Gene detail

Detail information of Am05G001450.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am05G001450.1	receptor like protein 6

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am05G001450.1	mRNA	Chr05	11689372	11692981	+

Sequences

CDS:

>Am05G001450.1
ATGAGAGGGCACATATTCTTTTGGCTTTTCTTCATACCATTCTGCTTAATAAATTCCAGTACTAACGTCAATGTGGTGAATGGCTCCTGTTTTGGCCATCAACGTTCTATGTTGCTCCATTTGAAAAACAACCTGATATTCAACCCCACAAAATCCTCAAAACTAGTTCACTGGAACCAAAGTGAAAGTGATGATGATTGTTGCAAATGGCATGGGGTAACATGCAGCAAGGGACTTGTTATAGCCCTTGATCTCAGCGAGGAGTCTATCTCAGGAGGACTTCATGATTCTAGCCCTCTTTTCAGCCTGCAGTATCTGCTTAGCCTGAATTTGGCTCTTAATGAATTTCATTCTATTAATATTCCTCCGCAGCTGCACAAGCTGAAGAGTTTGAGGCATCTTAACTTGTCTGCTGCTGGCTTTGAGGGGCAGATCCCAGAAGAAATCTCGTATCTCAGAAGGTTGGTTACTCTTGATTTGTCTTCTCCATTTACTTCACGCGGGCACAATCTGAAGCTTGAGAAGCCAAATATAGCTACACTTCTTCAGAACCTCACAGATATCACAGCATTGTATCTAGATGGGGTAGCTATATCTGCCAAAGGAGAGGAATGGGGACATGCTTTATCTTCCTTAGAGAAGCTTCGTGTTCTGAGCATGTCATCATGCAATCTCTCTGGACCTATTCATTCTTCACTTGCTAACCTGCAATCACTTTCTGTTCTAAAATTGAGCCACAACAAACTGTCAAGCACAGTGCCAAATTCCTTTGCAAATTTCTCCAATTTAACCACCCTACATCTCAGTGATTGTGGTTTGAATGGTTCTTTCCCCAAACATATCTTCCAAATACAAACATTACAGGTCCTTGACATATCAGACAATCAATATCTTCATGGTTCTTTGCCAAACTTCCAACCACTCGCACCTCTGCAAAACATGAACCTTCACAACACAAATTTCTCAGGAGAGCTTCCAGATACCATTTCGAATCTGAAGCAGCTGTCTACCATTGATCTATCTTACTGCCAGTTCAATAGTACACTCCCCAGTTCAATGTCAGAACTCACTCAACTTGTTTATCTAGACCTGTCTTCCAATAACTTCACAGGTCCACTCCCTTCTTTCAACATGTCTAAGAACCTCACATATCTGTCCCTCTTTCTTAATCATTTAACAGGGCCTTTACCATCCACCCATTTTGAGGGCCTCATAAATCTTGTCAACATCGACTTAGGGTTCAATTCTTTCACTGGGAATGTGCCCTCATCTCTATTTAAACTCCCATTATTGCGAGAACTAAAGCTTCCTTTTAATCAACTCAGTGGTGGCTTGGGTGAGTTTGACAATGCATCTTCTTCCCCTGTCCTAGAGATGCTTGATTTGGGAAGCAATAAGTTACAAGGGCCAATTCCTGTGTCTGTCTTTAACTTCAGAACACTACGAGTCATTCAACTTTCTTCAAACAAGTTCAACGGCACAATAAAGTTGGACGTGATTCGAAGGTTAAGTAATTTAACTATACTAGGCCTCTCACGTAACGAAAATCTGTCATTTGATGTCAACTTGAGAGATGATCATGACCTGCCCCTCTTTCCTAAGTTGAGAACTCTAATGTTGGCTTCATGCAAGTTGAGAGTAATCCCTAGTTTCATGAGAAACCAGACTGATTTAATATCTCTCGATCTATCTGGCAACGAGATTGAAGGATCGATACCTAGCTGGATTTGGCAATTTGAATCTCTCATTTATTTGAATCTTTCCAAAAACTTTCTGACAAATTTTGAAGCAAGTCATCAGAACTTCAGTTCTAATGCTTTTGTGGTTGATCTTAGTTCTAACCAATTGGAAGGGCCTATTTCTTACATCCCAAAGTATGCAAGTTATTTGGACTACTCAAGCAACAGATTCAACTCTATCATTCCACCAGACATTGGAAACTACCTCCTTTTCATACGTACATTGTTTCTTTCAAACAACAGTTTCCATGGTCAAATCCATGAATCCTTTTGCAATGCTTCAAGTCTCCGCTTGCTAGACCTTTCCCACAACAACTTTGTTGGGAAAATTCCCAAGTGTTTTGCAGCACTTGGTAGCAGTATGAGGATGTTAAATTTTGCTGGAAACAAGCTTCAAGGTCATATTCCAGATACTATGTTCCCAACTTCATGTGCATTGAGGTTTTTGGATCTAAATGACAATCTCTTGAGCGGTACCATACCAAAATCTTTGGTCAATTGTCAGAAACTACAAGTCCTAAACCTTGGAAAGAATGCAATAACTGACAGATTTCCGTGTTTCTTGAGCAACATTTCCTCACTGAGAATCATGGTTTTAAGGTCTAATAAACTCCATGGGTCTATCGGGTGCTCAAATAGCACTGGCGGTGATTGGAAGATGCTTCACATTGTTGACCTAGCCTCCAATAACTTGAGTGGCAAAATACCAGGAGCGCTGTTAAATAGTTGGAAAGCCATGATGCATGATGAAGACTTAGATGGGTCAGAATTCGGCCATTTGTTTTTTGAAATCGATGATAACTTTCATGCTATGAACTTGAAGGACGTATTACCACATATGAGCAAATATCTTGCACTGAAACTGGTCAAACTTGTTGCAGATATACCTCGCTCCATCCTTGACCAGGGGTTTGCAGATATTAATTTGGTGGATCTTGCTCGTTATCCTGATTCAATTATCATTATCAACAAAGGCCAACAGATGAAGTTGGTCAAAATTCAAATGTCTTTCACTTATGTGGATATGTCGAGCAACTATTTGGAGGGGCCAATACCTGATGAGCTAATGCAATTAAAGGCATTGAATGCTCTGAACTTGTCGCATAACGCATTCTTTGGTCATATACCATCATCTGTTGGGAACTTAAAGAATCTTGAGTCTTTAGACTTATCAAACAACTCCTTCAATGGAGAGATTCCTCCAGAGCTTTCAAGTCTATCTTTCCTCGAATATATGAATGTCTCCTTCAATCACTTGGTGGGAAGAATTCCTTTGGGTACTCAAATTCAAACCTTTGATGCAGATTCCTTTGAAGGGAATGAAGGGTTGTGTGGACCTCCACTGACCAACAATTGCAGTGGTGATGGAATTCAGGCATTGTCACCACCAGCATCTGAAACACCTTCCCATAGTTCAATTGATTGGAGTTTCTTAAGCGTTGAGTTGGGATTTATTTTTGGCTTTGGAATGTTCATCCTCCCCCTTATTTGCTGGAAGAAATGGAGGCTGTGGTATTCCAAACATATAGATGGGTTCCTTTATAGGATCATCCCCCAGCTTGATTTTGTGTATGAACAGCATGGAGGGAAGAGGTATAGAACTCTAAGATGGAGGTATTGA

Protein:

>Am05G001450.1
MRGHIFFWLFFIPFCLINSSTNVNVVNGSCFGHQRSMLLHLKNNLIFNPTKSSKLVHWNQSESDDDCCKWHGVTCSKGLVIALDLSEESISGGLHDSSPLFSLQYLLSLNLALNEFHSINIPPQLHKLKSLRHLNLSAAGFEGQIPEEISYLRRLVTLDLSSPFTSRGHNLKLEKPNIATLLQNLTDITALYLDGVAISAKGEEWGHALSSLEKLRVLSMSSCNLSGPIHSSLANLQSLSVLKLSHNKLSSTVPNSFANFSNLTTLHLSDCGLNGSFPKHIFQIQTLQVLDISDNQYLHGSLPNFQPLAPLQNMNLHNTNFSGELPDTISNLKQLSTIDLSYCQFNSTLPSSMSELTQLVYLDLSSNNFTGPLPSFNMSKNLTYLSLFLNHLTGPLPSTHFEGLINLVNIDLGFNSFTGNVPSSLFKLPLLRELKLPFNQLSGGLGEFDNASSSPVLEMLDLGSNKLQGPIPVSVFNFRTLRVIQLSSNKFNGTIKLDVIRRLSNLTILGLSRNENLSFDVNLRDDHDLPLFPKLRTLMLASCKLRVIPSFMRNQTDLISLDLSGNEIEGSIPSWIWQFESLIYLNLSKNFLTNFEASHQNFSSNAFVVDLSSNQLEGPISYIPKYASYLDYSSNRFNSIIPPDIGNYLLFIRTLFLSNNSFHGQIHESFCNASSLRLLDLSHNNFVGKIPKCFAALGSSMRMLNFAGNKLQGHIPDTMFPTSCALRFLDLNDNLLSGTIPKSLVNCQKLQVLNLGKNAITDRFPCFLSNISSLRIMVLRSNKLHGSIGCSNSTGGDWKMLHIVDLASNNLSGKIPGALLNSWKAMMHDEDLDGSEFGHLFFEIDDNFHAMNLKDVLPHMSKYLALKLVKLVADIPRSILDQGFADINLVDLARYPDSIIIINKGQQMKLVKIQMSFTYVDMSSNYLEGPIPDELMQLKALNALNLSHNAFFGHIPSSVGNLKNLESLDLSNNSFNGEIPPELSSLSFLEYMNVSFNHLVGRIPLGTQIQTFDADSFEGNEGLCGPPLTNNCSGDGIQALSPPASETPSHSSIDWSFLSVELGFIFGFGMFILPLICWKKWRLWYSKHIDGFLYRIIPQLDFVYEQHGGKRYRTLRWRY*

Promoter(3k):

>AM05G001450.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF13855.9	LRR_8	214	273	1.70E-52
PF13855.9	LRR_8	456	514	1.70E-52
PF13855.9	LRR_8	533	590	1.70E-52
PF13855.9	LRR_8	653	711	1.70E-52
PF13855.9	LRR_8	726	784	1.70E-52
PF08263.15	LRRNT_2	33	76	3.30E-07

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016301	kinase activity	Molecular Function
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0051707	response to other organism	Biological Process
GO:0016773	phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor	Molecular Function
GO:0140096	catalytic activity, acting on a protein	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR046956	Receptor-like protein 23-like
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2YLR7	_

SwissProt

SwissProt term	Description
RLP6_ARATH	Receptor-like protein 6

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G45616	receptor like protein 6
Medicago sativa L.	MsG0480018711.01.T09	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g40440.1	expressed protein
Cucumis sativus L.	Csa004821	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur002333s00041518.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr05_08740T	_
Arachis hypogaea L.	AH02G22830.1	Receptor-like protein 12 like

Expression pattern