATAGTGTGCTAATCCTCAAGTGCTCTTGTTGTATTAATTAAACTTGGTGTATTTTGTTATTCCCAATAGTTTTAGCACGTGATTGAACGCCCTCTTAAACCCTTCATAGATGGTGGGAGGAGTGTGTGTCAATGATACTGAGCTATTTGGTTATTAATATTATCATCTCTAATTATTGAAAAAAAACTGCGGATATTATTGAGTAAATATAAGGTCATCATCTAATTACATAATAATTTGTTAAAAAAAATATAAGGTCATCATTCAATTACATAATTATTTGTTCACTCGTGTCAAAATAATAATAATCATTTATTCACTCAGATATATCGGAAAGTGCGTTGAGGGATACTCAGTTCTTTGGATGTCCCGTGTTTTTCTATTCGATCCTTCAAATTTTTTGGTGCATAAGAACTTTATTATTCTTTCCATTTTATCTCTACAACTTAACCAATTTAAGGAAATTCACTTACCAATATGGGAAATCAGCTAGATAAGCAGAATATAGAAAAGAGTAGAAAAATAAGAAAAGTAATGGATAAAGGAAGTTTAGAGAAAATATATTACTCGCGTGGTTTAGTTGAAGGAAAAAAAAAGAATTGAAGGGGTCCAAAAACTTATCTCCTCTTAATTTGTTTTGCTAATTTTCTCTTCTCATATTTTGTCGTGAGAAGAAAATTAAAAAAAAAAAATTTGCTTGTTATCTTTATCACTTTAAAATATATAATGAAATTTTTTGCTAAACAAGAAATTTGCGTTTGGTTGAATAATTATGATCTATGGGGAAATCATTATTTATATATTCGATTTAATTAATTATAAGAAAATTCTAAATATGTATCTTAATTGGGATGTCTTTTTCGACTGAATTGAAATATCTTCACAAGGTATGTAATTATTTGCATATTGTGTTGTGTTGTGAGTACTCTCTAAAAGCAATTGAGTTGACTTGAGTTGATTACCAAGTCAAGTCTTGCTCTCCTAATCCTTTCAGTAGATGAACTATTGTAGTAGTAAATTGGTTGTTGTTTTCTTATTTAAACAACCACATCCATTGTGTTAGAAAACATATAAGAAGAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF13855.9	LRR_8	225	285	2.80E-54
PF13855.9	LRR_8	346	386	2.80E-54
PF13855.9	LRR_8	530	587	2.80E-54
PF13855.9	LRR_8	681	735	2.80E-54
PF13855.9	LRR_8	872	930	2.80E-54
PF08263.15	LRRNT_2	24	64	1.70E-07

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016301	kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0071944	cell periphery	Cellular Component
GO:0016773	phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor	Molecular Function
GO:0140096	catalytic activity, acting on a protein	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A0R0J3U6	_

SwissProt

SwissProt term	Description
CURE1_SOLLC	Cuscuta receptor 1

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G74170	receptor like protein 13
Medicago sativa L.	MsG0780039113.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g55420.1	leucine-rich repeat family protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa020306	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur001002s00038918.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_45680T	_
Arachis hypogaea L.	AH14G21860.1	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2 like

Expression pattern