Gene detail

Detail information of Am05G016240.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am05G016240.1	dicarboxylate transporter 1

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am05G016240.1	mRNA	Chr05	110583077	110586501	+

Sequences

CDS:

>Am05G016240.1
ATGGCTTCCATAGCACTCACCACCACTGCAACCCTCCCATCTCTCCGCCACCGCACTTCCTTCAAATCCCCACCACTTCGTCACTCCACCACTTTCAAAACCCTCAAATCAAATCACTACCCTTCCATTTCTTCCTTCCCTTCCTTCCCACTCTCCAATGTCGCTAAACGCCCCACCTTCACTGTAAAAGCCTCATCTGCATCCTCAGCCGCTATCACTCCATCTCCGGCTCCGGCTTCACCTCCAGCTCAGCCATGGCAAGGCGCGGCAATCAAACCCTTACTTGCATCTATAGCGACAGGTGTCATCCTCTGGTTCGTCCCCGTCCCCGAAGGCGTCACTCGAAACGCATGGCAATTGCTTGCGATTTTCTTAGGCACAATCGTTGGAATCATCACTCAACCATTGCCACTTGGTGCCGTCGCAATTTTAGGGTTGGGAGTTTCTGTTCTCACGAAAACCCTACCTTTTGCGGCTGCATTCTCCGGCTTCAGTGATCCAATCCCATGGCTGATTTGCCTTGCCTTCTTCTTCGCTAAGGGATTCATCAAAACCGGTCTCGGAAACCGTGTTGCGTATCAATTCGTTTCCCTTTTTGGCAGCTCTTCGTTAGGGTTAGGTTATAGTTTGGTTTTCAGTGAAGCACTTTTAGCACCGGCTATTCCTTCTGTTTCTGCTAGGGCTGGTGGGATTTTTCTTCCATTGGTTAAGTCTCTTTGTGTCGCTTGTGGTAGTAACGCCGGCGATGGAACGGAGAGAAGGTTGGGGTCGTGGTTGATGCTTACATGTTTTCAGACTTCGGTGATTTCGTCGGCGATGTTTCTAACTGCAATGGCGGCAAATCCACTCTGCGCTACTCTTACTCTGAATTCGATTAACCAGACAATTGGGTGGTTGGATTGGGCCAAAGCTGCTATTGTGCCTGGATTGGTGTCGTTGGTGTTGGTGCCGTTGATCTTGTATATCATTTACCCTCCTACTTTGAAAAGTAGTCCCGACGCACCCAAGCTTGCTAGGGAAAAGTTGCAGAAAATGGGGCCCATGACTACCAATGAGAAGATCATGACAGCTACCCTGTTTCTTACGGTGGGACTTTGGGTCTTTGGAGGGGTTCTTAATATAGATGCTGTAACTGCTGCCATTCTTGGATTAGCTGTGCTCCTTATCACAGGGGTTGTAACATGGAAAGAGTGCTTAGGTGAGGGAGTTGCCTGGGATACTCTCACGTGGTTCGCTGCCCTCATTGCAATGGCTGGGTATTTGAACAAATATGGTCTCATTTCTTGGTTCAGTCAAACTGTAGTCAAGTTCGTTGGTGGATTGGGTCTCTCATGGCAACTATCTTTTGGTATTCTGGTCCTCCTTTACTTCTACTCTCATTACTTCTTTGCAAGTGGTGCTGCTCATATTGGTGCCATGTTTACTGCATTTTTGTCCGTTGCTACTGCTCTAGGAACTCCACCATTCTTTGGGGCCATGGTGCTGTCCTTCCTCTCCAACCTAATGGGCGGCCTTACTCATTATGGGATTGGGTCGGCTCCAGTGTTTTTCGGTGCGAACTATGTTCCACTTGCTCAATGGTGGGGCTATGGCTTTGTTATTAGTATTGTTAACATTATTATTTGGCTTGGACTCGGATCTGTTTGGTGGAAATTCATTGGCTTGTGGTAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM05G016240.1
GTTGGGGTGTAATGTAACAACCCAAAATAATTAATTTAATTATTTTGATACTTAAACCGTTTAATTATTTTTATGGTGCTTAATTGATGATTTTATTAATTGATTGCTAAGTTAAATATTCATTGATGTGGGGTTATTTAGAAATTTAGAATAGATTGAGGGTATAAGGGTCATTTTACCCAGATAAGTTATTTTATTGGTAATAAAAATAAAAAGAGAAAAGAAATAAAAGAAAAGAAAGGGATAAAAGAGAGGGGGTTCGAGAGAGGAGAAGAAAAGAAAGAACAGAAGAGAAAGAAAGAAAGGAAAAGGAGAGAAGAGAGAAAAAGAGAGAGAGAGCGACGAGAAAGAGAGAGAAGAAGGGAGGGTTCCAACACTACAATCTTCTTCCTCTCCATTTTCGAAATCCATTAGCATTGTGAGGCTTAACACCACCATTTCATCCACATCTTCCTCTTCTTACACATCTTTGAAGATCATTGTTGTATGTTGATAAAAAGAGGGTTAAGAAGCTGAGTTTCGAATTCAAGCTTGGGGGTAGCTTTTGGGAGGCATTTCACTTCATCTTTAGCTTGTTGTGTGTTGAATCCGACAAATCGAGAGGAGTTCTACTCCGTTAGGGTTTTATTATGTTAAGTGTTGTTTGTGTTGTTGATTGGACTGATTGTAGTGCTGGGACTTAGTATTGTTGAGTTAGGAATTGATTGGATTGAGTTTGGAGTGACTGGCTATTGTTTGAAACGATTTTTATGCAGAAAACAGGGTCATAATCTATTATTTACCTCTGATAATCGATTATGAAGCTGCCATAATCAATTATCAGTGACAATTCCACAGAAAAATCATTTTTAAGCTGTCATAATCGATTATCAAGCTGTGATAATTGATTATTAAGCTGTATAATCGATTATGAATGCTTCTTGTTAGTCTTTCGACCATTTTCTTCGTAACATTTGATCCAAAACTCCGATTTGAGTGTTCTTGGATGCGTTGGAAAGCTAATGAGAAGAACTACAATTATAATCAAACATTGAAAGGATTAACATGCTTGTGATTGTTGAGGTTGAATGTCTACTGTTGAATGTTGCTTGAATGTGGCAAGTGAACGTTTCCAAATTGATTGCAAAGTCATTTCTTTTGAAAACGCGTTTGATGATAGATGTTATTGTTTAAACTCATTTGTTGATTGTGTTGAGTTTGGAGGAGATGGATAAATGGTTTTTGTGTCGAGTTAAACTCTTTTCGAACGAACGAGTGAGAAAACTAATTAGTACGTATATAAGTACACCATAAATGAACTAATGAATGGATGATGTACTTGGGGCGGCGTCATGAACTGTCTCAAGGCCCAAGAGGTTAAGTTGTGACGATTCCAAGAGGTTTAGTTATAGGGTTCTATTTATTTATTGAACACGGGTTCCCTATATGCATCGTCGTAGCTTTTATATTATGTAAGTCTATGGCGCAGGGGGATGCATCATAGGTAAAATAATAAAAGATATACGGAGAGTATTGGTAAGGAGTTGCAAAGGACTCACTAAGATTATGTAATTTCACCCCTCATTGTTGTTGTTTTTCAGATAAGCAGGTTAAGTTAATGAATGATACAACAAGGAAAGGATCCAAATTCATGGAGTACCTTGAAGTTAGACGTGTAGCATATTATTTTTGTTCTAAGTCTCATTTGATGAGAATTATGTATTAGTATATAAGTATTTATGTATTCGTAAACTGGATTAAGTTGTATGTTGACTCTGATATGTCTTTTGAACTCAGTAATGTTTTTAAGTATTGAACGAGTTGTATTTTATGAAAATCCTATCAACGTGAGTCTTTAATATTGTTTTTGTCAATCCAAATTACGAATGCATACTCTGAAAGATCTAAAAGGTAATATTCTAGATTTATCACCAGTTAAAAATCTAGGATGTTACAATTCTAAACAAGTTGTACCAACCAATAAGCAAAAGACTGCTTTAGAAACACAATATGCATTATAAATCGTAGTTGTAGATTAAATCATAAATGATTAAGATTTAAACAAAAAGTCCTATGACTTTTTTAAGTGATCATGTGATTAGTAAACAAATATTAATGTTTTAATCACGACCATCTATATATTATAGTGATCATTTATTTAATAAATTCAATTTTCAACTAAAATTCGACTCATTTAATTTATGAATAGGGTTCAACAAACTATTTATCAAGTCGAATTTCATATTTTATTGGCTTAAATATGTTTTAGGCCCCTGCAAATATAGGGTGTTTTGGTTTAAGCCCCTGCAATTTTTTTTTTGGTTAAAAGCCCTTGCAAAATGAAATATTTTGTTATAAGCCCTTCTCAACATATCCAGCAATCATAGCATTCCATGTTATAGGCTAACATTTTAGTCATAGAAGGGCTTATAACAAAATATGTCATTTTGTAAGGGCTTTTAACAAAAAAAAATTGTAGGAGCTTAAACCAAAACACCCTATATTTGCAGGGGCCTAAAACATATTTAAGCCTATTTTATTAGAGTTGGTTCAGTTCATTAGGAGCTACCTTTCACTGTTGCACGCAATAATGTGACTCTACTCGTCCATTCATATCTTGCCACGTATCCTGTGGACAACACAGTTATTTCCGTAGTTCCTTGTTCCGTGGGGCTGGCTGGTGATCAGTTAGAGGCTCTTTTCTGCCCTCACAATCTCCCTTTTGGTTTTTTACTTTTTTTTTCCCGACGGAGATATCAACATCTCACAGTCACAGGTAACTTGTCCAACTCTCCAAGTCGAGAATCACAAAGCCATAAGTGCACAGAAGCCACCAATTCCTCACCAACAAACAAAGCCGCATATTCCAATCACAATCTCAACCCTCCATTCCAAATCCAATGGCCCACAGTCAAAACCCCTCCTATCTCATTCTCACCAGCTCAAACCACATGGCACATGGCACTGTATTAAGCTTCCCACATCCCCCGCACCACTCCACACCAGATCACACTCCCTACC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00939.22	Na_sulph_symp	93	556	3.70E-141
PF03600.19	CitMHS	129	372	4.10E-16
PF03600.19	CitMHS	367	541	4.10E-16

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	DASS

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0015742	alpha-ketoglutarate transport	Biological Process
GO:1902356	oxaloacetate(2-) transmembrane transport	Biological Process
GO:0019676	ammonia assimilation cycle	Biological Process
GO:0005634	nucleus	Cellular Component
GO:0006355	regulation of DNA-templated transcription	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR001898	Solute carrier family 13
IPR030676	Citrate carrier CitT-related

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A2Z6PGX3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
DIT1_ARATH	Dicarboxylate transporter 1, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
K03319	divalent anion:Na+ symporter, DASS family

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G12860	dicarboxylate transporter 1
Medicago sativa L.	MsG0480021054.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os12g33080.1	2-oxoglutarate/malate translocator, chloroplast precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa010352	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000966s00025842.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_03740T	_
Arachis hypogaea L.	AH13G05500.1	Dicarboxylate transporter 1, chloroplastic like

Expression pattern