Gene detail

Detail information of Am04G003250.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am04G003250.1	Leucine-rich repeat protein kinase family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am04G003250.1	mRNA	Chr04	8073858	8077551	-

Sequences

CDS:

>Am04G003250.1
ATGAGAAGACACCGTCAAATTCATCTCTCTCATGCTCTATTCTGCGCCATTCTCTGTTTGCTTTCTTCTATTACAACAGTCACACCAGCAACTGAGAAAGAGATTCTACTTCAATTCAAAGGTAACATCACTGAAGATCCCCAAAACAGCTTGAGTTCGTGGGTTTCAAATGGAGACCCGTGTCAAGGTTACAAGGGTATTTTCTGTAACTCGGAAGGATTTGTTGAAAGAATCGTGCTTTGGAACACTAGCTTAAGTGGGGTGTTGTCATCTTCACTCTCTGGGTTGAAGAGGTTGAGGATATTGACATTGTTCGGGAATCGGTTTTCGGGTAATATTCCAAAAGGATATGCTGATCTTAAATCGTTATGGAAGATCAATGTGAGTTCTAATGCTTTATCTGGTTCGATCCCGGAGTTCATAGGTGATTTGCCAAACATTCGGTTTCTAGATTTATCAAAGAATGGCTTCACTGGAGAGATACCTTCAGCTTTGTTTAGGTACTGCTACAAAACCAAGTTTGTTTCTCTTTCTCATAACAATCTTGTTGGTTCAATTCCTGTTTCACTAGCGAGTTGCTCCAACCTTGAAGGCTTTGATTTTTCTTTCAATAATCTCAGTGGAGTTGTTCCTTCTCAACTATGTGATATTCCCAGCTTATCATATGTTTCACTGAGACGCAATGCATTGTCAGGGAGTGTGAATCAGCACATTTTGGCATGCCAGAGTCTAATGCATTTGGATCTTGGTAGTAATAGATTTTCTGATTTGGCTCCATTCAGCATACTTGCATTGCAAAATCTTACTTATTTCAATATATCTTATAATGGGTTTGAAGGACAAATTCCTGATATCACTGCATGTAGTGAGAGATTAGAAATCTTTGATGCTTCTGGAAATTATTTGGATGGGGAGATTCCATCCAGCATAACTAAATGCAAGAATCTAAAGCTCTTGGCTTTGGAGTTGAATAAGCTGAAGGGTAGTATCCCAGTTGATATTGAGGAACTACGAGGACTATTAGTTATCAAGCTGGGTAATAACTCAATAGGTGGAATAATTCCCAAGGGTTTTGGCAACATTGAGCTGCTTGAATTGCTGGATTTAAAGAACCTAAACCTCATTGGCGAAATTCCGGTTGATATAAGCAATTGCAAGTTTCTTCTTGGGCTGGATGTTTCTGGTAATAACTTAGAGGGTGAGATTCCTCAGGAGCTTTACAAAATGACAAATTTGGAAGCTCTTGACCTACATCATAACCAGCTTAAAGGAAGCATCCCACCAAGTCTAGGAAACCTGTCAAGGATCCAATACTTGGACCTATCACATAATTCATTTTCTGGTTCGATCCCTCCTTCCCTTGGAGATTTTGAAAGCTTGATATATTTCAATCTGTCATTCAACAATCTCTCTGGTGTCATTCCTGATATCACAAGCATACAACGTTTCGGTGCTTCTGCATTTTCCAATAATCCTTTTCTTTGTGGTGCTCCTTTGGACACTTCATGCTCAGTAAACGGAACTAGATCATCACCTTCAGCTCCTGGGAAGACTAAACTTCTCAGTGCCTCTGCAATTGTTGCGATTGTTGCTGCAGCTGTAATTCTTACTGGGGTTTGTTTGGTGACCATCATGAATATTAAGGCTCGACGACGTAGAAAAAAAGACGATGATGATCAGATTATGATTGTTGAAAGCACGCCTCTAGGATCAACCGAATCAAATGTCATAATTGGAAAGCTGGTTCTCTTCAGCAAAAGTTTACCATCAAAATATGAAGATTGGGAAGCAGGCACCAAAGCATTGCTTGACAAAGAGTCTATGATAGGTGGTGGATCAATTGGTACAGTCTACAGAACTGACTTTGAAGGTGGCATATCGATTGCAGTGAAGAAGCTCGAGACTATGGGAAGGATCAGAAATCAGGAGGAATTCGAACATGAAATTGGTCGACTAGGCAACCTTCAACACCCTAACTTAGTTTCCTTTCAAGGTTACTACTGGTCCTCTTCAATGCAGTTGATTCTGTCAGAGTTTGTTCCAAATGGGAATCTCTATGATAATCTACATGGGATTGGCTATCCTGGAACCAGCACTAGTAGAAGAGGCAATAGAGAATTGCATTGGTCTAGAAGGTTCCAAATTGCACTTGGAACTGCAAGAGCCCTTGCTTATCTCCACCACGATTGTCGACCTCCAATCCTTCATCTCAACATCAAATCCTCCAACATACTCTTAGATGATAAATATGAAGCCAAGTTGTCTGATTATGGATTAGGAAAGTTACTTCCCATTTTGGATAATTATGGTCTGACCAAGTTCCACAATGTTGTTGGATACGTTGCGCCGGAGTTGGCTCAAAGCCTTAGGCAGAGTGAGAAGTGTGATGTTTACAGTTTTGGGGTAATTCTTTTTGAGCTGGTTACAGGGAGGAAACCTGTAGAAAGTCCTTCCTCCAATGAGGTGGTGGTTTTGTGTGAATATGTAAGAGGTTTGTTGGAGACTGGCTTGGCTTCAGATTGCTTCGACAGGAATTTAGTGGGCTTTGCTGAGAATGAATTGATTCAGGTTATGAGATTGGGTCTAATTTGTACTTCTGAGGATCCTTTGAGGAGACCAAGCATGGCTGAGGTTGTTCAGGTCCTTGAGTCCATTAGAAATGGATTGGAATCTCATTAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM04G003250.1
TTGTTTAAGGAAGGGGTGACTTTAAGTTTGAAGCTTACTTCGCAGACCATGAAAAAATACATTATTTTTTAAGAGTATTTAATAATGATATTTTTTTACTCTTCCATTCAGTGTTTCGTCGTGATGACTTCATGGCTCTGATTTGGATTATTCTCATTATTTTTGAATAACATTTAATCATTTAAAACATATCAAATGCTCTTTTTTCATTTGTCTCTTATTGTTGGTTGGTTGGTTGTATTGACAATTTCAGTGACATGGAGACGTAGTTCTCAAGTGTAACCTTGTGTGTGCACGTATCATTTATTTGTCGTTTTGTCTAAATTGACCACAAAAATATTCTTTTTCACCTTATAATAAGTAGAGGTCATTACACGAACTTAATCAAGAAAAAAACACTAGCCAGTTCAAAAATTCAAAACTACAAAAAAAAACTATTTTTAATTTGCTTGGGCCACTTGTTTCTGCTAACCGTGTGGTTTGGTTCGGTTGGCAATTAACAATTGACTTACTTGGAAACGAACCAACCAAAACAACATACGAAAGGGCATGTTTGAATCAATTTATTCAAGTTTATTTAGTGACATAAATACTTGTGAGATTGTTTGTGAGAGCTTATGAAAACAACATATGATATGTTCATAAATTGTTTTCAGCTAATTTCAATAAGCACTCTAGAATAACTTATGGAAACAACTTATTTAAATAAGGGTATAATTAATGGGAGACTCACAATTTTCTTTAATTTATCATGCAAACTAAATTAATTTATTTGAGCCCAGTTTAAATTATCATTGCCAAACACAAAATTATATTTTTAAACCCACTTATTAAAATCAATATTTTTAATATCAATTATATTACAATTTCTTTTGTCCGCAAACAGAGTGACAATTACAACTCATAAACACACAAACAAAGTGGAGATTTCGACTTCAAACCTAGGTAACTACGAAAAATATCCATCCTAACAACATTAATTTTGTAAATTATAGCCTATTATAGGCTAAAATAAACTTTTGGTCCTTAATCTTTCATAGTTTTCGTCATTTATCTTTTAAAAAATTCGTTTACGTCATGTGTCTCTTTTCATAACTAACTAAAATGGTACTTCCTTAAGTGGCTGTTAATTAGGGCTTATGTGGATAGAGTGACATGCCACGTAAGCACTTGATTATGCTATTAGAGCATCCACAATAGAGTACCTCTCATTTTTCCCTTAAGTGAGACCTACGTGTATACATCACTCATTTATACTTTTTTAATGTTAGCTCCTTATAAGTACTCGATCTCTCCAACCCATCACCCCAAAAAGTTTACTAAATGGGTCCCACTATAATCCCAAAAAGTTTACTAAATGGTGAAGAGAGAAAAAAAAATAAAAGATTGTGTCATGTGGGACTCGGAGGGAGAGAAAATAATAGATAAAATTGGTTTTAATAGTGGGGCTCACAGAGAGGGGGGAGAGGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGTCCTAATAGAATGACTCATCCTTATTAATGATTGCTTTTATTTTCTCATTGGTATTCCTTATAGCAAACTCTCCCTAATAAGGAAAAAAAAGTATAAGGAACACCATTGTGGATGCTCTTAGACCATTAAATATTATTTTATTTTTGTCCTTTATCTTTTATAAAATATCAGTTAACGCCCTTCATTTTTTTAAAAATGTTCGTTGTCGTCTTTTATCTTTTAAAATGTTTGTTTACCTCCTTTATCATTTTATAGTTAATTAAAATGGTTCTTTCGTTAAGTGCACTCTTAATTATGATTTACATTGATAGTGACATAAATAATTGGTCATGTAAGCATGTTGACCTTGTTATTATAAAAATAGTAATAAAAAAAATATATGGTGCTAATATAGATATTCAAAAATGATTATTGAATAACAAATTAAAAAAAGTTGAGCATTAAAATAGAATAAAAGTGACAAAAGTTATTTATTCTTTGAAATTAATTTGTCAAAGTAAGCTGATGTCCTTTAAGAACTGAGAATAGTTAAGGTTAAATAATGAAGCTTGCCATTAATGAAGTGCATTTGTAAATGTTTTGCCGTGGTTATTTTTCTTTCACGGGTACGGCAGCTGTTAATTACGACGAATTCAAAGGAAAAGTGTCCCCAGCGAAACGGATATTTTCCGATTGAATAAAGAAAACTGTACTACAGACAAACAAACACACTCCTTAATTGACCCTTTCCTTTCCTCTCTCCCCTTTTTCATCATCTTTCTTCTTCTTCGTTTCCTAAACCATTACCTTCTAATTGAAATGGTGTTGATGACGATAGTGACTATGATGGTGACTGACTTGGTTGGTGGGGAAGAATAAATGCCTTGCTAGCTATACAAACAGGTCCTCACTAACACAATGGGGAGCAAGAAAGAAAGAAACAAGTAACAACTCATGTTCACAGTTTACATTACATCGTTAAAGGGTATCATTGCCTTTCTTTCTCTCATGCACGTGGTTCAATCTTCATTTGTTTGCAATCTCTGAATTTATTTATCACATTCTCATCTCATCACAAAAATAAACTATTATAAGAAATTTATTTAATTGCCTCTCACTTTCTCACCTGCCTCCTTTCCAGCAAAGGTACAGCCACCACTTCCACCTTCTTCATTTTCATTTACTTCCCCCCCATTCCCATTCTTTCTCTCTCTTCATCTCCTACAACCTCAAGCTTCCATTTTTATATTACCCATTTCAACCCCACAAAAGATAAATGATTTTTTTAAACCCCCCATACCTCACACAGAGAACATTCTGGAATCTTTGTTCTTGATGCTTGACTTAGAACAACAACCCAGAAGAGAAGTAGAGATTTAACGGGTATTTTGGTTTTTATTTAATGAAAATGCTTCATTTTGGTGACAATTTTGATGTTTTGTTTCTTATTGGACCGACATTTTACAAAACCTCAAACGTTGTACCTCGTAATCGTGATGATGTCTGAAGGGTGATCACATTGTTTCGAGC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	605	880	1.40E-34
PF13855.9	LRR_8	243	302	1.90E-34
PF13855.9	LRR_8	391	445	1.90E-34
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	605	881	2.70E-34
PF12799.10	LRR_4	410	450	2.80E-24
PF08263.15	LRRNT_2	30	70	1.40E-08

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.12.3:RLK-Pelle_LRR-VII-1

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004672	protein kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0032259	methylation	Biological Process
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0008168	methyltransferase activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2YXR9	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y1124_ARATH	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g12460

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G12460	Leucine-rich repeat protein kinase family protein
Medicago sativa L.	MsG0580024456.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os03g03570.2	leucine-rich repeat transmembrane protein kinase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa018038	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000445s00020020.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_41910T	_
Arachis hypogaea L.	AH15G04810.1	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g12460 like

Expression pattern