Gene detail

Detail information of Am02G030620.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G030620.1	Signal transduction histidine kinase

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G030620.1	mRNA	Chr02	174597025	174603082	-

Sequences

CDS:

>Am02G030620.1
ATGGCATTGCGGTCTTCGACTGTCGTGATCTTGCTGGCATACGGTGCGCTGATAGCTCTTGCCTCATTAATGCCATGTTGGTATGTCATGGTCACACATATCGAGAGACGTGTGAAATCGGACTCAGAAAATATTGTATCCCTATTGCAGTCAGAAATTGAATACTCAACTGAACTGTTACACCCAATGAAATCATCATCAACAAACTTGGCGAGATTATTGAGTTCAGCCCTTGATTCTACTAATATCTCCTTCTCTGATATTGACACCAAGGTGGCTCCATTATTATTTCAAGCATTTGAGACAGTTCCTCACTTAACCCAAATCTCATATATTGGGGTGGAAGGTCTCTTTTTTTCATACTGTAATGATCATGATCAAGCTCTAGCAATGTACTCCAACTCATCATCATCATCATCTTTGTCTTTTGGTGGCGGTGCCTCAAATAAATCCTTGTACTATGTCCAGCCTGTGAATCGTGAAACTGGAAAGGTTTTTGGAGAAGCCGTAATTTTTAACTCTTCCATCAATGCAAGTTGGATTCAGGAAGCACCTAATCTTTCAGATGGGGTTGCCTCATTGGGAACCAAGTGGAGCAATGGCCATGATCTGTTGTTCCTCAGTTCAGCTAAAATCTCAAGAATAGGAGTGATCTCTCTGGGGTTTTCAGCAAAAGCAGTAACTAATTTTGTCACCCGTGTTGACCGTCAAGGCACAAGCTCGTATTTGGCTACCAAAGATGGAAAAATTCTTGTGGAAGGGATTCAACATACCAGTATGCTTATTTCTAACGATACTGTTTCCTTTCAAACAGTGAATGCAAATGGCAATCCTATTAGGACTGAGGGTACTGCGTCATGCAAGGGCGAAGCATTTGCTTCTAGTTTGAATATTCAGGATACTGAATATCTAATCCACTGCTACACCATTGATATAATGGGACTAGAATCGGTGTATGTTTTGGCTACTCCAAGAAATGGATTTGTTGGCTTTGATCACAGTTATATGAAAAGGGGATTGGCACTGTTGATTATAACGATGATCCTGATAATTGTTGCTGTCTTCAGTTTTCTATTTATAAATGCTAGAGCCATAAGGCGAGAAATGCATTTGTGTGCCTCGCTCATCAAGCAAAAGGAGGCCACCCACCAAGCTGAGCAAAAGAATATGAAGAAGAGCCTCGCTTTTGCGAGTGCCAGCCATGATGTTCGCACTTCTCTCGCAGGCATTACTGCTCTGATAGAAATGTCCTCTAACTTAGTCAACCCTGGTTCAGATTTGGCAAAAAATTTAATCCAAATGGAGGATTGTTGCAAATACTTACTAGGACTATTGAACTCTATACTCGACACAAGCAAACTTGAGGTAGGAAAAATGCAACTCAAGGAAGAGGAATTCGACGTATTCCATCTCCTAGAAGATGTAGTTGATTTATTCTATCCCGTGGCCATGAAAAAAGGTGTAGATCTTGTATTGGACCCTTGTAATGGTTCTGTTATAAAGTATTCACGCGTGAAAGGTGACAGGGGAAGACTTAAACAAATTTTGTGTAATTTACTGAACAATGCTGTCAAATTTACTGATCAAGGGCACATAACAGTTCGGGCATGGGCACAGAAGCCAGCATTACATAGATCAATAATCAAGACTAACCAACACAGTTTCATGAAACATTTATCATTCTTATTTTATAAGAAAAAAGAAGCACACAGGGACCTAGAGAAAGCCGTGAATTCAATCCAACAAGAGCTGCATTCTATGGATTTTGTGTTCGAAGTGGATGATACGGGAAAAGGAATTCCAAAAGAGAAGTACGAGTCTGTGTTTGAGAATTATGTTCAAATCAAAGAAACTGCTCTTGGCCAAGAAGGAACAGGATTGGGACTTGGGATTGTGCAGTCGTTGGTACGTTTGATGCATGGAAGTATTGAAATTGTTGACAAGGCTATTGGCAAAAAAGGAACATGTTTCAGGTTCAATGTGCTCCTCACTTTATGTGAGAGTGATACAGTGACGAATGGTAGCACAGGGGAAGGTCTTGAGTATGGATCAGTTGACATGAACCAAGTTCAGGGGCGAACCATTCATGCTACTACCTCTTGCTCAAACATTTGTTCCATGAGTCCCAGGTTACATATGTGCAGGTTTAGTCGTAGGCCCGGGGCTTCCCGTGTTGTTCTTTTGATTGGAGATGAGGAGCGCCGAAGGATTTCTCAAAGGTTCATGAAGAGGTTAGGGATTAAAGTTGAGGCAGTAGAGTGTCCAGAACATCTGTTATATACTCTCCAGAAGATCAAACAGGAGTGTCACCATTCTGGTGGCCAAAGTTCTCCAGAGTCTTCCGATTTGAGTTCTCGGTCCACATCTCATAGTTCATTTGCTAGAGCCAGAGGGGTTCCTTTGAGTGCTATGGATGGAACTGAGTATATATCTTCAGTGTTCAAGAAGACAAATATTGGTGCTGCCCCGGGTTTCGTCTTGATTGTCATTGATTCAAATGCAGGAACATTTTCTGAACTTTGTAGGATTGTATCCAACTTCAAGAAAGACCTGCCCAACAGTTGTAATGTTGTTTGGTTGGATAAGCCACTTATGCGTAGAGTCAATTCCCAAACAATTGATCAAAATGATATTGTCATATCTGAACCATTTCATGGCAGCCGTTTGCTCAAGGTCATAAAGCTTCTTCCTGAGTGTGGTAATGCTCGGCAAAGCAGTAAGATAGAAACAGCTCATGATAGAGCTGGAAGGACTAGTAGTAGAGATTCGAGCTTATCAAAATGTCAATCCCCTCAGTTGTTGGACAGATCAGATTCAGACGTATCGCAATCTTGTGAAAGCCCATGTCTGCGTGTTGAGCAAGTTTGGAAAGGAATTCAGAAATCATGCATTAAAAAGTCTCCTGTTCATCAAGGAGGCATACATCTACAAGAACATGGAGAATCAAGCTGTTACAAACCCTTACATGGCAAGAAATTTTTGGTTGTTGAGGACAATAAGATCTTACGAATGTTAGCTACAAATATATTGATTTCCCTCGGTGCTACTGTCAAGCAGTGTGAGAATGGTGAACAGGGTGTGCAACAAGTTGATGAGGCTCTAGCAAGGGGTATCCTAAATCCTCCTTATGATTACATCTTAATGGACTGCCAGATGCCAGTGATGGATGGCTTTGAGGCAACAAGACAGATACGAGAGATGGAGAAGTCTTGCGGTGTTCACATTCCTATCATTGCATTAACTGCAGACATTGACAAAATGACGGCAGTGACTGGAATGGATTTTCAAATAGAGAAGCCCCTTAATAGAGAGAATTTACTTGATGCCATTAGATACATAAACAGAAAATTGTGCATAATGTAG

Protein:

>Am02G030620.1
MALRSSTVVILLAYGALIALASLMPCWYVMVTHIERRVKSDSENIVSLLQSEIEYSTELLHPMKSSSTNLARLLSSALDSTNISFSDIDTKVAPLLFQAFETVPHLTQISYIGVEGLFFSYCNDHDQALAMYSNSSSSSSLSFGGGASNKSLYYVQPVNRETGKVFGEAVIFNSSINASWIQEAPNLSDGVASLGTKWSNGHDLLFLSSAKISRIGVISLGFSAKAVTNFVTRVDRQGTSSYLATKDGKILVEGIQHTSMLISNDTVSFQTVNANGNPIRTEGTASCKGEAFASSLNIQDTEYLIHCYTIDIMGLESVYVLATPRNGFVGFDHSYMKRGLALLIITMILIIVAVFSFLFINARAIRREMHLCASLIKQKEATHQAEQKNMKKSLAFASASHDVRTSLAGITALIEMSSNLVNPGSDLAKNLIQMEDCCKYLLGLLNSILDTSKLEVGKMQLKEEEFDVFHLLEDVVDLFYPVAMKKGVDLVLDPCNGSVIKYSRVKGDRGRLKQILCNLLNNAVKFTDQGHITVRAWAQKPALHRSIIKTNQHSFMKHLSFLFYKKKEAHRDLEKAVNSIQQELHSMDFVFEVDDTGKGIPKEKYESVFENYVQIKETALGQEGTGLGLGIVQSLVRLMHGSIEIVDKAIGKKGTCFRFNVLLTLCESDTVTNGSTGEGLEYGSVDMNQVQGRTIHATTSCSNICSMSPRLHMCRFSRRPGASRVVLLIGDEERRRISQRFMKRLGIKVEAVECPEHLLYTLQKIKQECHHSGGQSSPESSDLSSRSTSHSSFARARGVPLSAMDGTEYISSVFKKTNIGAAPGFVLIVIDSNAGTFSELCRIVSNFKKDLPNSCNVVWLDKPLMRRVNSQTIDQNDIVISEPFHGSRLLKVIKLLPECGNARQSSKIETAHDRAGRTSSRDSSLSKCQSPQLLDRSDSDVSQSCESPCLRVEQVWKGIQKSCIKKSPVHQGGIHLQEHGESSCYKPLHGKKFLVVEDNKILRMLATNILISLGATVKQCENGEQGVQQVDEALARGILNPPYDYILMDCQMPVMDGFEATRQIREMEKSCGVHIPIIALTADIDKMTAVTGMDFQIEKPLNRENLLDAIRYINRKLCIM*

Promoter(3k):

>AM02G030620.1
ATCCCTGAATGAAGCATAGATATTTTTTTAATATAAATACTAGAATTGTCTCCCCATGCAGGAATTATGATTATTGAAAATATATTATGTAGTATTATACATATTTTGATTAAATTGTCTAGAATAATAATTTAGTTTAATACAATTCTTTTGGTCAAAAAAAGTTTAATACAATTCTATTGGTCAATTATTTATTTAGACTTTTAATCTAAATCTAAACAACCAAAAAATGCATTCTTAAAAAAAACTAAAAAAATAAATAAAAGAAATTATATGTATATGTAGTTTATATATAGGGATTTTTTATACCCCCATCACATCCCATATACCCCCTATCACATCCCATATACCCGAAAATACCCATGTCCAAATAACAAAGCGGATTTACCTTAAATGGGGGTACCTAATAGGTAAATCCGACTTTAAAAATAACAAAGCGGATTTACCTCAGATCGGATTTACCTAGAGGGTAGATAAATCGATTTCCCTAAAAAAAGGAATTCGGATTTACCCCACCTAAGGTAAATCCGATTTTGTTATTAAAAATAATTGTTTTTTATTTAAATTTTTAAAAAAGTTTATAAAAATGCTACTAAAAAACCGTTAAAGAGTCAAAACTAATCCAAAAATTATAAAAACACTACTAAAAATCTAATAAAACCAAAATAAGTTTATGCAATTTTTTTTAGATTTTCTGGAAATTATGAAATATTAAAAAAATTAATAAAAAATAGTAAACGATGAAATTTGGGATTTTGAGGTCCTCTATCCTAAAAGAAGTCACTTCTTTAAGTGTCTTGATCCTTGATTTTTTTCGGATTTAATGGCTGTGGTTTCATTACAATTTGAGTAGGTTGCCCGAAAACTGATTTTTTAGCCTAAATTATTCGCTCGACGTACATCATCACGTGTTAACGAACTACTCACTAAACAGAACCAAAAGACGGTCGAAATTCGTATCTAATTTTTTAAATGATTTATTTATTTATTAATTAGGTTAACAAAGCGGATTTACCTTAAGTGGGGGTAAATCCGATTTTGTTATTTAAAAGCGGATATAAGGTAAATCCGCTTTTAAAAATAACAAAATCGGATTTACCCCCACCTAAGGTAAATTCGCTTTGTTATTTTTAAAAGTGGATCTACCCCATCTTAAATAAATCCGTTTTTAATTTTGTAAAATTTTAGTGGAAATCGGATTTACCTCACAAATACCTAAATCCTATTTCCAAAAAAAATTTGAAATCAGGATACGTTCGGGTTTTTTAAATTTTGTGAAGGGCAATTGCGTCTTTTCGCAGGGTCGATGGGGTAGATTGTCATCTGATGGGGGTACAAAAAAAAATCCCTAATATATATACATATATGATTTGAGAGCAACGATCTTAGTCCAAATGGTAATTGGACTTGGATCCCACTCTAAGGTCTCGAGTTCGAATCTTGGGTGTGGCAAAAACTCTATTGAAAGGAAGAAACTCGTGGTCAGCCAAGTTTCCCAGTGTAGATTAGTCACAGGCAAAAGCCGGTGGAAACTACACATCTTAGCAAAAAAAAGATACATATATGATTTGAGAATTCTACCATACCCTTAAATCATTATATGATACGTCTGATAAAAAAAATCATTATATGATACGTTTTTTTTTTGACAGCATTATATGATACGCTTAAAATCTTAAAATCTTAAAATAGCATATAAATGATGTACCAAAAAAAAGTGCATTTCAGTGCACCAGCTAAGGCGAAATTCTAGAGACGAGTTAGGCCAAATTCTAAGGTGGGAAAGAAAAGAAATGGAAATTTTGAATCTTTGATCGAAGAAAAAGGCGTGTCTCGAGCAAAGAAATCCCTTCAGTTGAGGTGAGTTCTCTGTAAAATGCAATTGCCAGCAATGGCGTTTCGTCATCCAGCTCTGCATCTGCTCCACTACACATGGACATGGAGACATAGGGATAAGGTATCTTTATTCGTATCATCTCATTTAACTCCTTTGCTAATCGATATATTCTCTGAATAATTAGGGAAACTGTTTCTATTATGCTTCTCAATTTAAAAGGAAACATTTCAAATTTCTTGAAATTAAAAAAGGCAAGGAAATAATCACGGAATTAACATTGATTTCATATCATCTGTGTGGAGAATTTATCATGATTGATTGATTAATTAATTAATTTGCCAGCTTCAAATTTGGGATAAAATAAAATAAAAATCTCTCTTTTTCATTGAAGGGAGGCACTGCTTATAAGTTCATAAGTTCATACTCAACATTTGAGAGTGTAGTAAGTGGCACACTCATTGGAACTATTGAATCATCATCTGCTGCATAAAAAAAGAGGGCTACTCCAGGTTAGTACTACCTCCATGAACATTGGTGTCTAACACTTCTTTGATTAGTTTGTATGAAAACAAATTCATAATATCATAATTTTTAGTAGTGCTCGGGCTTTTTATTTCATAAGAGTAACGTAGAAATCATAAGAAGTTTTTCAAATTATTAATTGATTATTTGATTGCTTTATTTTAGATACTGTGCAACTTATGTAATAGTACGAATTGTTTCAATTTTTAGAATGAGTGTGATCTTTTCACATAACATGAACGCAGATTGTATGCAATTATGAATATGATTTTTTTGGCTGGGATTATGTGATGTTTTGTGATCTGAATTTGGAAAAATTTAAATTATTAATTTAATTTTTCAAAATTTGAGTTACAATCATGGAGATTATATTGCGCAAAGAATTAAAATTTAACACTCTTGAGACACGTTTTCTCCAAATATCATGCCATGTATAATTAATTAATCATAATCATATGTATAGAACAAAAACAATTCTCGACATTTTTGGTTGCCAAAAGTTTACTGTTGTTAAAGCCCGTAGTATTTTAACCATTCAGTGTATCTACTTCAATATTATGATATAGAGTTTCCAATGCAGACAATACATTAACTGAGCAGATTGATTACATTTGGAAGACTCAATAAGCCTCTGCTTTTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF02518.29	HATPase_c	507	663	2.50E-25
PF00072.27	Response_reg	994	1111	4.90E-19

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	Others

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0080117	secondary growth	Biological Process
GO:0046872	metal ion binding	Molecular Function
GO:0009553	embryo sac development	Biological Process
GO:0010087	phloem or xylem histogenesis	Biological Process
GO:0042803	protein homodimerization activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR001789	Signal transduction response regulator, receiver domain
IPR004358	Signal transduction histidine kinase-related protein, C-terminal
IPR036097	Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor domain superfamily
IPR003661	Signal transduction histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor domain
IPR036890	Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily
IPR003594	Histidine kinase/HSP90-like ATPase
IPR005467	Histidine kinase domain
IPR011006	CheY-like superfamily

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A3Q7XP89	_

SwissProt

SwissProt term	Description
CKI1_ARATH	Histidine kinase CKI1

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G47430	Signal transduction histidine kinase
Medicago sativa L.	MsG0180005002.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os06g08450.1	histidine kinase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa013898	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000125s00010021.3	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_38360T	_
Arachis hypogaea L.	AH19G14090.1	Histidine kinase CKI1 like

Expression pattern