Gene detail

Detail information of Am03G011330.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am03G011330.1	Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am03G011330.1	mRNA	Chr03	30948861	30954379	+

Sequences

CDS:

>Am03G011330.1
ATGAATCTATCCACATTGGTTCCGATGAATCCACCACTCAAGTTACTCTTCTCAGCGGCGCATTTACTTCTCATTTTACTCTCATCTTGCCATGCCTCACAGCCGGAGCTCCGATCTCTACTTGAATTCAAGAAAGGTATAACTTTAGATCCACTAGGTCGAGTTCTCGACTCATGGAACCTTTCTTCTCTCAAAGACACCACCGCATGTCCTCACACTTGGGTTGGAATCATCTGCGACACCACCACCGGCAACATCACCGGCGTAATCCTCGACCACTTCGACCTCGTCGGTGAACTCAAGTTTCACACTCTACTTGACCTCAAAGTGCTTAAAAACCTAAGTCTCTGCGGTAACCGCTTCACCGGACGTTTACCGCCTTCTCTCGGTACACTTACTTCTCTTCAGCATTTAGATCTTTCCAATAATTACTTTTACGGTCCTATCCCTGAACGGATCAATGAACTTTGGGGACTTAATTATCTTAATTTGTCGCTTAATCAATTCAAAGGCGGTTTTCCTACTGGTCTTAACAATCTTCAACAGTTAACGGTTCTTGATTTGCATTCTAATAATTTCTGGGCTGATATTGGAGATTTACTTCCCACTGTGCGCAACATTCAACACCTTGATTTGAGCCTCAATGTTTTCTTTGGAGGACTTTCACTCACTCTTGATAATGTTTCAGCTTTGGCTAATACTGTTCGTTTCTTGAACTTGAGTCATAATAAGTTGAATGGCGAGTTCTTTCCAAAGGATTCCATTAGCTTGTTTCGCAATTTGGAAGTTTTGGATTTGAGTGATAACTTGATTAGAGGGGAGCTTCCTTCTTTTGGTTCCTTGCCTGCTCTTCGGGTTGTAAGACTTGCTCATAATCTCTTCTTTGGGTCTGTGCCGGAGGACTTGTTGCAGAGTTCATTGTCCCTTGAAGAATTGGATCTTAGCGCCAATGGCTTTACGGGATCAATTGCTGTAATTAACTCTACAACTCTAAATGTTTTGAATCTTTCATCAAATGGTTTATCAGGCTCATTGCCAACATCTTTGAGGAAATGTACAACCATCGACTTGAGCAGGAATATGTTATCCGGTGACATCTCTGTTATACAGAACTGGGAAGACACATTGGAGGTTATTGATCTGAGTTTAAACAAGCTGTCAGGATCCCTGCCTCCTATTTTAGGGACATATTCAAAATTGTCTACAGTTGACTTAAGTTTTAATGAACTCAATGGATCCATTCCAGGTAGTTTAGTTACTTCATCATCACTGGCAAGACTAAATCTTTCTGGAAATCATTTTACAGGGCCACTTATGCTTCACAGTTCAGGGGCAAGTGAATTACTACTTATGTCTCCTTTTCAGCCACTGGAATATCTTGATGTATCTAATAACTCTTTGGAAGGTGCCTTGCCTTCTGATATTGGTAGGATGGGCGGGCTCAAACTGCTGAATCTGGCAAGGAATGGCTTTTCCGGAGAGCTTCCAAATGAAATGAGCAAACTTAGTTATTTGGAGTTCCTCGATTTGTCTAACAACAAATTTACTGGACATATTCCTGATAAGCTTGCATCTAGCTTGACTGTATTTAACGTTTCAAATAATGATCTATCTGGTAGCGTTCCTGAAAATTTGCAGCGGTTCCCTCCTTCATCCTTTCACCCTGGAAATGCAAAGCTAAAGTCACCAAATAATTCTCCTGGATCTTCTTCAGTGCCAGACAGTATTCCAATTAAAGGTAAACATCATAGTTCAAAGGGTAGTATCAGGATAGCTATTATTGTTGCATCCGTTGGGGCTGCTGTGATGATTGCTTTTGTTTTATTGGCTTATCATCGAACACAATCAAAAGAATTTCATGGAAGAAGTGAGTTTGCTGGCCAAACCACTGTAAGAGATGTCAAGTCAGGAGGACATATGAGGCCTTCCCTCTTCAAATTCCATACAAATGCTCAACCCTCAACAACTTCATTAAGCTTTTCAAATGATCAATTGTTGACTTCCAATTCGAGATCACTCTCTGGACAGTCAGAGATTATAACTGAACTTTCTGAGCATGGCTTGCCTCAAGGAATGGTAGCAACTAGTTCGGCATCTGTAAATCCTAACTTGATGGATAACCCTCCCACATCATCTGGAAGGAAGTCTTCTCCTGGTTCCCCATTATCGTCCTCGCCACGTTTTATAGAGGCTTGTGAAAAGCCGGTGATGTTGGATGTTTACTCACCTGATCGACTGGCGGGTGAACTGTTTTTCCTGGATTCTTCACTAGCATTCAGTGCAGAGGAATTATCTCGAGCTCCAGCTGAAGTTCTCGGCAGAAGTAGCCATGGCACGCTGTACAAAGCTACTCTGGACAGTGGTCATATGTTGACTGTTAAATGGTTAAGGGTGGGGTTGGTCAAACATAAAAAGGAATTTGCTAGAGAAGTTAAAAGGATTGGTTCTATAAGGCATCCAAACATTGTCCCTTTACGAGCATACTATTGGGGACCTAGGGAACAGGAGCGGCTTCTTTTAGCTGATTATATTCATGGGGACAGCTTGGCCCTCCATCTCTATGAGACAACACCCCGGAGGTACTCGCCACTGTCATTCAGCCAGAGAATAAAAGTTGCTGTTGATGTCGCAAGATGTCTTTTATACCTTCACGATCGAGGGCTACCCCATGGAAACCTGAAGCCGACAAACATTCTGTTAGCAGGCCCTGATTACAGTGCTCGTCTTACAGACTACGGTCTGCATCGGCTCATGACGCAGGCTGGAATTGCAGAACAGATACTAAATCTAGGAGCACTTGGATACCGTGCTCCAGAACTCGCTACTGCATCCAAACCAGTTCCATCCTTTAAGGCTGATGTGTATGCACTTGGTGTGATCCTAATGGAATTATTAACGAGAAAAAGTGCAGGTGACATAATATCAGGACAATCAGGTGCTGTTGATCTTACAGACTGGGTTAGGCTGTGTGAAAGAGAAGGAAGGGTAATGGATTGTATAGACAGAGACATTGCAGGTGGAGAAGAATCCTCTAAAGAGATGGACCAATTGCTTGCAACATCTCTCAGGTGTATTCTCCCTGTAAATGAGAGACCTAACATCAGACAAGTTATTGACGATCTCTGTTCTATATCGGTTTGA

Protein:

>Am03G011330.1
MNLSTLVPMNPPLKLLFSAAHLLLILLSSCHASQPELRSLLEFKKGITLDPLGRVLDSWNLSSLKDTTACPHTWVGIICDTTTGNITGVILDHFDLVGELKFHTLLDLKVLKNLSLCGNRFTGRLPPSLGTLTSLQHLDLSNNYFYGPIPERINELWGLNYLNLSLNQFKGGFPTGLNNLQQLTVLDLHSNNFWADIGDLLPTVRNIQHLDLSLNVFFGGLSLTLDNVSALANTVRFLNLSHNKLNGEFFPKDSISLFRNLEVLDLSDNLIRGELPSFGSLPALRVVRLAHNLFFGSVPEDLLQSSLSLEELDLSANGFTGSIAVINSTTLNVLNLSSNGLSGSLPTSLRKCTTIDLSRNMLSGDISVIQNWEDTLEVIDLSLNKLSGSLPPILGTYSKLSTVDLSFNELNGSIPGSLVTSSSLARLNLSGNHFTGPLMLHSSGASELLLMSPFQPLEYLDVSNNSLEGALPSDIGRMGGLKLLNLARNGFSGELPNEMSKLSYLEFLDLSNNKFTGHIPDKLASSLTVFNVSNNDLSGSVPENLQRFPPSSFHPGNAKLKSPNNSPGSSSVPDSIPIKGKHHSSKGSIRIAIIVASVGAAVMIAFVLLAYHRTQSKEFHGRSEFAGQTTVRDVKSGGHMRPSLFKFHTNAQPSTTSLSFSNDQLLTSNSRSLSGQSEIITELSEHGLPQGMVATSSASVNPNLMDNPPTSSGRKSSPGSPLSSSPRFIEACEKPVMLDVYSPDRLAGELFFLDSSLAFSAEELSRAPAEVLGRSSHGTLYKATLDSGHMLTVKWLRVGLVKHKKEFAREVKRIGSIRHPNIVPLRAYYWGPREQERLLLADYIHGDSLALHLYETTPRRYSPLSFSQRIKVAVDVARCLLYLHDRGLPHGNLKPTNILLAGPDYSARLTDYGLHRLMTQAGIAEQILNLGALGYRAPELATASKPVPSFKADVYALGVILMELLTRKSAGDIISGQSGAVDLTDWVRLCEREGRVMDCIDRDIAGGEESSKEMDQLLATSLRCILPVNERPNIRQVIDDLCSISV*

Promoter(3k):

>AM03G011330.1
TCCTATAAGATAAATTTTAATTACTATTTTTATAAGAGAAATCTACTTTTATTTTATTAAATAAGTATTAGATGACTTATATTAATTAATAAAATAAGATAAAACACACTTAAATATTTGTAACCAGATATTAACTAAAGACTATGAAGTTATTTGAGCGGCACGAGTATCTCATTACCGGTCCCCACTCCATTGACAACGGGTAATAGAACTACCATTTAATTTTACTAACGAGAACTCGTTCGTGTTCCTCACAAGTTTTATCCTCGAGTACCGAGTACTCGTGGTACGATTTTATTTTGCCACCCCTAAATGAGCCCCCGATAGATGATATTATTTCAGATTCAAAGGAATGGTCAAAGTAGGAAATCCCAAATTGTAATGTCTGGAAAATGGGAATAGGAGTTGAAGTTGAGCTGTGTGGGGTGGGTGCATGTGCATCATATCATATATCATATCATTCTATTTGCACCCTCCCACTCCCAGACAAGACATCCTCTTAATTTTATTTCTTTCCTTCATTGTCCACCCATCTCAATCTGCCCCCAATATCTCTGCTTCCTACTTCACGCCGTTTCTCTTTTGGATTTTTCCTTCCCCTCAATTTTAAATATATAGCATATAGCATACTCCCCCTTCCCCCTTTTTCCATCACCTTATTAATATAGATTAAAAAAGAAGTTTAACATTTAATTATTTACACATTATTTCTTTCCAGATTTTGAAGAGAAGTAGAAATTGTTTTTTCGTTTTTTACAATTATTAAAATTGCCTTTTTAGTGATTTCCTATTTATTGAAGATAACATTTAAGAAAAACTACTTAAAACGGTTTTCCATTTAGAGTAGTTTTTAGATTTTTTTCAGATATTATTTTTTTAAAAAATTGTAACAAATATATGTAAACTTTTAAAATTGATAAATTTTATCAAATTGATTCTATATGGATTAATAGAAAATCATTGCCTAAAAAGGCATAATCGTACGTGATAACTAATTTTAATTATTTATCTGAATATTTTAATCATTAACAACAAAAAAATAAATCTTTTGGTATAAACGATTGAAAATCATTATCTACCTATGAACTTAACATTGTTCTTAACTATACTTGTTAAGTTGTTATCCGTATTGGCGTACATAAAAAATAGGTAGTATAACATAAAAAATGTTATTTTTAGTCAAAAATTTTCACTAAAAAATAACCAAAAATTAATTTACAACATCAATTACCTAAGTTTTTTAGGTTATTAACTAAAAGATTTGGTTAATTGGTTACTTAGTTAATAGTCTAAAAAGCTTAATTAATTGATATTGTAAATTATTTTTTGGCTAAACTGCTGGATTAAAAAAAATGAGTATCGGTTGGTAGTAATGGTGACGGAAGCGGAAACTAACTGTAAAGTACTTGTAGTTGGCACTGATATTGTAAAAAGACGACAAAACATATATACAAATACAATACACAAGCACAAACAACACCCAGAGAGGGAGAGATATTATAGTATTATTATACTATACTATTACTATTACTACTACTGTATTTATAATAATAATAAGCTCTCACACACACTCATGGTTAAACAAGAAGAGAGCGAATTATTAAGGGCAACAAGACGGTGACGGCGTGAAGAAGCCGTTGGATAAATGTCATGCATGTGCGTTGTAGGGCTGGAAATTGGATGAGAGAGAGAAAGAAACCGAAGGCTAAAGTTTCCGCTAATCTTACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGATAAAATACACAGACAGACACAAAGAGAGAGTCTGTCTATGGGTTGGGTGGGAGCAACAGCACAGCAAACAACACAACAGAACAGAACAGAACACAAGACAGTACAGAGTGAATGAATGAAGGGCGAGAGGACGATGAGGTTGTTTGTGTCCTTTACAGTCTGTAGTTACTCACTCCCACCAACCAACACTCTCCACCTCACCCCCTCCCATTTCCTTTCTCTCATCTTTGTTACTAATCATTATTTATTACTCCTCCTTATCATGTTTATGTTAACATAGATTAAGGAATATTCAATTATAAATATTGTTATATTTTAATTAAAATATTTAATTTATATATTTGTTATATTTTATATATTGTAAAAAAATGATTTAATTTATATATACCGCTTGAATATAGTACTTCTTTATAGTAGCAAATAATTACGAATTGTCATCTCATTAAAAATATCAACTTCTTAATTATCTAAAAAGTTATTTATATACACCCAAGAGCGCTCCAAATTGTTTGGATCTATTCCAATTTAACTAAGATTTTAGGTTCGAATACAACATTTGCGAGAGAGCTTTGCTGTCTATTGTGGGCCTTCCCGACTTCATGGATTAGTCTTCTACAATTACGTACAGAAGATATCAATTTTAAAAACATTATTTATATCATGCTCTATAATTGATTGTGGATGTAATACTCACCAACAATACAATACAGAAGAACTAAATTGCATTTCTTATTTATTTTATTATAGTAAGTACTCAATTCATTCCTTTTTACTTGCTTTGTAAAATAGTTTTACACAAATTAAGAAAATTAATAAAAATTTTATTTTAATAAAATTATTAATTTTTTAACTATACTATTTTTTTGACCAAAAACTATAAGTTTTTATCTACTACAGTTATTATAATTTCCATACGAAATAATTTAAAATATAAATATTAAAAAATTATTAATATAGTCTTAAACGTAAAAAGAATATTAAATAAGAATTTAAGAAAGATAAACAAAAAAAATCAAAAGATGAATAAATATAGAAAGAAGTAGCAATTATCACCCTCCTTATTAAGAGTATTATTTTTTATTTCCATTTCAGTTTCTACTATTTCCCAGCCCTTTCTACTTCTTCTACTACTCTCTCTCTTCTTCCGTTCAATGTGAAGTTAACCTTCTCCTTCTCCTTCTAGGGTTCCTCTTTCTCCGTCGATGAATAATTAAACCGTGTACGGTTAACTACATCTTTTGC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	770	1038	8.80E-30
PF12799.10	LRR_4	260	298	5.00E-26
PF13855.9	LRR_8	457	515	2.50E-22
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	770	967	5.50E-22
PF08263.15	LRRNT_2	35	80	3.50E-08

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.9.3:RLK-Pelle_LRR-III

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0005737	cytoplasm	Cellular Component
GO:0006353	DNA-templated transcription termination	Biological Process
GO:0006355	regulation of DNA-templated transcription	Biological Process
GO:0003690	double-stranded DNA binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2YCL7	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y5020_ARATH	Probable inactive receptor kinase At5g10020

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G10020	Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein
Medicago sativa L.	MsG0280007708.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os07g43350.1	expressed protein
Cucumis sativus L.	Csa012045	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000225s00014729.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_64210T	_
Arachis hypogaea L.	AH20G23600.1	Probable inactive receptor kinase At5g10020 like

Expression pattern