Gene detail

Detail information of Am07G013100.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am07G013100.1	cyclic nucleotide-binding transporter 1

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am07G013100.1	mRNA	Chr07	103001104	103014880	-

Sequences

CDS:

>Am07G013100.1
ATGGTTCCTTATGAAAAAGATGAGGTACCAATGCTATCGGCAACATGTGGACAACTATCTGATGAACCTGTGGATTCTTCTAGCTTCCAAAGGCTCGTATACAGAACAAGAAGTGCTTCGATTTCTATTCCTATGGCTTCCCTGGAGCAACATGAGAGACCAACTAATGTAGGACATACCGGTCCACTTCGAACTACGAGGAAAATCCCCTTTGTGCAGATGAGTGGTCCACTATGTCCTACACCCAGAATTGGAAATATTTTGCAGAATACAGGAAACAAAGTAGGGGAGAACAACAAGACAGAAAATTTTTCTACATTTGATAGCTCAGATGAAAATCAATGGAACAACAACAATTATGATAGAAAAAATGAACATTTACTTAGGTCTGGGCAACTTGGAATGTGTAATGATCCTTATTGCACTACTTGTCCTACTTACTTCAAGGCTTCTCAGCAAAGAAATCCAAAGACTTCCACTATATTTGATCCCAAGTTCCACAATTCTCTTTATGGTGATGCGAAAGGTTTTGGAAGAAAACTTGTTTCTTTCTGCTATTCATGTATTCCTGGAGTTATGAACCCTCATACTAAAGTTGTACAACAATGGAACAAGATTTTGGCCATATTTTGCTTGGTGGCAATTTTTGTTGATCCATTATTTTTCTTCTTACTCTATATAAAGAAGGAAAATAAGTGTATTGTTATCAACAGGAATGTGGCAACAGCACTTGTTTTACTTAGAAGCATAAATGATGTTGTATATTTCTTGAACATTCTACTCCAGTTTAGGTTGGCTTATGTTTCTCCCGAGTCAAGGGTGGTTGGTGCTGGAGATTTAGTTGACCAACCAAAGGAAATTGCTCTTAATTACATTAAGAGTTATTTTTTCTTCGACTTATTTGTTGTAGCACCACTTCCTCAGATGATGATATTGTTCGTACTACCAAAGACCTTGGGGTTGTCAGGGGCAAATTATGCTAAGAATATTCTTCGTCTAGCAATCCTTGTACAGTATGTTCCTAGATTATTCAGGTTTTTGCCTATGCTAATTGGCCAATCTCCAACTGGATTCATATTTGAGTCGGCCTCGGCAAATTTTGTTATAAATCTTCTCATTTTTATGCTATCTGGCCACGTTGTTGGTTCATGCTGGTATCTCTTTGGTCTACAGAGGGTTAATCAATGTTTGCGAGATGCATGCCACCACTATAATCTAACTAACTGCATGGAATTGATTGACTGTGGTCCTAAAGTAAGCAAAACATCGGCTGATCTGTGGAGCAAAAATGCGGGTGCCATTGCTTGTTTGAATGCCACATCTGGTGTTTTTTCTTATGGCATTTATGAACATGCTATACCACTTACTATAGAAACTAAGGTGATCAACAAATATGTGTATGCACTATTCTGGGGTTTCCAGCAAATCAGCACTTTGGCTGGTAACCAAAACCCAAGCTATTTTGTGTGGGAAGTCCTTTTCACCATGTCCATCATAGGAATGGGACTCTTACTTTTTGCACTTCTCATTGGAAATATACAAAACTTTCTTCAGGCTCTTGGACGAAGGAGGGTAGAAATGCAACTTAGAGGTCGTGATGTTGAGCAGTGGATGAGCCATCGCCGCTTACCAGAAAATCTCAAAAGGAGAGTGCAGCAGGCTGAACGGTATAATTGGGCTGCAACAAGGGGGGTTAATGAGGAAATGGTTTTGGAGAATTTGCCCGAAGATCTCACGACAGAAATAAGACGTCATCTATTCAAATTTGTTAAAAAAGTTCGAATTTTCGCCCTGATGGATGAGCCTATCTTAGATGCCATTCGTGAGAGACTAAAACAAACGACATACATTAAAGGAAGTAGAATTTTGAGTAAAGGTGGTCTTGTAGAGAAGATGGTTTTTGTTGTGCGTGGAAAATTGGAGAGTAGGGGAGAAGATGGAATTCCACTTCCATTATCTGAAGGAGATGCTTGTGGTGAAGAACTTCTAACATGGTATCTTGAACATTCTTCTGTAAGCAAAGATGGTAAGAAAGTAAGACTTCCAGGACAGAGGTTGCTGAGCAACAGAACGGTAACATGTTTAACCAATGTGGAGGCATTTTCACTTCGCGCGACAGACATCGAAGAGGTTACAGTTCTTTTTGCACGATTCTTGCGGAGTCCTCATGTTCAAGGAGCACTAAGGTATGAATCACCTTATTGGAGATCCCTTGCTGCAAATAGAATCCAAGTTGCTTGGAGATACAGGAAAAAGCGTCTAAGTCGCGCTAATACCTCACAAGTAGATCAAAGGTTTTAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM07G013100.1
TATTCTTAGGACATTTTGATTATTTTAGGAAAACAATTATGACAGAATATCATGATCCTATAATTGCTTTTTGACAATGATGATCGTATAATGCTTCCAATCACAAATGAATACTTTCCGTATTGATTTCCTTTCCTTTTACATAAAACCTTTTGCTTACATAATCTTACAATACTGTGAACTGTGAAGTGTGTGAACTCTCTCATACATTTTTCTCGTGCAGGTGTGAAGAGGGTGGGAGCCAAGTCTTCACATGCATTGACGATGCTGCTGTTGGGTTGAAGATGCACCTCCTAAAGTTAATAACCTAGTAAGTCTTCGTTTTTTAATATACGCACTTCATATAAATAAATCGAATAACGAATATTTTCTTTTTGAGAATAAAATATTGGTGAAAAGTAAAAGTTTTATCCGTTAATTTCTCTTCTATATTTCAAAAAGTTTTATCGATGAATTTGCTTCAAAAAGTGTAAGAGGGATCACTCTTTTTAAGTAGTTAGAAGATTCAAATTAGTTTGAAGTTTTATTGATATGCTGTTTATAATTTAAATAATGTTGTTTGAATTTTGATGATTATTTTGATAAAGTATAATTAGAGACCTAATTACTTAATTTTTAAGAGTTGAACATGATCTCTAAATTGTTTGAGACGACCCTGACCGATACCTATATAGCTTAAAATTATCAATGCAATAAGGGAAGTCATTGAATATATAGTTGACACAGCAACGTACAACACACAAGAAATTATTATAAGAAAACACACACAAGTTACGTACTTACGTATATACGTACGTAGTCCTCCAACCATTTTCTGGTCAATGTTTTGCGAGATATTTAAAGTCAATTTCTTGCCTTCATTTATCTATTATCTATTAATTTTAATAAAACTGAATAGAACGCCTTATACCTCCCCCTCTTTAGATTATCATATTGCTACTTTGCAGGGCTGTCATTGACCCAACCTGTATGGCTTAGTCAAAATTAATCCACTAGCTTAATACTATAATTAAGTTTATATTACTTTTTCTGAATTAACGTTTGAGTCTATGACTTATATTATTTTATTTTTTTTCTTCTTTTCATTCTTATTATTCATTTAATTAAACTTTTCATTTATCTTTAATTAAATAAGTATATTTTTTTTAATTTTTATTTTTTTTAAGTTATTTCAATTGTTAATTTTGACAAACACTTTGAATTTGATTTGCTAGCTTATTTGCTACTTTAAATTCAGATATTAATATTGAGAAAACCAATAAAATACTTCTTTTTTTGACTGCACTAATAAAATACTATTCATTGACAAATTTGACTATCCATTAGAGAATTTAAAAAGATATAAAACATATGATATTATTTTAAAATTCAACTTTTTTATAAGAATTAACTTTTATATATATAAAATTTTATTCTCATTGTTTTACTTCACTAATGATTGATTTCTACATTTAATATGATGAAATACAAATTTAAATTTTCTTTATTATTTTTTATCAGTATTTAATTTTTTTAAATAAACACAAAATATAATATTTTAAAATAATTAATTTTTATTGAATATTTACTTTATTTTACCATTATTAAATTGTTAAAATGTTTTTATCTATTAAGTTATTATTGGCCATAACAAAGCACAGGTGTCCACATTCACGTTCACTAGACAACAAGCTCTCTCAAAAATTGAGTTTGTCAAAGTCTTCTTCCCCTTAACACACTCTCTATCCTTTGTCTTAGTCCACCTGTGTCTGTCAGAGAGTCTCTTTCACTCTACCCCATGATCACCAATCTCTTAAAAATGCTTCCTTTAGCTTCAATTTGTGCAAATTAGTTTGTGGGGGGTTTTCACTTGAACTTCCTTCCTCTTCAACCAACCAGGTTATATACACTTTACTCTTTCTGGGTTTATTGTTTCCTCTTCTTTTTCATTTTTGCTGCTATACTACTTGTTCATGCCCTTTTTTGTAACTTCCACTTGTTCCTATAACCAAATTGCAGCTCCTCAAAACTTGGAATCTTTCATATTGTTGTATATAATTATAATATAAGTGTGTGTGTATATACTAAATTTGTAAGTGTTTGCATGAAAAAGGGCATAGATATGTTTGACTATTTGTTAATGTTAAGTGTTAACTATTTCCTTTGAAACTATAGAGGTTGGATTGTACTTCATTTCAATAATTGTATGGTTAGTTTAGGTCATAGGTTGTCTAATTGGTTGTTTTCTTCCAAGCTTCAGAAGGTTTTAAGATTAGGGGATTGTTTGCTTCTCTCTCAATAGAAGTTCCACTGAAGAATCTTTTTGTGTCATTAAAAAACTTCATGTGTAAAGTCATATACACCATTCTAAATTTGACTGCAGGCCATATGTTGGGTTTTTTGAGGAACTGTGGAAGTATGGATTGTTGTTGGGCCAATACACCAACGAGCTCTGACACCACTTGTTAGTCTGGACAACTAGGATCTTCCTTGTGAATATTAGAGCTGTCATAATGGGCTGCCGACCCGGCCCAGCCCAACCCAATGGGCCAAAGTGCAAAAGCGAGCTAGTCTGGATCAGCTGAGTTATCTACTGGACTGCGTTTTTTGTAGTCCAGCCCAGCCCAAAATACTTGGTCAGCGGGCCGGCCCATTCCCGTTTTTAACAATGGAAAGCAAAAAAATGTCAAAAAAACTGGCCCACTTTGGCCCATGGGAAAACTGGGACGGGCCAAAATGTTTTGGTTCTTTTCCGGCATCCACTTTTTAAGCCCAGCCTAGCCCATAACACTAGCCCATCTGGCCGGCCCGCAAGGCTGAGCCAAAATTGACACCTCAACTTGTGATGCATTGAGTTCCATCTAGCTTTGTCACTAGCAGACAGTCTTTGGTTTTTCAAATTTTGAGCTGAATTGGTTTGTTTAACTTTAATATTGCTGATATGGTACATAGACACATATATATATATATATTGATACCTTTCTGGTTCCATAAAAATTTTCAGAATCATCAAACAGAAAC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00520.34	Ion_trans	205	522	7.20E-21

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	VIC

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005516	calmodulin binding	Molecular Function
GO:0006813	potassium ion transport	Biological Process
GO:0098662	inorganic cation transmembrane transport	Biological Process
GO:0022832	voltage-gated channel activity	Molecular Function
GO:0015079	potassium ion transmembrane transporter activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR014710	RmlC-like jelly roll fold
IPR005821	Ion transport domain
IPR018490	Cyclic nucleotide-binding domain superfamily
IPR000595	Cyclic nucleotide-binding domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9KF90	_

SwissProt

SwissProt term	Description
CNG20_ARATH	Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
K05391	cyclic nucleotide gated channel, plant

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G17700	cyclic nucleotide-binding transporter 1
Medicago sativa L.	MsG0680034773.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os02g53340.1	cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa004405	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000003s00001145.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_24730T	_
Arachis hypogaea L.	AH15G24010.1	Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic like

Expression pattern