Gene detail

Detail information of Am05G004960.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am05G004960.1	golgi nucleotide sugar transporter 3

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am05G004960.1	mRNA	Chr05	34974407	34976003	-

Sequences

CDS:

>Am05G004960.1
ATGTCTAAAGATAACGACGTTGAAAAAAACCCTACTAATATTCAGAATTTTCAGAAAGGGGTAAATTTGAATGATAGTGATGGAAATTGGTACAATTCAATTGTTCATCAAATTTCAGTATATGGTGTAGCTGCTGGTTACTGTTTATCAGCATCTTTACTTTCAATAATTAACAAATGGGCTGTCATGAAATTCCCTTACCCAGGGGCATTGACTGCCCTGCAGTATTTCACTAGTGCCGCCGGGGTTTTCCTTTGCGGCCGGGTGAAGCTCGTAGAACATGACTCCCTTGATCTGTTAACCATGTGGCGGTTTCTGCCCGCGGCTGTGATCTTTTACTTGTCGCTTTTCACTAATAGTGAGTTGCTGCTACATGCCAATGTGGATACTTTCATTGTGTTTCGGTCGGCTGTTCCCATTTTTGTTGCGGTTGGGGAGACGTTGTTTCTTCACCAGCCGTGGCCGTCGTTGAAGACGTGGGGCTCGTTGGCGACGATCTTTGCCGGGAGTTTGCTTTATGTTGCTACGGATTATCAGTTTACTTTGGCGGCTTATAGTTGGGCAGTGGCGTATTTGGTTAGTATGACTATAGATTTTGTTTACATTAAGCACGTGGTTATGACCATTGGATTGAATACTTGGGGTCTTGTGTTGTATAACAATCTTGAGGCTCTTTTGCTTTTTCCGTTGGAATTGTTGATAATGGGTGAGTTGAAGAAGATCAAGCATGAGATTTCTGATGAGTCTGATTGGCACTCGTTTCAAGTAGTTTTGCCTGTGGCATTATCGTGCTTGTTTGGTCTCTCAATTTCTTTCTTTGGATTTTCGTGTCGAAGGGCTATTTCTGCGACTGGATTTACTGTTCTTGGTATAGTGAACAAGTTGTTGACAGTTGTGATTAATTTGGTTGTATGGGACAAGCACTCAACGTGGGTCGGCACTGTGGGACTTTTGATTTGTATGTTAGGTGGGATCATGTATCAGCAGTCAGCGAGTAAACCGAAAGCTACAACACAAGCAACTGAAGGAGAGAACGAGGAGGAACAACTGAAGTTGCTTGAAATGCAAGTCAGTTCAGAGACCAACAATACTGATAATGAAGTTAGTAAATCAAGGGAGGGAAATTGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM05G004960.1
AAGGTTTCTTGAGTTGAGAACCTTGAGCACACAACCTTGATAGGAGATCACAAAGATAGTGTAGTCCTTATCATCTTCCCAAAAAAGAGGTGGCACACTTCACCTCCACTTCCATTTCTATCTTCTCCTTCATGTAAGTGTTGTTTCATTTGTGTTGTATTTATTGAGATCCTTCCTCTATTTTCTTTGAATTTCAAGAGCATGTGTTGTTGAAGATTTATGAGAATCAAGTTGTTTTTGCAACTTTTCTAGATCCAAATCTTTGGAGATCATGTTAGATCTCATCAAGTGGTACAAGAGCTTATCAGGCCTACTAGATAAGGTGCTTTTAGTTGGGTATCTTGCTTTGGTGCAACGTGTTCTTGAGCGTACTAGCGCGTGCTGCAGGTGGGGCCCATTCTTTTTAAACACCCCCTACTACTCTCCAAACCCCCTAAAGTGATGAATGGACTCAAACACCCCTAAAACCTTAAAATTTCCTCCCCACTCCTCTCCCTTTTTTCTTCACCCTCACCATCCTCCACACTCCCCACCACATCCCAAACTCCATATCCTCACCACCCATCTCCAACCCATCTTCTCCTAATCTACCTCATTCTACAACTTCTCATCAAACATCATTCTTCACACTCCCAAGGTTTATTTTCACCCCACCATCCACCATTTTTGAACGAAAACATTGTGTTCTTGTTTTTTTCTTGTGATTTGGCTTGATTCGGTACCTTAGTACCGAAGTAGGCCGGTACCAAAGTACCACACGTGTAAAAAAGTTGAAATTTTGGGTATTTTTCAGATTAACACACGCGGTACCTTGGTAATGGCAAATTTCGGTACGGAGGTATTGACCGTTATTTTTGTGAGTTGCTTAATACAAGTTTGGTACCAAGATTCTAATATTGTCAGGTACCAAGGTACCGCGTGTTTTAAGCTGAAATAGTAAGATTTTCACCCGTTTCAATGTGGGTCTTACATAATTTTCCCCTTTCATTTCAATTTTGTCTTAGGTTAATTAACATGATTAATATGTTGTCTTTGTATGTATTTATGGAGGATGGCAATCCACTACTCCCTATGAATCCGATATGGCGTGCTAATAGGTTGGACATAACACGTGATTGGGCAAAGGCACATGTTGGTCGCGTGCAACAATGGAGGTCGTTGCTTGTAGAGTCAAAAATGAGTTATATTGTAGATTAACTGACATTAAAAAAGATTGATTTCATTTTCCAAATGATTATATTTAATTGAATATTTTCCACGTCATTATTGTTAGTTGAATATTTTCAACGTCATTATATTGTCATTTTACTTGTTATTTGGTATTGTATAATAGAATATTAGTTACAATGCAGTAGTACTATTGCAGTATCAACACTACACTTAAAAAACAAAGTATCAACAAAATTCGGTAGCTTAGTATTGAGAGGATTCCGTACTTTGGTGCCGTGATGCCTCAGTACCAAAGGACCGCGTGTATTTTTCATGCAAAGTTTCAAAAGTACACATTCGGTACCTTGGTACCGTGCAGGTCCGGTACCAAAGTAGTAAATCCTCTCGATACTAAGATACTAAAAAGTTTAAAGTTGCAAAAAATATAAAACCAGAAACGCGAAAGGGAGGAGAGGGAGAAGATTATTTTTGGGCTCATGGCTTATTGTATTCCTGTTGTCTCTTGGGCTTGTGGTTGCTTGTTCGTAACCAGTGTCCCTTGTGCAAAAAAAAGTATATCATTTTAAGATTTTTTTAAAAATGAAGGTAAAATGGGTGCATCTAATATGGACCTCTAAATAATGGTCCAAAGATGGACTTTTACCATTTTTTATTAAGTTTTAATCAAATATTATTTTGTTCTTCATTTTTTATTATTGTAAAATTCTTTTTTTACTAAAAATGATAAATGTCCACCTTTGAACTATTTTTAAGAGGTCCATGTTAGATGCACTCCCTTCCATCTAATATGGACCTCTAAAACATAGTCCAAAGATGGACTTTTACCATTTTTAGTAAGATTTAATAAAATCTTATTTTTATTCTCTATTTTTTATTATTGTAAAATTATTTTTTACTAAAAATGATAAATGTCCACAGTTGGACCATTTTAAAGAGGTCCATGTTAGATGCACCCCGAGTACGTCTAATATGGACGTCTAAAAAAATTAAGGTTTAAATTTATGTTTAGTCCTTGCAAATATACGTTTTATCCAATTTAGTCCGTGTAAAAATAAAACTTTGTGTTTAGCCCTTAAAAATATAAGTTTGATCCAGTTTAGTCCATGTAAAAATAAAACTTTGTTTTTCGTCCCTGTAAATATACGTTTTATCCAGTTTGGTGTAAAATATTTTATTTTAGTCACTCCAATATGAGCAGAAAAAGGACTAAAATCAAATATTTTACATATTAATTAGAGAGATCAAACTGGATAAAACATACATTTGCAGGGATAAAAAACAAAGTTTTGTTTTTACTGAAACTAAACTAGATCAAATTTGCATTTGCAAGGGCTAAACACAGAGTTTTATTTTTACAGGAACTAAACTAGATTAAATGTATATTTACGGGGACTAAACATATATTTAAACCTATTAAATTAAACATAATTCGTGAAAGAGATATAAAACTGAAAATTCTTAGTTTTATAAAATAGAAATATAATAATTTAATTAATTAATAATTAATAATACCAACCTGGAGTATACACACGGTAAGAAGAACAAAACCCAAGAATGAATCAAATGAAATGAAAAAGGGAGATTTGGGAGCTGAAAACGCAAGAAATTCGCTTCCGTCTACGACAGTCCCCTCTTCAGTTCCATTCTGGTTAGTTACTTCCTTTCTCTACTCTTCTCTTCTGCATCAACGTCATTGTCGTTTCACGTACTAATCTAAACTTGCTTCAAAATTCTCTGCTTCACACCACACTCAACAGATCTGGATAGATTTTAATTTTAATTTTAATTTTAGACTGATAATAACATCGAGTAATTTTTTCTTGTGTTCAG

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF03151.19	TPT	51	327	4.40E-16

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	DMT

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0015297	antiporter activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0005685	U1 snRNP	Cellular Component
GO:0003729	mRNA binding	Molecular Function
GO:0006376	mRNA splice site recognition	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR004853	Sugar phosphate transporter domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9RSY6	_

SwissProt

SwissProt term	Description
GONS3_ARATH	GDP-mannose transporter GONST3

KEGG

KO	Description	Enzyme
K26221	GDP-nucleotide sugar transporter

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G76340	golgi nucleotide sugar transporter 3
Medicago sativa L.	MsG0480018800.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os03g11590.1	integral membrane protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa007489	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000787s00032055.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_44030T	_
Arachis hypogaea L.	AH12G23400.2	GDP-mannose transporter GONST3 like

Expression pattern