Gene detail

Detail information of Am02G030250.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G030250.1	PEP1 receptor 1

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G030250.1	mRNA	Chr02	173651866	173655608	+

Sequences

CDS:

>Am02G030250.1
ATGTGGTATCTCTTATTATTGCTTCTTTGTTTTTCTACCTTATTATATGCTGTTTCTGCCTTGAACTCTGAGGGGTTGAATCTCTTGTCACTGTTGAGCCACTGGACTATTGTGCCTGATGAAATAAACTCCACTTGGAAGGCTTCTGATTCCACTCCATGCTCATGGGAAGGAGTGCATTGTGATAATGCAACCAATGTAATATCTCTAAAGCTAAGTGGTTATTCAATTTCTGGTCAATTAGGATCTGAAATTGGACATTTGATTCACCTGCAAACCCTAGACTTATCAGAAAATGATCTCTCAGGAAACATTCCCTTAGAATTAAGCAATTGTAGCATGCTTAAGTACTTGGACCTTTCTTCAAACACCTTTAGTGGTCAAATCCATGAATCATTCTCTAGAATTTCTCACTTGGAAGATTTGTATCTCAACAACAATAATTTAAGTGGTTTCATTCCTAAAAGTATAGGGAACATCACTAAGCTTGTCTCGCTAGATCTTAATAGTAATCAGTTGTCAGGAACAATTCCAATATCCATTGGAAACTGTAGTAAACTGAGTTACCTGAATTTCGATTTGAATCAATTGGAAGGATTTATTCCTGAGAGTTTAAGCAATCTAAAAGAACTTTATGATTTAAGCCTCAATGATAATAATCTTGGAGGTACTATTCAACTAGGATTTAGAAATTGCAAAAAGCTATCTTATTTGAGTCTTTCATATAATAGCTTTAGTGGGGGTATTCCTCCAGGCTTAGGGAATTGCAGTGGCCTAATAGAGTTCTATGCTGCTGTGAATAATTTAGATGGCAGCATACCATCAACCTTAGGTCTCTTGCATAATCTGACTATGCTAATAATTCCAGTGAACCTTTTGTCTGGGAAAATACCTCCACATATTGGTAATTGCAAGTCATTGGAAATGTTACATTTGTATACCAATGGACTTGAGGGAGAAATTCCTAGTGAATGGGGAAATTTGAGTAAACTACGCGATCTTAGATTATATCAAAACCTTCTGACTGGGGAAATTCCACTTAGTATATGGAAAATTCAAAGCCTTGAGCATGTACTTTTGTACAACAATAGCCTCTCTGGGGTGCTACCTTTAGAGATGACAGAGCTGAAAAATCTGAATAATATATCATTGTTTAATAACCAGTTCTCTGGAGTTGTACCTCAAAGCTTAGGAATTAATAGCAGTTTGGTGCAGTTGGATTTTATGTATAATATGTTCACTGGTATTCTCCCACCAAATCTTTGTTTTGGAAAACAGTTAGTCAAGTTAAATATGGGTGGCAATCAATTTCATGGAAGCATACCTCCTGATGTAGGAAGGTGTACAACTCTTACAAGGGTGAGACTTGAAGAGAATAATTTTACCGGGCGTCTTCCGGATTTTGAAACTAATCCGAATATCTCGTACTTGAGCATCAACAAGAACAATATCAATGGGACAATTCCATCAAGTTTGGGAAACTGTACCAATCTCTCTCTTTTAGATTTATCCATGAACAAGTTAACAGGTCTTGTACCCTTGGACCTAGGAAACCTTGTGAATCTCCAAACTTTGGATATTTCTCACAATAACTTGGAAGGTCCTTTGCCACCTCGGCTATCAAAATGTACCAAAATGGGAAGGTTTGATGTGGGATTCAATTTCCTTAATGGTTCATTTCCATCAAGTTTGCGGAGTTGGACAACATTAACAACTTTAATTCTCACAGAGAATCATTTTAGTGGGGGTGTCCCAGCTTTCTTATCAGAATTTGAAAAGCTCACTGAGTTACAACTTGGTGGAAATATGTTTGGAGGAAATATTCCTAAATCAATTGGAGAATTGCAGAATTTGATATATGAGTTAAATCTAAGTGCTAATGGGCTGATCGGCGAGCTTCCTAGAGAGATTGGAAACCTCAAGAATCTACTAAGGCTGGATTTATCTTTGAACAATTTGACAGGAAGTTTACAAGTTCTTGATAAGCTCAGTTCATTAACTGAACTGAATATTTCACACAATTCTTTTGAAGGTCCTGTACCACAACAGCTGATGAAGTTACTAGATTCTTCTTTATCTGACAATCCTGGCCTGTGTGTTTCATTATCCAATGGCTTGACTGAGAACTTCACTAGAAGCAGCAATTTAAGGCTATGTGATGGCTCAAAATCAAAAAGTCGTAGTAAAGTTGCAATTGTGATGATACCACTTGGATCCTCAATACTTATTGTTCTGCTGCTGGGACTAATTTATATATATTTTGTTAGAAAGACTAAGCAGGAAGCCATCGTCACCGTCGAAAATGATTCTACAGCCCTTCTCAAGAAAGTGATGGAAGCTACAGAAAATCTAAATGATCGGTATATTGTTGGCACAGGAGCTGAAGGAGTTGTGTACAAAGCTGCAATAAGTCCAGACAGAATTTTGGCTGTGAAGAAGCTTGTCTTTGGTGAGGATGAAGGGGAACGCTTAAGCATAATGAGAGAGGTTCAAACTCTTGCAAAGATTAGGCATAGAAATTTGGTAAGATTGGAAGGTGTCTGGTTGAGAGAAAACTATGGTCTAATCTCTTATAGATACATGCCAAATGGAAGCCTTTATGATGCTTTGCATGAGAAGAATCCATTACAGTCCTTAGAATGGAGTGTCAGGAACAAGATAGCTTTTGGAATTGCTCATGGTTTGGCTTATCTTCATTTTGACTGTGATCCTGTCATAGTCCACAGAGACATCAAAACAAGCAACATACTTTTAGATTCTGAAATGGAGCCTCATATTGCTGACTTTGGTCTTGCTAAGCTTTTGGATCAGTCTTCTACCTCAACACAGTCAATATATGTCACTGGCACAGCTGGTTATATTGCACCAGAGAATGCTTATACAACAACAAAAGGTAAGGAGTCTGATGTATACAGTTATGGGGTGGTTTTGTTGGAGCTGATATCCAGAAAGAAGGCATTAGATTCATCATTTATGGAAGGAGTAGATATAGTTAATTGGGTCAGAACTGTGTGGGAGGAAACAGGTGTTATTGATGAAATTGCTGATTCAGGACTTGCCAATGAAATTTCAAACTCGGATGCAATGAAACAAGTAACCAAGGTGCTTTTGGTGGCTTTGAGATGCACGGAAAGGGATCCATTTAAGAGACCTACAATGAGAGATGTTGTCAAACATTTGTAA

Protein:

>Am02G030250.1
MWYLLLLLLCFSTLLYAVSALNSEGLNLLSLLSHWTIVPDEINSTWKASDSTPCSWEGVHCDNATNVISLKLSGYSISGQLGSEIGHLIHLQTLDLSENDLSGNIPLELSNCSMLKYLDLSSNTFSGQIHESFSRISHLEDLYLNNNNLSGFIPKSIGNITKLVSLDLNSNQLSGTIPISIGNCSKLSYLNFDLNQLEGFIPESLSNLKELYDLSLNDNNLGGTIQLGFRNCKKLSYLSLSYNSFSGGIPPGLGNCSGLIEFYAAVNNLDGSIPSTLGLLHNLTMLIIPVNLLSGKIPPHIGNCKSLEMLHLYTNGLEGEIPSEWGNLSKLRDLRLYQNLLTGEIPLSIWKIQSLEHVLLYNNSLSGVLPLEMTELKNLNNISLFNNQFSGVVPQSLGINSSLVQLDFMYNMFTGILPPNLCFGKQLVKLNMGGNQFHGSIPPDVGRCTTLTRVRLEENNFTGRLPDFETNPNISYLSINKNNINGTIPSSLGNCTNLSLLDLSMNKLTGLVPLDLGNLVNLQTLDISHNNLEGPLPPRLSKCTKMGRFDVGFNFLNGSFPSSLRSWTTLTTLILTENHFSGGVPAFLSEFEKLTELQLGGNMFGGNIPKSIGELQNLIYELNLSANGLIGELPREIGNLKNLLRLDLSLNNLTGSLQVLDKLSSLTELNISHNSFEGPVPQQLMKLLDSSLSDNPGLCVSLSNGLTENFTRSSNLRLCDGSKSKSRSKVAIVMIPLGSSILIVLLLGLIYIYFVRKTKQEAIVTVENDSTALLKKVMEATENLNDRYIVGTGAEGVVYKAAISPDRILAVKKLVFGEDEGERLSIMREVQTLAKIRHRNLVRLEGVWLRENYGLISYRYMPNGSLYDALHEKNPLQSLEWSVRNKIAFGIAHGLAYLHFDCDPVIVHRDIKTSNILLDSEMEPHIADFGLAKLLDQSSTSTQSIYVTGTAGYIAPENAYTTTKGKESDVYSYGVVLLELISRKKALDSSFMEGVDIVNWVRTVWEETGVIDEIADSGLANEISNSDAMKQVTKVLLVALRCTERDPFKRPTMRDVVKHL*

Promoter(3k):

>AM02G030250.1
ATGATTCGTTAACTTCGTCAATGTGACACGTTTATCTCATTTTAGTCCCTGAAAGTTGTCACTTACTGTCATTTTAGTCCCTAAAAGATGTCACTTACTCTCATTTTAGTCCCTTAAAACTCTTATGTTTCAGGGACTAAAATGACAGTAAGTGACATCTTTCAGGGACTAAAATGACAGTTAACGAAGCACATTAACGGGAGGGACTAACGTGACAGACAGATTACACATTGAGGGACCTTTTTGCATTTTCGCTCGAATGAGGGACCAAATTGACAGCGAGTTACACTTCCAGGGACCAAAATGGCTATTAACCCAATCGGTGGATTAGATTTTAATAGTAACTTTTATTTTTGTTTAATTAAAAAACCAACTTTGAAATCTGGATGATCCGATCTTTTTAGGATGGCTCTCAACTATCAGACTGCTTGACTGCACACGCAGTCCGACTGCACCTAAACCGAATCCTACTTATTCCACTCTCTCTATTCACCACGCACTCCAAGCTCTGCGAAATGATAAAAATACTCTTAATGAATAAAAAACTTCTAAGCGCGTCCCTTTTTAATGAGATTTAACGGGTACAACACCATGTTGCCGAACTTGGCACGGTACCATGGTGTTGTGGCACAATTTTTGCCAAACACCCCCCTTATAGGATTTTTAACAGGTACGACACTATGATTTCAAACTTGTAAGGTATCATGGTATCGTACTCACTAAATCTGTTTTTTTTAATTGAAAAACAAGGTTTGGTACTATAGAATCGTACCAATTCGGAACTATAGTGTCGGATCTGTGTTTTCCAAAAAATTTTAGACAATTCGATACTATAGGACCAAACATCCCTAAATGCAGAAAAAAATATGACAATGAAGTAACTGAGAAAGAGGAGATGGAGGTGGTGAGAGGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAAGGAGAAGAAAAGAGGGGAGAAGGTTGTGGTGGTGATGGTTAGAGGGAGGTGGTGGTGGTAGTGTTGGTCAGAAAGAGAAGGTGGTGGTGGTGGTGAGAGGGGGGAGGTGGTGGTGGTGGTGAGAGGGAGTGGGAAGGTGAAAGAGGGAGGGAGAGTGTGGGAGAATGGAGTTTTGGTGAGGGGTACTTTTCGAATATTTGAGGATTGAGAGTGTGGTGAGTAGGAGGCTGAGTGGAATAAGATTCAAGAGAAACTTAAACTTCATTACAAAGAAATCAGAAGTGGAAAATTATTAAACCTCTGTGTGTAAGAATTAAAGTAAGAAATAAAGAAGGTATGTTTCTAAAATGGATTAATGAAATAATTATGCTTATAGCAACATATGATAGATTTATGGGTCAAATATATTTTAAGTCACCATTAAAATGTGACTTTTTAATTTTTAAGTCTTGAATAATTTATCTTTTAACTTTTACTTCTCGCTTATATCTCTATTTGCACTTTTGGTCCTCACATATATCTATTTTAATTTTTTGTGGACGAACTATTGCGCTAAATCTTGCCTTGTCACACTTTAATGACTAAGATGTCAAATTACTTGACAGAGCAGGTGATTTGACATCATAGTCATTAAAAGGTGTAACTTAGTCGATGCCGACGTAACATTTTGTTAGCCAGTTTAACACCAAATTAACGTTAGAAAAATGTGATTTGACATTATAATTATTAAAAAGAAGAACGTGACGAGCTTCTTGAGAGCCCGCAGATGCTACTGTACCCCTCAAAAAAACACAGGTTTTTTTCACATACTACCTTCCCTTCGGAATCAAAAGAGATGCCACTGTGTTGTTCGAGGTTTGATGGGTTTTTCTGGGTGTTTTGAATCGATTTGAAGAAGAAAGAGATAAACAAAAATTGGCTGCAATGGAGTTGCAGAGATGGTTTCGGTACACACAAACAGAACAAATAGAGGGGAGGGTGAATAGTGAATAGAGAGAAAAAGAAAAATAATTAAAAAATATAAAGAAATGTGGAGAAAGAGAAAGTAATGCTATATTTTAAGCCTTGGACATAGCAAATGCTCAGTAACCATGATTTTACGACTTACATCACTTTTTTTGAACAAGCGCTGCACAAATGTATTACAAGTAATGTTATAATACCTTAAAAAATTATATTATACGAATAAATTTGATTATAATTTTCAAAAATATAAATTCAATTATAATAGTTTAGTTAGTATCTTGGTACCCCAATATTTTGAGCAAACTCAGTCAGTGGACGTGACATGTTCAAGTGTGATAGTCCGTTAGCGAGTTGAATATTTACTTAACGTCGTCGGGGATGAAAAGTGAAAACAAAATTATAAGTGGAGATCAAAAGTTGAAGAATTAAACTTTTATTAAGTACTAAAAATGAAAGTTGTATATTTTACGAAACTAAAAACATCTTTAATCGAGATTGACTAAAATAAATCGAATAATTTTTTTTTGGTTTGTAGAAGAAGTGGAGTGCCACTAGAAACTCACACACACAACTGTGATGTCTCGAGCTCAAACTCGAAACATGATACCCAACCTAGCAATTTCGGCATTTGCCGGTTGAACTAGCCCTTACGGATAAATAAATCGAATAGATGACGACTAATTAATAAGTTAAAACAGTTGTAAAAAAAATTAATAAGTTAAAACAGAAGAAATGCACTCAAGCCTTGTTTCCACCGTACCAAGTACCAACAAAGTAGTCGCTGACCCAACTACCCATTAATTACAATCAATATTCTACGCTTTGAACTTTGAAGAAAGTTGGAAGCAGCCAAAATTTATTCAACGCCCACTCTTATCTTCTACGTATATTTGTCCATAGCCCACAATTATATGAAGATCAAAGTTTCATTACTTTCAAGTTTCAACCATCCACTTAATTTTTCTCTTCCACCTTTCAGCTCTTTCCATGCAATTTCAGCTCCTCCATAACATATTCTAAAGCTTAGCTATAGGTAAATTCTTTTTCTTTTTCCTCTCAAAACTTTGCTACCCTTTATTAGCATCTCCTTCCTTTTCTTTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	789	1059	1.10E-43
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	789	1060	7.20E-38
PF13855.9	LRR_8	115	173	1.60E-36
PF13855.9	LRR_8	162	221	1.60E-36
PF13855.9	LRR_8	472	532	1.60E-36
PF08263.15	LRRNT_2	22	62	5.20E-07

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.12.4:RLK-Pelle_LRR-XI-1

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0071944	cell periphery	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0033612	receptor serine/threonine kinase binding	Molecular Function
GO:0003723	RNA binding	Molecular Function
GO:0016757	glycosyltransferase activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR013210	Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR003591	Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2XYX8	_

SwissProt

SwissProt term	Description
RPK1_IPONI	Receptor-like protein kinase

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G73080	PEP1 receptor 1
Medicago sativa L.	MsG0180004965.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os08g34640.1	receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa018799	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000095s00007012.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_01090T	_
Arachis hypogaea L.	AH18G00070.1	Receptor-like protein kinase like

Expression pattern