Gene detail

Detail information of Am06G003890.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am06G003890.1	alpha-glucan phosphorylase 2

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am06G003890.1	mRNA	Chr06	9019574	9043183	-

Sequences

CDS:

>Am06G003890.1
ATGCAAACCATTTCGTTTCCACTCCCCACTCTCACTCACTCATTTCGGAATCCATTCACTTCCTTTCATCCATTTCCGCATCCAGCAGAGTTCTCATTCTCCCCGCTTTCGATCCGGCGTGGCACCGTTTCACGAGATAATCGTGTGCGTACTTCTACCAGCGAATCAACTTCTTCGACGTCAACGATCACCGTCGACAACTCCGATTCCGGCGAATCCACCGCCTTCGTGATCCGAGCTCGCAATAAGATTGGACTTCTCCAGGTCATTACCAGGGTTTTCAAGGTCCTTGGCCTCAGCATTGACAGGGCAACGGTCGAATTCGAAGGCGATTTCTTCGTTAAGAAGTTCTTCGTCACTGATTCCCATGGGAACAAGATCGAGGACTCTGAGAATTTGGAGAGGATCAAGCGAACATTGGAGGAAGCGATCGATGGTGAAGACGGGACGGTTTCGGTGGCCAAGTCGACAGCGAACCGAGGGATTGTGGTGAGGAGAGCTGGATTTGGGGAACATAAGGCAAAAGCAGAGAGAATGTTTGGCTTAATGGATGGATTTCTAAAAAACGACCCTCTCAGTCTTCAGAAGGATATTCTTAATCATGTTGAGTACACCGTGGCGAGATCACGGTTTAGTTTTGACGATTATGAAGCGTATCAGGCTTTGGCACATAGTGTGCGGGATCGGTTGATTGAACGCTGGCATGATACTCACATTTACTTCAAGAGGACAAAACCCAAGCGCCTCTACTTCCTCTCGCTCGAGTTTCTCATGGGTCGCTCCTTGTCAAATAGTGTTATCAATCTGGGCATACAGGATCAATATGCTGAGGCCCTAAGCCAACTTGGATTTGAGTTTGAGGTTTTGGCGGAGCAGGAAGGAGATGCAGCACTAGGGAATGGTGGCCTTGCTCGTTTTTCAGCATGTCAAATGGATTCTTTAGCAACTTTGGACTATCCTGCATGGGGTTATGGGTTGCGTTACGAGTATGGGTTGTTTCGTCAGATCATAGTGGATGGCTTTCAACATGAGCAACCTGATTATTGGCTGAACTTTGGAAACCCCTGGGAGATTGAGCGGATTCATTTAACATATGAAGTGAAGTTCTATGGGACTGTTGAAAAGGTAGACATGAACGGAACAAAACAGGAAGTTTGGATCCCTGGAGAGACGGTTGAAGCTGTGGCTTATGACAACCCAATACCAGGTTATGGGACAAGAAATACCATAAACCTTCGACTATGGGCTGCTAAACCTAGTAATCAATTTGATTTGGAGGCCTATAACACCGGAGACTACATTAATTCGATTATCAACAGACAAAGGGCGGAAACTATTAGCAATGTTTTGTACCCTGATGACCGATCTCATCAGGGGAAGGAGATGAGGTTGAAACAGCAGTATTTCTTTGTCTCAGCATCTATACAAGATATCATCCGGAGGTTCAAAGAAGAACATAATAATTTTGATGAATTGCCGGAAAAGGTAGCTTTCCATCTAAACGATACCCATCCATCCCTTTCAATTGCTGAGATTATGCGAATATTAGTCGATGAAGAACATTTGGGCTGGAATAAAGCATGGAACATTGTATGCCAAATTTTCTCTTTCACAACTCACACAGTGGTAGCTGACGGACTAGAGAAAATACCTGTTGATCTGCTTGGCAGCCTCCTCCCTCGCCATTTACAGATTTTATATGAAATAAATTTTAATTTCATGGAGGAGTTGAAGAAAAGGATTGGTTTAGATTACAATCGACTGTCTCGGATGTCAATTGTTGAAGATGGTGCCCTGAAGAGCATACGAATGGCCAACTTGTCAATTGTTTGCTCCCATACTGTTAATGGTGTTTCAAAATTACATTCAGATACACTGAAAATGAGGACATTTAAGGACTTCTATGAGCTATGGCCTGAAAAATTTCAATACACGACAAATGGTGTAACCCAGCGCCGGTGGATTGTGGTGAGCAATCCTAGTTTATGTGCTCTTTTGTCAAAACGGCTAGGGACTGAAGCTTGGATCCGCAATGCTGACCTTTTGGCAGGATTGAGAGATCATGTTGATGATGGTGATTTTCGTCAAGAATGGAAAATGGTTAAAAAGCTTAATAAAACGAGGCTTGCTGAGTACATTGAAGCAATGAGTGGTGTGAAGGTTAGTTTGGATGCAATGTTTGATGTTCAGGTGAAGCGCATACATGAATACAAAAGACAGTTGCTTAATATATTTGGAATTATTCATAGATATGACTGTCTCAAGAATATGGACAAGAATGACAGGAAGAAAGTTGTACCTCGTGTTTGCATAATTGGTGGGAAAGCAGCTCCTGGCTATGAAATTGCAAAGAAGATTATCAAACTTTGTCATGCTGTAGCAGAAAAAGTTAATAACGATGCTGATATTGGAGATCTTCTGAAATTAGTTTTTATCCCTGATTATAATGTTTCTGTTGCTGAATTGGTGATACCAGGGGCTGACCTTTCTCAACATTTAAGCACTGCAGGACATGAAGCATCTGGAACTGGAAGCATGAAATTTTTGATGAATGGATGCTTACTTTTAGCTACAGCAGATGGATCTACAGTAGAAATAATTGAGGAAGTAGGGGTTGATAACTTGTTTCTCTTTGGTGCAAAAGTGCAAGAAGTAGCAGAACTGCGTGAGAAAGGAGCTGCTTTGAAAGTTCCTCTACAATTTTCCCGTGTGTTGAGAATGGTTCGAAATGGATATTTTGGCGATCAAGACTACTTTAAATCCTTATGTGACACGGTGGAAGTTGGTAAAGATTTCTACCTACTTGGTTCTGATTTTGGGAGTTACCTTGAAGCACAGGCTGCTGCTGATAAAGCATTCGTTGAACCAGAGAAGTGGATTAAGATGAGTATCCTTAGTGCCGCCGGCTCTGGCAGATTTAGCAGTGACAGGACCATTAGAGAGTATGCTGAGGGGACATGGAAAATTGATCCCTGCCGATGCCCTCTCTGA

Protein:

>Am06G003890.1
MQTISFPLPTLTHSFRNPFTSFHPFPHPAEFSFSPLSIRRGTVSRDNRVRTSTSESTSSTSTITVDNSDSGESTAFVIRARNKIGLLQVITRVFKVLGLSIDRATVEFEGDFFVKKFFVTDSHGNKIEDSENLERIKRTLEEAIDGEDGTVSVAKSTANRGIVVRRAGFGEHKAKAERMFGLMDGFLKNDPLSLQKDILNHVEYTVARSRFSFDDYEAYQALAHSVRDRLIERWHDTHIYFKRTKPKRLYFLSLEFLMGRSLSNSVINLGIQDQYAEALSQLGFEFEVLAEQEGDAALGNGGLARFSACQMDSLATLDYPAWGYGLRYEYGLFRQIIVDGFQHEQPDYWLNFGNPWEIERIHLTYEVKFYGTVEKVDMNGTKQEVWIPGETVEAVAYDNPIPGYGTRNTINLRLWAAKPSNQFDLEAYNTGDYINSIINRQRAETISNVLYPDDRSHQGKEMRLKQQYFFVSASIQDIIRRFKEEHNNFDELPEKVAFHLNDTHPSLSIAEIMRILVDEEHLGWNKAWNIVCQIFSFTTHTVVADGLEKIPVDLLGSLLPRHLQILYEINFNFMEELKKRIGLDYNRLSRMSIVEDGALKSIRMANLSIVCSHTVNGVSKLHSDTLKMRTFKDFYELWPEKFQYTTNGVTQRRWIVVSNPSLCALLSKRLGTEAWIRNADLLAGLRDHVDDGDFRQEWKMVKKLNKTRLAEYIEAMSGVKVSLDAMFDVQVKRIHEYKRQLLNIFGIIHRYDCLKNMDKNDRKKVVPRVCIIGGKAAPGYEIAKKIIKLCHAVAEKVNNDADIGDLLKLVFIPDYNVSVAELVIPGADLSQHLSTAGHEASGTGSMKFLMNGCLLLATADGSTVEIIEEVGVDNLFLFGAKVQEVAELREKGAALKVPLQFSRVLRMVRNGYFGDQDYFKSLCDTVEVGKDFYLLGSDFGSYLEAQAAADKAFVEPEKWIKMSILSAAGSGRFSSDRTIREYAEGTWKIDPCRCPL*

Promoter(3k):

>AM06G003890.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00343.23	Phosphorylase	279	989	6.20E-295

Gene family

Gene family	Subfamily
Carbohydrate-Active enzymes Family	GT35

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0008184	glycogen phosphorylase activity	Molecular Function
GO:0005980	glycogen catabolic process	Biological Process
GO:0005737	cytoplasm	Cellular Component
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0030170	pyridoxal phosphate binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR035090	Phosphorylase pyridoxal-phosphate attachment site
IPR000811	Glycosyl transferase, family 35
IPR011833	Glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase
IPR045865	ACT-like domain
IPR002912	ACT domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XBT3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
PHS1_DICDI	Glycogen phosphorylase 1

KEGG

KO	Description	Enzyme
K00688	glycogen phosphorylase	[EC: 2.4.1.1]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G46970	alpha-glucan phosphorylase 2
Medicago sativa L.	MsG0280006767.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g63270.1	alpha-glucan phosphorylast isozyme, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa016227	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000071s00005294.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_C00052_unscaffolded_00150T	_
Arachis hypogaea L.	AH20G07080.1	Glycogen phosphorylase 1 like

Expression pattern