Gene detail

Detail information of Am03G000400.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am03G000400.1	translocon outer complex protein 120

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am03G000400.1	mRNA	Chr03	1175251	1179489	+

Sequences

CDS:

>Am03G000400.1
ATGGATACTGAGGTTGATGTTCTTAATGGGTATGGTGAGGGAGAGGGGAAGAGGATTGACGTCGTCGTGTCTCAAGAGAGTATTTTGAAGGATTTGGAAGGAGATGGGGTTTTTGAGGAAGCAATGGACCCACAAAACCTTTTCCATGATCAGGATAATGTTGTTCTTGGTAAAGGCAACGATGCTGCTACGGCTTTTGTTGATGAAATCCCTGAAGCCGCAGATGAGCTGGATAACTTTGAAGAGGCAATTGGGGTTGCTGATGAATCTGGCAAACACTGCAAGGGTGGAGGATCTTCTGAAGAATACTACTGTGTGATGGATGATTGTTTTGAAATTAGTGATGGAAAGCATGTATCTGATTCAAACATCGATGGAGACATGGCATTTCATGAGAATAGAGACTTGGTTGATGTAAACTCTGGTTCATCTAGTGAGAAGGCTGAAAACGAGGATCCTGAATACTTGACTCCTAGTCAAAATGGTGGTATGGTCTTGGAAAATGGAAACACAGACAAGGTGGATTATGTTGCTGAGCTTGGTACAGAATCTGAATCCAATGAGGGGATGCCAAACCAGGGTGCTGATGCTGTGGGTTTGAAGGAGGGTGGCTTCGATCCCGAGTATAGAGATGACAAAATAGAGGAACCGTTGAATGCCACAGGTGATCCTTGTGGTGAAATTCCAGTTGATTCAGGTGAAAATGCACATGAAGATTCAACTCATGGGAATTTAGAACATCAAGGTGAAATAATTATAAAAATGGAGGATGGAGTTCTTGGCAATGATACAATCCGTGACGATAAAAATGGCAAGGAAATGGGAATATCTGATAGTCAGAGTACTGAATGCAAAAGTTATAGTAATGGTGAAACTAAGGATACTAAAGCTGGATCAGATTCAGAACATCTGGAAACAATTGATGAAATGGGAGGAGCATCTCCAACTGTGGAGGAAAGAAAAGAGATACAAGCTGCATCCTTTTCAGAAAATTCTTTTGCTGATGAGACACCAGCCGTTCATGCGAATGCAGCTTATTTAAAAGAGGGAAGTACTAAGGATTATCGGTCTAAGATTCCTAATGAAGATAATCATGAGAATCATGAAAACTTGGCTGATGCTGGGAATCCTGAAAAGATACCAGAGAAAGAGGTGACTGAGAAGGAAACCGCTCAGATCCCTAAAGAACAAAACAGTGAGCTTGTTTTCTCATCTGGACAATCTGTTTCTACTAGTCCCCCACTTGTTCGTCCAGCTGGTCTTGGACAAGCAGCCCCATTATTGGAACCTGCTCCTCGAGCAATGCAGAAGTCTAGAGTGAATTGTACTGCATCTGATACACAGCCCCGAAAAATGGAAGACTCCTCAGTTGGGGAGCCTGAAGAGTACGACGAGACCCGTGAGAAACTTCAAATGATTCGGGTGAAGTTTTTGCGGCTTGCTCACAGGCTTGGACAGACACCCCACAATGTTGTTGTAGCACAAGTTTTGTATAGACTAGGACTGGCTGAACAACTCAGAGGGAGGAATGGTGGCCGTGTTGGTGCTTTTAGCTTTGATCGAGCAAGTGCAATGGCTGAGCAACTCGAAGCAGCGGGACAGGAACCACTTGAGTTCTCTTGTACAATAATGGTTATTGGAAAGACGGGAGTTGGAAAAAGTGCAACTATCAATTCGATATTTGACGAGGATAAATTTAATACTGATGCTTTTCATACGGGGACAAAAAAGGTCCAGGATGTTGTGGGAACAGTACAGGGCATAAAAGTACGAGTCATTGATACGCCAGGACTCCTATCTTCCTGGTCAGACCAGCGGCATAATGAGAAGATCCTGCACTCTGTCAAGCGCTTTATTAAGAAAACACCACCTGACATTGTGCTGTATCTTGACAGGTTAGATATGCAGAGCCGAGATTTTAGTGATATGCCCCTCTTACGCACGATTACTGAGATTTTTGGATCATCCATATGGTTCAATGCTATTGTCGTTTTGACCCATGCAGCATCTGCTCCACCTGACGGCCCTAATGGCACTGCTTCCAGTTATGACACGTTTGTCTCACAGCGCTCTCATGTTGTGCAGCAAGCCATTCGTCAAGCAGCTGGAGATATGCGACTCATGAATCCCGTGTCTTTGGTAGAGAACCACTCGGCATGTAGAATTAATAGGGCTGGCCAAAGAGTGTTGCCTAACGGCCAGGTTTGGAAACCTGATCTGTTACTCTTATCTTTTGCATCAAAAGTTCTGGCTGAAGCAAATGCTCTTCTTAAGTTACAAGATAGTCCACCTGAAAAGCCTTACACCGCTCGAACAAGAGCGCCACCATTACCGTTTCTTCTGTCGTCCCTTCTGCAGTCAAGGCCGCAATTGAAGTTGCCAGATGAGCAGTATGGTGATGAGGACAGTCTCGAAGACGATCTTGCTGAACCATCAGATTCCGATGATGAAACAGATCCTGATGACTTGCCACCTTTTAAACCTTTGACAAAGGCCCAGATCCAAAAGCTATCTAGAGCTCAGAAGAGAGCATATTTTGATGAGTTAGAGTACCGAGAAAAACTTTTTATGAAGAAACAATTGAAGGAAGAAAAGAGGCAACGGAGGCTGATGAAGAAAATGGCAGAATCAATGAAAGATATGCCAAGTGATTATCATGAAAATGTGGAGGAAGAAAGTGGCGGTGCAGCTTCTGTTCCTGTCCCCATGCCAGATTTGGCTTTGCCTGCTTCTTTTGATTCTGATAATCCCACTCACAGGTATCGGTATCTTGATTCGTCCAATCAGTGGCTTGTAAGACCTGTCCTAGAAACTCATGGATGGGACCATGATGTGGGTTATGAAGGCTTAAATGTAGAAAGATTGTTTGTTCTGAAAGAAAGGATACCCTTGTCTTTTAGTGGTCAGGTAACCAAGGATAAAAAGGATGCTAATGTTCAGATGGAAATAGCCAGTTCAGTCAAGTATGGAGAAGGGAAAGCAACTTCTTTAGGTTTTGATATGCAGACTGTTGGGAAAGACTTAGCTTACACATTACGAAGTGAGACAAAATTTTGTAATTTTAGGAGAAATAAGGCTACTGCTGGTCTCTCATTTACTCTCTTGGGTGATGCCTTATCAGCTGGGATTAAAGTTGAAGATGAGTTGATTGCTAATAAGCAATTTAGGTGTGTTATTACTGGTGGTGCAATGTCAGGGCGTGATGATGTTGCTTTTGGAGGCAGTTTAGAGGCCCAGCTGAGAGATAAGAATTATCCGCTAGGACGCTCATTATCAACTCTTGGGCTTTCTGTTATGGATTGGCATGGTGATCTTGCTGTTGGGTGCAATTTACAATCACAAATCCCCATTGGACGGTATACAAACCTTGTTGCACGAGCCAATTTGAACAATCGCGGGGCTGGACAAATCAGCATTCGATTAAATAGTTCAGAACAGCTTCAAATTGTCTTGATTGGTCTCATCCCTCTGCTTAAGAAGCTAGTTGGTTATCCTCAACAATTGCAGTTCGGACAATGA

Protein:

>Am03G000400.1
MDTEVDVLNGYGEGEGKRIDVVVSQESILKDLEGDGVFEEAMDPQNLFHDQDNVVLGKGNDAATAFVDEIPEAADELDNFEEAIGVADESGKHCKGGGSSEEYYCVMDDCFEISDGKHVSDSNIDGDMAFHENRDLVDVNSGSSSEKAENEDPEYLTPSQNGGMVLENGNTDKVDYVAELGTESESNEGMPNQGADAVGLKEGGFDPEYRDDKIEEPLNATGDPCGEIPVDSGENAHEDSTHGNLEHQGEIIIKMEDGVLGNDTIRDDKNGKEMGISDSQSTECKSYSNGETKDTKAGSDSEHLETIDEMGGASPTVEERKEIQAASFSENSFADETPAVHANAAYLKEGSTKDYRSKIPNEDNHENHENLADAGNPEKIPEKEVTEKETAQIPKEQNSELVFSSGQSVSTSPPLVRPAGLGQAAPLLEPAPRAMQKSRVNCTASDTQPRKMEDSSVGEPEEYDETREKLQMIRVKFLRLAHRLGQTPHNVVVAQVLYRLGLAEQLRGRNGGRVGAFSFDRASAMAEQLEAAGQEPLEFSCTIMVIGKTGVGKSATINSIFDEDKFNTDAFHTGTKKVQDVVGTVQGIKVRVIDTPGLLSSWSDQRHNEKILHSVKRFIKKTPPDIVLYLDRLDMQSRDFSDMPLLRTITEIFGSSIWFNAIVVLTHAASAPPDGPNGTASSYDTFVSQRSHVVQQAIRQAAGDMRLMNPVSLVENHSACRINRAGQRVLPNGQVWKPDLLLLSFASKVLAEANALLKLQDSPPEKPYTARTRAPPLPFLLSSLLQSRPQLKLPDEQYGDEDSLEDDLAEPSDSDDETDPDDLPPFKPLTKAQIQKLSRAQKRAYFDELEYREKLFMKKQLKEEKRQRRLMKKMAESMKDMPSDYHENVEEESGGAASVPVPMPDLALPASFDSDNPTHRYRYLDSSNQWLVRPVLETHGWDHDVGYEGLNVERLFVLKERIPLSFSGQVTKDKKDANVQMEIASSVKYGEGKATSLGFDMQTVGKDLAYTLRSETKFCNFRRNKATAGLSFTLLGDALSAGIKVEDELIANKQFRCVITGGAMSGRDDVAFGGSLEAQLRDKNYPLGRSLSTLGLSVMDWHGDLAVGCNLQSQIPIGRYTNLVARANLNNRGAGQISIRLNSSEQLQIVLIGLIPLLKKLVGYPQQLQFGQ*

Promoter(3k):

>AM03G000400.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF11886.11	TOC159_MAD	899	1162	2.90E-121
PF04548.19	AIG1	541	700	2.10E-33
PF01926.26	MMR_HSR1	543	630	5.40E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	CEPT

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0009707	chloroplast outer membrane	Cellular Component
GO:0003924	GTPase activity	Molecular Function
GO:0005525	GTP binding	Molecular Function
GO:0015031	protein transport	Biological Process
GO:0046872	metal ion binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR005690	Translocase of chloroplast Toc86/159
IPR024283	Translocase of chloroplast 159/132, membrane anchor domain
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR045058	GTPase GIMA/IAN/Toc
IPR006703	AIG1-type guanine nucleotide-binding (G) domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2Y9E0	_

SwissProt

SwissProt term	Description
TC120_ARATH	Translocase of chloroplast 120, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G16620	translocon outer complex protein 120
Medicago sativa L.	MsG0880046838.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os10g40110.1	GTP binding protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa013997	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000089s00008775.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_05690T	_
Arachis hypogaea L.	AH02G18890.2	Translocase of chloroplast 120, chloroplastic like

Expression pattern