Gene detail

Detail information of Am04G010930.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am04G010930.1	Basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am04G010930.1	mRNA	Chr04	32193972	32196786	+

Sequences

CDS:

>Am04G010930.1
ATGAATCTGTGGAGCGACGACAACTCATCAGTGATGGAGGCCTTTATGACCTCCTCCGATTTATCCTCTATGTGGCCACCAGCGACGGCGCCGCCACCACCACCACAACAATCAAGCCACGTGTTCAACCAAGACACACTTCAACAAAGACTTCAGGCTCTAATCGAAGGTTCCACAGAGAGTTGGACCTATGCTATCTTCTGGCAACCATCTTACGATTACTCCGGCGCCTCTCTCCTCGGTTGGGGTGACGGTTACTATAAAGGCGAAGAAGACAAAACAAAAGCCAAATCTAAATCTAAAGCAACTTCTCCCGCTGAACAAGAACACCGAAGAAAAGTTCTCCGTGAACTCAATTCCCTCATCTCCGGTAACCCTGCACCAGACGACGCCGTCGATGAAGAAGTCACTGATACTGAGTGGTTCTTTTTGGTTTCCATGACTCAGTCTTTTGTCAACGGTGTTGGACTTCCTGGACAAGCGTACTTTAATTCAACTCCGGTTTGGGTTATCGGCGGCGATAATCTCTCAATTTCGTCGTGTGAGAGAGCAAGACAGGGTCAAGTCTTTGGTCTTCAAACCCTAGCTTGTATACCTTCGGCTAACGGTGTTTTGGAGTTAGGATCCACTGAATTGATATATCAGAATACAGATCTAATGAATAAGGTGAGGATGTTATTCAATTTCAATAATAACTTTGATTTGGGATCTTCTTGGCAATTAGGTTCTAATATTGCTCATCAAGGAGAAAATGACCCTTCTTCTATGTGGCTTAACGATCCCGAAACAAGAGATTCAGTTGATAATAATAATACTGTTGCAGCCACCACCACCACCGCGGCCGCCGCCGCCACCACCACTTCGGTTTCTATTCTTAGCAACCAGAACAATAATAGTAATATTACGAAGACGATTCAGTTTGAAACTCCGGGTTCAAGTACGTTAACGGAGGTTCCCAGTGTGGTTCACGTTTCCAGCAAGCAGAACCAAAGCTTCTTCTCGAAAGAGATGAACCAGCAGCATTCTTTGAAGCCAGAATCGGGAGAGATTCTGAATTTCGGAGATAGCAAGAAGAGTTCTTATTTGGGTAATAATGGGAATTCCAATTTCTTCTCCGGTCAATCACAGTTGGTTATATCCACTGAGGAGAACCACAACAATAACAACAACGGGAACGGAAAGAGGAGGTCTCCGAATTCGAGAGGAAGTAACAACGAGGATGGGATGCTTTCATTTACTTCCGGCGTGATTGTTCCTGGGTCGACTTTGAAATTCTCCGGTGGAGCTGGTGGTGGGGATTCGGATCATTCGGATCTGGAAGCTTCGGTGGTGAAGGAAGCGGATAGCAGCAGAGTGGTGGAGCCGGAAAAGAGGCCGAGGAAGAGGGGGAGGAAGCCCGCGAATGGGAGAGAGGAACCTTTGAACCATGTTGAAGCTGAGAGGCAGAGAAGAGAGAAGTTAAATCAAAGGTTCTACGCTCTTCGTGCAGTTGTTCCTAATGTTTCAAAGATGGATAAAGCTTCTCTTTTGGGAGATGCTATATCTTATATCAATGAGCTGAAATCAAAGCTTCAGGTTACTGAATCAGACAAAGATGGATTAGAGAAGGAACTTGATGGGGTGAAGAAAGAACTCCAGAAAATCACTGATAACTCTTCAACAACACAACCACCACCAGCACCCAATAAGTCCTCCTCCAACTCCAATCAACCGTTAATCGATTTGGATATCTTGGATATCGACGTGAAGATTATAGGTTGGGATGCAATGATAAGGATTCAATGCAGTAAGAAGAACCACCCAGCAGCGAGGTTGATGGCGGCGTTAATGGAGCTGGACTTGGAAGTGAACCACGCAAGTGTGTCTGTGGTGAATGATTTGATGATACAACAAGCAACTGTTAAGATGGGAAGTCGTTTTTATACACAGGAACAGCTTCAGGCAGCACTGTCCTCAAAAGTTGGCGATGCCCCTTAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM04G010930.1
CCGTGTTTTGTACTTGATTTTGTTGATATTTTAGTATACCCTCCATGGCTCCATTTCCGTATATAAACAAATACAACTATGCACAAACCCGGCCAGGCGTGGGGTTCAGCAGTTGGGGCTGATCTTCCATTAACCAATGGTCGGGAGTTCAATTCCCGCCTTGGATACGGAGCAACGTTAAAACTCTGGGTCAGCTGTCCTGTCCCTCGAGGCACCTACAATGAGCGATGGATTAGTCACTGCTGTCCGTGTGATGGATACCCGAGTTTACCCAAAAAAAGACAACTATGCACACCCTTTAAGACAATTAAGAAAAAATAAAGTAAATTTGGAAAACCAAAAAGTACTTGTATTGATAAGAAAAATAGAGCATTTAATAACGATAAACTTAGTACGTTAACTTAAAAAACTTTTTTTTGGTTCGTAGACGGAGTGACAATTGTCATCAGAAACTCACGGACACAACTGTGAGGTTCTGGGTTCGAGCCCGAGACATGATATATATCTAGCCTAACAATTCGGTATTTGCCAGTTGAGCTAGGCCTTACAGATTAACTTAAAAATCTTTAATATGCTTATATAATTTAATAATATAATAAAATTTATCACTATATGGTAAAGTCATAATAATTTTTTAAAAAAATCACAATTTAAATATCTTGAATATAATTTAAGTGATTTTTAGAGTGAGAGATCAACTAAGAGCATATCTAATGGTGGTTTTTTTTGGTGAAACTAATGATCAACATAGATGTAAGAACTCATTTTTTTATTGATTTACACTTGGAGTTGGCCATGTCGGAGGAGAGAAGTGAACAATCTCTTCTTGCCGGAAACTGGGTATTACTGGCGGTTTTTTTCCGCCGGAAAATCCACCGGTAACTGCAAAAAAAAAAAACGCCAGTAAATTAAAGTTATAACCCGCCGGTAAATGCTATAATCCGTCGGTAATTATCGGCGCCAAATCCGCCGGTATTTATTTAAGAAGCCGCCGGAAAGTTTTCAAAAATCCGTCGGTAAAATAATGGACTCCGCCGGTAATCTATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAACAGTTTCTTTATTCGTTTATTTAAAAAAAATAATATTATTAGTATTCGTTAATTAAAATATCTATTATTTAATTCAAAAAATATAATTAATTTTATAATATAAATATTTATTTCATATAAATGCTAATTAAACAAGAATTGAATAATGCTTTAAAATGATAAAATTTGCATAAACATCCAAGAATTAAAATATTTATTACATTTTGTCAAAAAAAAACTGCTAGTCATAGTGGCGCTCGGACGAGTTGTTGTTGAGGTCTGGATTATTTAGCCATGTTTCAAAATCAGTGTTGAGGTCTAGATCTGTGTTGATCTGCTGCTGGGGTTGCTCGGGCTGCTGCTGGGGTTGATGGAGCTGAGAGTTGAAACCAGAGTACGGCTGACCATATGGGCTGTGGAAGAAAGGCTGGAAGACTAGTGCGTACGGCTGAAAAGCAGAGCCGTAAGACTGCATCTGCTGCGGTGGATAAAATGATGATGATGATGGCATAGATGGCCTCGGGTATTGAGACATGTATCCATCATATGCTTCCAGAGATGATGATGGAAGACCTGTTGATGTCACTGTGTTCAAGCAGATAGTAGGTAGTCTTATGTACCTAAATGCAACACGACCAGATCTCACTTACTCAGCGAGCTTGATTAGTAGATACATGGACAAACCTACAGAGAAACATCTTATAATTGCCAAGAGGGTATTGAAGTATTTGAAGGGTACAACAGACCTTGGTATCTTGTACAAAAGAGGAGAAAAACATGAATTGACTGCATATTGTGACAGTGACTATGCAGGAGATATTGATGACCGCAAAAGTACTTCTGGATATGTGTTCTTATTGAGTGGTGGAGCTGTGTCATGGTCCTCTAAAAAGCAACCCATTGTCACACTCTCCACTACAGAAGCTGAATTCGTGGCTGCAGCTCACTGTGTGTGTCAAGGAGTATGGTTGAAGAGGATCCTTGATGAATTAAAGCTGCAACAGAACAAGACATTGACTGTGCTATGTGACAACAGCTCAACAATTAAGCTGTCAAAGAATCCAGTAATGCACGGGAGGAGCAAACACATCAATGTAAGATTCCATTTCTTAAGAAATCTATGCAAAGAAGGCCTGGTGGAGTTGAAACACTGTCCTACACAGGAGCAACTTGCTGACATTCTAACTAAAACTTTGAAGACTGATAGCTATGTGAAACTGAGAAGATGTCTGGGAATATGTTCTCTGGCTGAGAGTGAGCTTAGTGTAAATAATCTGAAAGCTTGATAAAGCCTTAGATTATGGGAGGAAATGTTATAGTAAAAGTTGTAATAAAATTTGTGTAAGTAGTATTAGTTTGGCGCATTTTTGATTGTCTGTTATTGGGCTTGTTTTAGTTGTAAGCTGGCCCATTTTCATGAAGCCAGTTTCTGTTAATGTAAATAACTCAGCCATCAATGAAAGTATATGTGTTTTCACTTGAGAATTCTGTCATTCTGCTATTCCTGTTTACATGCCTATCATACACTTAATTAATCCCTCACCTTACCTTTTATTTAATAAAAAAAATGATGATGTTTTTAAATTAACATTTATTCTCCCAATAATTTAAGAAAACAGGATTGAATACCTAACACAAAAATAGTATTTTATAGATTACAATTATAGATTACAGCGCCGTATTTTTACGAATAAGTCATTTTCACTCAGGAAAGCTGACACGCAGGTTCACCTTAACGCTCAAATTCAACCTAAATGCACTTCAAATGAATTCCTATCCCAAAAGCACCCTCGTCCCTTCTCTCGTGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATCTCAATATCAGCACTGTGTGTGTGTGAAAGTGAGAGGTTGTCGGTTGTGTTCTATAGCTCTCTCTAATTGAACCCCAAATTGATTAAAAAAGTGTGA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF14215.9	bHLH-MYC_N	47	227	2.40E-54
PF00010.29	HLH	475	520	5.20E-11

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	bHLH

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0140825	lactoperoxidase activity	Molecular Function
GO:0006979	response to oxidative stress	Biological Process
GO:0098869	cellular oxidant detoxification	Biological Process
GO:0020037	heme binding	Molecular Function
GO:0046872	metal ion binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR025610	Transcription factor MYC/MYB N-terminal
IPR045084	Transcription factor AIB/MYC-like
IPR011598	Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638	Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2YZU7	_

SwissProt

SwissProt term	Description
MYC2_SOLLC	Transcription factor MYC2

KEGG

KO	Description	Enzyme
K13422	transcription factor MYC2

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G32640	Basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding family protein
Medicago sativa L.	MsG0580025555.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os10g42430.1	transcription factor MYC7E, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa018697	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000126s00013635.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_37070T	_
Arachis hypogaea L.	AH05G38880.1	Transcription factor MYC2 like

Expression pattern