Gene detail

Detail information of Am08G002480.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am08G002480.1	receptor-like protein kinase 2

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am08G002480.1	mRNA	Chr08	16274362	16278872	+

Sequences

CDS:

>Am08G002480.1
ATGGGTCTTGTTTGTCTTCTTCTTTTGTCTCTTCTGTTTCACTCTTTCGTTGCAAATGCTTTCAATACTTCGATTCCAAACGATGCATTGTCACTTCTAGCGTTCAAACACTCTGTCTCTTCGGACCCTTCGAAACTTCTCGCCGGTTGGACTCACAGTTCTTCTTCGAGTTTCTGCGGTTGGTACGGCGTTAGGTGCGGAGGTGACGGCAGAGTAACCGCCCTTCAGGTAACCGGTCTCTGGGGTGCTCAGTTGGCGCCTTCGGTCGGAGATATGTCGGAGCTTCGTGTACTTTCCATTCCCGGAAACATGTTTTCCGGCGAGATTCCGGCGAGCATAGGAAATCTCCGGCGACTTGAGGTTCTTGAGTTACAAGGAAACAACTTTTCAGGGAAAATTCCTTATCAGATGAGTTATTTTGAATCCCTTGTAGTTGTTAATCTCTCTGGTAATGCATTTTCTGGTTCAATTTCAAGTGGGTTAATTTTTTCTAAGAATGTGGAATTTGTTGATTTGTCAAATAATCAATTTGCTGGTTCAATTCCTGTGAATGGTTTTAGTAATTGTGATTCTTTGAAGCATTTAAGGTTGTCTCATAACTTTTTGACTGGTGAGATTCCACCACAAATTGGTAAATGTAGAAACTTGAGAACCCTATTGGTTGATGGGAATATTTTGGAAGGTAGAATCCCTTTTGAGATTGGGTATATTGTTGAACTTAGGGTTCTTGATGTTTCTAGAAATAGTCTCACTGGAAGAATCCCTAAAGAGCTTGGTAATTGTTTGAAATTGTCTGTGCTTGTCCTAACTGATTTGTTAGATGATCATGTCGGCCTCAGTCGCGGTCTCTATGAGGGAAGCTTGGAGGATACCTTTAGAGGAGAATTTAATGCTTTTATAGGGAATGTTCCTCATGAAGTGTTATTGCTTTCAAGTTTACAGGTTTTGTGGGCGCCGAGAGCGAATCTCGGTGGAAGGTTACCATCTGGCTGGACAGATTCGAGCTCTTTGAGAGTACTCAATTTGGCAGAGAATTATGTTACTGGTGTTGTGCCTGAGAGTTTGAGAATGTGTAGGAATTTAACTTTTTTGGACTTGAGTTCTAACAGTTTAGTGGGATATCTTCCTTCTCCGCAGCTTCAGATTCCTTGTATGATCTATTTCAATGTAAGCAGGAATAATATATCTGGCACGCTTTCGGGATTTAAGAAAGAAAGGTGTCGAGTGAGTAGCGCTGCTGCTGTGCTGGAACCTGCATTCCTAGAATTGGAAGGTGAAGGTTTGAATGATGCATACTTCAATATTCCTGTTTTTAGATTTCAAGAGAATGCTCTCACTGGATCAGGATTCGAAGAGACTATTGTCATTAGGCATGATTTCAGTTGGAACAGTTTTGTGGGACCGTTGCCTTTGTTCTTTGTTGGAGATAATCTTTTCGCTGCAAATCGTAAAGTCTCCTACATGCTGTCTCTCAATAACAATAAGTTCAGCGGAACTATACCGTACCGACTAGTTTCAAACTGTAATGACCTCAAGACGTTGTCGGTTAACTTGAGTGTGAACCAACTATCAAGCGGGAATTCACAAGCATTGTTTCTCGATTGCTTGCAGTTGACAGATTTCGAAGCAGCTTACAACCAGATTGATGGGTCGATTGGCGCTGGTGTGGGTGATTTGGTGATGCTTCAGCGACTTGATTTGAGTGGGAACGAACTATCTGGAACTCTGCCTAATCAGTTGGGAAATCTTAAAAACATGAAATGGATGCTTCTAGGAGGAAACAATCTAACAGGAGAAATTCTTTCTGAACTCGGTCGATTGACTTCTCTTGCTGTTTTGAATCTATCTCGCAACGCTCTTATTGGAACAATTCCATCAAGTTTGTCAAATGCCACAAGTCTTGAAGTTCTGCTGCTAGATCACAACAATCTTTCCGGGGAAATGCCTTCATTGTTTTCTGCTATGTCCAATCTTGTTCAACTAGATGTTTCTTTCAACAATCTTTCGGGTCATATTCCCCATCTTCAACATCCAACTGGTTGTGATTCCTTTAAAGGGAATAAATACTTGCACTCATGCCCTGATCCTCACTCGGATTCACCTGCTCCTTTTCCGATCCCTCTTGCAGTCCAAAATTTGCGTAGACGGAGTAGGAAATTAATGATAGTGGTTATTGCAGTGGTCACTTCTTCCATTGTTGCTCTCTGCACACTTCTTGTGATAGTGTTGGTGATCTGTTTCAGAAGGAGTAAGTTTAGTCAGCTCGGAAGTATTAGAAGGCGGCAAGTGGTAACATTTCAAGATGTTCCTGTAGAATTGAGTTATGATAGTGTGGTCACAGCTACCGGAAATTTCAGCATTCGGTATCTAATTGGCACGGGCGGTTTTGGGTCAACTTACAAGGCAGAACTGTCTCCAGGTTTTCTTGTTGCCATTAAGAGATTGTCCATAGGTAAATTTCAAGGAGGCATTCAACAGTTTGAAACCGAGATAAGGACACTGGGGAGAATTCGGCACAAGAATCTCGTGACACTTATTGGCTATTATGTAGGAAAAGCTGAAATGTTCTTAATTTACAATTACCTTTCTGGTGGAAACCTCGAAGCTTTCATACATGATAGTTCAGGGAAAAATGTGCAGTGGCCAGTTCTTTATAAAATAGCGAAAGATATAGCTGAGGCCCTTGCTTACCTTCATTACGATTGTGTTCCTCGCATAGTTCATCGTGATATAAAGCCGAGCAACATTTTACTCGATGAATATCTTAATGCCTACCTGTCTGATTTTGGCTTGGCACGACTGCTCGAGGTATCCGAGACTCATGCCACTACTGATGTGGCAGGCACATTCGGTTACGTCGCACCTGAATACGCCACGACTTGCAGGGTTTCTGACAAAGCCGATGTTTATAGCTTTGGTGTAGTGTTATTAGAATTGATGTCTGGAAGAAAGTCGCTGGATCCGTCGTTTTCTGAATATGGAAATGGATTCAATATTGTACCATGGGCCGAGCTGCTAATGAACGAAGGTCGTTGCGCTGAGCTATTTTCATCTTCTTTGTGGGAATCAGGGCCTAAGGAAAAGTTGTTGGAGCTTTTAATGGTTGCGTTAAAGTGCACAGAAGAGACTCTTTCTGTTCGACCGTCAATGAAGCAGGTTCTTGAGAAATTGAAACAATTGAAAACTTGA

Protein:

>Am08G002480.1
MGLVCLLLLSLLFHSFVANAFNTSIPNDALSLLAFKHSVSSDPSKLLAGWTHSSSSSFCGWYGVRCGGDGRVTALQVTGLWGAQLAPSVGDMSELRVLSIPGNMFSGEIPASIGNLRRLEVLELQGNNFSGKIPYQMSYFESLVVVNLSGNAFSGSISSGLIFSKNVEFVDLSNNQFAGSIPVNGFSNCDSLKHLRLSHNFLTGEIPPQIGKCRNLRTLLVDGNILEGRIPFEIGYIVELRVLDVSRNSLTGRIPKELGNCLKLSVLVLTDLLDDHVGLSRGLYEGSLEDTFRGEFNAFIGNVPHEVLLLSSLQVLWAPRANLGGRLPSGWTDSSSLRVLNLAENYVTGVVPESLRMCRNLTFLDLSSNSLVGYLPSPQLQIPCMIYFNVSRNNISGTLSGFKKERCRVSSAAAVLEPAFLELEGEGLNDAYFNIPVFRFQENALTGSGFEETIVIRHDFSWNSFVGPLPLFFVGDNLFAANRKVSYMLSLNNNKFSGTIPYRLVSNCNDLKTLSVNLSVNQLSSGNSQALFLDCLQLTDFEAAYNQIDGSIGAGVGDLVMLQRLDLSGNELSGTLPNQLGNLKNMKWMLLGGNNLTGEILSELGRLTSLAVLNLSRNALIGTIPSSLSNATSLEVLLLDHNNLSGEMPSLFSAMSNLVQLDVSFNNLSGHIPHLQHPTGCDSFKGNKYLHSCPDPHSDSPAPFPIPLAVQNLRRRSRKLMIVVIAVVTSSIVALCTLLVIVLVICFRRSKFSQLGSIRRRQVVTFQDVPVELSYDSVVTATGNFSIRYLIGTGGFGSTYKAELSPGFLVAIKRLSIGKFQGGIQQFETEIRTLGRIRHKNLVTLIGYYVGKAEMFLIYNYLSGGNLEAFIHDSSGKNVQWPVLYKIAKDIAEALAYLHYDCVPRIVHRDIKPSNILLDEYLNAYLSDFGLARLLEVSETHATTDVAGTFGYVAPEYATTCRVSDKADVYSFGVVLLELMSGRKSLDPSFSEYGNGFNIVPWAELLMNEGRCAELFSSSLWESGPKEKLLELLMVALKCTEETLSVRPSMKQVLEKLKQLKT*

Promoter(3k):

>AM08G002480.1
TAGCAGATGAGCTGGCAATGGATAACGAATAGCAAGAAAGCCAGCAAATTGAGTTTAAAGTGTTTGGTAAAATTAACGATTGAACTAGCCTACAAATATGGAAGGACGTTTGTAATTAATGTTAAAAAGTGAGAGAAACTATGCATTTAATGCATGATAAATTAGTAATATAAATAAAATAATAGGGGTAAAAAATAAAGAGAAATGAAATGTTATAAGTTATAAATTCAACTCCTACTTCAAGTAGCATCTAGAAAAACAGTATAAGCTAGTAAGCTAGTGAAAAAAATGCTAAACACTATTGTTATCAAACACTTCTATTTTATTTTAGTGAGCTTATATGCTAAACGCTACTGGTTTAACCTTACCAAACAGAGCCATAGTATTTGAAATTAGTCTCAACCTTTGATTATATACTCCGAAGACTATTAAAATACTTTCTTACAAGAATTTAATTTAGCTTTAATTATTGTGTAAGTCCCTGAACTATTTGAGAATTTTTAGATAGGTTTCTAAACAAAAAAAAAGTTGTAATTAGGTCTCTGAGCTAACATAGTTTTTTTTTTCAATTAGGTCATTCTATTATATTACAGTTAGTCAATAGTTAGTCGATGTTGACGTGACATTCGCAATTGTAAATAGGTTCCTGAACTAATTTAAACATATAAAAATTTGACCTTAGAAAAATAATCAAAAATTATTTGATATATTCAAGTCACAACAATGCTAAAATATAACTGTCAACAGCCTGATATATTATTCTACTCTCTAGATATTAATTAAAAATAATAAAAAATAATCTTTTACTTAAAAACCTTAAAACAAAAATAAAAATACAATATTTTCTTATTTGATTGATTGAATAATTTTTTTTTGACAAGATTAATTTCAAAACTATAGTCATATTTTATGAGCATACAATTTTGTTATTTAAGTGAAGAGTTATTTACAAAATAATTAAAAATAAACTCTTGGTTATTATGTATATCTCAAAAAGAAAGTCTTAAATGATATATTTACAACTAAAACTAAATGCTATAGAATATAAAAAATAGTACAACCATTTTAAAATAACTTAAGTATATTTTAACAGACAAAAGTAGTTTTTATTTAGAATAAAATAATAAGAATAATTTTTTTTATCAAAGCGATACTAAAATTTTATATGAAATGCAATAAACTTGTGAAAATATGATATGCAAAATAATGTTAATTACTCACGTAAAAATTAAATCTACACTTTTAAAATCCTACATATGTTCTATGAATGCTATTTTTTTAATTCTAATTTTTTGCACGATTAAAAGTATATAAGATATATGTTGAGTACATTTAACAATATATTTTTTAAGGAGTATTCTTTAATAAAATATAGTTATTATTTTTCATTTAATTGAATAAAAAAATATTAAATATTTCAAAAATCTTTAGGGAATTACCTTTATTTAATATTTTATTGTATAAATTAAATTTTACTACCAAAATAACAAAAACAACATTATAAAGCATTAATTACATTTGGGTTAATTGTGGGCTTGAATTTCTCACTTTATTTTTTTATTTTTTTTATAAAAGACAAATTTTTATATATTTAAATTATTTTAGAGACCTATTTACCAATTGTTAATTAGTTCAAGGAGGTTCTTTACAAATTGTCGATGTCACATGAGCATTGGCTAGATGTTGACTAACTTTTTTTGTTATCTTGTTGTTGGTACGCAGTATTTATTAGTTTTGTCGGTTACTAATCTACGGACACATTTGTACTTGATTATGCCGGTATGTATGGTTTTTCTTTCCCAATAGAGTTTTTGCCGTACCCAATAGTCGAACCCGTGACTTTTGGTGTGGAATCTGAGCCCAGTTACCGTTCAGACCAATCTTTTTTGGTAATGTTAACTAACTTTAATGTAACAGAATGACCTCATTAAAAAAAAATTAGTCTAGGATCTAATAACAAAACTTGTTGGACCTATTTAAAAATTCCTAAATAGTTCGGGAATGAGTTTTTAGTCATTAACTAATAAATTAAAGGTATAATTATCATTAATCAATTAGTTATACGGGGCTCATTGTTTTAATCATTTCCGGGGCTCATTGTTTTACGATTAAAATAAAAGTGATTAGTCTCCACAGTCGCTGTGAATGATACATTGGTTTACCAAAAAAAAGTTATTATTAGATAAAATAATTTAGATATTTTTTTAAAGGTTTTTTTTTAGATTATTTTTTTAAAGGTTTTTATGCAAAGCAAAAGTTGATTTATGTTTATTTACTATAATAAAAAACCACTTTTTTAAGTTTTTTTCTCATCGGTTTTTAAAAATCAATTTTTTTAGAAACTACCAAATACAGTATTTCATTTTAATCATAAAATTTTTTTTTTAATTCTGAAATAATATAAAAATCTTAAATCAAAACTACTAACTCTATTTTTTTAGTTAAAAAATGATTTTTTCTAAAATAATCTAGAACAAATGAGATCTAATATTAATTGCATAAAAAATCAATCATATTATGATCTGTGATTCTTTGTTATTATAATAAATTTACAAAGTAAGCTATGCTTACATTTTAGGAATTACTTGCAAAAAAATTATATATTTTAGGAATTAAAGTAGTAAAAACATGGATAGTTTAGGCAATTAAAATGGAGCGTTTACTTTGTACCAAAAAAAACAATGGAGCGTTTACTGAAAAAAGAAATAAAAGATTGAGAGAGAAAAAGCACACAAATGTTACCGTTTTCGCTCCAAATGAGAGTTATCTTTTTCAACGTTATTTCGTTCTTTTGCCACTCTCACTCACACATCGCTTTCCCTAATACACTTTCTCTCTCACTCTCACTCGCCGGAGCTTCATTTTCCGGCAATCCCGCCGGCGAGATCTGACCGGAACTCAAATTTTAAAACCATGATTAAATAACAAAGTTTGCATCTTTGAGAAAAACCCACCTCATTTTCAGTCTCATTTTCTCTTTTCTCTCTCTCTCTTTCAAAC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	790	1054	5.20E-42
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	789	1057	4.00E-41
PF13855.9	LRR_8	168	224	1.00E-27
PF13855.9	LRR_8	333	371	1.00E-27
PF08263.15	LRRNT_2	26	66	8.50E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.12.2:RLK-Pelle_LRR-XV

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0051707	response to other organism	Biological Process
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0051726	regulation of cell cycle	Biological Process
GO:0032440	2-alkenal reductase [NAD(P)+] activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR017441	Protein kinase, ATP binding site
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9LHM8	_

SwissProt

SwissProt term	Description
RPK2_ARATH	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G02130	receptor-like protein kinase 2
Medicago sativa L.	MsG0780040076.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os07g41140.1	receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa012611	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000424s00026900.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr05_01300T	_
Arachis hypogaea L.	AH06G23460.1	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2 like

Expression pattern