Gene detail

Detail information of Am02G008270.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am02G008270.1	Homeodomain-like protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am02G008270.1	mRNA	Chr02	44195278	44208728	-

Sequences

CDS:

>Am02G008270.1
ATGGACGGTGACCGGAAAATTCCTGCTCCGTCAGATGGACCCGTTGATAGGGTTAAGAAAGGGAGGACTACTGGCCCTACAAGGCGTTCTACAAAAGGGCAATGGACTCCAGAGGAGGATGAGATCTTGCGAGAGGCTGTCGAGCGTTTCAATGGAAAAAATTGGAAAAAAATTGCGGAGAGTTTCAAGGATAGAACTGATGTACAATGCTTACATAGGTGGCAGAAAGTGTTGAATCCTGATCTTGTTAAAGGTCCATGGACTGAAGAGGAAGATGCAATAATTATTGAAATGGTGGACAAGTATGGGCCTAAAAAGTGGTCAGCTATTGCACAACATTTACAAGGACGTATTGGGAAGCAATGTCGAGAAAGGTGGCATAATCATCTTAATCCTGCTATAAACAAGGAAGCATGGACACAAGAAGAGGAGTTGGCTCTAATACGTGCTCATCAGATTTATGGGAATAGATGGGCCGAGTTAACAAAGTTTTTGCCTGGAAGGACAGACAATGCTATTAAAAACCACTGGCACAGTTCAGTGAAAAAGAAATTGGATTCCTACTTGGCATCAGGCTTGCTTACTGAGCTTCAATCAGTTCCTCATGCTGGAAATCCATGTCAATCAATGGTTATAACATCTTCAAGGTTGCAATGTAATGGAGATGATAATGCTCTTAGGGGGTCCGAAGGAGAGGAAGTTTTAGAATGTAGCCATGAGTCAGCTAATGCTCTTCAATGTCCATCCACAAAAGAGATGACCAATGTTGAGGAGTATAGGCCAAATGAAGAATGCAGTCTTGGAAAGGACCACAGTCCAAGTCAAGCTTCCTGTTCAGAGCCATCTTATGTATCAATTGATGACCCTACTGTATGCGTCCCAGAAATTGCTTGCCATGATGCAAACACTTCTGGATTCGTTGAGCAACAATACTCACATGAGCCTGGAAGTTCCATAAATGGGGATTGCCAGTTTAATTTAGATTTATTACCCGATATTTCATCAATGGAGTTGGGGCAGGAATCCTCGCAGTTGCAAAGAGATTGTACAGATCCTACTGAAATTGGCGACTTAGTGAATGTTCCATATCAGACTTCAATGGGGTTAGGTGTTTCAACGTCCATGGAACCTACATTGACGGATTCTGCTAATCCAGAGCACATGTTGATATCTGACGATGAGTGTTGCAAGGTTCTGTTTCCGGAGGCAAATAATGATGGATCTTTTTACCCTGGAGATTATAATGAAGGTGAAGATAGAGTTGCATTTTCTGGACACCCTGCATTTGGTTGTCAAACATGTCATAATCAGATACCAGACACTGGTGGAACCTCAACTCCGCAGTTAACTTGTCCTCAGTGTTCTAATCATTTTATAGGAATGTCGTCCTCTCAATCTGCCCCTCCAGTGCATTCTGCTATTGATAGTAAGCTGGCATGCACTACCAAAGATAATCAGTTATTGTGGCCTGAGGATCAGCAGCTTGCCTCCAGAGCACCTAATAACTTCAGTTATGCCAATGACATATCTAGTTATCCTTGTATTGATGGTAGAGATAATGCAGAAGCGCAACAATCATCAGATACTCTGAAGGATACTTCAAAGTTGGGCACTGTAAATAGTTTTTGCTATGGATCAGATGCTAAGAAAACTTGTTTTCCAACAGATGAAAAGCCAAATGTGCTCACGGAAAAGGAGGACACGGGAGCTCTATTTTATGAACCTCCCCGTTGCTTGGATGGGGCTTTCATCAGCTGTGATCTTGCACAATCTGGGTTTGATATGCAGCAAGAATTTAGTCCTCTGGGTATCCGCCAATTAATGATGTCTTCCATGAACTGTATGACTCCGCTAAGGTTGTGGGACTCGCCTTCTCGTGATGACAGTCCAGAAGCATTATTGAAAAGTGCGGCTAAAACTTTTACGGGTACACCATCAATATTAAAGAAACGACGTGGAGATGTGTTGTCGCCACTCTCAGGTAAAAGAATTGGGAAGAAACTTTTGACTGACATGACATCCACTTTTTCCAGTTTGGAAGCAGATATTCTTTCTCCATCTTCATTGCGTAAGAAGAAATATCGGGCTTCTGTTTATGATGATGATAAAGAAAATTGTGGACAAGCTTATAAAGGGGAACGAGTAGATGGGACAGTTAAATCTGCAACTTTTTATGAAAATTACTCTCAAAGTGATGCTCTAGACATTAATTCTCATTGTAAGGCTGAGCAGCGACCTTTTGATGTTGATTCTGAAATGAAGACCGATGCTGCTAGTGAGATTGCGCAACAATCTTCTGGAGTTTTGTTTGAACATGATATGAATGACTTATCTTTTAACTCTTCTGATCGAGTTGGTGGTATAAAAGACAGAGTTCTGGGTACTCCCAGAAATTTGAACAACAGTAGTTCAGAAACAGCTCCAAACCAGAGCAACCCTTCAAAATTATCTTCTGAAAACCCTTGCTCAAGGATTAGCCCGTGTGTTCGTGAGAAGGAGCATGAAGGACTTACAGTTTCTGTTTCGCGTGAAAAAACTCCAGGGGAGAATTTGGGTGCTCAAACCAGAAATGATGGTGGCTTTGAATCAAGTAACATATTTGGTGGAACACCTTTTAGGAAAAGTATTGAATCACCTTCTGCATGGAAATCTCCTTGGCTCTTCAATACTTTTCTGTCTAGCCCCAGTTTTTGTCCTGAACTTACAATTGAGGATTTTGGGTTTTTCATGAGCCCAGGTGATAGAAGCTATGATGCAATCGGGTTGTTAAAGCACATCAGTGACGAAAATGCTGCTGCATACGAAAATGCTCAGGAGATTTTGAGAAATGAAGCTCCTAAGGGTAGGAGCCAAGAAAATAATGATCAGCCTAGTCAATCTCAATTGCGCTTAAATGCTGTGATGGAGCGACGCGTACTCGACTTCAGTGAATGTGGAACCCCAGAAAAGGGTGATAAAAGTAAATCCTCAGCACCAGAAAAGGGTGAAAGCAGCAAAGCCTCAACACTAGAAAAGGGTGATAACAGAAAATCATCAGCACCAGAAGAGAATGATAGCCGCAAATCCTCTACAGCAGAAGAGGGTGATAGCAGCAAATCCTCTACACCAGAAAAGGGTGATAACAGCAAATCCTCACCTATGAGTTTCTCAAGCCCTTCTTCATATTTGTTGAAAGGTTGTAGATAG

Protein:

>Am02G008270.1
MDGDRKIPAPSDGPVDRVKKGRTTGPTRRSTKGQWTPEEDEILREAVERFNGKNWKKIAESFKDRTDVQCLHRWQKVLNPDLVKGPWTEEEDAIIIEMVDKYGPKKWSAIAQHLQGRIGKQCRERWHNHLNPAINKEAWTQEEELALIRAHQIYGNRWAELTKFLPGRTDNAIKNHWHSSVKKKLDSYLASGLLTELQSVPHAGNPCQSMVITSSRLQCNGDDNALRGSEGEEVLECSHESANALQCPSTKEMTNVEEYRPNEECSLGKDHSPSQASCSEPSYVSIDDPTVCVPEIACHDANTSGFVEQQYSHEPGSSINGDCQFNLDLLPDISSMELGQESSQLQRDCTDPTEIGDLVNVPYQTSMGLGVSTSMEPTLTDSANPEHMLISDDECCKVLFPEANNDGSFYPGDYNEGEDRVAFSGHPAFGCQTCHNQIPDTGGTSTPQLTCPQCSNHFIGMSSSQSAPPVHSAIDSKLACTTKDNQLLWPEDQQLASRAPNNFSYANDISSYPCIDGRDNAEAQQSSDTLKDTSKLGTVNSFCYGSDAKKTCFPTDEKPNVLTEKEDTGALFYEPPRCLDGAFISCDLAQSGFDMQQEFSPLGIRQLMMSSMNCMTPLRLWDSPSRDDSPEALLKSAAKTFTGTPSILKKRRGDVLSPLSGKRIGKKLLTDMTSTFSSLEADILSPSSLRKKKYRASVYDDDKENCGQAYKGERVDGTVKSATFYENYSQSDALDINSHCKAEQRPFDVDSEMKTDAASEIAQQSSGVLFEHDMNDLSFNSSDRVGGIKDRVLGTPRNLNNSSSETAPNQSNPSKLSSENPCSRISPCVREKEHEGLTVSVSREKTPGENLGAQTRNDGGFESSNIFGGTPFRKSIESPSAWKSPWLFNTFLSSPSFCPELTIEDFGFFMSPGDRSYDAIGLLKHISDENAAAYENAQEILRNEAPKGRSQENNDQPSQSQLRLNAVMERRVLDFSECGTPEKGDKSKSSAPEKGESSKASTLEKGDNRKSSAPEENDSRKSSTAEEGDSSKSSTPEKGDNSKSSPMSFSSPSSYLLKGCR*

Promoter(3k):

>AM02G008270.1
AATTGTTGAGCCCAAAAAAAAATGTTCAAAAAAAAAGTTCAAAATTTAAACAGTTCGGTTCGAGCTCGAACTGCCGAACCGAACTATTAAGACAGTTCAGTTCGGGTCATCGAACTACTAAAACAGTTCGGTTCGGTTCGGTCGAACTGTCTTAACAGTTCGGTTCAGTTCGGTGCAGTTCACCTTTAGAACTGAACCATGAACAACCCTACCCGTTGGCACCCCCGTTGGCGCTCTCGTTACCTCTCTCTTTACCACTCTTGTTGCCACTCTCGTTACCTCTCTCGTTGACCAAAAAACGCAAAAAAAAATGATGAAAAAAAACTTAAAAAAAAAACAGATTTTGAAATGCGCCTCTTGACACTGTCGTTGGACATTAGAGGAAACTATCGCCGTTGCTAGTCCCGTCTGCAATCCCGTTGCTGATCGAATTGCTAGTGTCTCGTTGCCGCTCCCGTTGCCACATGTTAACTCATATTTTCCTATATGATTTAATATTAGTTAAATCATATTCGTTTAATTATAAGTAAGTTATTTTGTAATATTTGGTAGTGGTTAAAGTTTTTTTTACAATTCTTAGCGGTTAATTTCATTAACTTCATTGATTTTAGGGTCCTCGCTCCCGTTGCCACGTGTTATGAATTATTTTTTTCTATATAATTTAATATTAATTTAATCATATTTATTTAATTATAAAAAAGTTATTTTGTAATATTTGGTAGTGGTTAAAATTGTTTTTACAATTCTTATTCATTGATTTTAATAGAGAGATTATATTAAATAGTAAATTTTAGATTACTTAATTATTTAGTATAATATTAATTTAATAATTCATTTTTTTGAAAAAAAAATAATTTTAAGCTTTTGTTAGTGGTTGAAATGATTAATTTTATCGTTGTAAAAAAATAATTAACTTTAGTAATTTTAGTAGATTATAAAAATAGTGACTAAATTTTATTAGTAAAAAAAAGGAAAAAAAATTAATGTTTCCGAAAAAAAATCCTTTAAAAAACATTTGAAAAAAAATAATGAAAAAAAACTGTTTTTAAAATAAAAACAGTTTTAAAAAAATGTGTTTTAAAAATATTTAAAAAAAATAAAAAATCTGACTTTTTTTTGACCCTGACGCCTGCGCAGCTTTTTTGTTGTTTTAACTTTTTTTTCCTTTTTTGTTTGTAGCTTTTGCCGCTGTTGGTATATTTATTTTATGTTTGTGTAGTTTTATTTTTTTGGTTTTTTACTTTTTGCAGCTTTTGGCTGTTATGCAGGTTTGTTGTCAGCCTGTTTTTCCATCTTTTTCTACAAGAAAGCTGTTAATTTGTATTTTAGCGGTGAAATGACGAAAATGTCCAAAAAATTGGACACGTGGCAGCTTATTGGAATGTCTAAAAAAGTCTATTTGCTAGCATGTGTTTTTATTATATTGAGAGTAGATTGCGGTGAAAATAATTTAAAACAAACATAGCCTAAGAAACTTGAATATCCAAAAATATGACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGATAAGGAAAAAATATGACATGATATGATTAAGGTTACATTTTAAAGCCACTATTCCTATACACATGCTCTATAGGGTATACCATTTTTTTGTTAGCGAAATAATTTCTTAAACTAAACATGACTTAGTTTGGGAACAAATATTTTAATACGATGATTCATGTGTATATTATTCACTAAGCCCGCGTTTAGAATCACATAAGGAAAGTAGTTCACCAATGCGGATGAAATGAAAAATTTCAAGAAATAGTCTATGCAATGAATTGTCTGGGCTCCGCAAGTTTCCAAACGCAAAATAAGAAACTTTTTTTTTCTATCTGAGAAAAATAAAATAAGAGCCTGTTTAGCTTCCCCAAAAAGTCGTCATTTCTCGAACGAAAACACGTATTCCTTATACAAAACACGATTTCTGTAGCTATTGCGGTGGAAATAATTTAAAACAAACATAACTAAAGAAACTTTTTTTGATGGTAACCTAAGAAACTTCTTTTTTTTGAAGACAACAAGGTAACCTAAGAAGCTTGAATATCATCAAAAAATATGATATGGTTTACGTTATATTTGAAAGACAAATAAAAGAACATGTCCTATACACATGTTTTATAGGGTATATCATTTTTTTTTGTTGAAGAAAAGAGAGGACTAATAAACCATAAAATAAACCATTTAATTAATGATTTAACAACCGTAGGGTTTGATACTTTCAGATTCCGCCTCTTTATGTTTGAATAGGGCATAAGCACCCCTAACGTTTTTCCGAATTTTTCGAATATTTTTTCTAATATATAACAAACAGAAAATACACGCAACGTCTATTTTTTTTATCTTTCTCTGAAAAATCTTCCAATTCGCTTTGCAGCGGCAGAGTATTTCGCAAATCATTCTTCGGAAAAATCTGTTGTCGTATCGATCCCGCTGATGCAAAACGTTCGGTCGTCTCAGACCTTCAACTTCAGTTCGGTAAGTGATGAATTTTTACAATCTTATTTGGATTCTTTGATTTCTTATAATTCGAATTCAAATTTGATTTTCTTTGTTTGTTCTTGTATTCAGTGTAAGGGTTTTTCAGTTTTTCAAGAAAAGGAGTTTGATTGATTTTCTTTGTTTGTTCTTGTCTTAAGTGTATGAATTCTCAGTTCTTTTCAAGAAAAAAGGAGTTTGATTTTAGCACCAATGATATAACCTTTGTAATTAAGCTATCGGCTCAAGAAATTAGTAATTTTTTCTTTTTCTGTTGGAATGGGTGATTTTTTTGTTGATATACGTTGTTGAATTCTTTCGTTGAGGGTGATTTTCTGTTTTTTTTTTCTTTTGCCAGTTTTGATTGGTTTCTTGCAGGAGTATGATCTTGCTGGCTCTTTAACGGGAATATAATGATTTGCAGTCGAGTTGGAATTGGGGTATGCGTTTTTAATTCTTTGCTAGCAAATT

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00249.34	Myb_DNA-binding	32	78	1.60E-48
PF00249.34	Myb_DNA-binding	84	130	1.60E-48
PF00249.34	Myb_DNA-binding	136	178	1.60E-48
PF13921.9	Myb_DNA-bind_6	35	88	2.50E-34
PF13921.9	Myb_DNA-bind_6	87	145	2.50E-34

Gene family

Gene family	Subfamily
Transcription Factors Family	MYB

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0000978	RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding	Molecular Function
GO:0006357	regulation of transcription by RNA polymerase II	Biological Process
GO:0005634	nucleus	Cellular Component
GO:0000981	DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific	Molecular Function
GO:0010597	green leaf volatile biosynthetic process	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR001005	SANT/Myb domain
IPR017930	Myb domain
IPR009057	Homeobox-like domain superfamily

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2Y2U2	_

SwissProt

SwissProt term	Description
MB3R4_ARATH	Transcription factor MYB3R-4

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT4G32730	Homeodomain-like protein
Medicago sativa L.	MsG0180000882.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os12g13570.1	MYB family transcription factor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa021079	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000456s00017928.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr01_08480T	_
Arachis hypogaea L.	AH06G28200.1	Myb-related protein 3R-1 like

Expression pattern