Gene detail

Detail information of Am02G030420.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G030420.1	SKU5 similar 3

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G030420.1	mRNA	Chr02	174070581	174073956	-

Sequences

CDS:

>Am02G030420.1
ATGGCTTCTAATGGTCCTCAACTGAGATTCATTCCATCTACAATTTTGCTGCTAGCATTTTTTGTTACAATAGTCACTAGTGCTGATATATTCTTTGATTGGCATGTTTCCTTGGACTTCAATATAACGCCAGTATCTGCAGATCAACCGGTTATAACAATCAATGGCTTATTCCCTGGACCACTTATAAATGCAACAACAAATGATAATATTCATGTTAATGTTTTCAATGATTTGGATGAACCTTTGCTGAATTCATGGCAAGATGGGGTATCTGGTACAAACTGCCCCATCCAACCTGGTACAAATTGGACTTATGTTTTTCAAGCCAAAGACCAGATTGGCACATTCTTCTACTTTCCTTCCATCAATTTCCTTAAAGCTGGTGGAGGATTCGGTCCAATTCGAGTCAACAATCGCGCTGTCATAAGTGTTCCTTTTCCAAAACCTGAAGCAGAGTTTGATGTTTTAATTGGTGACTGGTACAATAGTAGCTACAAGGATATTAGGTCAAGGTTGGACAAGGTGGATGATATTTCCCCAGGTTGGATGCTAATAAATGGAAAAGGACCATATATGAACATTTTTTCAAAGTCATATGAGACCTTCAATGTCACACAAGGTAAAACATATCTGCTTAGGATATCAAACGTAGGGACAGCTAGGGGCTTCAATTTCAGGATTCAAAACCACCAATTGCTTTTGGTTGAAGCTGAAGGATCTTATGTGAATCAGATAGAGTTGGAGTCTCTAGATGTTCATGTAGGCCAATCCTACTCAATTCTTGTCACAGCAAACCAAAATGCTGCTGATTACTACATAGTGGCCTCTCCTAAAATGACTCAAGCTGATAATAATAACAGTAATTTTGGCATTGCTGTGTTCCATTATAATAACTCTACCACACCTGCTAATGGTTCTCTCCCAAGTGGTCCTGATCCATTTGATTTACTATTCTCCATCAACCAAGCAAAATCCATTAGGTGGAATCTGACAACTGGAGCTGCAAGGCCTAATCCACAAGGAACCTTCAATGTAACAAATGTGACAATATCTCAGACATTTATTCTACGAGCATCGACAGCGACGATTGATGGAATATCTCGCTACACTGTCAACAATGTATCTTACTTGACCCCAGATACACCACTGAAACTAGCTGATCAGTTTTCCAATGGTTCTGGTGTATATGTTCTTGATGCTTATTCTAAGAACACTTCAAATGTTAATGCTGTGCATGATGTTTTTGTAGCAAGTGCATTGCATAAAGAGTGGGCGGAGATAGTGATCAAGAATGATCTAACCAGCATTGATTCTTGGCATTTGGATGGATATAGCTTCTTTGTGGTTGGATTGGGAGAAGGAGAATGGAGAGAAGAGTTACGGTGGAGTTATAATCTATATGACCCTGTAGTTAGGTCCACTGTGGAAGTGTTCCCAGGAGGGTGGAGTGCAGTGTATGTGTTTCCTGATAATCCAGGAATGTGGAACCTGAGATCACAGAAGTTGCAAAACTGGTATTTAGGTGAAGAGCTTTATGTGAGAGTTTATGATCCTGATCCTAACCCTGCTAAAGAGAAGCCCCCTCCACAGAATCTCCTTTTATGTGGAAAGTATCAACCTCCAGCTCCAACTCCTGCTCCCTCAGGGTCACCACCTCCACCACCCCCACCACCAAATGTCCCTTCATCCAAGGCATACAATCCACATACACCAAGGTCTCTATTTGCTATCATCACCACCACTGCCATTTTTTACCACCTCCCCCTCCATTGCTTCCAGCCCTCACCGATGCTGTTCAGCAGCTCGTCCAACTGCTGGCCCGACAGGAGGTCGTGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM02G030420.1
ATATTCAGTGTTTTTTTTTTTTGGCAGCTGGACAAGAGAGGTTTGGAACAGTAATAAGATCTTATTACAGAGGAGCACATGGAATCATTCTTGGTATGCTATATAAATTAGAAAGTTGAATTTATTTTATATATAAAAAATATAATCAGATTTGTCCATTATTATTGCTCTTCATATATACAAGTGATTCCCTTGAAAATAAGCATGTATAGGGCCTTTTCATTGACTACGGTAATTTTTCTTGTATATCCTGTTTTGGTCAGCTGTATTGTAAGCTATGCACAGTGCTTTGATGTACTAGTATCCCATGAGAGGAAGATTGTAGTATAAATGTTGAAGACTAACCTATAATTAAATCTCCTCAAAATGGCTTGTCCTCTACCCCTCTCCTCTCCTTTTCAGTATTCTAAATATTTTGAAGGGAATATGGTTGCCTCTTTAATGTGTTGACATATATTCTAACAGTTTTTTTCTTCAAATTTGTAATAATGTAGTGTATGATGTAACACGGCGTGAGACATTTACAAACCTGGTGGATGTATGGGCAAGGGAGGTTGAACTTTACTGCAGTAATCAAGATTGCATCAAAATTCTTGTTGGCAATAAGGTGGATAAGGTAAATTTTATGGTACTTATTATGGTCTTCAAATCCTTTACATACTTGGGGAAAAGACAGAAAACACCATACAGATTCTTGTTGATAATTAATTTGGCTTTTTTTGCTGCTGCACGTTTTTGTGGATTTTGAAGAGTTGACTTTTCATTTTTCAGGAGTGTGAAAGAGCTGTAAGCAAAGAAGAGGGTATGGCTCTTGCAAAGGAACATAGATGCTTGTTCGTAGAGTGTAGTGCTAAAACTAGAGAAAATGTTCAGCAATGCTTTAAAGATCTCACTTTGAAGATGTTAGAGGTGCCAAGTTTGAGGGAAAAGGGGTCTGTAGCAGTGAAGAGACAAAAGCGCATATATGAGACAACTCAAAGAGGTGGTTGTTGTTCTTAGTAAATATGCTAGCTGCAACATGAATGTGCCCAAGTTTTTTACAAAAAGGATACCACAGTTACTAGCTGGACCCACAAATTAGTTTAGATGAACACAAAACTCTTTATTATTTATGCTTTTTCTTACTTCTGTTATATAGTTTTGGAAACACATACCATATTTTACACCATATGTAAATATGTCTTCAGCATTGGTTTGGTCAGGAAATTATGTGTACTTTTGTTTATTGACAATTTCTATACAAATCATAATGAAGCTTCTATCTATCTGTTTCTATACAGCTACACAAATTCATTTATTCTTTTCATAGTGTATCTCAGATTCTCAATAAATCCAAGTCTCCCTCTATCTACAGATTAGTTCAATTTATTATTACTTGATGAAGAAGTAGTAGTAATCAATGTCAACATAATCGTGGAAAGTTAATGTTCCACACAAAAGTGTAGAAACTAAGGGTCTCTTTGATTTCCTTCTTAAAATTTGTTTTTCAGTTTTTTTTGACAAACATATTTTTCAAGTTTTAAAAAGAGAAAAACTTGATTTGTAAAACTGTTTTACAAAAACTATTTTCTTTTTGTTTTTAAAACTAAAAAACCAAAACAAATAACATTTGTTTTAAAAGCACAACTTTTCAGGATTATTCTGCTAACAAGGGCTGGTCTCAACTTTGTCAAAAAAGAGTGTTGGTCCGAGTAGTAAATGATTTGGGATCCCATTCTAAAGTCTAAAGTCTCAAATTCGAGTCTTTAGTGTGACAAAAACAGTTTTGCAAACAGCAAACTACACGAGTCGGTAAAGCTGGATACACGCGGCCAACTAATAAATACTGCGCACCATAAACATGATAACCAAAAAACTAAAAATCCAATACACAATCACACAAGTCCTAAGAGGGGGAAATTAAAGCTCCATTGGATCTTTCAAAAATATCTAATTTAAGTTGATCCAATACAAAGGGCCTGTTTGATAGTATTTTTCATTTTTTTAAGTTTTAAAAAGTGTTCTATAAAATAATTTTGAAACTGTTTTTTGTTGTTTTAATTTCGAAATTGTTTTTTAAAACATGTATTATTTGTTTTTATTCTCTTAGTTATAAAACAAGAAATTAAGAAATAATTTTAATAAACAACCTAATTAAACAAGTTTTTCATGTTTTTTTTTTCTAAAATTGAAAAACAGATTTTTAAAAGAAAACAACCTCCCAATGTCAAGAAAAAACCTCCTAATTTCTCTGACCTAAACATACATACATACATATAGTTTAAACCCAACGATAGGTAAAATAATGCCGTTGAATAAGATGATAAGATGAGCCTACTTAGCTTGCACGCTGGGATGTTGTGACACTACCCTTTTAGATTTAGTAATCCTCTTTTTTTTATTTTCTTTCTGTTTATACAGATGGAGCCTTGAACACCAACATGGTATAGCACAAGTGGTAGATACTTGGGCTCCTTAACCATTTGGTCAAATGTTCGATTCCTGGTCGGTGCATATGGAAAAATACCTGGTGGGAGATATCAACCCTCAGGGGATTAGTCTCTGCAGTTGCGCGTAGGGGATACCTTGGTTTACCAAAAAAGATGTAGCCTTGAGCCCGCATTACATTAATTGCTTAGTCTAATTTTAATCTAACATTATGCCTTTTCTAGGCTAAATTAAAAAAATACACAGCATGCTTCATATCAACAAAAATAAAACAAGGCATGCTATGCTTTTTCTTTGACACATAAGCATTGCATTTCAATTTGATTAAGTCAAACTTAGGGAAAGTTAATTACACAAAGTGAGTCACTATTAATCCAAATTTAAGGTCTTGTATTTTGGCCGGCTTCAGTACATGAATTTAATCGAACCTCTTGTACTTTTCTTCCTTGCATTTAGCAACTGATAACTTCAAAGCTATTTAAACTAACAACTTTTTAGCCGTTTGAAATGTAACAACTTAGATTAGAGGCAATGTTAGTCACAACCAACGGCAGAAATTAAGCTCTTCTCTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00394.25	Cu-oxidase	156	299	8.10E-37
PF07732.18	Cu-oxidase_3	44	140	1.10E-26
PF07731.17	Cu-oxidase_2	408	519	1.20E-24

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	ILT

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0060320	rejection of self pollen	Biological Process
GO:0016491	oxidoreductase activity	Molecular Function
GO:0005576	extracellular region	Cellular Component
GO:0003924	GTPase activity	Molecular Function
GO:0005525	GTP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR001117	Multicopper oxidase, second cupredoxin domain
IPR011707	Multicopper oxidase, N-terminal
IPR011706	Multicopper oxidase, C-terminal
IPR045087	Multicopper oxidase
IPR008972	Cupredoxin

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XZI8	_

SwissProt

SwissProt term	Description
SKU5_ARATH	Monocopper oxidase-like protein SKU5

KEGG

KO	Description	Enzyme
K19791	iron transport multicopper oxidase

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G48450	SKU5 similar 3
Medicago sativa L.	MsG0180004982.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os08g05820.1	monocopper oxidase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa010694	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000177s00010903.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr07_27230T	_
Arachis hypogaea L.	AH09G23570.1	Monocopper oxidase-like protein SKU5 like

Expression pattern