Gene detail

Detail information of Am02G037370.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G037370.1	Sec-independent periplasmic protein translocase

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G037370.1	mRNA	Chr02	193305634	193308377	-

Sequences

CDS:

>Am02G037370.1
ATGGGACTGGTTACCACCACCACCACCACTGTTCCTATGAACTTCCTTCCGCTCCGAAACCACTTAACCTCCATTCGGATTAACAACTCCTCCGGCTTCAGCTTCCCTCTCTCTCGGCGGAGGAATAGTAATAGTATGGGTAGAAGACTCGTTTGCTTCGCTGTTGATGACGACCTCAGAAAGAACCAGCAACAACTTAGTATTAGTTCAACTCGTCTTGGCTCCGCCATCGAAGAAAGACCACCCGATATGCTTGATAGCACAAGTGAAGAAAATTTTGATCAAGATGGGGAAAGAGGTGCTATCTATGATTTTCTTTATCCTAGTAAAGAGCTTCTTCCTGATGATAAAGAAATGAGCATATTTGATCACCTTGAAGAGCTACGACAGAGAATCTTTGTATCGGTTCTCGCAGTTGGAGCAAGCATTTTAGGATGCTTTGCCTTTTCAAAAGACTTGGTATTGATTCTAGAAGCTCCTGTTAAATCAGAGGGTGTCAAATTTCTTCAGCTAGCTCCTGGTGAATTTTTCTTTACCACTTTAAAGGTGTCTGGATACTGTGGCCTTCTCTTGGGAAGTCCTGTCATTCTCTATGAAATCATAGCCTTCGTACTTCCAGGTCTAACGAAATCTGAAAGAGGGTTTCTCGGGCCAATTGTTTTAGGCTCGTCAGTTCTTTTCTATGCCGGAATAACCTTCTCCTACTTAGTTCTGGTACCCGCAGCATTGAATTTCTTCGTGAATTACGCCGAAGGTGCTGTTGAATCATTGTGGTCCATTGATCAATACTTTGAGTTTGTTCTGGTTCTTATGTTCAGCACAGGCTTGTCTTTCCAGGTACCTGTTATACAATTTCTATTAGGGCAAGTTGGATTGGTGACCGGAGACCAGATGCTATCGGTTTGGAGGTATGTTGTGGTTGGCGCAGTAGTGGCAGCTGCTATAGTTACGCCATCTACAGATCCTCTCACTCAAGTTCTTTTAGCGGCACCCTTATTGGGTCTTTACCTAGGTGGTGCATGGATGGTCAAGCTTGCTGGACGGTGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM02G037370.1
ATGGACAACTGCACTGATATATAAAAAAATACGGGGATAATTGCAATGATATATATAAAAACACGGGATAGATGCACTGATATATAAAAAAACATGGGATAACAACACTGATATATAAAAAAAAACACTGCACTAATATATAAAAACACACGGGATAAATGCACATATTGTTTTTAAATGATACTTTTACATTTTTAGTTTTAATATTTATCAATTTTTTATTTGAAACTCCTTTTTTATCTACTTTAAATTTTTCTTTATTTTCACGGGGTAATGTTCAGACTATTTAAATACTGTCTAAATTCATTCCTAAAAAGAACACGACAGCACCTGTCCGTATGCAAGTCATCATCTATAATTTACAATTGATTTTAGATTAATGAGATTTCAAACTAACGTTTCTATTTGAGGTAATCGTATGCCGTAACGCGATCGGCCCGTGCGGATGCACGGGTATAGTACTAGTATTTATACAACTAAACCACATATGATTTTACCAATACCCCCATTCTATTTAAAAGACACCTCAAATTTTTTAGGGTAAAAATGTCATTACACTCTATTTCTTCTTTTTTTTCTCTTTATTCTTACACTCTCTTTCTTACTTTTCACTTTTCTCTTACACTCTCTTTCTTTCTTTTTTCTCTTTCCTTTTCATTTTTCTTTTACACTCTCTTTCTTTCTTTTTTTCTTTTTACTTTACTTTTCCCATAAATAATTATTCTCGTTCTCTTATCACTTCACTTTAATTATTTTAACTAAATTTCTAAATTTATACAAACACTACTTTAATTAAAAAATTTAAACACCACTACTATAAACCTACTATCTAAAAAACAAGAAGACTTAATGACTATTTTAATTTGTAATTAATATTTAAAACAAATACTCATTATTGATAATCTAATACCTAACTTTAGTTATCTATTATAATTTACTAATCAACTAAAATAATCAATTGAAAATACGAGATAACTGCACTGATAAATAAAAAAACACGGGATAACTGCAGTGATATATAAAAAAACATAGGATTAATATTTACCATTGAATTTTATAATTTTTTTTGACAATTTATAATTAAAAAAACATGGGATTAATATTTTACCATTTATATTTATCATTTTTTTTGACAATTTATAATTAATATTTACCATTGATATATAAATAAAACATAGGATTAATATTTACCATTGAATTTTATACTTTTTTTTGACAATTTATAATTAAAAAAACACGGGATTAATATTTTACCATTTATATTTATAATTTTTTTTGACAATTTATAATTGATATTTACCATTGATAATTATAATTTTGAAAATCTACTATAAACCTACTATCTAAAAAAACACGGGATAACTGCAATAATCCATTATAATCTACAAATCAACTCAAATATAAAAACACGGAATAACTGCAATAATCTACTATAATCTATTAATCAACTCAAATAATCAATTGAAACTATGAGATAACTGCAATGATATATAAAAACACACGGGATAAATACACCAATATATAAAAAAACACAGGATTAATATTTGTCATTGATAATTAAATTTTTTGAAGACTACTATAAACCTACTATCTAAAAAACAATAATATTTAATGATTATTTAAACTACTGATTAATATTTAAAATAAATATTTCTTATTGATAATCTATTATCTCTCTTTTACTATCTACTATCTAAAAAATAAGCAGACTTAATGACTATTTAAATTACTAATTAATATTTAAAACAATTATTTTTTATTGATAATCTACTATCTAACAAATTCTATCTACTATAATCTACTATCAACTAAAATAATCAATTGAAACTACCAGATAACTACACTGATATATAAAAAACACGGGGATAACTGCAGTGATATATAAAAAAACACGGGATTAGTATTTGCCATTGATAACTATAATTTTTGAAAACTACTATCTAAAAAAACAAAAAAGCTTAATGACTATTTAAACTGATTAATATTTAAAACACACGCGACAAATATTTGTCACTAATACCAAAAAAAGGACAAATAAATGTTACTCATATATAAAAAACCATGGGATAAATATTTGTTATTGATAATCTACTATTTATCTTTTACTATCTACAATAATCTACTAATCAACTCAAATAATCAATTGAACCTATGAGATAATTGCACTGATACATAAAAAAACACTTGACAACTGCACTGATATATAAAAAATACAGGGATAACTACAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAACACGGGATAGTTGCACTGATATATAAAAAAACATAGGATAACAACACTGATATATAAAAAAAACACTGCACTGATATATAAAAACACACCGGATAAATGGACATATTGTTTTTAAATGATAATTTTACATTTTTAGTTTTAATATTTATCAATTTTTTATTTGAAACTCCTTTTTTATCTATAAATTTTTCTTTATTTTCACGGGGTAATGTTCAGATTATTTAAATACTGTCTAAATTCATTCATTAAAAGAACACAATAGCACCTGTCCGTATGCAAGTCATCATCTATATTTTACAATTGATTTTAGATTAATGAGATTTCAAATTAACGTTTCTATTTGAGGTATTCGTATCACGTAACGCGATCGGCCCGTGCGGATGCACGGGTATAGTACTAGTTTTTTAGTATAAAACACTTTTTTTAACCACGTCAAACTTTTTTTGTTTTTTTACTGAAGTCAAACTATTTTTTATTTTTTTTGACACAACAAACTATTTTTTATAAAAGCACAATTTTTGCTTAAAATTGATTTACAAGGTGGATGCATGTTTAATCTCAAAGAATAATATCGTGGTTTTAAGTAGAGGAAGTGCAAAATATCATCGTCATCACACTCGAGGAACACGCAAACCAAATCGTATCTAACGAGAGCCAACCGTTTGAGGGTGGAAAGAAAATTGACGCCTCCGTGGCGTGGCCGAAGC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00902.21	TatC	123	331	2.30E-59

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	Tat

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0033281	TAT protein transport complex	Cellular Component
GO:0043953	protein transport by the Tat complex	Biological Process
GO:0065002	intracellular protein transmembrane transport	Biological Process
GO:0009535	chloroplast thylakoid membrane	Cellular Component
GO:0045038	protein import into chloroplast thylakoid membrane	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR019820	Sec-independent periplasmic protein translocase, conserved site
IPR002033	Sec-independent periplasmic protein translocase TatC

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9QU95	_

SwissProt

SwissProt term	Description
TATC_PEA	Sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
K03118	sec-independent protein translocase protein TatC

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G01110	Sec-independent periplasmic protein translocase
Medicago sativa L.	MsG0180005898.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g31680.1	uncharacterized protein sll0194, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa001040	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000293s00015216.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_63680T	_
Arachis hypogaea L.	AH19G39650.1	Sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic like

Expression pattern