Gene detail

Detail information of Am07G010920.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am07G010920.1	non-intrinsic ABC protein 8

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am07G010920.1	mRNA	Chr07	90796870	90803795	-

Sequences

CDS:

>Am07G010920.1
ATGACTTCCTTTGTAACACTATCACCGTGGCATTGCAATTCTCCCCTTTCATCTTCTTCTTCCTTCAGAAGAATCAGAACATCAAAACCCTCACTCTCATTTCCACTCTCACGCGTTCTCACAACAAACCCTCTCAAATTCCAATCACGACGCATATCTCTTCTTTCTACAACACCACCTCTCTCTTCCTTACAGCCACGTGCTTACGTCACTGGACCCGCATCCGACCCGAATATCATCGATTCGGATCCGAAATTTGACGAGTCGGTTTCGGAGAAGAGCGAGCCATCGAAGGTGATAACATGGGAACTACTCTCTATGCTTCTTGTTAAGCATAAATTGCGACTTGCTGTTTCTGTTGCTTCTCTCTTTGCTTGTACCGCTTGCACCTTATCCATGCCCATTTATTCTGGGCGTTTTTTTGAAGTTCTTATTGGTGCTAGACCCGAGCCGCTATGGAGACTTCTCAGTAAAATTGGAATCCTGTATGCCCTAGAGCCACTTTTAACTGTTATATTTGTTATAAACATGAACATAGTATGGGAGAAAGTTATGTCAACACTAAGAGCTCAGGTCTTTGGAAGAATATTGATTCAGAAGGTTGAGTTTTTTGACAAATACAAGGTTGGTGAACTCACTGGTTTGTTAACATCTGATTTGGGTTCTCTTAAAAATATTGTCGGTGAAAATGTTTCAAGAGATCGCGGATTCAGGGCATTATCTGAGGTCACTGGAACCATATTCATACTCTTTGCTTTATCCCCTCAACTGGCTCCAATTCTTGGTATTCTGATGATCGCAGTTTCCGTTTCAATTGCTGTCTACAAGAGATCAACTTTGCCTGTTTTTAAAGCACATGGGTTGGCTCAAGCATCCATGTCTGATTGTATAACAGAAACGTTTTCTGCTATTCGAACAGTGAGATCCTTTAGTGGAGAAAAGCGCCAAATGTTTACGTTTGCTAACCAGGTTCTATCTTTCCAATCGAGTGGGATAAAGCTTGGGACTTTCAAATCTCTAAATGAATCCTTGACTAGAGTTGCAGTTTATATTTCTTTAACTGCATTATATTGTCTTGGAGGAAGCAAAGTTAAGGCGGGTGAACTCTCTATTGGAACAATGGCATCTTTTATTGGATATACTTTCACTTTAACATTCGCCGTTCAAGGATTGGTTAATACTTTTGGAGATCTTCGTGGAGCTTTTGCTTCTGTTGAGAGGATCAACTCTGTTTTGTCTGATGTTCAAGTTGATGATGCCCTTGCTTATGGCTTAGAAAGAGAACTGAAACAAAAAGCAGTGAATGATGAAAACTATAAATTGTTCTTCTCCGATGGTTCTCCTGAGGAAAACCAAAAAAATTATTTGCATTACATGTCAGCATTAAAAACATCGAGCAATTTGATTAACTTAGCTTGGTCCGGAGATGTTTGTCTTGAAGATGTGTATTTCTCTTATCCTTTAAGGCCAGATGTGGAAATCTTAAGTGGCTTAAATTTAAGACTAAAATGTGGAACTGTAACTGCACTGGTGGGTGCTAGTGGTGCGGGCAAAAGTACAATAGTACAACTATTGTCTCGTTTTTATGAGCCAACAAGAGGTTGTATAACAGTTGGTGGAGAGGATGTCCGAACATTTGACAAGAGTGAATGGGCTCGGGTTGTCTCTATTGTAAATCAAGAGCCTGTTCTGTTTTCGGTGTCTGTTGGAGAAAATATTGCATATGGACTTCCAGATGAAGACGTTTCTAAAGACGATATAATTAAGGCAGCAAAAGCTGCAAATGCTCATGACTTTATAATTTCACTTCCGCAGGGCTATGATACACTTGTTGGTGAGCGTGGAGGCCTACTAAGCGGAGGACAGAGGCAGCGAGTTGCTATTGCCCGAGCTCTCCTGAAGAATGCTCCCATCCTTATACTTGACGAGGCTACCAGTGCTCTGGATACAGTGAGTGAGCGTTTGGTCCAAGATGCTCTAAACCATTTGATGAAGGGGAGGACAACATTAGTAATAGCTCACAGATTAAGCACAGTCCAAAATGCTTATCAAATTGCACTCTGTTCAGATGGGAGGATTACAGAACTAGGCACCCATTTTGAGTTATTGGCTAAGAAAGGCCAATATGCTTCACTGGTTGGCACTCAAAGGCTTGCATTTGAATAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM07G010920.1
AGTTTATGCTGGGGTGCATATACATTTAGGTGTCTATTGTTACCATGGTTCCTTAATTTTCTCAAAACTACATTCACATTTCTACTCTTACCTAAATGCTAAATGTCTCCCACAAAATTCTGATCGATGACCTTGCTGTTAGTTATCTATTTGAAACCAAAAGAACAAATAGTTTTATTTGCCAGGATACTTATAATGTCCATATTACAAGTTGGGGGGATGATTGTATTGTGAATACATTCACATGAAGGCATTAACGTGAGTATATTCTGATCTATTGGGCTAAATCTCGAATTCTATATTTCCAATATGCCCAAAACATCACCTCACTTTGTAGCTGAAACTGTGACAATCTACAGGTTTTTTGTCCGTTACACTCCAGCAACATCTCAACATTTCAGTAGGAACTATATGAGGAACGTAATTGTAGATGTTGTCAACATTGAAGAGTCCTAAGCAATTGGGCTGAATTGAAAACTTAAGTTGTAGACAACTTGGGATTTTTATTCCTCTTTTGTTGTGTATGGATTTTGAAACTTAGAATTTCTAATTGCATTTGAACTTATGTATTATACCAATGTCTATTTAATTTTCACCATCTTTAATTCCTCTTACTATTTAAAATCGTCAATAAATAGTTACTAAAGCTTTTACCCCGTGCATCGCACGTGTAAATACGCTAGTTGCTACAAATGTGTATGGCGGTCTTTGAAAAGAATTACTAAACTACAACTTTTTTGTGTTTGTTTTATTTGTAGAAGTGAATGTCTAATTTAAGTTGTATAACGGGCTTATGAAGGGTGCCTCTAATAAGTGGCAGATGTAGGACCTAAAGTCGGGAGGTCAAAAATTTTTAAAATCACACATCAATAAAAATATAATAAAAATAAATTTTAATATATTTAAATAAATAAATTACACAACTCATAATTGTCCCCTATGCATATGGACCCAGGACCCCGGGGTCAGGGGTGTCAAATTTTTTAAGGCCGGTGTCAAATGGGTGCAAAACTTGGTCTACTAGTACAATTTAAAATTTTCAGGGGGGTCAAAATTACAATTTCAGGAGATTTAGGCTATTTATATAGGGTGTTTAGTGCAAAAAAAAATTCCAAGGGGTTCAACTGAACCCCTTGGTTGTATGCTAGGTCCGCCACTGTGAGCGACTGTCTGAGTGTCGTGTTGTGTGAACTTGATGCAAAATTAGGGACTAAAGTGCAAATTATATTTTTTAGGGTGTGTAAAATATTTTAGTTTAAAGGAGCAAGTGTAATTTTATTTTTTGAGGATGTACGCTTGACACCTAAACAAGCTAAACAGGTTTTACGGGTTTGCGAGTTTCCGGTACTCCAACTAGTTCAAAGTCTTCGATATTTTAGATTGTGTACTTTCAAGTCTTACTTTGTTCTTGTTGTCTTCTGGGTCCGGGTTGTGGACCGGGTCTCTATGTTTGAACTTGGGTTCTCTTATGTTGAGCCTTTGGCTTGTAATGGTTGGGGCTTGGCCTATTTACGTAATCAACGCAGCAACTAAGTAAATAATTAAATACACTTAGGCTAACTTAACCTTAACTAACTTTGATCAACATTGATTAGTTGACTAATATTATTATTTAAAAGAAATTCCAAAATCCACCGTTCACCCTCTTTCCCTCCTCACCTCTCTCCCTGGAGTTACGTTACAGAGATGATCCATGCCTAGCAAACCAAACTCACCCCCTTCGATGCATGAATCACAACACTAGGTTTTAATATAATTAAGTAAAATAATGTGATTATTTAACCAATTTTTTTTAAACCAAGGTATTTTCTATGGAGACAGTGAAAACTAATTTTTCGAGCTATCCATTTAAAGAGTTGATATCTCCCAACCAGTGGCGGATCTACATATAAGTGAGGGTGTGCAGCTGCACACTCTCAAATTTAAAAATTTGCACCAATACCCCTATGAAAAATATATTTTGACACTCCTAGTTTTATTTTTTGCACATCCTACTACTATTTTTCTCTTTTCATTCCTAGCTGCTCTTTCCTATTGCAGCTTCAGGAGCAGTTGGTAGTGTAACTATGGGGTAGTTTTGGTTATCAAAAAATAATATATGTATTTAGATAATTAGGTATATTTTAAATTCAGCTACCCCGATAATATGTTATTTAGCTACTCCAACTAACTTTATTTGTCTAATGAGATAAAAGAATAATAACAAGTCCATTAGTCTAATTAGTCTCATTTGATCAAAAAAAGTCTATTATTATCACAAATAAATATGGTGATTTTTTTAGCTTGGTGATTATAGTCTTTTTATTTTACTTTGACAATTTTTGCCCCCAATTTTCCCCTCAAAATTATATATTATTTGCTCTTTTGGTCTTAAAAAATTTTGAATTTTGGAAAAATAAAGGAATAAAATTACACAATCCATGATTTTTAGTAACCAAAAGTGCAATGAAAAATCACAAAGACCAAAATTACCAAATTAGAAGAACAAAATATGTTTATTTGGTATACACGATCGCGGTAAAAACTTTTTAAGGTAGGTGAGATAAATTCAAACATTTTTTATGATGTATTGTTTCGTGATTGACTGCCGTTGTAAAAAAATTCTACACGACGATGTATATTAATTGTTAAATTAAATCGTTTGACCACCCTGGACACTCCTCCCAACAAAATATTTTTTACAGAGAGTGTGAAGATTAATCATTCGAACTATTGGAGATCCATTTACGGAGTTGACTTCTCGCAACAAATGTTTTTTCATATGTAGCGGCCAGGGATCGAAATGGTCAAGTGATCGATACTATACTATCAATTGTACATCTCAAGTAGCTAGCTCGGTTACCGAGTTAAAAATTAAAGAGTTTACGGTCCAAATCTCGGAAACGACTAACAACTAAAAAAAGAAAAGGATAAATTACACATGTCATGATGTCCAAAGAAAATGAATATATAAACCCCATTTTCTTCTCCTTCTCCTAATTCTTTCTTCACATTTTCTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00664.26	ABC_membrane	118	387	5.50E-36
PF00005.30	ABC_tran	495	646	5.20E-32
PF02463.22	SMC_N	573	685	6.70E-08

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	ABC

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016887	ATP hydrolysis activity	Molecular Function
GO:0035673	oligopeptide transmembrane transporter activity	Molecular Function
GO:0009941	chloroplast envelope	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0005829	cytosol	Cellular Component

InterPro

InterPro term	Description
IPR039421	Type 1 protein exporter
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR017871	ABC transporter-like, conserved site
IPR003439	ABC transporter-like, ATP-binding domain
IPR036640	ABC transporter type 1, transmembrane domain superfamily
IPR011527	ABC transporter type 1, transmembrane domain
IPR003593	AAA+ ATPase domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A9D5GX69	_

SwissProt

SwissProt term	Description
AB28B_ARATH	ABC transporter B family member 28

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT4G25450	non-intrinsic ABC protein 8
Medicago sativa L.	MsG0680033900.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os07g28090.1	ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa012400	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000962s00030560.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_49110T	_
Arachis hypogaea L.	AH15G35280.1	ABC transporter B family member 28 like

Expression pattern