Gene detail

Detail information of Am03G023250.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am03G023250.1	DegP protease 7

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am03G023250.1	mRNA	Chr03	70917141	70937879	-

Sequences

CDS:

>Am03G023250.1
ATGGGAGATCCATCGGAGAGGTTGGGATCGGAGGGTTTAGACTCCGTCGCCACCGTTAAGGCCGAGGACTTGTGCATGGAAATCGATCCGCCGTTCCAGGAAAACGTTGCAACCGCGGAGGACTGGCGGAAGGCTCTCAGTAAAGTCGTCCCCGCTGTTGTTGTCCTCCGAACCACTGCTACTCGCGCTTTCGACACCGAGTCCGCCGCTGCCAGCTACGCTACTGGCTTCGTCGTCGACAAACGCCGTGGTATCATTCTCACCAATCGCCATGTCGTTAAGCCTGGACCTGTGGTTGCTGAAGCAATGTTTTTGAACCGCGAAGAGGTTCCGGTGCATCCGATATACAGAGATCCAGTACATGATTTTGGGTTTTTTCGGTATGATCCCAGTGCTATACAATTTCTGAGCTATGAGGAGATACCGCTTGCTCCAGAGGCTGCTTCTGTTGGCCTAGAAATCCGAGTTGTTGGTAATGATAGTGGAGAGAAGGTTTCCATTTTGGCTGGTACTCTTGCCCGACTGGATAGGGATGCCCCTCACTATAAGAAGGATGGGTATAATGACTTCAACACATTCTATATGCAAGCAGCATCTGGGACCAAAGGAGGGTCAAGTGGTTCCCCGGTTATAGATTGGCAAGGCCGGGCAGTAGCCCTGAATGCTGGGAGCAAGTCATCAAGTGCATCTGCATTCTTCTTACCTCTAGAACGAGTAGTGAGGGCACTAAGGTTTCTTCAAAAAGGCAGTGAAACTTATGTTGATAAATGGAAGGCAGTTTCTATACCTCGTGGTACACTTCAGGTGACCTTTCTCCATAAAGGATTTGATGAGACTCGTCGGCTTGGCCTCAGAAGCGAGACAGAGCAGATAGTAAGGCACGCTTCTCCAGCCAGTGAAACTGGAATGCTTGTTGTGGACTCTGTGGTGCCTGGTGGTCCAGGCTATAAACATTTGGAACCGGGGGATGTTCTTGTTCGTGTTAATGGGGAAGTTATTACTCAATTCCTGAAACTGGAGACTATTCTTGATGACAGTGTAAACACAAATATTGAATTACAAATTGAAAGGGGCGGCACGTCAAATAGTTTAACTTTGTTGGTGCAAGATTTACACTCAATAACTCCTAATTATTTCTTGGAAATTAGTGGAGCAATAATAAATCCTCTTTCATATCAGCAGGCTAGAAACTTTCGATTCCATTGTGGTCTTGTTTATGTGACAGAACCGGGATATATGCTCTATAGAGCAGGAGTTCCTCGCCATGCAATAATTAAGAAATTCGCCGGTGAAGAAATATCTTGCCTCGAGGAACTAATATCAGTTCTATCTAAGCTATCTAGGGGTGCTAGAGTGCCATTGGAGTATATAAGCTACATGGATCGTCATCGAAGGAAGTCGGTGTTGGTGACGGTTGATCGCCATGAATGGTATGCACCTCCCCAGATATACACTCGTGACGACAGTACTGGTCTATGGAATGCTAAGCCTGCTTTTCAGCCGGATTCCCTTCTTCTATCATCTGGGGCCAAAGATGTTGGAAATCTGGACAGACAGCCAATTTCACTAACTGGTGAGCATGCTTGTGGGGGACATGTGTGTGAAGGCAACAATCAGGAGTTGGTTGATGGTATCACTAGCATGGAAACTAATTATGAAGATCCTTCAGAGCCTGTATCTCACAACAATGCATCTGATGGCTTGGTAAAGAAACAGAGAGTCGATGAAGACTCATCAAATGATGGAAGTGTTGTTGCTGATTTATCCTTAAATGGATGCCAAGAAACTAAGCCTGAAAAGTCAAGTGCTATACAGGATGATGGATTAATGAACTATCAAGGTTCTCCTGCTACCACAGGAAATGCATCAGTTGCTGAACGTGTGATTGAGCCTACTCTTGTGATGTTTGAGGTTCATGTTCCTCCATCTTGTATGCTTGATGGTGTTCATTCACAGCACTTTTTCGGAACTGGTGTCATAATATATCATTCTCAAACTATGGGATTAGCTGCAGTTGACAAGAATACTGTTGCAGTATCTTCCTCTGATGTGTTGCTATCTTTTGCTGCTTACCCAGTTGAAATTCCTGGAGAGGTGGTATTTCTCCATCCTGTTCACAATTATGCTCTCATATCATATGATCCCTCTGCGTTGGGACCTGTTGGTGCTTCAGTGGTTCGTGCCGCAGAGTTACTTCCAGAGGCATTGCGTCGAGGGGAATCTGTTTATCTCGTGGGGTTAAGTAGAAGCCTTCAAGCAACTTCTAGGAAATCCGTTGTTACCAATCCTTGCGCTGCATTAAATATAGGATCTGCGGACTCCCCACGTTACAGAGCAACCAATATGGAAGTGATTGAACTTGATACTGATTTTGGTAGTACATTTTCGGGTGTGCTAACAGATGAACAAGGAAGGGTCCGAGCTATTTGGGGAAGCTTCTCTACTCAGAAGAAGAAAAAGAGAAGAAAGACAAAAACTGGGAAAAGAGGAGAGAAGGCAATATTTACTCAAACTTCAAAAGGCTACCTGATGCTGAAATTTGGCGGCAGTACATCAGAAGATCATCAATTTGTGAGGGGCATCCCGATTTATGCAATAAGCCAGGTCCTGGACAAGATTATATCTGGTACGACTGGAACACCTCTTCTCATAAATGGTGTCAAAAGACCTATGCCCCTTCTGAGAATTTTAGAGGTTGAACTTTATCCAACATTACTTTCAAAGGCTCGCAGTTTTGGACTAAGTGATCATTGGATTCAGGCACTTGTTAAGAAAGACCCAATAAGACGACAGGTTTTACGTGTTAAAGGTTGTTTGGCTGGATCAAAGGCCGAGAATCTTTTAGAGCAAGGGGACATGGTTTTAGCAATCAATAAAGAACCAGTTACATGCTTCCATGACATTGAAAATGCTTGCCTAGCTTTAGACAAATCTTATAGCGATGATGGTAAGCTTCAGATGACTATTTTTCGGCAGGGTCGAGAGGTTGAACTTCTTGTGGGAACTGATGTTAGGGATGGAAATGGCACAACTCGTACAATTAATTGGTGTGGTTGTATTGTTCAAGATCCACATTCAGCAGTGCGTGCTCTTGGATTTCTTCCTGAAGAAGGTCATGGTGTATATGTGGCAAGGTGGTGTCATGGGAGTCCTGTACATAGATATGGTCTGTATGCTCTTCAGTGGATAGTTGAAATTAATGGAAAACCGACTCCAGATCTAGATTCTTTCGTTAATGTAACAAAGGAACTGGAGCATGGAGAGTTTGTTCGTGTAAAGACGATTCACCTCAATGGTAAGCCACGAGTCCTAACATTGAAGCAAGATTTGCACTACTGGTCTACATGGGAATTGAGGTTTAATCCAGAGACTGGAATTTGGCATCGTAACATAATCAAGGGATTGAACTGTAGTTCTGATGAATGA

Protein:

>Am03G023250.1
MGDPSERLGSEGLDSVATVKAEDLCMEIDPPFQENVATAEDWRKALSKVVPAVVVLRTTATRAFDTESAAASYATGFVVDKRRGIILTNRHVVKPGPVVAEAMFLNREEVPVHPIYRDPVHDFGFFRYDPSAIQFLSYEEIPLAPEAASVGLEIRVVGNDSGEKVSILAGTLARLDRDAPHYKKDGYNDFNTFYMQAASGTKGGSSGSPVIDWQGRAVALNAGSKSSSASAFFLPLERVVRALRFLQKGSETYVDKWKAVSIPRGTLQVTFLHKGFDETRRLGLRSETEQIVRHASPASETGMLVVDSVVPGGPGYKHLEPGDVLVRVNGEVITQFLKLETILDDSVNTNIELQIERGGTSNSLTLLVQDLHSITPNYFLEISGAIINPLSYQQARNFRFHCGLVYVTEPGYMLYRAGVPRHAIIKKFAGEEISCLEELISVLSKLSRGARVPLEYISYMDRHRRKSVLVTVDRHEWYAPPQIYTRDDSTGLWNAKPAFQPDSLLLSSGAKDVGNLDRQPISLTGEHACGGHVCEGNNQELVDGITSMETNYEDPSEPVSHNNASDGLVKKQRVDEDSSNDGSVVADLSLNGCQETKPEKSSAIQDDGLMNYQGSPATTGNASVAERVIEPTLVMFEVHVPPSCMLDGVHSQHFFGTGVIIYHSQTMGLAAVDKNTVAVSSSDVLLSFAAYPVEIPGEVVFLHPVHNYALISYDPSALGPVGASVVRAAELLPEALRRGESVYLVGLSRSLQATSRKSVVTNPCAALNIGSADSPRYRATNMEVIELDTDFGSTFSGVLTDEQGRVRAIWGSFSTQKKKKRRKTKTGKRGEKAIFTQTSKGYLMLKFGGSTSEDHQFVRGIPIYAISQVLDKIISGTTGTPLLINGVKRPMPLLRILEVELYPTLLSKARSFGLSDHWIQALVKKDPIRRQVLRVKGCLAGSKAENLLEQGDMVLAINKEPVTCFHDIENACLALDKSYSDDGKLQMTIFRQGREVELLVGTDVRDGNGTTRTINWCGCIVQDPHSAVRALGFLPEEGHGVYVARWCHGSPVHRYGLYALQWIVEINGKPTPDLDSFVNVTKELEHGEFVRVKTIHLNGKPRVLTLKQDLHYWSTWELRFNPETGIWHRNIIKGLNCSSDE*

Promoter(3k):

>AM03G023250.1
TTCCTAATAGTAAATAGTAATACAGCTCTAGATACACTTTTTTTGAGGTACATTTATCACCAAAAAACAGCTCCTAAACTCTTTAGAAGCTCATGCGAACAATTTAGATTTGGCTTAATTACAGTTTTGGTCCCCTTATTTTCATAAACTCACGATTTTAGTCTTTTAAGAATTTTTTTCACGAATTTAGTCCCCCTATTTTCACTAACTCACGATTTTAGTCCCTCAAAAATGTTTTTTCACGAATTTAGTCCCCCTATTTTCCCAATTTGTAAAATCAAAGTCCCCTTTTAATTTGGTCAAAATTGGCACTGAGTTGTCAGTCACTTATCCTACGTGGCTGACATAGTGGCTTACCTTGTTGGAATTTAAACATAAACATTATTATTATTATTACAAAAATTGTTTTTTAATTATTATATTTAATAAATAAAAGTTCCATCTTCTTCATTCGATACTTCCTCTCCATTCGCGAACCTAAACCCAGCAAACTCAACATCATTCATTCAAAAGCAAACTATATAAACATCAGTATTGCCTCTAGGAATGTTTGATTATAGTTTCTAAAAATAGTTTTGTGTTTTTGTCCAAAAAAAAGAATAATTTTGTGTTTATAAAAGTTGATAACGTTCTGTCAAAAAAAAAGTTAACGAAGAATAATATTCTTGTGAATTTGGAGTTCAAATTTACTTCATTAGATATACTTTACTATCGAAGTGAGTTTTGAATCTCTCAAAAAGACATTTCCATACACATGATAGGACCAAATCCACGACAACGTGCTTAAGAAACTAATCTATCTGCTCGTGATTATACCTACTTTTCACAAATTGCAGCTAGTTTGCTTTTGAAGGAACGAAGAAGAAAGGTGGAATTTTTATTTATTAAATATAATAATTAAAAAACAATTTTTGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTTTATGAAGGGGACTATGATTTTACAAATTGGAAAAATAGGGGGACTAAATTCGTCAAACAAATTCTTGGGGAGCTAAAATCGTGAGTTGGTGAAAATAGGGGGACTAAATTCGTGAAAAAAATTCTTAGGGGACTAAAATCGTGAGTTGGTGAAAATAGAGGGACCAAAACTGTAATTAAACCTTTAGTTCTTTTGGTATAAACCGGGTATTCTCTACGCGCAATTGCAAAGACTAATCACTCGAGTCGGGTAGGACTACAATGTGCGGTAAAACTCTCCCTCAAGAGATTTAATAATTTAGTTGAATTCTTGGTAAAAGTAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAAGACCAAGTAAAGTTTTTTTTTGCCTTAATTACACTTTTGGTCTCCCTATTATCACCCACTCATAATTTTAGTCCCCAAACTTTTTTTTCATGAATTTAGTTCCCCAATTTTCCCAATCTCTAAAATCACTGCCCCTCTCTAATTTGGTCAAATGTTTTGCTGACTTTTCACTCATTAATCCTACTTGGAATGACACATTGTACTGACATGTTGGATTCTAAAATAAAATATATTATTGTTTTGGTTAAATAAGAAAGAACAACTTAATCTTTTTCTATCGAGACCCACATAATTAATTTCATGATCTTTATTTTTTTGGATTAAAAATAAGATTTTTTAATTTAAAATCCAACATGGCAATCCAAGATGACATTTGACGTAGAATTTATGAGTAACATGTCAGCAAAATGTTTGATCAAATTAGGGAGGGACAATGATTTTAAAAAATGAGAAAATAAATAGACTAAATTTGTAAAAAAAATTTAGAAACTAAAATCGTGAATGAGTCATAATAGGGGGACTAAAAGTGTAATTAAGTTTTTTTTTGGAAGCACCAAGTATAGTTACAACTAGGGGTGTTCGCGGTGCGGTTTGGTTCGGTTTTGAGATAAAAAGTGAACCGAACCGCAAGGTAAAACTACATGCGGTTTGGTTTGGTTCGGTTGGCTTCCTAAAATAAAACCAAACCAAACCAAACCAAACTAATGCGGTTTGAATTGGTTCGGTTGGTTCGGTTTTTTCCAAGACAAAACATAATTTAAAATGAAGTTAAAATTAACTAACATTAAAAATGGCTAACTTAAATCTTTAAGAAAAAATCTACTCAAATATATGTAGTATATAAATTACGCTCTTTTAATTCTTTTAAGATAGTTAAGACAATGTTTAAAAGAATTTGAATTAAATATTTTATTGTAATTTTTAAATATAGCATAACAATATAGATTGTTTGTAAGTGAGTCAAAGAATTAATTGTATTTGGGCTAGTAAGTGAGTGAGAGTTGGGTTTTAGTTGCATTTGGGCTAGTAAGTTAGTAAGGAAGGTTGTAAGTCAATAAGTCTTAGTGTTACTTGCGGTTTGGTTTGGTTTAGTTCGGTTTCTATAATCAAAACCGCGAACCGAACCAAACCGCGCGGTGCAATGAAAAAAAGAACCGAACTAAACCAATAAGAAGCGGTTTTTTGCGGTTTTCGGTTTGGTTTGGTTCGGTTTGCGGTTTTCTATTGGTTTGGTTCGGTTTTGAACACCTCTAGTTACAACTGCATATATAAGTATATTAAGAAAACGAATATTAAGATGGGAGATGATTATTGTTTTTTTTTTGGTACAAGATATATGGGAAATGATTTACGTTGTGAGATCATTGGTTCATAATTGTAAGTAAGAAGAGTTCCACCCAAAAATAATAATTGTATGAAGAGTAAGATTGATTTTTATTTGCTGTTCTGACCGGGTCTTCTTCCAAAAACACGTTACCTGTATGCACTGAATTCCGTTGCGAAGCGCGCAGCACTCACCCGGTGGTACTACTACTAGTTTAGTGGTCATCTCATTAGCGTGGACTAGAGACACTTATGAGTTGAGTGAGTGTGGCGTGACTGATTATTAGCTTTTCACACCAAATCATCAACCCAACCCTAATCACTTAGAGAAAGTGAACAACCATTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF12812.10	PDZ_1	373	446	4.50E-24
PF12812.10	PDZ_1	1010	1086	4.50E-24
PF13365.9	Trypsin_2	74	220	5.30E-23
PF02163.25	Peptidase_M50	301	372	1.60E-16
PF17820.4	PDZ_6	305	357	4.10E-16
PF00595.27	PDZ	279	339	1.70E-12

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0006508	proteolysis	Biological Process
GO:0043231	intracellular membrane-bounded organelle	Cellular Component
GO:0043155	negative regulation of photosynthesis, light reaction	Biological Process
GO:0009644	response to high light intensity	Biological Process
GO:0005737	cytoplasm	Cellular Component

InterPro

InterPro term	Description
IPR001940	Peptidase S1C
IPR043504	Peptidase S1, PA clan, chymotrypsin-like fold
IPR009003	Peptidase S1, PA clan
IPR008915	Peptidase M50
IPR025926	PDZ-like domain
IPR036034	PDZ superfamily
IPR041489	PDZ domain 6
IPR001478	PDZ domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A0R0HTR5	_

SwissProt

SwissProt term	Description
DEGP7_ARATH	Protease Do-like 7

KEGG

KO	Description	Enzyme
K22686	pro-apoptotic serine protease NMA111	[EC: 3.4.21.-]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G03380	DegP protease 7
Medicago sativa L.	MsG0380015303.01.T01	_
Oryza sativa L.	_	_
Cucumis sativus L.	Csa020409	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur002186s00035495.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_31200T	_
Arachis hypogaea L.	AH03G38500.1	Protease Do-like 7 like

Expression pattern