Gene detail

Detail information of Am04G026450.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am04G026450.1	Leucine-rich repeat protein kinase family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am04G026450.1	mRNA	Chr04	169318309	169323295	+

Sequences

CDS:

>Am04G026450.1
ATGCAGGCTATTTGGTTAATGCTGTTATTGTTGGTGGAAATTGCAATGGGGAATTCAGATATTGATGCACTACTTGAACTTAAGAAGGGTATTCAGAATGACCCTTCTGGATTAATTCTTAAATCTTGGGATTCCAAGTCTTTAGATTCAGATGGATGTCCTCAGAATTGGTATGGAGTTTTGTGTAGTGAAGGAAATGTTATTTCAATCACTTTGGATAATGCTGGTTTAGTTGGAGAGTTTAATTTCCTTGCTATTAATGATCTTACAATGCTTCGCAACTTGTCAATTGTCAACAACCAATTCACAGGAAATATCATAGATATCGGTCGAATGAAATCGCTTAAATTTCTTGATTTGTCACTCAACAAGTTTAACGGTTCGTTGATCTCTAGCATGGTTGAATTGCGTGATTTAGTGTATCTCAATCTTTCTTCAAATGAATTTAGTGGCACAGTTCCTATTGGGTTTCATAAACTTGAGAAGTTGAAGTATTTGGATTTGCATAGTAATAGCTTTTCTGGGGATATTATGGATATATTTTCTCAGATGGGAAGTGTGCTTCATGTTGATTTAAGCAGTAACATGTTTTCTGGTACATTGGATTTAGGACTTGGAAATGATTCTTTTCTTTCCTCAATTCAGCATTTAAATGTTAGTCACAATTCATTGATTGGTGAGTTGTTTGCTCATGATGGTATACCTTACCTTGACAATTTAGAAGTCTTTGATGCTAGTAATAATCAACTAGTTGGGAATATACCTTCCTTAGCGTTTGTCGTATCGCTAAGGATTCTTCGACTTGCATGCAACCAGTTGGAAGGTTCACTGCCAGAAACTCTGTTGAAGGAAAGTTCAATGATGTTGTCTGAACTTGATCTTAGTCAAAACAAACTTGAAGGTTCCATTGGAAGCATTACCTCAATGACTTTCAGGAAGCTTAATGTATCTTCAAACAAATTATCAGGACCATTACCTCTCAAAGTAGGCCACTGTGCCATCATAGATTTGAGTAATAACAAGCTATCAGGTAATGTGTCAAGGATCCAATATTGGGGTAACTATGTGGAAGTTATTCAGCTAAGTACAAACTCATTAACAGGAATGCTACCAAATGAAACTTCTCGATTTCTAAGGTTAACAGCACTTAAGATATCGAATAATGCGTTGGACGGTTTTCTCCCACTAGTTTTGGGAACATATCCAAAACTTAAAGAGGTTGATCTTAGCCTCAACCAGCTTTCTGGAAACCTCTTAGATAGTTTTTTCACCTCAACCAAATTGACTATTCTTAACCTCTCAAACAATAAGTTTTCTGGCCCAATTTTTATTCATTTTCAACCTCTTGCTGCTGAAAATTCTAGTCTTCTGTTTCTTGATCTTTCACACAACAACTTGAGTGGGATTATTCCTTCAAAAATGAGTAAACTCCACAATTTGGCATATCTCAATGTATGTAACAACAAATTGGAAGGTACTATTCCTAATGATTTACCAGATGAGTTGAGAGGATTCAATGTGTCCTTTAATAATCTTTCTGGTGTCGTTCCGGATAACTTATCGAAGTTTCCTGAATCAGCATTTTATCCAGGAAACACTATGCTGGTATTTCCACATTTGCAATTGTCACCGAAAGATAATTCCAACTTCGGTTCGAGGGAACATCGGTCACATAAAAAATCTTTAACTAGGACTTTCTTGATTGCAAGTTTAATTGCTGCTGCTTTTGTGATGGCTATTGTGAGTATAATGGTTTATTATAGGATTCATCAGAACAATAAAAGGACTTCTAAATCAAATGCAGCAAGTCCTTCCACATCAAAGAAAGAAGTTTCTGAAAGAAATTTGGAATCACTACCACCTTCTCAAAGAGCTTCTGCTGATGATACCGGAAACATTGATCCGATAGTAAAGAAGCCGGAGGAAGGAACGTCTTCTCCAATGTCTATCGTGTCAGCTTCGAATCCTTCATCTTCGACAAGTCATCAGTTTGAGAATCCCGGTTCGCTCAAAGTATCATCTCCAGATAAACTGGTTGGGGATTTGCAATTATTTGATGGATCTTTGGTGATAACAGCGGAAGAACTTTCGTGCACTCCGGCCGAACTTGTTGGAAGGAGTTGTCATGGAACACTTTATAAAGCTACTCTTGAATCTGGTCATGCATTGGCTGTTAAATGGTTAAGAGAAGGAATAACTAAAGGTAAAAAGGAGTTGGCAAGGGAATTAAAGAAACTTGGGACTATTAAGCATCCAAGTTTGGTTTCTATTCAAGGTTACTATATAGGGCCAAAGGAGCATGAGAGATTGATTATTTCAAATTACATGAATGCACTATCTCTGGACATTTATCTCAATGAGGCAGATAAAAGAAATCTCCATCTATTGCCTCTTGATGAAAGGCTTCGAGTGGCTGTAGAGGTGGCGCGATGTCTTCTTTACCTACACACCGAAAAAGCCATACCTCATGGAAATCTCAAATCCACAAACATTCTAATAGAAGATCCCAACAGAAATGTCCTACTCACTGACTACAGCCTACACAGAATACTTACTGCTGCTGGTACTGCCGAGCAAGTTTTAAACGCTGGTGCACTCGGTTATCGACCTCCTGAGTTTGCTCGATCAACCAAACCATGCCCTTCTATGAAGAGTGATGTCTATGCATTTGGCATTATCTTGTTAGAACTCCTAACAGGAAGAAGTTCTGGAGAAATAGTTTCTGGAATTCCTGGGGTAGTTGAACTTGCTGATTGGGTTATGTTCTTAGCTGAACGAGATCGCTCTAGCCAATGCTTCGACAAGTCCCTCGTGGACAACAACAACAATGGTAAACAAACATCTAAGATTCTTGATGATATGTTAAAGGTGGCTCTTAGATGTATCCTTCCAGCATCTGAAAGGCCTGATATGAAAACAGTGTTTGATGATCTTTCAACAATAAGGGAGATTGCTGATCATAGCCTTAACCACTAA

Protein:

>Am04G026450.1
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Promoter(3k):

>AM04G026450.1
GAAGTTAACTTCTGGCCAATACAAACATAATAACTTCTCTGATAACTTTCTAGGAACAAACACACAATACTTATATCCTATTACACACCAAATAACTAACACATAATAACTCCCACACAATAACTACCTAGTAACATAAATATTTTACAAATAACTACTTTTCATTTATTCTTCTTAGCCCTTCTCTCATATACCCTCCAACTGACTGGTTTACCCCTCTGGCTATCTACATTCCACACACCTTACGGACCTTGCCACCTCAGCAAGGCGCACACACCCACTACTAGCTAATCATTAGTTAGTTATTGGGGCTTTGATCTCCTATCACATTACTCACCTTAGTTCCCCTGCAGTCCCTTCTTTTTCTCTCATACAATGTTTTTTTATACTTATCGGTAAATAGCCCAGTTAGTTGATGATCATGTTGCATGCAGTAATGACTTTACTAGACAATGAAGTCGCTAGTTTAGTGAACATGGCTGGATATTACGGCTCTAAGAATTTTCTGTATATAACTATATATGGTAATTTTAGTCTCTAAAGAGTACCTTTAACAGAGTGTTTTATTTTTGTTTACGCTGCTTATTATTGAGCATATTAGAGACGTTTACTATATAGTTGACATCCCGGATGTCTAAAAGTATTTTAATTTTTCCAATTTTCTATAAATGTCAGCAAAAGTAATAATGTTAAAAATAGAGAGAAAAAACCGATTAATAAAAAATATGACACTTAACACATGACGAAGTAAGTCTACAACTATTGAGAGAGATATTGAGATGACTATAGTGAACCGGTAGAGAGAGGATAAATTTGACATCAAATTGACTCATTTCATTAAACTTCCAAGAATTTTTTAATAAATTTCTTTTTTGTTTCATATACTAAATTGATAGACCGACATGTGGACATTTGATTGCGGTTTTTTCCCCAAAAAGAATATATGACATTTACCTGATTCTTATTTTAAAAGTTAATACTACTAATTTTAAAAAATTTCAAGTATTAAAAGTGGCATTCGGATTTATGTTTTTTAAACGAATTGTAAATAATTGCGAAACTAAATATGTATAATTAATTCAAAATTATTTTATGGTTGAAAGATTCAATTAATATTGAACTTCTGAAATAAGTTTGTAACTTGAAAACATATGTTGTTCAAAACTTTGCATCAAAAAAATATGTTGCTTAAAACTTACAATTTGCACTACTCTCAATCTTTTTGGATCAATAACATGAAAGGAAAAAAACCATTGAAAAAAACAAATCTTAAAGACATAAACCTTGTGTAATCTCCAAGTGGGTCCCTCCCACTTTTGACACCAAACTCCCCCTCCCCCCCCACTCCCTCCCTCTTTTTTTTAATCCCTCCTCTCCCTTTTTAATTCTTTATCCCTTATTTTTTTTCATATTTTTATTTAAGGTGTGATGTTAGGCAGCGTGTTTTGAAATATTTTAGAGTCTGGAAAAAAAATTTATTGTTCGCATATCCAAAATGTGTTTTTCAATAACCAGTTTGTTGAAATAAAATAGTAATTTCGCAATAAAGTACGTAAAGAGAAATGCTTAACTGTTCAAATACGCGAGTTTTGTTTCTCAGTAACCGGTTCGATGAATAAAAATAATTTAATAACAAAATATGTAAAGTACGATTTTAAGTTGTGGTTTCAGATGCTTTTGTGTTTGTAAAAAAAAAAATCAACTATTCAAATATGCGAAATTTGTGCCTCATTAACCAGCGTGTTTAGGAGTCATTTAGTGCTCGAAAAAAAACTTAACCATCAAAATACTCAAAGTTCATTCCTCAATAATCGATTTGGTAAAAAAAAGTGACAAATATATAAAGAGTTATTTTAAGCATTGTGTTTCAGAATACTTTAGCATTCAAAGGACCAACAAATAAGACTTTTTTGTATTGCGATTTTAAAAATAAATTTTAGCAAGACATGAATTTTGCATTAACGGAAATTGTTGCCCCTTTCAAACAAACGCACTACTGGACACACTAGTAACACTAATACTTCAAATTCAATGTCTTTTTTAAAGATGTTACGGTAAGAAAATGCCAGCACGCGCTTTTGCATTGGGATGGATAAAAGAAAAAAAAGGAAGGTATGGTTAAAAAGTTTCCAAAGTCAAAGGTTATTCAACTCACCAAGGTTAATAGTAATAATAAATAAATCTTGTATAGTTTGCCTTTGTATCCGGGAACAATTAGTGACTCTGTCTCAGAAAAAATAAGTGTTTTTTTTTTTCTTTTAATTCTTGCAGCTAATCACATTCATATGATAAAACAAAACAAATAGCACCCCACCTACCATGTTTCTCACTTATGGGTCTTCTTCTCACTCTTCTTCTATTACTATCTGTACTGTACTCCACTATACTCCCTTTGTAGCTTCTTTCAACACTTTCCCTAAATAAATAATTTCTCTTCCATACTCATTTGCTTCTTTTTACTTCAGATTTATAACCTCTCTTCTCCCCCGAACCATTCTTTTTGTTTTTCATTAATGGGGTTCGGTTTTTTCTCTGAGTTTCTTCTACTTCTCCTGCCTTGCATTCTTGTCTAGTATATTCTTCACTGTTCAACTCTAATGCTTGTGAATTAAGAGGTAAGAATTTGTCATTTTTTTTTTCTTTTCATTGTTCTGTTGTTTTGTTATGATTTTTTGCCATTTTGTAGCAAGCCTTTAAAAGGGTAGGTTAGGTTTCTTGTTTAATGAGTATAACAGTTGTTGGTAGAGATGGACATGGTAAGATTATTGTTAGCTAAACTAGTAAACAATTGAGTTCCCCCCATTTTTTTTACTTGAGATTTGTAACATGTCATAAGCCATTTTCATAAGCTCTCTCAAAGAGTTTCATTAGTACTTATGTCAGTAGATAAGCCGATCCAATCATGTTAGTGCATTATATTATAGAATATAGTATTTTCTCTCATATAGTAATAAATTTTGTGTGTTTTTGATGCTTAGATTAGGAGCTACTAGGAAAGGC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	703	973	1.40E-26
PF00069.28	Pkinase	702	902	2.00E-23
PF13855.9	LRR_8	139	196	7.10E-16
PF08263.15	LRRNT_2	18	63	5.30E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.9.3:RLK-Pelle_LRR-III

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004672	protein kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0006952	defense response	Biological Process
GO:0051707	response to other organism	Biological Process
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR001245	Serine-threonine/tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A8B8JQD5	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y5020_ARATH	Probable inactive receptor kinase At5g10020

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G27060	Leucine-rich repeat protein kinase family protein
Medicago sativa L.	MsG0280007708.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os03g20450.1	expressed protein
Cucumis sativus L.	Csa012888	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000135s00007281.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_14560T	_
Arachis hypogaea L.	AH07G05670.4	Probable inactive receptor kinase At5g10020 like

Expression pattern