Gene detail

Detail information of Am05G000210.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am05G000210.1	receptor like protein 6

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am05G000210.1	mRNA	Chr05	2439833	2443659	-

Sequences

CDS:

>Am05G000210.1
ATGAGACCAATATTTGTTCCCTCACTTCTTCTGTTTGTTTGGTTGTCAGTTAGAGTAAACACCAAGGCCATGAGAATTACATTAGTTTCATTGCTTTCCTTCATTTTCTGCTACTGCATATCTCTCAGTAATATTGCTTCTGGCCAATGTCTTGGGGACCAAAAATCATTGCTGCTCCAATTGAAAAACAATCTCAAGTTCAAGTCAGAAATTTCTAGTAAACTGAAGCTGTGGAATCAAAGCATTGCTTGTTGTAATTGGAAGGGTGTAACCTGTGACATTGAAGGACATGTTATTGGCCTTGATCTGAGTGGAGAATTAATCTCTGGTGGGTTCGACAATTCAAGTAGTCTTTTCAGTCTCCAACATCTCCAAAAACTCAATTTGGCTGCTAACAATTTCAATTCTCCCATTCCATCTAGATTCAACAAGTTGGAGAAGTTAACTTATCTGAATTTGTCATATGCTAACTTTGTGGGGCAGATTCCAATTGAGATTTCTCAGCTTACAAGTTTGGTTACTCTTGATATCTCTTCTCTTGGCTATTTAATAGGCCAAGAGCTGAAACTTGTGGACCCAAATCTACAGAAGCTTGTTCAAAATCTCACCAGTATTAGGCAACTGGTTCTGGATGGTGTAATTATAACAGGTCTGGGACAGGAATGGTGCAATGCTTTGTTGCCGCTGCGTGACCTGCAAAAATTGAGCATGTCTGGCTGCAATTTATCAGGACCCCTTGATTCTTCCCTGGCAAGACTTGAGAATCTATCAGTCATTATTCTTGATGAGAATAGTTTTTCATCCCCAGTGCCAGAAACATTTGCAAATTTTAGAAACCTGACCACCCTCAGTCTTGTATTCTGTGAGTTGACTGGAAAATTTCCATCAGAGATCTTCAAGATTGGAACATTGTCAGTTATTGACTTGTCACTTAACTACAATCTCCATGGTTCATTTCCAGAATTCCCTCTGAGTGGATCTCTCCATACCTTAAGGGTAAGTAACACAACCTTCTCTGGAGCATTTCCACACATTATAGGTAACATGAGGCACTTAACTGAATTAGATCTTTCTAATTGTCAATTTAATGGTACACTTCCTAGTTCACTGTCAAATCTCACAGAACTTAGATACCTGGATTTGTCATCTAACAGCTTCACAGGCCCAATGCCATCTTTTGTTATGGTCAAAAACCTCACCCACGCAGACCTTTCTCATAATGGATTAAGTGGTGCAATTCCATCATCCTCTCACTTTGAAGGACTGCACAATCTTGCAAGCATTGACTTGAGTTATAATTCTATCAATGGGAGCATTCCTTCATCCCTTTTTACACTCCCATTACTACAGAAGATTCAGCTTTCATTCAATCAGTTTAGTAAACTGGAAGAATTCAAAAGTGTGTCTTCCGCTGTATTAAACACCCTTGATTTAAGCAGCAACAATCTATCAGGGCCTTTTCCAACATCTATCTTAAAGCTCAATTCACTCTCTATCCTCAAACTTTCCTCTAATAGGTTGGATGGGACACTTCAATTTGATAAGCTTTTGAAGCTTAGAAATTTAACTACAATAGACCTTTCATACAACAATATATCAGTCAATGCAAATGTTGCAAGTGCTGACCAGTCTTCCTTTACCAACATTAGCACTCTAAATTTGGCATCCTGCAACTTAAAAGCTTTCCCTGGTTTCTTAAGAAACAAATCCAGATTAACCATTCTAGACCTTTCACATAACCAGATTCAGGGAACAGTGCCCAACTGGATTTGGAAATTAAAGAGTCTTCAAAACCTTAATATTTCTCAGAATATGCTCACTGATTTGGAAGGACCTTTGCAAAATCTCACATCCAACTTGATAGCTCTTGACCTTCATAACAACCAGCTGCAGGGACCAATACCTGTTATTCCTAAATTTGCAGTCTATTTGGATTACTCGACAAACAATTTTTCTGTTATCCCACAAGATATTGGTAATTACCTATCTTCGGCAATTTTTCTTTCTCTTTCAAATAATAATTTACATGGCAGAATCCCTGTTTCCCTCTGCAATGCTTCAAGTCTGAAAGTGCTTGATATTTCCATGAATAACATTTCTGGAACAATTCCCTCATGTGTGATGATGACTATGACTGAGACACTTGGGGTGTTAAATCTTCGGAATAACAACCTCACAGGCCCTATCCCAGATATGTTTCCAGCCTCCTGTGCTCTAAGGACTCTAGATCTCCGTAAGAATGAGATAGGTGGACAGATTCCAAAATCTCTTGCTAATTGCTCAGCACTAGAAGTGCTAGACCTTGGAAAAAACAATATCATTGATGGATTTCCATGCATGTTAAAGAACATATACACACTTCGTGTCCTGGTCTTACATAAAAACAAATTCTATGGTCCCCTTGGATGTCCAAAGACCAATGGCACTTGGGACATGCTTCAAATAGTTGATATAGCATATAACAACTTCAGTGGTAACCTACCTGGAAAATGTTTCACAAGGTGGGAGGCCATGATGCCTGATGAAAATCAATCTGATTCCAAGGTAAATCATATCCAATTTCAGGTTCTTCAATTTGGTGGTGGAATATATTATCATGATTCAGTAAAAATTACAAGCAAAGGTCGACAGATGGAGCTGGTTAAAATTCTAACTGTCTTCACTTCCATCGACTTCTCATCTAACTACTTCCAAGGAGAAATACCAAAAGAGCTATTTGACTTTAAAGCACTCTATGTGCTTAACTTGTCAAACAATGCTCTTTCTGGTCCAATTCCCTCATCTATAGGAAATCTGAAGCAGCTTGAGTCCTTAGATCTATCAAACAACTCACTGGAAGGAAAAATTCCCACAGAGATTGCAAGTCTATCTTTCCTTTCATTCCTGAACCTCTCTTTTAATCAGCTGTCAGGAGAAATCCCTACAGGTACTCAAATTCAATCATTTGAAGACACTTTCTTCATTGGTAATAAAGGATTATGTGGCCCTCCTTTGACAAAAAACTGCAGCACCAATACTAATCCACTCACAAAAGAATCAATCATGGAATTTGATTGGCAGTATATATCCACAGGAGTGGGTTTTGGGGCTGGAGCTGGACTAGTTTTTGCCCCATTGATGATTTGGGAAAGAGGAAAGAAATGGAGCAATGACATCACAGACAAAATTCTTATGGTGGTTCTTCCCATTTTTGGACTAGTTTATACCCCAATTGGTGATGATGAAGAAGGGGATGATCATGATACAGAAGAGAAGGACTCAAATTTGACAGAGGATAGTGGTTACACTGAAGAGGAAGATGATTGGGGTTATTCAAGGTTCAGAGGGAGGTATTGTGTCTTTTGTTCCAAATTTGACATCAGTAAGAAAAAAGTCATTCATGACCCCAATTGCACATGCAACCACTCATCACCGGCTTCAAATTCTACTCATTTATCAGATTCAGATTCTTCCTAG

Protein:

>Am05G000210.1
MRPIFVPSLLLFVWLSVRVNTKAMRITLVSLLSFIFCYCISLSNIASGQCLGDQKSLLLQLKNNLKFKSEISSKLKLWNQSIACCNWKGVTCDIEGHVIGLDLSGELISGGFDNSSSLFSLQHLQKLNLAANNFNSPIPSRFNKLEKLTYLNLSYANFVGQIPIEISQLTSLVTLDISSLGYLIGQELKLVDPNLQKLVQNLTSIRQLVLDGVIITGLGQEWCNALLPLRDLQKLSMSGCNLSGPLDSSLARLENLSVIILDENSFSSPVPETFANFRNLTTLSLVFCELTGKFPSEIFKIGTLSVIDLSLNYNLHGSFPEFPLSGSLHTLRVSNTTFSGAFPHIIGNMRHLTELDLSNCQFNGTLPSSLSNLTELRYLDLSSNSFTGPMPSFVMVKNLTHADLSHNGLSGAIPSSSHFEGLHNLASIDLSYNSINGSIPSSLFTLPLLQKIQLSFNQFSKLEEFKSVSSAVLNTLDLSSNNLSGPFPTSILKLNSLSILKLSSNRLDGTLQFDKLLKLRNLTTIDLSYNNISVNANVASADQSSFTNISTLNLASCNLKAFPGFLRNKSRLTILDLSHNQIQGTVPNWIWKLKSLQNLNISQNMLTDLEGPLQNLTSNLIALDLHNNQLQGPIPVIPKFAVYLDYSTNNFSVIPQDIGNYLSSAIFLSLSNNNLHGRIPVSLCNASSLKVLDISMNNISGTIPSCVMMTMTETLGVLNLRNNNLTGPIPDMFPASCALRTLDLRKNEIGGQIPKSLANCSALEVLDLGKNNIIDGFPCMLKNIYTLRVLVLHKNKFYGPLGCPKTNGTWDMLQIVDIAYNNFSGNLPGKCFTRWEAMMPDENQSDSKVNHIQFQVLQFGGGIYYHDSVKITSKGRQMELVKILTVFTSIDFSSNYFQGEIPKELFDFKALYVLNLSNNALSGPIPSSIGNLKQLESLDLSNNSLEGKIPTEIASLSFLSFLNLSFNQLSGEIPTGTQIQSFEDTFFIGNKGLCGPPLTKNCSTNTNPLTKESIMEFDWQYISTGVGFGAGAGLVFAPLMIWERGKKWSNDITDKILMVVLPIFGLVYTPIGDDEEGDDHDTEEKDSNLTEDSGYTEEEDDWGYSRFRGRYCVFCSKFDISKKKVIHDPNCTCNHSSPASNSTHLSDSDSS*

Promoter(3k):

>AM05G000210.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF13855.9	LRR_8	123	179	1.30E-60
PF13855.9	LRR_8	327	385	1.30E-60
PF13855.9	LRR_8	398	459	1.30E-60
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PF13855.9	LRR_8	715	773	1.30E-60
PF13855.9	LRR_8	910	969	1.30E-60
PF12799.10	LRR_4	571	610	2.20E-37
PF08263.15	LRRNT_2	52	93	4.00E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016301	kinase activity	Molecular Function
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0051707	response to other organism	Biological Process
GO:0016773	phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor	Molecular Function
GO:0140096	catalytic activity, acting on a protein	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR046956	Receptor-like protein 23-like
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A072UHN3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
RLP6_ARATH	Receptor-like protein 6

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G45616	receptor like protein 6
Medicago sativa L.	MsG0480018768.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g40440.1	expressed protein
Cucumis sativus L.	Csa004821	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur001978s00029866.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr05_08740T	_
Arachis hypogaea L.	AH12G25230.1	Receptor-like protein 12 like

Expression pattern