Gene detail

Detail information of Am06G003970.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am06G003970.1	HAESA-like 1

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am06G003970.1	mRNA	Chr06	9292430	9296139	+

Sequences

CDS:

>Am06G003970.1
ATGCCTCCCCTGCTTCCCTTCCTCTTCCTTCTCTTACCAGCAACCATTCTATGTCTAAACCAAGAAGGTCTCTACCTCTACAAGTTCAAACAATCAATGGATGACCCAGACTCCTCTCTTTCCACATGGAACAACCGCGACTCAACCCCTTGTAACTGGTTCGGCATCACCTGTGACCCCACAAACACCACCGTCACCAAACTAGACCTCTCCAACGCCAACATCGCTGGCCCATTCCCTTCCTCCCTCCTCTGCCGTCTCACTAATCTCACCTCCCTAATCCTCTCCAACAACTCCATCAACCAAACACTCCCTCTTGATATCTCTCTTTGCACCTCCCTTATTCACCTTGACCTCTCCCAAAACCTCCTCACCGGCACACTTCCCCACACTCTATCCCTCCTCCCTAACCTCCTTCACCTCGACTTAACCGCTAACAACTTCTCTGGCCCTATCCCTAACTCCTTTGGAACCTTCCAGAACCTTCAAGTCATCTCCCTCGTTTACAATCTTCTTGACTCCATTTTACCCCCTTCTCTTGGTAACATCACTTCACTCAAAGTTCTTAATCTCTCTTACAATCCCTTTCTCCCTTCTCATATCCCTCCGGAGTTTGGAAACCTAACTAACCTTGAGATCCTCTGGCTTAGTTCTTGCAACCTCGTCGGCGTTATCCCTGACTCGCTTGGGAATCTCAAGAAACTCAAAGTGCTTGATCTCGCGATGAATAATCTTAACGGCGTGATTCCGAGTTCGTTAACTCGGATGGTGAGTTTGAATCAGATTGAATTTTATAATAACTCGTTGTCCGGTGAGTTACCGGCGGGAATATCGAATCTCACTGCGTTGAGGCTTATTGACGTTTCTATGAACAGTTTAAGTGGTGCTGTTCCTGATGAGTTGTGCCGTTTGCCTCTTCAGAGTCTTAACCTTTACCAGAATCAGTTTACCGGTGAGTTGCCGGCGAGTATAGCCGACTCGCCTAACCTGTATGAACTCAGGTTGTTTCAGAATATGTTTTCCGGCGAGTTGCCGGAGAATTTGGGGAAGAATGGTCCGTTGATTTGGCTTGACGTTTCTAACAACAACTTCTCTGGTAAGATTCCGGCGACTTTGTGTTCCCTTGGTGCGTTGGAAGAGCTTCTTATGATACAGAACTCGTTTACGGGTGAGATCCCGGCGAGTTTGGGCGCGTGTCGTACATTGACGCGTGTGAGATTCGGTTTCAACAAATTGTCCGGTGAAGTTCCGGTGGGTTTGTGGGGTCTCCCTCGCGTGTATTTGCTTGAACTAGTTCATAACTCGTTTTCTGGTTCAATTTCAAAGACCATTGGTGGTGCTGGGAATCTCTCGTCTTTGACGTTATCTAAAAACAATTTCTCCGGTCCGATTCCTGAAGAGATTGGATGGTTGAAAAATCTTCAGGAATTTTCAGGTGGTGATAATCAGTTCAACTACTCGCTCCCTCAGAGTATTGTGAATCTCATGCAGCTTGGGACTCTTGATCTCCATAACAATAAGCTTTCTGGGGAGCTTCCTAAGGGGATTCAAACCCTCATGAAACTCAATGAGTTGAATTTGGCTAATAATGAGATTGGTGGGAAAATTCCTGATGAAATTGGGGATCTGTCTGTGCTTAATTTTCTTGATCTATCCAATAATCGATTTTCTGGAAATGTCCCTCTAGGTTTACAGAATTTAAAGCTAAATCAGCTGAACTTGTCTTACAATAGTCTTTCTGGGGATATTCCTCCTATGCTGGCTAAGGATATGTATATGGATAGTTTTGTTGGTAATCCTGGTTTGTGTGGGGATTTGAAAGGTTTGTGTGATGATGGTAGAGGGGAAGGTAAGAGTGCTAATTTCGTTTGGTTGCTTAGAACTATTTTCATAGTGGCCAGTTTGGTGTTTCTCTTTGGTGTGGCTTGGTTCTATTTCAAGTACAGGAATTTCAAGAATGCCAAGTCCATTGATAAATCGAAATGGACATTGATGTCGTTTCATAAACTGGGTTTCGGTGAAGACGAGATCTTAAACTGCCTCGATGAAGATAACGTGATAGGAAGTGGATCATCTGGAAAAGTCTACAAGGTTGTACTCACCAATGGGGAAGCTGTTGCTGTGAAAAAGATCTGGGGAGGGCTTAGAAAGGAATTGGAGAGTGGAGATATAGAAAAGAGTAGGTTTCAAGACAATGGTTTTGATGCAGAAGTTGAAACATTGGGCAAAATTAGACACAAGAACATTGTCAAGCTATGGTGTTGCTGCACCACTAGGGATTGCAAGCTTTTGGTTTATGAATATATGCCAAATGGTAGTCTTGGTGATTTACTGCATAGCAGTAAAGGAGGTCTGTTGGATTGGCCAACTAGATATAAGATAGCTCTTGATGCTGCAGAAGGCCTCTCTTATCTGCATCATGATTGTGTTCCTCCTATTGTTCATAGAGATGTGAAATCTAACAACATCTTGTTGGATGGAGACTTCAGCGCAAGGGTTGCAGATTTCGGAGTTGCTAAGGTAGTTGAATTCACAGGGAAAGAAACTAAATCAATGTCTGTCATAGCTGGATCTTGTGGTTATATTGCACCAGAATATGCATACACGCTTAGGGTGAATGAAAAGAGTGACATATATAGTTTTGGTGTTGTCATACTTGAGTTGGTTACTGGAAGGAAGCCTATTGACCCTGAATTTGGGGAAAAAGACTTGGTCATGTGGGCATGCAACACTTTGGATCAAAAAGGCGTGGACCATGTGCTTGATTCACGGCTTGATTCTGGTTTCAAAGAAGAAATTTGCAAGGTCCTCAACATTGGCCTAATGTGCACTAGTCCTCTTCCAATCAACCGGCCTGCAATGAGAAGAGTTGTGAAGATGTTACAAGAGGTAGGCACACAGAATCACCAAAATCTGTGTGCCAAGAAAGATGGGAAGTTATCACCTTATTACTATGATGATGAGTCGGATCATGGAAGTGTTGCTTAA

Protein:

>Am06G003970.1
MPPLLPFLFLLLPATILCLNQEGLYLYKFKQSMDDPDSSLSTWNNRDSTPCNWFGITCDPTNTTVTKLDLSNANIAGPFPSSLLCRLTNLTSLILSNNSINQTLPLDISLCTSLIHLDLSQNLLTGTLPHTLSLLPNLLHLDLTANNFSGPIPNSFGTFQNLQVISLVYNLLDSILPPSLGNITSLKVLNLSYNPFLPSHIPPEFGNLTNLEILWLSSCNLVGVIPDSLGNLKKLKVLDLAMNNLNGVIPSSLTRMVSLNQIEFYNNSLSGELPAGISNLTALRLIDVSMNSLSGAVPDELCRLPLQSLNLYQNQFTGELPASIADSPNLYELRLFQNMFSGELPENLGKNGPLIWLDVSNNNFSGKIPATLCSLGALEELLMIQNSFTGEIPASLGACRTLTRVRFGFNKLSGEVPVGLWGLPRVYLLELVHNSFSGSISKTIGGAGNLSSLTLSKNNFSGPIPEEIGWLKNLQEFSGGDNQFNYSLPQSIVNLMQLGTLDLHNNKLSGELPKGIQTLMKLNELNLANNEIGGKIPDEIGDLSVLNFLDLSNNRFSGNVPLGLQNLKLNQLNLSYNSLSGDIPPMLAKDMYMDSFVGNPGLCGDLKGLCDDGRGEGKSANFVWLLRTIFIVASLVFLFGVAWFYFKYRNFKNAKSIDKSKWTLMSFHKLGFGEDEILNCLDEDNVIGSGSSGKVYKVVLTNGEAVAVKKIWGGLRKELESGDIEKSRFQDNGFDAEVETLGKIRHKNIVKLWCCCTTRDCKLLVYEYMPNGSLGDLLHSSKGGLLDWPTRYKIALDAAEGLSYLHHDCVPPIVHRDVKSNNILLDGDFSARVADFGVAKVVEFTGKETKSMSVIAGSCGYIAPEYAYTLRVNEKSDIYSFGVVILELVTGRKPIDPEFGEKDLVMWACNTLDQKGVDHVLDSRLDSGFKEEICKVLNIGLMCTSPLPINRPAMRRVVKMLQEVGTQNHQNLCAKKDGKLSPYYYDDESDHGSVA*

Promoter(3k):

>AM06G003970.1
ATATATAAAAAAACACGGGATAACTGTAGTGATATATAAAAAAACACGGGATTAATATTTGCGATTGATAATTATAATTGTTGAAGACTACTATAAACCTACTATCTAAAAAAACAAGAAGGCTTAATGACTATTTAAACTGATTAATATTTAAAACACACGTGACAAATATTTGTCACTAATTCCTAAAAAAGCACAAATAATTGTCACTGATATATAAAAAACACGAGATAAATATTTCTTATTGATAATCTATTATCTACTATAATCTACTAATCAAGTCAAATAATCAATTGAAACTATGAGATAACTGCACTGATACATAAAAAACACGGGATAACTGCACTAATATATAAAAAAATACGGGGATAACTGCAATGATATATATAAAACCACGGGATGACTACACTGATATATAAAAAAAATACGAGATAACAACACTGATATATAAAAAAACACGAGATAAATGCTTAGATTGTTTTTAAATGATACTTTTTCAATTTTAGATTTTAATATTTATATTTATCTACTTTAAATTTGTTTTTATTTTCACGGGGTAATGTTCAAACTATTTAAATACTGTCTAAGTTCATTCTTAAAAAAAACACGACAGCACCTGTGCGTATGCACGGGTATCCTATCCTACTATCCTACTATATTTATCCTACTATATTTATACAACTAAACCACATATGATTTTACTAATACCCCTATTCTATCTAAAAGACACCTCAAATTTTTTAGGGTAAAAAAGCTATTAGACTCTATTTCTTCTTTTATTTTCTCTTTATTCTTACATTTGATTTCTTACTTTTCACTTTTCTCTTACACTCTCTTTCTTCCTTTTTTCTCTTTCTTTTTACACTCTCTTTCCTCCTTTTCACTTTTCTTTTACACTCTCTTTCTTCCTTTTTTTTCTTTTTACTTTACTTTTCCCATAAATAATTATTCTCTTTCTCTTATCACTTCAGTTTAATTCTTTTAACTAAATTTCTAAATTTATACAAACACTACTTTAATTAAAAAATTTGAAGACTACTACTATAAAACCACTATCTAAAAAACAAGAAGACTTAATGACTATTTAAATTAGTAATTAATATTTTAAAAAATATTTCATTTTTTTGACAACAAAAAAAAATTCTTATTGATAATCTAATATCTAACTTTTATTATCTACTATAATCTACTAATCAACTAAAATAATCAATTGAAACTATGAGATAACTGCACTGATAAATAAAAAAACACGGGATAACTGCAGTGATATATAAAAAAACACGGGATTAATATTTACCATTGATATTTATAATTTTTTTTGACAATTTATAATTAAAAAACACTGGATTAATATTTACCATTGATATTTATAATATTTTGTTGACAACTTATAATTAATATTTACCATTGATAATTATAATTTTGGAAAACTACTATAAACCTACTATCTAAAAAAACACTGGATAATTGCAATAATCTACTATAATCTACTAATCAACTCAAATAATCTAATATAAAACACGAGATAACTGCAATAATCTACTATAATATATTGAAACTACGAGATAACTGCACTGATATATAAAAAAACACGAGATTAATAATTGTCAATGATAAATACAATTTTTGAAGCCTACTACTACAAACCTACTATCTAAAAAATAAGCAGACTTAATGACTATTTAAATTACTAATTAATATTTAAAACAATTATTTTATTGATAATCTACTATCTAACAAATTTACTATCTACTATAATCTACTATCAACTAAAATAATCAATTGAAACTACGAGATAACTGCACTAATATATAAAAAACACAGGGATAATTGCAGTGATATATAAAAAAAAACACGAGATTAATATTTTCCATTGAAAATTATAATTTTTGAAAACTACTATCTAAAAAAACCAGAAGGCTTAATGACTATTTAAACTAGTTAATATTTAAAATGCACGCGACAAATATTTGTCATTAATACCTAAAAAAGGACAAATAGTTGTTAATACCTAAAAAAGGACAAATAGTTGTTACTCATATATAAAAAAACACTGGATAAATATTTGTTATTGATAATCTACTATCTATGTTTTACTATCTACAATAATCTACTAATCAACTCAAATAATCAATTGAAACTTTGAGATACTGCACTGATACATAAAAAAACACTCGAAAAATGCACCGATATATAACAAAATACAGGGATAACTGCAGTGATATATATAAAAACACGGGAGAGTTGCACTGATATATAAAAAAAACATCGGATAACAACACTGATATATAAAAAAAACACTGCAGTGATATATAAAAACCCACAAGATAAATGCACATATTGTTTTTAAATGATACTTTTACGTTTTTAGTTTTAATATTTATCAATTTTTTATTTTAAACTCATTTTTTTTCTACTTTAAATTTTTCTTTATTTTCATGAGGTAATGTTCAGACTATTTAAATACTGTCTAAATCCATTCATAAAAAAAACACGACAGCACCTGTCTGTAGGCAAGTCATCATCTATATTTTACAATTGATTTTAAATTAATGAAATTTTAAATTAACGTTTCTATTTGAGGTAATCGTATCATGCAACGCGATCGGCCCGTGCAGTTCGGATGTATACTACTGGTAAAATTTGAAATCAAATCAAATCAAATTAACAACAATAAATATAACTAGTTTTATTTTCCCCGCCTAATATGAAAGCTACTATAAAACTTGTTTTCCTCGTATTGGAGACCTGTGTTGTTTAGATGGACAAAAAGTGAATAAATGATAGCATCATTCATCAAAACTCAAATAGAATATAATAACACGTCGTAAAGCATCGTATCTCTCGGGCCTTTATGGAGAAGACAGAGCTAAAAAACCTGTCTCTCTCTCACCAGTGATAGTTTTGTTTTTGTATGGAGAACCAGAAGAAACCAAAGCCAATCCATCACACACAGTAATCCATTGAGTGACGACGGTGTTTGTTTCTCTGTTTTCCAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	683	900	1.50E-41
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	684	959	1.40E-37
PF13855.9	LRR_8	210	268	1.30E-33
PF13855.9	LRR_8	498	556	1.30E-33
PF08263.15	LRRNT_2	20	59	4.30E-13

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.12.4:RLK-Pelle_LRR-XI-1

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0051707	response to other organism	Biological Process
GO:0071944	cell periphery	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0033612	receptor serine/threonine kinase binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR017441	Protein kinase, ATP binding site
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XBU3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
HSL1_ARATH	Receptor-like protein kinase HSL1

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G28440	HAESA-like 1
Medicago sativa L.	MsG0480022325.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g13800.1	receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa013537	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000071s00005283.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_05500T	_
Arachis hypogaea L.	AH10G02390.1	Receptor-like protein kinase HSL1 like

Expression pattern