Gene detail

Detail information of Am02G025270.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G025270.1	Protein kinase family protein with ARM repeat domain

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G025270.1	mRNA	Chr02	160185495	160201226	+

Sequences

CDS:

>Am02G025270.1
ATGTTCAAATTCCTGAAAGAAGTGGTGGGTGGATCTGGAACGGGCATCAAAGATCTCCCATACAATATCGGCGAACCCTACCCTTCCGCTTGGGGCTCTTGGCTTCATCACCGTGGCACCTCCAAGGATGATGGTTCTCCGGTGTCAATTTTTTCACTATCTGGAAGCAATGCTCAAGATGGACATTTAGCTGCAGGTCGCAACGGTGTCAAGCGTTTACGCACTGTTAGGCATCCAAATATTTTGTCATTTCTTCACAGTACGGAGATTGAAACTTTTGATGCTGGTTCTTCAAAGGTTACGATTTATATCGTGACGGAGCCTGTAATGCCATTATCAGACAAGATAAAGGAGTTAGGTCTTGGAGGTACACAAAGGGATGAATATTATGCTTGGGGCCTTAATCAGATAGCGAAAGCTGTGAGCTTCTTAAATAATGATTGTAAACTTGTTCATGGTAATGTTTGCTTGGCTAGTGTTGTTGTCACACAAACTTTGGACTGGAAACTCCATGCTTTTGATGTTCTATCAGAGTTCGATGGGAGTGGTGAAGCTTCCTCTGGGCAAATGCTGCAATATGCATGGCTTGTTGCTTCACAGTACAAACCAATGGAGCTGGTAAAATCTGACTGGGCTGCAATAAAAAAGTCTCCTCCATGGTCCATTGATTCTTGGGGCATGGGCTGTCTTATCTATGAGCTATTCTCTGGCATGAAGTTGGCCAAAACAGAGGAGTTGCGTAACACTGTCTCGATTCCCAAGTCTCTGCTTCCAGATTACCAGCGGCTACTGAGTTCCACACCTTCTCGTAGATTAAATACATCAAAGCTTATAGAAAACAGTGAGTATTTTCAAAATAAGTTGGTAGACACAATACATTTCATGGAAATTCTCAGTTTGAAAGATAGTGTGGAGAAGGACACCTTCTTCCGCAAGCTTCCAAATTTGGCAGAGCAGCTTCCCCGCCAGATTGTGTTAAAGAAGTTACTTCCTTTATTAGCTTCTTCCCTTGAATTTGGTTCAGCTGCTGCCCCCGCTTTGACTGCATTGTTGAAAATGGGTTCCTGGCTTTCAGCTGAGGAGTTCCGTGCCAAGGTTCTTCCTACAATAATTAAACTCTTTGCCTCCAATGACCGAGCTATTCGTGTCAGCCTTCTTCAACATATTGATCAATATGGAGAGTCATTATCAGCCCAAGTTGTTGATGAACAGGTTTACCCTCATGTTGCTACTGGTTTCTCTGATACATCTGCTTTTTTGAGGGAACTCACTCTCAAGTCCATGTTAATTCTAGCTCCAAAGCTGTCTCAAAGAACCTTGTCTGGGTCATTATTAAAGCATCTGTCGAAGTTACAGGTCGACGAAGAAGCAGCAATACGAACAAATACCACTATCTTATTAGGAAATATTGCAAGCTTCTTAAACGATGGGACAAGAAAAAGAGTATTGATAAATGCATTTACAGTCCGTGCTTTACGCGATACCTTTCCACCTGCTAGAGGAGCAGGCATTATGGCTTTATGTGCTACCAGTTCCTATTATGACATCACTGAAATTGCCACACGGATTCTTCCTAATGTTGTTGTACTCACAATTGATCCTGACAGTGATGTTCGCTCTAAGGCATTTCAAGCTGTTGATCAATTTTTGCAGATGGCGAAGCAACATTATGAAAAGACAAATACTGCAGAGGCTACTGGGAGTGCAAGTATGGGAATCTCATCAATTCCAGGAAATGCAAGTTTGCTTGGGTGGGCCATGAGCTCCTTGACCCTGAAGGGTAAGCCTTCTGATCATGCTCCAGTTGCTTCTGTGAGTTCTAGTGTTCTCACTCCAACATCTTCTAATGCCAGCTCAGCTGTAGACACTCCTTCAACAGCACCCATCCATGTAAATTCCACAACAGACTTCACTGAGCACCCTGTCCCTGCATCTCCAACATCAACAGATGGCTGGGGGGAACTAGAGAATGGAATTGATGACGAGCCTGAAAATGACAAGGACGGGTGGGATGATCTGGAACCACTTGAAGAAACAAAGCCAACTCCAGTTCTTGCTAACATTCAAGCAGCTCAAAGGCGGCCAGTTTCTCAACCTGTTTCACAGACAAAACAAGCTTCAAGTTTGCGACCCAAAATTGCACCAAAACCAAGCAAAGATGAAGATGATGATTTGTGGGGTTCCATAGCAGCTCCTGCTCCAAAAACATCAAAACCTTTAAATTTAAAATCAACTGCAACCGATGATGATGATCCCTGGGCTGCCATTGCTGCTCCTGCACCCGCTACTAGGGCCAAGCCTTTATCAGCTGGTAGAGGTCGGGGAGCTAAACCTGCTGCTCTAAAGTTAGGTGCTCAGCGGATAAACCGGACATCGTCATCTGGGATATAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM02G025270.1
TATATTTAGCACTCTGTTGAGTAACGCACTCAGTTGGTTATATTTTTAGCCTCTAGTGAATTGTGAATTTAAGCTGGATTAAATAATATGCTGTCAGGAGGTTAATTTAGTGACACTTTGTCTATGATTCGTGTCACCGCAATTCGAATTTGCATTTACATTGTCGGTACAATTAGTTGTTAAACCAATAGAATTGTCTGTAAAAGAACCAATAAAAATATGTAAAATGAGATGAAAAAAATTATGATTTTTTAAATATAATTTTCAGTTGTTATTTTTTGTTTGAAAATTAAATATTTTATTAAGCTAAACTATATAAGCTAAACTTCAAATGCCACTTTAAGTATTGTCTAAAGAAGTTAATATTTTTTTTTTATCAAATACTTGTATTTTGGTCAAATATATATGCTAGTTTCTTTTTTCTGAATAGCTAGTTAAATAATCTCTGCACCAGCTTAAATAACTAGTCAAATATACTAATAACTAATTTTAAATATTTTATTATTAATTCAAGGACTTAAAGAGATGGATGAGGTTTTACTATTGATTTTGTGACTCCACTTAAAATATTCTGAACACACTAGTTGATGATAAAAGTTTATGAATGTTCTTTTTTCTTTTTAAAAGGAAGTTCATGAATGTTCTTATAAGTTTTTTTTTTTATGATTGTTGATGATAAAATTGATATTTTTCATTTTATTTTATTTTCACCTAAATCCCTAATTAGTTGAGTCTATTGAATTTGTACTTGTTCTTGTGAAAATGTTGAATCGGTTGTTGTTCTTATTATCCTAATTTTGATCCTGTTAATGCTATTTAACTGGTACTTTGTGTTAGTGCTATTTAATTTATTTTGATTATATTAGTCTATTTACTTATAATCTATTCTTGTATTTTGTGAATACGTTGATTCTCTTAGTGCTATTTAATCTGTATTTAGGAACTTGTTTGTGCTATTTAATTTATGTTGATCTAGTGCAACACAAGTTGTGAACTTGTTAAAATTTTACTTATTATGCTGGCTAAATTATAGTTTTGGTCCCCCTATTTTCACAAATTTAGACATTTGGTCTCCTTATTTTAAAACTCAGACATTTAGTCCAACTATTTTTACAAACTCAGACATTTAGTCTAAATGGGTTTTTTTTTTATTTTTTTTAGTTGATGTGAAGATGTATAAAAAAAGGTGAGGTGAACCTCATTAATTGACGTGACACCTGACGTAGGCACCACACGTGGCTGCCACGCCTATTAATGAGCCACGTGTATATGTCACATCATAAACTTATTAATAAAATATTGGCAGAATAGCACTTTTGGTCCTTTATGTTTGCTCCAGATTTCACTTTGGTCCTTTATCTTTTTTTTGGTCCGTTTTGGTCCCTTATGTTTCATTTTTGTTTCACTCTGGTCCCTGACGTTAGTTTTTACTAACGGACGCCACGCTGGCAGTTAACTGCTGACGTGGCGTCCTCTATTAATTAAATGAAGTGGCAATTCATTAAACACATCAGCATTTCTAGTTTTTTAAATTTTAAAAACACAAATATTAAAAATCATTAAACACAAATTTTGATTTTGGTCCCTTCACTGTTGGCTCTCTCCTCTCCCTCGCCGTCACCTCTCCTCTCCCTCGCCGTCACTCTCTCCTCTCCCTCGCCGTCGCATCTCTCTTTCTCTCCCTCCATGCGAAGCTTTATTTCTCTCCTACTGCTTCTACTTCATCTTCGAAACCCAGATCTGAGGAAGACGAAGACGAACGCGATCTGAGGATCTTTTGTTCCCTCTCCCTCGGTCTCTCTCGCGGTCCCTCTCCCCCGGTCTCTCTCGCGGTCCCTGTCTCTTCTGTTAGATCTTCTGTTCTTTCACGCGAGGCGCGACAGTGATGAACCAGACGAAGACGAAGACGAACGCGGTCTGAGGAAGACGAAGATGAACCAGATCTGAGGAAGAGAGGAGGACGAGGCACGACGGTGATGAACCAGATCTGATGAACCAGAGAGGGTTACAGTTTGAGAGGGGAGGTTTTCTGGGTTTTCGGTTTGAGAGGGGATGTTTCTGCGCAGAGAGGGTTACGACGGTGGTGGGAGGGTGGCGACGGTGGTGGGAGGGGTGGCGACGGTGGTGGGAGTGGCTGGGAGGGTGGCTGTTTTATTTAAATAATTTATGTTTTATTTAAATAAAAAAAGGAATTTATGTTTTATTTAAATAATTTATGTTTTCTGTTTTATTTAAATTGAAAAACAAAATGCTGATGTGGAAATGAATGGAGGGACGCCACGTCAGCAGTTAACTGCCAGCGTGGCGTCCGTTAGTAAAAACTAACGTCAGGGACCAAAGTGAAACAAAAATGAAACATAAGGGACCAAAACGGACCAAAAAAAAGATAAAGGACCAAAGTGAAATCTGGAGCAAACATAAAGGACCAAAAGTGCTATTCTGCCTAAAATATTAAAACTAAAAAACAAACAACAAAAACTTAGATAAAATAAAAATCATAAATTTTGAACTATTATAATTTCTTCTTTCAATACTTAATTATTAAGATAGATGAAACAGAGGTATCTTAGGAAAATATTAGATAAATATCATAAATTTTGAACTATTAATTGTCTTTCCTTAATCTATGTGACATTATCTTAAACCTCAAATAAAATAGGAGGAGACATAGGTAATAAATGGGTAAGATCTCCTTAAATTTTAAAATCAAAATCACATTATTAACTTTTCATTACAAAAAGTATCATTTCAATTAAATATTAAAATTATGAAAATAAAACTCGCAAAGCAAACAAATATTTTTGAGAAGATAAAATAAAAATTGCGATGGCCTTTCCCTCTTCGTAACTAGGTGTTCGATTTGGGACTGTGTTGATGAGCAATCCAATTCTCCCTCCCAATTATTTGTTTAAGGAAGAAGATTGAATCAGATCGCGACCAGTATCATATACAGCTATAACCAGCGTTTTCAGATCAGAATTGTGATTACGGATCGTAAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	44	250	4.60E-08

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:4.5.4:SCY1_SCYL1

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0016705	oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen	Molecular Function
GO:0004497	monooxygenase activity	Molecular Function
GO:0005506	iron ion binding	Molecular Function
GO:0020037	heme binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR021133	HEAT, type 2
IPR016024	Armadillo-type fold
IPR011989	Armadillo-like helical

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A8B8M873	_

SwissProt

SwissProt term	Description
SCY1_DICDI	Probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1

KEGG

KO	Description	Enzyme
K08876	SCY1-like protein 1

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G40730	Protein kinase family protein with ARM repeat domain
Medicago sativa L.	MsG0680035650.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g60440.1	HEAT repeat family protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa013466	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000226s00010829.2	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr03_45760T	_
Arachis hypogaea L.	AH19G22800.1	Probable inactive serine/threonine-protein kinase scy1 like

Expression pattern