Gene detail

Detail information of Am03G013920.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am03G013920.1	myb domain protein 116

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am03G013920.1	mRNA	Chr03	38020462	38021746	-

Sequences

CDS:

Protein:

Promoter(3k):

>AM03G013920.1
ACTAAATTATATATAATTTAATATTAATTTACAAATTCTACGTAGTTATTGATTTTTTACGAAAAATAAGTTAATAAAAGAGTAAAATAAGAGTAGATTATTGATTTTTATTAAAAAGTATGCTGCCCTGTTGGTGCTCCCGTTGCCTCTCTCGTTGCCGCTCCCGTTGGCGCTTTCATAGGCGCTCTCATTGTCGCTCCCATGCGGGTCACAAAAAATAGCAAATGAGATTTAATTATTGATTTTTTGAAGAAAAATTATTTTCGAATTTTTTCTAGTGGTATCGTTTTTTTGACAATTAGTAGTGGTTAAATTAATTGGTTCGTAGTTAAGTTGATTGATTTTATTAATTTGAGTAGAATTTTATTAAATAGTAAATCGTAGCTAATTTTATATTTGTTTAATAATAATAATTAAATTATTAGATTTTAAAAAAAGTTATTTTAGAGTTTTTGGTAATGATTGAATTTTTATTGACAATTATTAGAAGTTAAAATAATTTGTTTTAATAGATTGTAATGAATAATAAAGTAAATTAATATTTTATGTCATTTGAAAAAAAAAAGCCAACGTCAGTTTTCATCCGTCTGCCAACTTTATGTCATTTGAATTGTTTTAGTAGATTGTAATAATAATAAAGTAAAGTAAGGTGTGCGTCAGTTTTCATGCATCAGCAAAATGTCTTTTGACAAAAAAGGTATAGTGATGTAACTAATGGAGGGAGGGCAGGATAGTAATTTTGGTGGAGGGTTAATGGCAACTATTTATAGTAGATTGTCTTAATTATATCACTTGATATTATTTAAATTCTATTTTAGAATAATACATTTAGGGTCGACCAGTGTTATTAAACTCGGCCCAGAACTGGTGTTGCGTAACACCCTTAATTTTAATCGTCATTAATTTTTGATGAATATAAATTATTAATTTAACTATTATGGTTTGGAAAAAATATAAATTATATTCATAATAAACTTTTCCTTCAAGTTTTTTACTTTTATAACTCGTAATTTTTTTATTACCTTGTTATTGGTGGTAGTATATATCTATCGACTTTGCCAATAACTAATCTGCGCTCGGAAGTCTGACTGACCACGTGTACCCGGTTTTGTCTAGGGGTGTTCGTGGGTCGGTTTGGATCGGTTTTGACCAAATTCGTTGCCCGAACCAATGATAATTATTCGGTTTGGGTTGGTTCGGATTTTACATTTTTTCCTCCAAAATTCGAACCAAACCGAACCGATATTGGACGGGTTGGTTTGGATTGGGCTCACGGGTCATTCACTAAAATATTAATTTTCTAAAATTTAAAAAACAACATTTTTTTTTATGATATTCCAACACTTTAAATAGCTAAAAAAACTGAAAATCACACGAAATCAAACTCAAATCCACTAATAGTCTTCACATTCATAGTATTAAAATTTTACAACTTAATCATAAATTATTAAGCTAAAAACTCTAAGCAAATAAAATCGTGTGCATCTAAAATTACAAAATTGTTATGACGTAATATGGGTTGGTTCGGGTTCGCGGATTTGATTTTTAAAATCCGTTGTCCGATCCAAACAACTACGGGTTGGTTTGGATTTGTTCGATTTTGACTCGAACACGAAAAATATCCGAACCGAACATATCGGTTTGGATTGGATCGTGGGTTGGTTTGGATTTGCCCGAACCACTGAACACCCCTAGTTTTGTCGCTCTGTGTGGTTCTAATCTCTCAATAGAGTTTTTGTCACACCCAAAATTCCAACTCAAGACTTTGGGGTGGAATATGAACTCACTTACCAGGCAGACCAACTCTTATATATTGGTGTAATTTTTTTTGTTTCATCTTCTCATTTAAAAAGATTTAATTTATACAATAAAAAGATCTCACTTTAAAGTTTAGTTTAGGCCTACAAATATGTTTACCACTTCATCATTGAAACCGCAGTTTATTTGACTAAGCTTTTCTGTAAGCTGAACTCTCCTCACTCTTCAGCTTTAGCCACCTGATTGAGAAAAATGCAATCATCCCGCCATTGAAACCGCTCGCTCTCTTTGCTTGATTAACAACAGCAAACGCTGAAAGTTATGCAACCATACCGATTCATAAGTCAATTATTGCAGCACAGCAGCAGTGACTGACTGACTATTATTCTTCTATAATTTGTGTTGTTCAAAAGCAGAACGCAATGGAAAATTTCCGGACGAACGGAAACCACGCACTTTTTCAAATGCTAAGGTGGATGGACATCATGCGACAGCTCACAAATGACAATCAATCCAAGTATGATTCCTAGCAGACTTTCCTTGCCTCCCTTTATTATCCCAACACCAATAACAACACGTTTTTAGTAAATTTTTCTTTAGTTCAGTCAACCACGTTTCTGTCACTGTTATTATGAGTTGTGATCCCATACTTTATCAATTTTTCAATGCCTTAATCACATGATAAGTGTTGAACATATACTAAATGTCCATATCAAAGGTTATCGATCTATAACTCTCTCTCATTTTGGGGAGACTTTTCTTGACACCTGTATATAGAATATTGAGTCATCAATATGGTATGCAATTTATTATTTGACTCACTAGAACAACTTAGTCCAGCCTTAGGCATAACCTTATAACAGTAATTTCTAATTTTTATTTTTATCTGGAATTCTGGAGTAAGACTAATGATCATAAAGTAATGCAATTGTCATTTTGTGAAGAAGAAAAAAAGATAAAATGCCAAGCAATGAACCTATCCATATTTCAATGTTTTCTGTGTACTATGGAAAGTGAATGGAAGGTGTCATATGGAATTTATCTCTTAGAAAAGTAATAAAGTGTATAGTACTTACTTGACCCCAAAAATGGGATACACTATATAATATTATTATACCATGTACCTTGCGTATACCATTTTGCTTTGAAACTCTAGTTTCTTTTTTTCTTCATTCTATTTAAGTCCTGCATAATATATATAAATATATGCATACTTTTTTAAAAAATTTATAGTCAGTGAGA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00249.34	Myb_DNA-binding	17	64	6.90E-32
PF00249.34	Myb_DNA-binding	70	113	6.90E-32
PF13921.9	Myb_DNA-bind_6	20	78	6.20E-19
PF13921.9	Myb_DNA-bind_6	74	118	6.20E-19

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	MYB

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005634	nucleus	Cellular Component
GO:0006355	regulation of DNA-templated transcription	Biological Process
GO:0003700	DNA-binding transcription factor activity	Molecular Function
GO:0003824	catalytic activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component

InterPro

InterPro term	Description
IPR001005	SANT/Myb domain
IPR044676	MYB-like transcription factor EOBI/EOBII-like, plant
IPR017930	Myb domain
IPR009057	Homeobox-like domain superfamily

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A8B8KCG6	_

SwissProt

SwissProt term	Description
MYB62_ARATH	Transcription factor MYB62

KEGG

KO	Description	Enzyme
K09422	transcription factor MYB, plant

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G25340	myb domain protein 116
Medicago sativa L.	MsG0180005953.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g03720.1	MYB family transcription factor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa008970	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000201s00012376.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_63020T	_
Arachis hypogaea L.	AH13G24560.1	Transcription factor MYB21 like

Expression pattern