Gene detail

Detail information of Am02G029360.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G029360.1	multidrug resistance-associated protein 4

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G029360.1	mRNA	Chr02	170871160	170878675	-

Sequences

CDS:

>Am02G029360.1
ATGTCCTCTTCTTCAGATGCAACTTGGATTACTTCCTTCTCATGTTTATCACCTTCAGGAGGAAAAACTTCAACTCTACCTCAATGGTTGAGATTTATTTTCCTCTCTCCATGTCCACAAAGAGCTCTTCTTTCAGCCGTTGATGTTTTACTCTTGTTCACCTTCTTTGTTTTCGCCGCCGTTAAAATCTACTCAAGATTCACTTCCAATGGTGCAAGAACCTTCAACTCAGAGCTCAACAAACCTCTAATAAGAAATAACAACAGAGCTTTAACCCAAACAACTATATGGTTCAAGTTAACGGTAACAGTAACGGCTGTTTTGACAATATTGTACACTGTCGCTTGCGTTCTTGCATTTACCAATTCCACTGAGGTGCAGTGGAAGCCAGTCAATGGACTATTTTGGTTACTTCAGGCTATAACACAATTAGTCCTTGTAATCTTAATAATCCATGAGAAAAAATTTGAAGCTGTTGTTCACCCTTTGTCGCTTCGATTATATTGGATTGCGAATTTCCTTGTTGTTTCTTTATTCACGGCTTCTGGGGTCATACGTTTGGTCTCTGTCACTTTTATTGTTGATGACGTGGTGTCCTTCATTTCCCTTCCTCTGTCACTTTTTCTGCTCTTTGTTGCAGTTAAAGGATCCACCGGGATTATTAAGTCCAGTGAAGAAACACAGCCGATTATTGAGGAGGAAATTAAGCTGTATGAAAAACTCAATGTTACTGGGTTTGCTTCAGCTTCTGCTGTATCCAAAGCCTTTTGGATTTGGTTAAACCCGTTGTTGAGTAAAGGGTATAAGTCACCTCTTAACATTGATGATATTCCGTTTCTTTCACCACAGCATAGTGCTGAAAGGATGTCTGTTATATTTGAATCAAAATGGCCTAAATCAGATGAGAGATCGAAGCACCCGGTTAGAACAACGTTGCTTCGATGTTTCTGGAGGGAAATAATATTCACTGCTATCCTTGCTGTTATTCGGTTATCTGTCATGTTTGTAGGACCAGTTCTTATTCAAGATTTTGTTGATTTCACAGCAGGGAAACGTACTTCTGTTTATGAAGGATATTACCTAGTGTTCATTCTTCTGTTAGCTAAATTTGTTGAAGTTTTAACAACTCATCATTTTAACTTCAATTCTCAGAAACTTGGAATGCTTATTAGATGCACACTCATAACTTCTTTGTATAAGAAGGGATTGAGGTTAACCGGTTCTGCTAGGCAAGATCATGGTGTTGGGCCTATTGTGAATTACATGGCAGTTGATACTCAACAATTATCTGATATGATGCTTCAGTTACATGCTGTTTGGATGATGCCTTTTCAAGTTGGTATTGGTTTGTTCTTGCTTTACAATTGTTTAGGTGCTCCAGCGATTACTGCACTAATTGGACTTAGTGCTATTATTGTGTTTATTGTTGTGAGTACTAGAAAGAACAAGGGTTATCAGTTTCAAGCAATGATAAATCGCGATTCGAGAATGAAAGCTGTTAATGAGATGCTTAATTACATGCGTGTTATCAAGTTTCAAGCATGGGAAGAGCATTTTAATGACAGAATCTTGGAATTCCGTAGGTCTGAGTTTGGGTGGCTTTCTAAGTTTATGTACTCAATTTGTGGCAATATTATTGTGTTGTGGAGCACACCAATGTTGATATCGACTCTTACGTTTGGTACCGCGCTTTTGCTTGGTGTTAAACTGGATGCTGGAACTGTTTTCACTACCACAACTGTGTTTAAGATCCTGCAGGAGCCTATTAGAACTTTTCCTCAGTCAATGATATCACTTTCACAAGCACTGGTATCATTGGGAAGGTTAGATAGGTACATGTCTAGTAGGGAATTGTCTGATGATTCGGTTGAGAGAGAGGAAGGGTGTGATGGACACATTGCTGTGGAGGTTAAAGATGGAATTTTTGGCTGGGATGATGATGGTCAAGAACAAGATTTGAAGAATATTAATTTGAGGATTAATAAAGGGGAACTCACAGCTATTGTTGGTACTGTTGGGTCAGGAAAGTCTTCTCTTCTTGCATCAATTCTTGGTGAAATGCACAGAATTTCTGGAAAGGTTCAAGTTTGTGGGACTACTGCTTATGTTGCACAAACATCTTGGATTCAAAATGGGACTATTGAAGAGAACATTCTCTTTGGTTTGCCAATGAACAGACAGAAGTACAATGAAGTTGTTCGGGTTTGTTGCTTAGAGAAAGATTTGGAAATGATGGAGTATGGAGATCAGACCGAGATTGGAGAGCGCGGCATCAACCTTAGTGGGGGCCAGAAGCAGCGTATACAACTCGCCAGAGCTGTTTACCAAGACTGTGATGTTTATCTTCTTGATGATGTCTTCAGTGCCGTTGACGCACATACGGGCACTGAAATATTTAAGGAATGTGTGAGGGGAGCTCTAAAAGGAAAAACCATTGTTCTTGTAACACATCAAGTAGACTTCTTACACAATGTGGATCTTATAGTGGTGATGAGGGAGGGAATGATAGTCCAAGCAGGGAAGTACAATGATCTACATGATTCTGGGTTGGATTTTGGTGCTCTAGTAGCTGCACATGAGACATCTATGGAACTAGTAGAACAAGGTGCAGTAACACCCGGTGAAAAATCAATTAAATCTCCTAAGGCAGCTTCTTTTAATAACAGAGAAACCAATGGTGAAAGTAATTCTCTTGACCAACCCAAATCTGCAAAGGGAAGTTCTAAACTCATCAAAGAAGAGGAGAGAGAAACTGGGAAAGTTAGCTTAAATATCTATAAACTCTATTGTACTGAGGCTTTTGGATGGTGGGGTATTACAGCAGTTCTACTTCTTTCTGTGTTGTGGCAAGCAACTATGATGGCAAGTGATTATTGGCTTGCATATGAAACTTCAGAAGAGCGTGCTGAATTGTTCAATCCTTCTGAGTTTATTTCCGTTTACGCGATTATTGCTGTAGTCTCCGTTATTTTCATAGTGCTAAGATCATACTCAGTTACTATTTTGGGGTTAAAGACAGCACAGATTTTCTTCTCTCAAATTCTTTACAGCATCTTGCATGCTCCCATGTCTTTCTTTGACACTACTCCATCAGGAAGAATTCTAAGCAGGGCATCCACTGATCAGACCAATGTTGATATCTTCATCCCTTTGTTTTTCAACTTTGTGGTGGCCATGTATATTACAGTGATCAGCATCATTATCATCACTTGTCAAAATTCTTGGCCAACAGCTTTCTTGATAGTTCCTCTTATTTGGTTGAACATCTGGTACCGGGGTTATTTTCTTTCTACTTCTCGCGAATTAACTCGGCTGGATTCAATTACAAAAGCACCTGTCATTCATCATTTCTCTGAAAGCATTTCCGGGGTGATGACAATCCGTGCATTCAAAAAGCAGAAGGAATTTTGTGCACAAAACATTAAACGTGTGAATTCTAATCTGCGAATGGATTTCCACAACTACAGTTCCAATGCGTGGTTGGGTTTCCGGTTAGAACTTCTTGGAAGCTTAGTCTTGTGCATTTCTGCCATGTTCATGATCTTATTACCCAGCAATATCATAAAGCCAGAAAATGTTGGCTTATCTCTCTCTTATGGATTGTCATTAAATTCGGTGCTGTTTTGGGCTATATACATGAGCTGTTTCATTGAAAACAAGATGGTATCAGTTGAGAGGATAAAGCAGTTTTCAAAAATTCAAGCAGAAGCAGCATGGAACATTAAGGATCGTTCGCCTCCTCCAAACTGGCCTGGCCAAGGCCATGTTGATATCAAAGACTTGCAGGTCAGATATCGTCCAAACACTCCTTTGGTTCTTAAAGGAATTACTTTAACCATTAATGGAGGAGAAAAGGTCGGTGTTGTTGGTCGAACGGGGAGTGGAAAATCAACTTTAATTCAAGTTTTCTTCAGGCTGGTGGAACCTACAGGAGGGAAAATAATCATTGATGGAATTGACATATCCGCCTTAGGGCTTCATGATCTTAGATCTCGTTTCGGCATCATCCCTCAAGAGCCTGTTCTTTTCGAAGGAACTGTCAGAAGTAACATTGATCCAACTTCACAATATACTGATGAAGAGATATGGAAGAGTTTGGAACGTTGTCAACTAAAAGATGCAGTGGCTTCTAAGCCTGAGAAACTTGACTCATTAGTGGTTGACAATGGAGATAACTGGAGTGTGGGACAAAGGCAGTTGCTTTGTTTAGGGCGGGTCATGCTTAAGCAAAGCAGGTTGTTATTTATGGATGAAGCAACAGCTTCTGTTGATTCTCAAACCGATGCTGTAATTCAGAGAATCATCCGAGAGGACTTTGCATCTCGTACCATCATCAGTATTGCTCATAGGATACCAACAGTTATGGACTGTGATAAAGTGTTAGTTGTAGATGCAGGGCGGGTGAAAGAATTTGACACACCCTCCAACTTGCTTCAGAGGCAATCGCTCTTTGGAGCTTTAGTTCAAGAGTATGCCAACCGCTCCAGTGGACTATAA

Protein:

>Am02G029360.1
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Promoter(3k):

>AM02G029360.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00005.30	ABC_tran	653	786	2.80E-53
PF00005.30	ABC_tran	1273	1421	2.80E-53
PF00664.26	ABC_membrane	321	588	6.00E-52
PF00664.26	ABC_membrane	941	1193	6.00E-52

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	ABC

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0140359	ABC-type transporter activity	Molecular Function
GO:0055085	transmembrane transport	Biological Process
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0016887	ATP hydrolysis activity	Molecular Function
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR017871	ABC transporter-like, conserved site
IPR003439	ABC transporter-like, ATP-binding domain
IPR036640	ABC transporter type 1, transmembrane domain superfamily
IPR011527	ABC transporter type 1, transmembrane domain
IPR044726	ABC transporter C family, six-transmembrane helical domain 2
IPR044746	ABC transporter C family, six-transmembrane helical domain 1
IPR003593	AAA+ ATPase domain

trEMBL

trEMBL term	Description
I1L7W1	_

SwissProt

SwissProt term	Description
AB4C_ARATH	ABC transporter C family member 4

KEGG

KO	Description	Enzyme
K05666	ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 2

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G47800	multidrug resistance-associated protein 4
Medicago sativa L.	MsG0180004869.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g25386.1	multidrug resistance-associated protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa002782	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur001281s00028026.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_39580T	_
Arachis hypogaea L.	AH16G06650.2	ABC transporter C family member 4 like

Expression pattern