Gene detail

Detail information of Am06G007390.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am06G007390.1	ATPase, F1 complex, gamma subunit protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am06G007390.1	mRNA	Chr06	18624702	18626440	+

Sequences

CDS:

>Am06G007390.1
ATGTCTTGCTCCAATATCACCATGTTGGTTTCCTCCAAACCTTCTCTATCTGATACCTCTAACCTTTCCTTTCGTTCTGCTTTCAACCCTTTTCAGCTTCCTCCACAAAACTCATCTTCTCCTTCCACACCTTCAAGAACTTCGGTTACTACTATTCAATGTGGTCTTAGAGAACTAAGAACACGTATTGATTCCGTGAAAAACACTCAGAAAATCACTGAAGCAATGAAACTTGTAGCTGCTGCAAAAGTCAGAAGAGCTCAAGAAGCTGTTGTTAATGGAAGACCATTTTCACAGACACTTGTTGAAGTCCTTTACAACATCAATGAACAGCTACAAACTGATGATATTGATGTTCCTTTAACTAAACTTAGACCTGTGAAAAAGGTTGCTCTTGTTGTTTGCACAGGTGATCGTGGTCTTTGTGGTGGTTTCAATAATGCAATTATAAAAAAAGCTGAAAGAAGAATTGCTGAGTTGAAAAATCTTGGTCTTGATTACACTGTTATTAGTATTGGTAAAAAAGGTAACACTTATTTTACTCGTAGACCTTATATACCTGTTGATAGGTATTTTGAAGGTGGTACACTTCCTACTGCTAAAGAAGCACAAGCTATTGCTGATGATGTTTTCTCACTTTTTGTAAGTGAAGAGGTTGATAAAGTTGAGCTTCTGTATACAAAATTTGTTTCTTTAGTGAAATCAGATCCTATAATTCATACTTTGCTTCCACTATCACCAAAAGGAGAGATATGTGATATTAATGGTAATTGTGTGGATGCTGCTGAAGATGAGTTATTTAGGTTGACAACAAAGGAAGGAAAGCTAACTGTGGAAATAGATTCTGTGAGGACTAAGACACCAGATTTCTCACCAATATTGCAGTTTGAGCAAGATCCAGTTCAGATTCTTGATGCACTTTTGCCTTTGTATTTGAATAGTCAAATATTGAGGGCATTGCAGGAATCACTTGCTAGTGAATTAGCTGCTAGAATGAGTGCTATGAGTAATGCTACTGATAATGCTATTGAGTTGAAGAAGAATTTGTCAAGGGTTTATAATAGGGAACGTCAAGCTAAGATTACTGGTGAAATATTGGAGATTGTTGCTGGTGCTGATGCTCTTATATAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM06G007390.1
TTACCAGATATGATGTAGATGAGGTTGGTGATCAGTCTCATCCTGGGATAGTGATGGAGCAAGAAGAGTTGAGTGATTCTGAGGAAGAGATTGAAGAACATGTAGAGTTTGAGTGTGAGGAGATGGATGATTCTGAGGGAGATGATAGTTCAGGTTGTGAACAAGCTCCCGAGGTTCAAAATAAGGTAATTGCTTTGTGTCAGTTAGTTTTAGTTTTTAAACGTGTGTCTGTATACATTTTTCAAATGTTGATGGGGAGAAATAACATAAATATTCTCTTATATAGATTTTTATTCTTTATTTTATTTCAAGTTTCAATTTCAATCTTCCTAAATGAAATACTGAATGTTTTTGTTAAATTATGTTGAACCATCAATTATTAATTTTCAGTGTGGTTTGTGGTCCTCACTACTTACTAGGAAATTTCACTGTTCGTATTGAGTTGAATTATTTAACATAAAAAACACTTTCTGTTTGAGCCTTTTAATGAGAAGGCATACACATCAATTTGGAGACCGCCATATTCATGTCTTTCCAAGTTTGACCCTGTTATTTGTTTGGTTATTACTTATATCAGCCAGTCAGTGGCAACATGATAATCCTTTTCTGCATGCAAATTTGAAATTCACACTATCCTTATTAGGTTCTCAACTCTACTCCAAGCCATGTTTTAACTCGAAGGCCCTGATAATAATTAATCTGTTACACTTCACATGTAAATTCACGTTCCTTCGCGAAAACTTTCTAATTTTGACTTTTGCCTCGTGCTTTAATAGATATTCATCAATCTATTACCTTTTTGTTTTTGTTGCTTCTTGCTTTATGATCATCTGAGCATTATGAGCCAGTCTTTTTTTGTTGACTAACCTTTATGCTAGGTGGTGGCTGGTCGTTTTTCTTTGCTTTCTTGTCATGTATCATGCTAAGATTCAAAACCCCGTTATTCTTCTTTGGTGCTAGTTCATATTCTTAGCTAATGTTTTGAAGTATGTTTTTTCATCCCTTAATAACCTTTTTAACTTTGTTTTGTTAGGAGGTGCCAATTTCTTCAGAAGAAAATGTTGCAATGCAGAGGGCTCGTATGAAAAAACCATATGAACCAAGGGCCATTTCTGATACTCAAGTTGATTCCAGTCTCCTTAAAGATAGTGCTAAACCAAATATGGTTTTGATGAGTGATGGAATGGATGACTTAAGTAGCTCATCATGGTTAAGTTTAGACTCGAGTAACCCTGCACCGTTGAAGACTATGCTTCAACGGGATATGGCCGGTGAAGATTCTGCACGAAGACACTTTACAATTAATAAAGTAGTTACTGATGGCGGACATAGCATTGACATGGTACAACTACCGAGTCAAGGTCCTCATATGTTTACCGCACCGCCAAAACTTGGGAAGCGTAATGGCAAACTCAATACAGATTTGAATATAGCATTTACTGCTGAAAAATCAGACCATGATGGTGATCATGAAGATGGTTGATTGAAGTGTTCTAGCAAATGGAGTGAAAATAGGATTCGGTGTCAAAAGATTAGCCCATCGTGTAAATGTTAAACAACCGAACTTGTTTTTGTTACTCATATTGCTGCAATTGCTGGATCGCAGTTAATCAGAAGTTAGGTGCTAAAGGATAAGGAGGTTTAGATTTGTACATTTACCGGCAATAGGTTCAAGTAAAGTTTTGTCTTTGTAAATATGTCACAAGGGGTCATGGCCAAAATTAATCTTGACCATTGTCTCCTAGATCATGATGGAACCTTTGAATTGTATAGAGCTATTATTATGTCCACCAATTCTTCTGATCTCCCAACAAGCAATGTTGAAAAAAGTGCCAAGAATCTGTTGGATTTACTGAAATTACTTTTGTAGGGTATCTTTTTAGAGTGAGCCACTAATAAGTATAGTTCATCCATTAGTCATAATAGTAAGTTATAATATCCCTATATATTTTCTTTACAATTGTGTTATTTGAACATTAAATTGGGACACCAAAAAATTGACATCAATTTTGCTTGATAGTAGAATTTGTACATGTTAATGAAGTGTTGAACTTAGTTAGTGGCGTCTCTTTTAATTAACTATTAATTGAATTTTATTGACTACGATTTTGAATGTTAATTACAATTACAATTTTAGGTGTTTGAAGATTATATGTGGATACCTAAAAATTGTATTAATAATGTCTAAATTTGTAGTTAATGAATTTAGTTGGTGGTTAATGAGTTGCAATACTTTGATATGTTATTTGATCTCGTTAACCATCATTTTGGTCTTTGAATGTGTGAGGTTTTATCATTACAGTCCTGAATGCATTAAAATTGCACACATTTGTCTAAGCATCTCTTTTGAGGACCAAAGTGACTAACAAAAGACACATTTGAGAACCAAAATGACTTGCTAAAGAGACATTTGAGGATATATTTGCAATTTTGATGCATGCAGGAACTATAATGATAAATGCCCACACATTCGGGGACCAAAGGGCCTGTTTGCCCCTTAATTGACTATGTAAAGTTATCTATTTCTTATTCCTTATGAGTACTCAAACACTAGAAAAAATTAATTAATTAAACAGAAAACATAAACACAGTCAAAATAAAATGGGTAAACCTTCAAATTAGTCTATCAACTATCACTCTATCTTCGGTTTAGTCCCTACACGATTTTAAATGATTAAAGAGTTCCTAAAATATACCCTCAGCAGATCTAAGACTCAAAACCATTCAAACATAGCCACGCCAGATTGGACCCCACAAGAGAAGAATTACATGTTCTACATGGCATTGGCAATCAAAATCCTTATCCTAAAACCTCATCCACTTCTTCTCATTCCCTCCACTCATTCCTACTCTTTACTTCCATGGCAGTAGAACAATCTCAACCCAAACAACACATTTACATGAAGAGAAGATAAGATTTCATCAGAATAAACCAACCAAATCCACATAAACTCACTCTCTCTCTTTCTCTGCTGAACAGCAGAGAGAATCCTCAAAACA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00231.22	ATP-synt	56	375	5.90E-88

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	F-ATPase

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0045261	proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1)	Cellular Component
GO:0046933	proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism	Molecular Function
GO:0015986	proton motive force-driven ATP synthesis	Biological Process
GO:0009535	chloroplast thylakoid membrane	Cellular Component
GO:1902600	proton transmembrane transport	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR035968	ATP synthase, F1 complex, gamma subunit superfamily
IPR023632	ATP synthase, F1 complex, gamma subunit conserved site
IPR000131	ATP synthase, F1 complex, gamma subunit

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S3DYS3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
ATPG_PEA	ATP synthase gamma chain, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
K02115	F-type H+-transporting ATPase subunit gamma

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT4G04640	ATPase, F1 complex, gamma subunit protein
Medicago sativa L.	MsG0280007247.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os07g32880.1	ATP synthase gamma chain, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa026590	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur001341s00032155.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_28040T	_
Arachis hypogaea L.	AH14G05120.1	ATP synthase gamma chain, chloroplastic like

Expression pattern