Gene detail

Detail information of Am04G022340.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am04G022340.1	ABC transporter of the mitochondrion 3

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am04G022340.1	mRNA	Chr04	146619210	146636326	-

Sequences

CDS:

>Am04G022340.1
ATGCTTGCTGCTGCTGCTTCTGCTTCGAGACAACTTCTTCAACGCGATGCCAGACCCAGCATTGGCGGCGCCGGCAATCCTGTACGGTCGCTTTTAACTGCTTCCGGCATCGCCATCAGCTACTCAATTCGCAATATAAGAGGTTACGGTTACAATTACAGTTACGGTTATGGAATCAGTTACAATAACTGCCAACGTAGATCATGTCCAAGTTTGATTTTCTCTATAAAAGGATTTCTCTCTGATTCATCATCATCATCATCATCATCGTCTTCTTCATTACATGGAGGAGTTACCAGACCTTACTTACCAATACCTAGTTCAACGGTAGATGGGAGAGTGTTATTCTCAACTTCAACTAAATCTGGTGATGGAAGCCAGAACCAAAAAACTGCTTCTACTGTTCCTAAATTACCTTTAAGTGGACAAGTGGCTGATGTGAAGATTCTTCGAACACTTGCTAGTTACCTATGGATGAAAGATAATCCTGAATTTCGGTTTCGTGTTGTTGCTGCATTGGTTTTACTTGTTGGAGCTAAGGTTCTGAATGTTCAGGTCCCTTTCTTATTCAAACTTGCAGTTGACTGGTTGAATACTGCCACAGGCAATGCTGGTGCTCTTGCTTCAAATCCGACTGCGGTGGCGCTTTTTGCAACACCAGTGGCAGTGTTGATTGGATATGGGATTGCACGTTCAGGAGCTTCTGCTTTCAACGAATTGCGGACTGCTTTGTTTTCTAAGGTAGCACTGCGAACAATTCGGTTAGTATCAAGGAAGGTCTTCTCACATTTGCATGACCTTGACCTTCGATATCATCTAAGTCGTGAAACCGGTGCATTAAGTCGAATTATTGATCGTGGTAGCCGTGCAATAAATTTCATTCTCTCCTCTATGGTTTTCAATGTAGTACCAACCATATTAGAGATATCTATGGTATCAGGTATACTGGCCTACAAATTTGGAGCACCTTTTGCGTGGATTACTTCCCTATCAGTTGCTGCTTATATTGTTTTTACACTGACTATCACACAGTGGAGGACTAAATTCAGGAAAGCCATGAATAAAGCTGATAATGACGCTAGTACACGGGTTATTGATTCACTTATTAATTATGAGACTGTCAAATATTTCAATAATGAAGTTTACGAAGCTGATCATTATGACAAGTACCTAAAGAGGTATGAGGATGCTGCTCTGAAAACCCAACACAGTCTTGCTTTTTTGAACTTTGGTCAAAATATTATATTTAGTACTGCGCTTTCAACAGCGATGGTTCTGTGTTCTCATGGGATCATGAATGGCACAATGACTGTTGGTGATTTGGTGATGGTGAATGGGCTTCTCTTCCAACTATCTCTTCCACTCAATTTCCTTGGAAGTGTTTATCGTGAAACTATACAAAGTCTAATTGACATGAAATCCATGTTTCAGTTACTTGAGGAAAGAGCAGACATTAAGGATAAAGAAAATGCAAACCCTCTAAGTTTTAATGGGGGGAGCATCCAATTTGAAGATGTACATTTTAGTTACCTCAAAGAAAGAAAGATACTGGATGGAGTATCACTTGTTGTGCCAGCTGGTAAAAGTGTTGCAATTGTTGGGACTAGTGGAAGTGGAAAATCAACCATTCTTAGATTGCTGTTCAGATTTTTTGATCCTTATTCTGGAAGTATAAAGATAGATGGCCAAGATATTCGGGAGGTAACCCTTGAGAGTTTGCGGAAGTCTATTGGTGTTGTTCCACAGGATACTGTACTTTTCAATGATACAATATTTCATAACATTCACTATGGCCGGCTCTCGGCAACAGAAGAGGAGGTCTATGAAGCTGGTAGGCAAGCAGCAATTCATGACACTATCGTGAAATTTCCTGAGAAATACTCCACTGTTGTGGGAGAGCGAGGGCTCAAGCTAAGTGGTGGTGAGAAGCAGCGTGTTGCCCTAGCTCGTGCATTCTTAAAAGCACCTGCGATACTGTTGTGTGATGAAGCTACAAGTGCTCTTGACAGCACGACAGAAGCAGAGATTTTAAGTGCATTGAAGTCACTAGCAAATAACCGAACTTCAATATTCATTGCTCACAGGCTTACAACTGCAATGCAGTGTGATGAGATCGTTGTTTTGGAAAATGGAAAGGTAGTTGAGCAAGGACCACATGAAGTTCTCTTAGCAAACGCAGGAAGATATGCACAGCTCTGGGGACAGCAAAATAACACAGTGGACGCTACTGATACTGCAATCAAATTGGGAGCATAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM04G022340.1
TAACAAAGCTTATAATCTATTTCTACTCTCTACTGTACCAAAATAAAATTCAACATATACTCTTTAAGAATCATAATTTCTACTTACATTTTATTTGGTGAATATAATAATTTCTACTTAAATAAATAAATTTGCCGAGATGTTAAAAAATCAAATATTCTATCCTTCACTTTCAATTTTCAATTGAGAAAACGTAATATATAGGCTTTTACAAATTACCACCAATCACAATTTATAGAGTGGTTGGTTACCAATTGATTAATTAGTGGTTATCAATTGACCAAGTTCTTTTTAATGATGTGTCAACCTATACTTAGTAAATAGTGTAAAATATGTATACACCTATTGTATATAAGAATTAAATCCAAACGGATATTCATGAATCCAAAAAATCAAAACAAAAATTTCATGATAAAATTTGGGGCAAAGCTGTATTAATTATATATTTGGTCGAACATTCAAAAAGTGTAAAAACCTAAAAAATGGGGTAAAAAACGACTGTAGCACCAAAAAAAAATTTATTTACCAAAATAACACCCTTTTTAGATTATTTACCAAATTAGCACACATCCAAAATTCAGGCCAGAAGTCACCCCCACAGGAAACGACTTCTGAACTGGATTTTGCAAATTTTTTTGCTTTTTCAGTTCAGAAGTCGCCCCCACAGGAAACGACTTCTGAACTGGGTTTTGCAAATTTTTTTGCTTTCATCGGGTGATTTCTGAACCGTGTTTTTTTATTTTCTTTTTCTTATATATTAATTTAAATAAATTTAATTTAATTAATTTAGAAAATTAACATTGTTAATTCTTAATTAATTATAAATATTATTGTGAAAAAAAATTATCGGCTATATTGAAATATGGAACTAACTGTATTTATTTAATTAGTAGCACATTACAAAAAACTGATAGAAATTAACTATTCTTTAAAGGTTACGCCTTTTGCCAACTGGATAATAAATTCGTGATTTCCCTACAAGTTGTGGTCCTTCCTCTTCCAAACGCACTGTTGTTGCAGAAGCAGAATGAAGCATTTCAACAAATGTCAACAACAGCAATAATAAGAAATCACAACTTTGTACCAGAGATTTCCCTCTTTGTGGTTCACTCAACAATAATGTCGTTGCAGCTTCAGTCAACAAAGACTTGCGTCAACATGGAGGGTGAGGAGCAAGAAGTCATTCGTATTGTTTATCACTACCCATCTAAGTAGTTTGTATTATGTTTTCGTCTCGTTTCGTTTTGTATTTTCTAATGGTGTATTTCTGGGAACTGTGTTGTTTATTTAAGTATTTCTTCTATAGCGTAAATTAATTACCAAAATAACACTGTTTTTAGATTAATTTAAATAAGTTTAATTTAAATTATTTATTTAAATTAATGAATAATTTAAATAAGTTTAATTTAATTAATTTATTTAATTTAGAAAATTAATATTTATAATTTTAAATTAATTATAAATATTATGGTGAAAAAAAATTCTAAATTAATTTTAAAAGTGTCGGCAAGATCTCGTGCGTCCAAAAGTGTCGGCAACATCAATACCATTGAAAAAACACCAAAACTGGGGAAACATGAGCCGTTTATTAGTGTTGGCAAGATCTTGACCGTTTATTAGTGTCGGCAAGATCGTGACCGTTTATTAGTGTCGGGAAGATCCTGACCGTTTATTAGTGTCGGGAAGATCCTGACCATTTATTAGTGTCGACAAGATCTTGACCGTTTATTAGTGTCGGCAAGAACTTTGTTTTTTACTATGTTTTAACCACTTTTTATTGCGAGTGATGCGGTATTTGTAGAAATGAGGGTCACAACCAAAATAACTGTCCAAACCGCAATCTAGACTAGTAAATTTCTATCAATTTTTTGTAATGTGCTACTAATTAAATAAATACAGTTAGTTCCACATTTCAATATAGCCGATAATTTTTTTTCGGCTAAAGTGCTTCCGGGGTCCCTTATCTTTATTTAAAGTAACGATTTGGTCCTTTATCTTTTTTTTGTCCCAAATCAGTCCTTTATGTTTTAAATTTTTGACACATAAATCCTTTTCTGTCCCAAATCAGTCCTTTATGTTTCAAATTTTTAACACATAAATCCTTTTTTTGGACACATAAATCAGCACTGTTAACGGAAAAGGATTTATGTGTCAAAAATTTGAAAGATAAAGGACTTATTTGGGACAAAAAAAACATAAAGGACTAATTCGTTACTTTAAATAAAGATAAGGGACCCCGGGAGCACTTTAGCCTTTTTTTTCACAATAATATTTATAATTAATTTAGAATTAACAATATTAATTTTCTAAATTAATTAAATTAAATTTATTAAAATTAATATTGAAGAAAAAGAAAAATAAAAAAACACAGTTCAGAAGTCACCCTGGGGAGGCGACTTCTGAACTGAAAAAGCAAAAAAATTTGCAAAATCCAGTTCAGAAGTCGTTTGTGGGGGCGACTTCTGGCCTGAATTTTGGATGTGTGCTAGTTTGGTAAATAATCTAAAATGGGTGCTATTTTAGTAAATAAATTTTTTTGCTACAGTCATTTTTTTTCCAAAAAATGGTGATTTGAATACACTCATTTGATTTACGAGTTGCGGTTAACAATTCCGCAAATGAAAAAGTCTTGTGAGGTTTTATAAAGGTTCATTGTTTTGTATTCCAAAGGATGTTGGACTTGTTGCGTACAAAAAAATACGCACATGTAAAAGTCCGCAGAAAAAAATGAATGAACTTGACTCGCAGAATGGGAAAGGGGGGAATAGCATTAAGCCATTAACATTAACAATAGCATAACCGCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTCCTTTGCTTCTTCTTTCATGCTACACTTCCAATTTCTCCTTTGACTACTCTTCTTATTCACAACACCGTTGACTATTATGCTCATCGATAAACAATTCGATTAGGGTTTGTTTTCCATTTCACCAGAGAAAAGTTCTTCGCTCACAGAAGAGAAAAAAGCTGCAGCACTCTGAAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00664.26	ABC_membrane	170	454	1.80E-37
PF00005.30	ABC_tran	517	666	5.50E-35
PF02463.22	SMC_N	529	708	4.50E-08

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	ABC

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0006879	intracellular iron ion homeostasis	Biological Process
GO:0005743	mitochondrial inner membrane	Cellular Component
GO:0016887	ATP hydrolysis activity	Molecular Function
GO:0055085	transmembrane transport	Biological Process
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR039421	Type 1 protein exporter
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR017871	ABC transporter-like, conserved site
IPR003439	ABC transporter-like, ATP-binding domain
IPR036640	ABC transporter type 1, transmembrane domain superfamily
IPR011527	ABC transporter type 1, transmembrane domain
IPR003593	AAA+ ATPase domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XKK9	_

SwissProt

SwissProt term	Description
AB25B_ARATH	ABC transporter B family member 25, mitochondrial

KEGG

KO	Description	Enzyme
K05662	ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 7

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G58270	ABC transporter of the mitochondrion 3
Medicago sativa L.	MsG0580025502.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os06g03770.1	ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa007695	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000153s00013703.2	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_31630T	_
Arachis hypogaea L.	AH07G11900.1	ABC transporter B family member 25, mitochondrial like

Expression pattern