Gene detail

Detail information of Am04G026880.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am04G026880.1	receptor like protein 34

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am04G026880.1	mRNA	Chr04	170821887	170824793	-

Sequences

CDS:

>Am04G026880.1
ATGGGGTGGTTTTTTCTGTTGCCTCATTTTACCTTCTACTTGTTTTTATTGCTCACTCACTTTCCCTCCTACACTCACACTCACTCACTGTGCAACCATCAGGATAGTTCTTCCTTGCTGAAATTCAAGAACTCATTCACTGTCCACACTTCATATGATTATTATGAGTGTGATAACCCCTCTTTTACTTCCAAGACAGAATCATGGGAAAATGGCACTGATTGTTGCGAGTGGGATGGAGTCACGTGCAACAACTTATCAGGTCACGTGATTGGTCTGGACCTTAGTTGCGGTAAACTTGAAGGTAAATTATATCCCAATAGCACTATCTTCCAGCTCAAACACCTTCAAACACTCAACTTGGCTTTTAATTATTTTTATCGTTCTTCAATACATTCTGGAATTGGTGATCTTGTGAATCTCACACATCTAAATTTATCAAACTCTGAAATTGGTGGTGATATTCCCCCTGTAATCTCTCACTTGTCAAAATTGCATGGAAACGTTCCAAATGACATCCTCTCATTACCTAATCTCCAAGAACTAGATTTGTCGGGTAACGACCTTAGTGTCCAGCTTCCAAAATCCAACTGGAGCACTCCTCTAAGGTACTTGGACCTGTCTAGCACTGCTTCCTCAGGAGAAATTCCAAATTCCATAGGTCATTTGAAGTCTCTTAACCATTTAGATCTTCGTGGATGCTATTTTGTTGGATTAATTCCTCCATCTTTATGGAACCTCACTCAAATGACTTACTTGAGCCTCTCATTCAACAACTTTCAAGGTGAGATCCCATTCTTACTTTCGAATCTCATACATCTCACTTCCTTTAATCTTGGAAATAATAATTTCAGTGGTCCAATCCCTGATGTGTTTGGGAAGCTTATCAAATTAGAAAGTTTAATCCTTCACGATAACAATCTAAGTGGTCAAGTTCCATCATCATTATTTAATCTAACTCAACTTTCTTATATAGATTTATCATCTAATAACCTAGTAGGCCCAATTCCAAATGAAATCACCAACCATTCAAAGTTAGTTTTTCTAGGTCTGAATGGAAACATGTTAAATGGAACAATTCCGCAATGGTGCTATTCCTTGCCATCGTTGACTCGCTTGTACCTCGAAGACAACCGGTTCACAGGATTAATAGGTGAACTCTCAACTTATTCTTTGGAAGAGTTGTATCTCTCTGATAACAAGCTACAAGGTGATTTTCCTATTTCAATATTTAAATTGGAAAATCTTACCTACTTAAGTTTGTCATCAAATAGCTTGAGTGGTCTTGTGGACTTTCACCAATTTTCAAACCTTAAAAAACTACAATTCCTTGATCTTTCCCAAAATAGTTTTCACTCCATTAACAACACCAACAACAGTGCTAGTGCTGACTACATCCTCCCCAACCTTGGATTTGTAGTTTTATCTTCTAATAATATTAGTAGCTTTCCCATATTCTTAAAGGCACTTCCAAATATACAACTATTAGATCTTTCAAATAACAAAATTCAGGGGGAAATTCCCAAGTGGTTTCACAGGGAGTACATTCACACCATTGATCTCAGTTTCAACAAGTTCCAAGGAGACCTTCCAATTCTGCCCAATGGCTTCGTATTTTTAGCCTCAAATAACAAATTCACTGGAAACATTGCTTCAACATTGTGCAATGCAAGGTCCCTACTTATGCTCAATTTGGCACACAACAACTTAACAGGCATGATTCCACAATGCTTAGGATCGCTTCCTTCTCTTCGGGTGTTGGATTTACAAATGAACAACCTTATCGGAAGAATGCCTAGAAACTTTTCCAAGGAAAATGCATTTGAGACTATAAAGTTAAACGGAAACCAATTGGAAGGACCATTACCACAGTCGTTGGCTCATTGCACAAACCTTGAAGTTCTTGACCTTGGAGACAACAATATAATGGATGCATTTCCCAATTGGCTAGAAACTCTACAAGAGTTGCAAGTAGTCATTTTGCGATCAAACAAACTCCATGGTGCAATCACTTGCTCTAGCATGAAGCATCTTTTTCCCAAACTGAGAATTTTTGATCTCTCCAATAACAATTTTAGTGGTCCCTTGCCAACATCGTGCATCAAGAACTTCCAAGGAATGGTGAAAGTGAATGACAGCCAAACTGATGGTCCGCAATACATGATGGGCGCGGCCAATGGGTACTACTATAATGATTCTGTGGTGGTCATAATAAAAGGTATATCCGAGGAACTAACCAGGATATTGACTACTTTCACAACTATTGACTTATCAAATAACATGTTTGAAGGAGAAATTCCTGAACTCATTGGAGAATTACATTCTCTTAAAGGTCTCAACCTTTCACACAATGGAATCACAGGTACCATTCCACATTCTTTGAGTAATTTGACAAATTTGGAATGGTTGGACCTCTCAAGGAACAAACTGATGGGTGAGATTCCTATGGCTCTAACAAATTTGACTTCTCTCTCTATATTGAACCTTTCACAAAATCAATTGGAGGGAATGATACCTACAGGAAAACAGTTTAATACATTTGGAAATGATTCCTATGAAGGAAATCCCTTGTTATGTGGACTCCCTTTGTCAAAATCATGCAAAAATGATGAAGAGCGACCACCTTATTCAACATTTGATGATGAAGAGGATTCAGGAGATTCAGGATTTGGCTGGAAAGCAGTGGTTATAGGATATGCATGTGGAGCAGTGTTTGGGGTGCTCATGGGATATAATGTTCTCTTGACAGGGAGACCCCAATGGCTTGCGAGACTTGTTGAAAGTGCGTTTAACACAACACTGAGAAGGGCAAAGAAGAAGAGAGTCAATGGAAATCGTAGAGGAATCAATTAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM04G026880.1
TCCACTAATACACAATTATTTGTTAGTGTGAACAGAATCTTAAAGCATAATGTCCCGTGGATGCTAATGAATGAATGTTGTCAATTGTCATATCATTAACTAAGCTACAAGTGCAACCCAATAATTCTTCTCAATGGAGTGTTACATACGGTTGAAGAATCCTCTCCCACTACAATTCAAGAGTATCCAATCCAAGTATTACATGTGTATTTTGTATGCTTGCTTTCAGACTAGCTTGTTTTCAATACAATGTTTGATGAAAATTTTGATATAATCTTTCAAATAAAAATGCAAATTAATTTCCAAAATATGGGATGTAATAAACAATTGATAAGCCTAATTTCTAAATTATAAAGGAATAGGGTTAAGTTTTTTGGATACTAGAATTAGATTTTAATGTAGTACGATAATAATACAAGTTGCAGAAAAACAATTAAATAAAAAAAAAAATCAATAATACCCCGTTTTCTCATAATTTCTATATATTAGAGAATCCAAGTGCGGGATATAATATCACTTTGTCAAATAATGAATAAAATAAAGAGTATATAAGATATTATAATCATTAATTCCTATCAATTATTTTAGAAACAAATGTAGTTCAAGTCTTTTATTATACATCTCACAATAATACGAAATAAAAAAATGGTATCTTTTAACCAATTTTTTAATTAAGTTTATAACCTTGTTTGTTTTACCCCAAGTAGCAACCACCACACAGTTTATTCCCATTACTAGAGTGTTACATACGGTTGAAGAAAGTCTCTCCCCAATCTCACAATTCAAAAGCATATTATCCAAGTATTACATGATTTGACTCTTTTACTCTGTCTTATGTTTTTTTTTGTTTTACTTTGTGTCAAATTATGTGTTTTTTTATCCCCTTCTTCTTTTCAGGATTACAAGTTATGATAATAATTGAAACTTTGAAAAGTAAGTCAATGAAATTGTAGCATGTTACCAAATAACAATAACTAAACACCATTCAGCTTCACGTAAAACGTCATCCACTATAGAGATGAAAAATGGGAATCCTCTGGTCAAGGTAGGTACTATAATATTTGTCCCTATATCCATATTTGTAAAAAGTGTCGTACACGCAAACAATGCTTTTAGTGTCCGTCTCCATACTCTATGGATACTTAAGTGTCCATACCTCCATTTTAACTAAAAAACAATAAATAACACAAAGACATTATAATTCAATTAAAGAATAATCATTTTTTAAATCTACTTATTAAATATTACAAATTATAATGTTTAGCGAAATAAAATATCTTAAATATTAGTAGTTAGATATAATGCTTAACAAACGAATATTTTATTTTTTTAAAAAAATTGGTATAGATAAAATAGTAATATTTGTAATACACACACACACACACAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATGTATACACACTCACACACATGCACGTACATATATAAGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTTCCCGTACCCATTTTGTGCGAGTAATTATCTTTACATCATGGGTAATTTTTGCAAATGCCTAATAGGTATAAGTCAAATTCTCATCCATAACCCGACATGTTCTACCCTTTCAAACGTGAATTAGTTGGTTTATGTCTAAAATTGAGAATATGTTTAGCTAAAGTGAGAAAGTCATCAATTGTGTATCTAAAATTATAAGTTAATTCTCACCCTATTTTAATATAGGCTATTTTATTTGATCAACAAAAATATAAGAGGTCATCATTGACAACGACACTCACCTTCTTGGAATGGTTTAAGAGGTCATCCAATCACGTGCTAGAGTTAAATGAAAAAAATACATTGAATTCATATACCAAAAAACAAAAAGGGAATTGTTTTAAGAGTCTCTATAAGCTAAAAAATGTTTTTCCATCCTGGAAATATAGAGGTTTCTGTTTTTCGTCTCTGTATAAATAGTTTTTTTTTGTTCCTACAGTATAGAATTTTTTGGTTTAGTTCTTTTTGTTTTGTTTTAACCCTTATAATGTTGTTTATATCTGGTTCTAGTCCCTGAAGTTAAAGATAATTTTGATTTTAGTCCCTGAGTCATGGACTAAATGAGGGTTAATTCAAAAAAAATGATATTTATTATAGGAGCAAAAAAAAGATTTTTCTAGGGAAAAAAACAAAATTTAGAAAACTACAGGGACAAAAATTAACAAAAAATATTCCAAAATTAAAAGAAAAAACCTTTATATTTATCGAGAGGAAAAACATAATTAAGTTTTAAAATATGATAAGTAAGTGAGTGTAGATTCCATTTTTATTAAATATTTATTGGATTAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGGAAAAATGGTTAAAATGTCTATATAGAATTTGACACTTACTCTCTCGTGGAGGGTAACTCATATAAATTAGGAGTAAGTGAAGCAAAGTACAAAAATTAGTTTAATTTTTCAGGGTTTTTTTTTGACAACAATTTTTCAGTAATTTAATACATATGTTGTCCTGAAACACTCAAGTTTCAATTAAGAAACTCAATCTCAGTATAAAATCAATATAAGGTGATATATGTTAATACTGAAATTATACGACTAATTTAATACTTCACATGTATTATGAAATTATCTTTTAATTTATACAATATCGAGATTGATTTTGAAATTGTTATTAGTAACTGTAAAAAAATCATGTTTGAAGGATATTGAAGTACATGACAAAATGATCTGTGTACTGTAGTGTAGAGCAATGTATTCTTAGACAGACTTATGGGGCATCATCATGGATGCTTACTTGCATAAAAAATTCCAAAGCCTTTGAGGTTAGCTTACTTATAAATAGAGGCTAATCAATTGAATTGTTACATCAAACATCCTCAAGAGAAAAGTTTGAGCTCCTAAACCAAACAATTTCCATATAACTATTTCTAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF13855.9	LRR_8	273	332	4.30E-63
PF13855.9	LRR_8	391	450	4.30E-63
PF13855.9	LRR_8	543	594	4.30E-63
PF13855.9	LRR_8	753	810	4.30E-63
PF12799.10	LRR_4	391	429	5.00E-52
PF08263.15	LRRNT_2	33	84	5.50E-11

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005886	plasma membrane	Cellular Component
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0016301	kinase activity	Molecular Function
GO:0051707	response to other organism	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR046956	Receptor-like protein 23-like
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A396HVM8	_

SwissProt

SwissProt term	Description
RLP34_ARATH	Receptor-like protein 34

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G11010	receptor like protein 34
Medicago sativa L.	MsG0580029466.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os12g12120.1	verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa004821	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur003194s00044694.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_10630T	_
Arachis hypogaea L.	AH17G04960.1	Receptor-like protein 12 like

Expression pattern