Gene detail

Detail information of Am03G030190.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am03G030190.1	polymerase gamma 2

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am03G030190.1	mRNA	Chr03	133349062	133368973	+

Sequences

CDS:

>Am03G030190.1
ATGGTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTACTCTGCTCTTCTCCCAATTCCTCCTTCTCTTTCTCTCTGTTTTCTCTCGTGAGGGCATATGTCCTCTCTCTACACTCTACAATGCTTTATTTACCCCTTTTGATCAAACCACAACAAAACTGGAGAGACTTGTCGCCATGAGGGCCTCTTTTCAGACAACCCCTTTCAAACCACCTTACTACTACTATTGTCCCTCTTGCTTCTCCTTCTCTCAGTCTCAATTTTCTTCCCGCCGCCCCTTTAGTCTCCCTCTCTCTTCTTTCTCCTTTTTGGCTTCCTATGGACCACCCCGACACAGCAGAAGAAAAGTTCAATCAATTCAGATTGCCAACAATGTCCTCCTACATAACATGTCCTCTAGTAACTCTCTACAATATAGAGAAGGTTCATACTGTCTAAAGAGAATATCTTTTGGGTTGAATAAACGCCATGACATGGAATATAATCATAATTCTCCAATACATATTTCAGTAATGAAATTTTCAACCGTGTCATTAAGCAAGTTGGAAGTAACAAATCAAACAAGACAGCAAGAAGAGCTGAGATCTTTGTATTCCTATGACAAACAAGTTACGATGACGAATTTGGATTCTCGGAATCACAGATTATCCAAAATCACTTCTAGTAAAAAATTATCTGGTGATAAAGCAGGCTGGGCTGAGGCTATCTCTAATATGACTCGGATAAAAATGGAAATGCATGCTCCAGACAAGGGTAGTTCCTATCCATCCAATATAAAAGGTTTTAGTGGTCATATAAAGGCTATTTCTAAGAACGGACCTCACAATCTTATGCTACAGGATCTACATGACCCTGTCTCATCTTCTGTTCATCATTCTATAGTAAACAAGTCAAAGGTTTTGAGGGACACTGAACGGTTGGGTACCCAGTCAAATGTATCTTCGTTAAAGATCAGTGAAGAGAAAACTGATAGAGTTAATGGCAATCATGGTTTGGATACAACTGCAAAGGATGAAACTAATGCAACATCGACTATTACATGGTCATGCAGTGCTGAACAATCAAAACTTCGAGACAGGCTCTGTAGTATCTATGAAGACATATTGGTTGTTAATAATCTTTCTCTTGCAGAGGAAGTAGCTAAGAAGCTTACAGTAAATTATAGGCATCTTATTCATGCATGTGATACTGAGGTGGCCAAGATAGATGTCAAACAAGAAACACCCGTAGATCATGGCGAGATAATATGCTTCAGTATTTATTCGGGTCCGGAAGCTGATTTTGGAGGTGGGAAGTCCTGTATCTGGGTAGATGTTCTTGATGGTGGAGGCAAAGAGATTATAAATAAGTTTGCTGAATTTTTTCAGGATCCGTCCATCAAAAAGGTCTGGCATAACTATAGCTTTGACTGTCATGTTATACAAAATTATGGATTTAAGGTTTCTGGATTTCACGCTGATACAATGCACATGGCGCGATTATGGGATTCATCAAGACGTTGGGTTGGTGGTTATTCTCTTGAAGCACTTACAGGTGATACAGAGGTTATGTCTAGGGCTAAGCTGAATCGTGAAAAGGTTTTGATTGGTAAGGTGTCAATGACAACTATATTTGGTCAGAAAAAGGTGAAGAAAGATGGATCCGAGGGTAAAATAGTTACCATTGCCCCTGTTGAAGTGCTGCAAAGAGGAGAGCGCATATCTTGGATATGTTATTCTGCCTTAGATGCTAGAAGCACTCTAAAGCTTTATGAGAGCCTTAAGAGTCACCTGTCAAGTTTGCCCTGGAAAGTTGATGGAAAATGTGTTTTACATAAAAACATGTATGATTTTTACACGAAATATTGGCAGCCGTTTGGTGAGCTTCTTGTCAAAATGGAATCTGAGGGTATGCTAGTTGATCGGTTATATCTTCAAGATATAGAAAAGGTGGCGAAAGCTGAGCAACAGGTAGCTGTTAATAGATTCCAAAAATGGGCATCTAACTATTGTCCTGATGCTAAGTATATGAATGTTGGAAGTGATGCACAGTTGCGTGTACTGCTTTTCGGTGGCACTGTGAACAGAAAAAATCCCGATGAGGCACTTCCAAGCGAGAGGATTTTCAAAATCCAAAATGTTGATAAAGTGATTGAAAAAGGCAAAAAGATTCCCACAAAATTTCGTGATATTAAGTTGAATAGCATTGGCTGTAACATGAAAATTGACATGTACACAACTAGTGGTTGGCCCTCAGTTAGTGGTGCTGCTTTGAAGGCCCTGGCTGGAAAAATTTCTACAGATTATGATTTTAGCGAGGCTGTTGACTTGGACCTCGATGATGAAGATGGAAATCCTTCTCAAATTGAAGTTGAACCTGTAGAAATAGACAATTCTGCATATGGAACAGCCTTTTATGCTTTTCCAACAGAGGAAGAAGGGAGAGAAGCTTGTCATGCAATTGCTGCTTTATGTCAAGTCTGTTCAATCGACTCTTTGATCTCTAACTTCATCCTTCCCCTGCAGGGACATAATATATCCGGAAAGGATCAGCGTGTTCATTGTTCCATAAATATCAACACTGAGACTGGACGCTTGTCAGCAAGAAGGCCAAGTCTGCAGAATCAACCAGCTTTGGAAAAGGACCGATACAAAATCCGTCAAGCATTCATAGCTTCTCCTGGAAATTCTCTTATAGTTGCTGATTATGGACAGCTGGAGCTTAGGATACTTGCACATCTTACTAATTGTAAGAGCATGTTGGAAGCCTTTGAAGCTGGTGGGGATTTCCATTCCAGAACTGCAATGAATATGTACCCATATATTCGTGAAGCAGTTGATAAAAAGCAAGTGCTTCTTGAATGGCATCCTCAGCCTGGTGAAGACAAACCCCCTGTTCCTCTGCTGAAGGATGCCTTCGCTTCTGAAAGAAGGAAAGCCAAAATGCTTAACTTCTCAATTGCATATGGAAAGACTCCACTTGGCCTTTCTAAGGATTGGAAGGTTTCTGTGAAAGAAGCCAGGAACACAGTTGACCTCTGGTACAATGATAGAAAAGAAGTTTTGAGATGGCAAGAGAAACGTAAAAAAGAAGCTTCTGAAACTGGATGTGTTTACACATTGCTGGGGCGGGCCCGACGCTTCCCTATAGTGAACCAAGCAAACAGCTACTATAAAGGTCACATCGACCGAGCTGCTATTAATACCCCAGTGCAGGGTAGTGCAGCAGATGTTGCCATGTGTGCCATGTTAGAAATATCAAATAACAAACAGTTGAAGGAGCTTGGGTGGAAGTTACTTCTACAGGTTCATGATGAAGTCATACTAGAAGGACCAACAAAGTCAGCTGAGGTTGCAAAGGCCATAGTTATTGAGTGCATGTCAAAACCCTTTAATGGAAAGAATTTTCTCACAGTCGCCCTATCCGTGGATGCCAAGTGTGCACAAAACTGGTACGCTGCAAAATAG

Protein:

>Am03G030190.1
MVSLSLSSTLLFSQFLLLFLSVFSREGICPLSTLYNALFTPFDQTTTKLERLVAMRASFQTTPFKPPYYYYCPSCFSFSQSQFSSRRPFSLPLSSFSFLASYGPPRHSRRKVQSIQIANNVLLHNMSSSNSLQYREGSYCLKRISFGLNKRHDMEYNHNSPIHISVMKFSTVSLSKLEVTNQTRQQEELRSLYSYDKQVTMTNLDSRNHRLSKITSSKKLSGDKAGWAEAISNMTRIKMEMHAPDKGSSYPSNIKGFSGHIKAISKNGPHNLMLQDLHDPVSSSVHHSIVNKSKVLRDTERLGTQSNVSSLKISEEKTDRVNGNHGLDTTAKDETNATSTITWSCSAEQSKLRDRLCSIYEDILVVNNLSLAEEVAKKLTVNYRHLIHACDTEVAKIDVKQETPVDHGEIICFSIYSGPEADFGGGKSCIWVDVLDGGGKEIINKFAEFFQDPSIKKVWHNYSFDCHVIQNYGFKVSGFHADTMHMARLWDSSRRWVGGYSLEALTGDTEVMSRAKLNREKVLIGKVSMTTIFGQKKVKKDGSEGKIVTIAPVEVLQRGERISWICYSALDARSTLKLYESLKSHLSSLPWKVDGKCVLHKNMYDFYTKYWQPFGELLVKMESEGMLVDRLYLQDIEKVAKAEQQVAVNRFQKWASNYCPDAKYMNVGSDAQLRVLLFGGTVNRKNPDEALPSERIFKIQNVDKVIEKGKKIPTKFRDIKLNSIGCNMKIDMYTTSGWPSVSGAALKALAGKISTDYDFSEAVDLDLDDEDGNPSQIEVEPVEIDNSAYGTAFYAFPTEEEGREACHAIAALCQVCSIDSLISNFILPLQGHNISGKDQRVHCSININTETGRLSARRPSLQNQPALEKDRYKIRQAFIASPGNSLIVADYGQLELRILAHLTNCKSMLEAFEAGGDFHSRTAMNMYPYIREAVDKKQVLLEWHPQPGEDKPPVPLLKDAFASERRKAKMLNFSIAYGKTPLGLSKDWKVSVKEARNTVDLWYNDRKEVLRWQEKRKKEASETGCVYTLLGRARRFPIVNQANSYYKGHIDRAAINTPVQGSAADVAMCAMLEISNNKQLKELGWKLLLQVHDEVILEGPTKSAEVAKAIVIECMSKPFNGKNFLTVALSVDAKCAQNWYAAK*

Promoter(3k):

>AM03G030190.1
GTGTTCTTTTATTTAAGTCTTATTTTAATGTGCTTATTGTTAATTTGTTGATGATCTAGCAAGATGATTCCTACTTGTGCTTTGTGCACTTTATGTTAAGTAGTTGATGATTGCTAGAGGTGATTCAACTTTGTTTATGTGTTCTTTTATTTAAGTCTTGTTTCAATTTGCTTATTGTAAATTGTTGATGATGGGCAAGTTGATTCTCACTAGTGCCTAGTGCACTTTTCTCAAAGTGGGAGGATTGCTCTATGTGATTCAACCTTGTTTATGTTTTCTTTTATTTTAGTTTTATTTTAATTTGCTTGTTGTAAATTGTTGATGATAGGCAAGTTGATTCTCACTAGTGCCTAGTGCACTTTTCTCAAAGTGAGAGGATTGCTCTATGTGATTCAACTTAGTGGTGTGTTTATTTAATCTTTGTATTTTTATTTTTGCTTATTGTTAGTGGTTGATGATAGGCAAGTTGATTCTCACTAGTGCCTAGTGCACTTTTCTCAAAGTGAGAGGATTGCCCTATGTGATTCAACCCTAAGTGATGAGGATTACTACAAGTGACTCAACTTGCTTTTAATTTTCAATGAATAAATGCAAGTTTATGCTTATGTCGAATTGAGAATGCTGATTTTTGGGGCTTGTAAATGTGATGTTTTGGGTTATTAATTTGTTCAATTGGTTGATGATTGGTGAGATGAATCAACATGTGTTTTCTAGCACCATTTTAAAATGTTGAGGATCACTTGAAAGTGATTCGACTTTTATCTATGCTTTAATGTTAATTTGGTAACGTGACTAGACACTTATGCATTGAGCATTGTTAACAAGTGTCAAGGATTACCAAACACTTTTAACTTGTGCCTAATGCCTAAAATCCGAACCAAGCTTTTGCAATGTTTCCTTAAGTGCCTTTCTTGGCAACTTATTTGGTTGTTTTTGATCTCATATATTCATGCCATTAATTGTTGATGACTCAATGTCATTTTTGTGTACAATTGTTGTAAATGGAAATGCTTATGCTTGTGCTCTCATTATTGATTATTTTGCTTGCAAATTGGTAAGTATTGCATTTTGGTTTTGACTTGAAAGTTGATTGAAGATTCTACTTTCTTTTCTTTTGTGGCCAAAGCCACCCTCGAATTCTCTTCCTCTCCCCTCTAATCAATCCTTTTTCAAATGATATTCCAAAATCCAATGCTTCGCTAATTGTCTTCACCAATTAATCAATTTCTTTTTAGATCAATAATCAACCTTTTGAAAACTCATAAGGAGGCAAGTCGGACGTACGACCGATGTTGTCTAGCGTCCTAAGATCGGAGTTGTACAACTCAAACATCTTGGGATACTTATGAGAATTAAAACAGATAATTAACAACTTCAACCCTTTTCAAAGATGAGTGAGGAACCGATTCGGATGTACGTTCGACATTGGTTAGAGTCCTAGGATTAGTGAGTTGTACAGCTCGTGCGAGCCTAAGATACTTACTCGAACAAAAACTACCAATCTCACAGCAAATCTTTTTTTTTTCAAGTAATTCAAATCACTTTTCGATAAGCAGGGGGCACGTCGCCTGTACGGGCGGGGATGTCTATGTTTTAGGGTTAGTGGACTGTACAGTTCAGACCCGAGAACCCCTGCAATAAAAGACACCAACACACCCAAAGTTTCTCGACCCAGGAGAACTACGTAGCTTTGATTTCCTCATTGCATCTGAGGATACGTAGGAGCGGGCCACGTCCCGTCAAGCACCCTTTTCAAAAAAATACCAAAAAAAAAAAATCTTTCTTTTCCCCGTTTTCTTTCCAAACGCTTTTCTCAAATAAAAAAAGAAAAAACGAAAAGAAATAGAACATCGTTTCAAATCAAACTTTGTCGAAACCACACATCAAATTAATGGTTTCCTTTCGGTAGAAAGGAGATGCGGGGTGCTTATACCTTCCCCGTGTCTAACCGACCCCCAAACCTACATCTCCTGATTTCGAAAAGACCACCCGCCTTGTGTAAAAAGACGTTTTTTCAATGTTTTCGTCTAAAAACTAAAATATTGATGGCGGCTTCATTTATCTTCCACGTTGTACATTGAGAAATCCCTACCGGATTTTTCGGGGTGCAACAGGTATGGGTAAAAACGTACCTGTCAGGTGATGTCATGGACTCTTTATATAGTACCAGGGGTGCTGCAGGCGACCGTCGGATCCTGCGAAGATTCCTCTTCGCCGTTGATCTTCCCATCGTGGGCATTAGATGGCGCCAAGTTGCTATTGGGCCGCTCGCACAGACCCAACATTCTTTACGGGTCGCGACCCGATCCAAATCGACGTGTAATGCTGGCTGATTATTCGGCTGCTCGACCCGGTCCAGTATTCTTCGTGGGCTGCGGCCCAGTCCAGAACATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATCTATATCTTATATTGTTATATTATTATAATTAATGTTATTAATTATTAATTTTATTGTTTTTTATTATATATAGATATAGATTATATATATTACCAAAAAAAAGGTAGATAGATTATATAGATAGATTGTAGATAGCGGTTTTTTTTAAAAGATAGCAGAAGTGTTTATTTAATTTTCTCCAATTTTTTTTTTAATTTTTTTGACCAAAACTGTTTATTTAATTTTAATTGTAATAAAACCCTTGATACATAGATACCCCTCGATATAACCCAGAGCCTGGAGTAGCAGTTGGGGCTGAACCTCCCTTAATCAAGGGTCAGGGGTTCGACCCCCGGCTTAGGTACGGAGCAGCGTTAAAACTCTGAGCTAGCTGTCCTGCTTCTCAAGACACCTACAATGAACAATGAATTAGTATACCCGAGTTTAACTCAAAAAAAAAAATAGATACCCCTCGATTATTTGCTGCTAATTAATTGAAAAACAACAAAAAAGTTTGCCTTCCAGTTCACTAATCCATTCACTAATCCATTGTCACTTTTGTACTTGTAAGAATATTCAAAGCCGCAGGGGTTT

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00476.23	DNA_pol_A	808	1140	4.40E-74
PF01612.23	DNA_pol_A_exo1	409	586	1.20E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0071897	DNA biosynthetic process	Biological Process
GO:0006302	double-strand break repair	Biological Process
GO:0003677	DNA binding	Molecular Function
GO:0004672	protein kinase activity	Molecular Function
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR012337	Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397	Ribonuclease H superfamily
IPR001098	DNA-directed DNA polymerase, family A, palm domain
IPR043502	DNA/RNA polymerase superfamily
IPR002298	DNA polymerase A
IPR002562	3'-5' exonuclease domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2Y7M1	_

SwissProt

SwissProt term	Description
POLIA_ARATH	DNA polymerase I A, chloroplastic/mitochondrial

KEGG

KO	Description	Enzyme
K02335	DNA polymerase I	[EC: 2.7.7.7]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G50840	polymerase gamma 2
Medicago sativa L.	MsG0380013861.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os08g07840.1	PolI-like DNA polymerase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa017016	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000029s00003626.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr04_30950T	_
Arachis hypogaea L.	AH00G02540.1	DNA polymerase I A, chloroplastic/mitochondrial like

Expression pattern