Gene detail

Detail information of Am02G009400.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G009400.1	Protein kinase superfamily protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G009400.1	mRNA	Chr02	61108777	61110894	-

Sequences

CDS:

>Am02G009400.1
ATGAATAAGCAACCAATATTTCATCCCCTTCTTCTCATCTCACTTTACACACTTCTCATAACAGCATCATCTTCATCATCATGTCCAATGGATCTAAGCTATGTCTCAACCTTTCCATGGGACACAACAGCATGTAGAGATCCAATAGACACAAACCAATGTTGTCAATCACTTCTTAGTCTCTTTGGAATAGGACTTGCTCAACACCTTAAAGCAACTTCCCTTTTTCAACTCCCTGATGAATCCACTTCCTCAGCTTGTTTATCTGATTTCAAATTCAAACTTTCAGCTCTTAAAATCCAACCTTCTTTAGTCCCTTCTTGTTTCAAAAACTCAACACAGTTTGTTACAAACTCTTCAAACTGTGCAGGTATCAAAACCATCACAGATTGGAAGGACAAAGTTGGTATTTTAAGTCCTTTAGATACTTCATGTAATGGAGATCTAAAAGATCAAACTAGATGTAGTGTTTGTCTTGATGCTGGTTTTAAAGTAACTTCTCAGCTTAATGCTATTAAACCAAATTCAACAAAGTGTTTCTATTTCTCAGTATTATATGCTATTGCTATTGTGAATCAGTTTGGTCCAACTGATGTTAACACAGCTGGTTGTATATTAGGTATGCCACTTTCTATAAAAGGTTCATCAAATAGAAATCAAGTCTTGAAAGTTGTTTTTGGATTGTTAGGTGGTGTTGTTGGTGTTGTCCTTGCTTTTTTGTTGATTATTATGTATAGGAAATGGGATAAGATGAGAAGGGAAAATGTTTATCATAGGGGAGTTGAAAATAGTGTGAGGAATAGTGTTTTACCTAATGCTGGTGCAAAATGGTTTCATATATCTGAACTTGAAAAGGCAACAGGTAAATTCTCACAGAAGAATATGATTGGTCAAGGTGGTGATGGAGTTGTGTATAAAGGGACTCTTTCTGAGGGAACTTTAGTGGCAGTTAAGGAAATTTTTGATTTGGATACTAGAGGTGATGAAGAGTTTTGCTATGAAGTTGAGATTATCAGCAAAATAAAACATAGGAATCTTCTTGCTTTAAGAGGTTGTTGTGTTACAAGTCATAATTTGAAAGGTAAGAGGAGATTTTTAGTTTATGATTTTATGCCTAATGGAAATCTCAGTTACCAATTGTCAATTTCTGGTGCTAATAGATTAACATGGCCACAAAGAAAGAACATTATTCTTGATGTGGCTAAAGGGCTTGCTTATTTACATTATGAGATTAAGCCTCCAATTTATCACCGTGATATTAAGGCAACAAATATACTATTGGATTCAAAAATGAGGGCAAAAGTGTCAGATTTTGGTTTGGCAAAACAAGGAAATGAAGGGCAATCTCATCTTACAACAAGAGTTGCTGGTACATATGGTTATTTGGCACCAGAATATGCATTATATGGTCAATTAACTGAGAAAAGTGATGTGTATAGTTTTGGTATTGTGATACTTGAAATTATGAGTGGAAGGAAAGTGCTTGATACTATGAATTCACCTGTGGTTTTGATAACTGATTGGGCTTGGTCACTTGCTAAATTAGGAAAATTGGATGAGATATTTGATCAGGGAATAAAATATGAAGGGCCAGAGAAAATTATGGAAAGGTTTGTTCTTGTTGGTATTCTTTGTGCTCATGCTATGGTTGCTTTAAGACCTACTATTGCTGAAGCTCTTAAGATGTTAGAAGGTGATATTGATATACCTAATTTACCTGATAGGCCTGTTCCACTTGGTCATGAGTCTTTTCAATCTACTTTATTGAATGGTTTGCAAACAAGTGGAAGATCAACACCTTACTTTTCATCTTATATTCAACAAGTATGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM02G009400.1
GGGGATGTGAGTGTTTCGTGATACCCGTGGATGAATACAAGAGGTCGCGAGTCATTTCAGGGAATGGATTCGACGTTCCACTTCGTTGGTGCGGTCTCGCTTACAGTTGTCTACGAGAGAGCTCCTAATCTCTTGGTGTAGTGGGCTGCTCATGGAGAGGTGACAGGGGCCGAGCTACGAGGATGGTCCTATATCACCTAGAGCCCAAGTGTTGTATGTGCCTCTCAAGTAGGAATGGCAAAGCGGATCGGCTTTCCTTGCTTTGTCGTGAGCCCTCCAAAAAAGTGGTGGAGTAGAGAAACCTGCCAATGTGCGGCGGATTGAGAAGTTGAGGCCACACTGCCTCATCACGAGTTAGCCAGCCTAGAAAATGGCGTGTTGACCTGCCACAATCCATCAAAAAATACATAAAAAATTGAAAATGTTGTTTAAAACAAGAAAAAAAAATTAAAAGAAATAGTCTCGATGGGCTTGCCAGCACAACCCTACCAGCGTGTCCTGACGGTTTGGCGTGTTAGTTGGACTCATGGATCGGGTTGTATAGGATAGTAGGCCGATAAACACCAACCACCTTACCGTTTTTTGGGAGTTGGCCGTCTGACCCACCGAACCCAACCCGTTTTACCACCCCTACCCTCAAGAGTGGATTCTGTCGGCCCAACTCGTTTTAGCACCCTACCCTTTTTTGACAAAATTTTAGCACCCTACCCTCAAGAGTCCTAGATGGAGATTGGTGTGCTCCCGAACCTTAGTTTATATACATAACTGTTTGCATTCCACCAAAGAGAGTTTCAACTTTTTTTTTTGACAAGCAAAGAGAGGTTCAACTTATAATGTTGCTATGTAGTTCATATTGGAGTGTAGTTAATTGAGTTTGCAGTTTTCAACATTATCAACGAGGTTTAAACTTAAGGTTCTGTCAAAAACCATGCCAAATTCTTTTTGAATATTATATATAGTTGCAGAAACATAAAACTTGCACGTCAACCCCTGGTGATATTAATATTTTATTTAATTATAAGTGACAGTGAAATGAAGAGATATGAATGTCCCTAAGAGAAATGGAGAAAACTTTTGCAACAAACTAGGTTGCTGGTAGAAATAGTGAGAGATTTTTTTTTAGTGAGAAAGAAAAAGTGAGAGATGTCGAGAGCAACTATTTGTAAGTTTACACTCTATTTGGATGCCTAAAGAAATAAAAAAGAAAGCCATAAAGAAAGAGAAAAAGAAGAGAAATTCTATATTATTCAAATTCAAATGAATAAATTAAAGTAAGCTTTTGAACTTACTTTTGAAATTAAGTTTTTTAAAATAAAAAATAATAGTATAAAAATTACGATAATGACAAGATAAATGAAAAAAATATATTGATGACACATATATGTTAAAATATATCTGATATTGAAAACATTTACAATTTTTAAAATTACAAAATAATCAAATGAAATTAGTTTTTATAAACTATATCCATCTTTAGATTCTTAAAGTATACCTTAAAATAATTATAAAAAAAGTATTCCATTAAATTGAAGAAGAAAAACAAAAATATGACCACCAAGGCGTATAGGCTAAAACTAGAGCTAGCAAAATGGGCTGGGCCCGCTGTGTCGGGCCGGGTTAGCCCAAAAAAATGTAGTGCTTGGGCCAAATAATTTGAGTACATTTTGTATATTGAGTTTTTTAGTCCGACCCAAAAAAGCCCGAGTCTGCTCTGGGCTAGCCTAGCTGGATCATGGGTAGGCGCAGGCTCGAAAATTTCAAAAAAATACAGTGCATTTGGGGCCAAAAGCCCAAATTAGTAACCCAAACCAAAGGCTCAAACACAATTACAATTCTTGACAAAAAAAAACACAATTAGAATTTTTACTGAACGCACATAATGTCTCGGTCTCTTGAGTTACTCACTATTTAAGTCTATAATTCTCTATCTAGTCCCAAACAAACACAAGAGTTTGTCTCTCACGGTCTCACCGATGCCGGCAAGGGGCTAAAAATATTTATTGGAAATATGCCTTTTTCCAGAATGTAGTATTTAAAAATTGAAATATATCGAGCCTTTTGATAGTCACCCCAAAGTATTGCTGCAAATTGCGTATAATACGGGTTAGTCCGAAAAGCCTGTAGCCCTATAGGGGTTGGGCTTGAGTCGTAAAGGTTGAGCATGAATTTCAAACCAGACTTTTTGGCCCGAATCAAAAAAAACCCGAGTCCAATATGGACGGCCCGATGCGAGCCGGGTAGGCTGCTTTGCACCTCTAGTTAAAACATTGTGTTTCCCCCAGAATCCGGATCCTCTACATGCTGTAGAGGGTGCAGCAAGTTGCTGCACCGTCCGATCTAGAGAGAGAACGGCGCAACAATTGTTCTCTCTCTAGATCGGACGGTGCAGCAACTCGCTGCCCCCTCTACGGCATGTAGAGGATCCGATCTCGTTTCCCCATTGCACTAATCAGTATTATTTCATTACATTGTCAGTGACTTAATAAATACAATTATATTTTTGCTTTGACACCTTTTTATTGTGTTAAAAAAATATGAAGGCATAAAGTAGGGGTTTGACCCACTTTATTCTTGCATTAAGACCTTTGTTTTGTATTGTGCACAAACCGAATAGTTTGGGCACAAAAATATAAGCCGCCAGTGTGTTAATTAATCAACTTGTTTACTTTAATAAAGTTGTCTGTGTGTTTAATTAATGGTTAACAAAGACTTTATAACTAGAAGAATAATCCAATGTCCTTGCTTGCCCAATTTGACGACCACCACCAAAAAGAAACAAGTTCACGTTTGTTAGTGAATCGGCGCACGTGACTTTTTTGTCCAAAACTCATACATTTTATAATACAAAGCGTGCCCTTTTGACCACAGCAAGCCACAGTTGTTGACTAGTAAACCTTCAGATCTTTCCCGGAAAACATTGAGTGTTAAAAGGGTCCAAAAGGTTTCAAAATAAGTGCTTGTGGTGGTGGTGGTCCTTTCATTCAACACAAATCCAAAAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	291	560	3.70E-42
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	292	556	1.50E-41
PF19160.3	SPARK	23	179	1.60E-35

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.6.4:RLK-Pelle_RKF3

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004672	protein kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0004888	transmembrane signaling receptor activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR043891	SPARK domain
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2Y2N6	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y1105_ARATH	Probable receptor-like protein kinase At1g11050

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G11050	Protein kinase superfamily protein
Medicago sativa L.	MsG0180001053.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os05g34950.1	cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa015776	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000744s00021940.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_54940T	_
Arachis hypogaea L.	AH20G21460.1	Probable receptor-like protein kinase At1g11050 like

Expression pattern