Gene detail

Detail information of Am01G040150.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G040150.1	FER-like regulator of iron uptake

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G040150.1	mRNA	Chr01	212176258	212177827	-

Sequences

CDS:

>Am01G040150.1
ATGGACATAATGGACCTTCACCAAAATTCACTAATGTACGTGAATAATTTTGAGGTTCATGATTTCATTGATAATCCCAACTTTGATCAATTTGTTAATTTGATTAGAGGGGAGAATGAAGATTTCATAAGTAACTTTGGTTCTAATCTTATCAATGATTTTGGTTCTACCCTTATCAATGATTGCTTTGTTGATAATCAACTCCTTTCATGTCCTACAAACCCTTTTGATCATCAAAACATTATTGATGATAATAATGTTGTGGATTTCTATGATCCAAGCTCTACTACTATTAGCTCCTTCTCTTATTTTGATGGAGAGGTGAAAGGTGAAGGTGAAGGTGAAGGAGAAAATGATGGAGGGGATTCTTCAACAACGACGACGACAACAACAACAACTAAACCGAGAGTGAAAACCGATAGGTCCAAGACTCTCGTTTCTGAGAGGAGGAGGAGAGGCCGCATGAAGGATAAGCTTTATGCATTGCGTGCTCTGGTTCCCAACATTACTAAGATGGACAAGGCCTCAATAATTGGAGATGCAGTATCATACGTACATGATCTTCAAGCACAAGCTAAGAAGCTAAAAGCTGAAGTTGCAGGACTTGAAGCATCCTTATCAGTGTCCCAAAATTATCAAGGATCAATTAATAACAACAATGTTCAACTCACTCAAAAAAACCAACCCATTTGCAAGAAAATTATGCAGGTACTAGATATGTTTCAAGTTGAAGAAAGAGGGTATTATACAAAAATAGTGTGCAATAAAGGAGAAGGTGTGGCTGCTTCACTTTACAAAGCTCTTGAATCTCTTTCAGATTTCAGTGTCCAGAATTCAAATTTGGCTACAGTTTGTGACAGTTTTCTACTTACATTTACATTGAATGTAAAAAGTTCTGAAGCAGCTGAAATTAACCTTCCAAATTTGAAGCTATGGGTAGCTGGAGCTCTTCTTAATCAAGGCTTTGAATTCATGCCATCATTTCATGCTTGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G040150.1
AAAGGAATAAAATTACACAATCCATGATTTTTAGCAACCAAAAGTGCAATGAAAAATCACAAAGACCAAAATTACCAAATTAGAAGAACAAAATATGTTTATTTGGTATACACCACCGCGGTAAAAACTTTTTAAGGTAGGTGAGATAAAGTCAAACATTTTTTATGATGTCTTGTTTCGTGATTGACTGCCGTTGTAAAAAAATTCTACACGACGATATATATTAATTGTTAAATTAAATCGTTTGACCACCCTGGACCAGGGTCCTAGATACGCCACTGCCTGTGACTATCCTATCATCATGTATCTATAGTTACAATCTTCCCCTGAATTTGAGTTAAGTTAGAAACCAACAATAAGATAAGAAAATAATTTACTCATTTACCCTACTAAAATATATTTTTAAATATATAAATATGAAATCTAATAATATATATGTATATATTAAACAGCAATAAAAAATTAATGTTAAATTGAAAATTTTAAAATATCAGTACTTAATTTAAAAAATAATGTATGATTCTATTGAAATTAAAAAAAATTAAAATAAGTGTTAAAAAGATAAAATTACTATTTTTTTTGACTCAGGATAAAATTACTATTAAAAATATAAAATTAATTTAATTTTTTAACAAATGAAATATACTTGTCATAAGGGTAGTTTTGTCATTAACGTATATAATAAAATAATAATAATAATAATATATTATCTTATTTCTTATCAGATATTACACATCGATCAAACACGTTATATGATAATGTTATTCTGTCTTTATCATATCCTATCTGTATCTCGCTTCTTATTCTATCATGTCTGTGTCCTATCTTGACCATAAAACGCTCAAAAAGTTTTTTATGGGATTGTCAGCGTAAAATATAAGAATTGCTCAAAAACAGCAAAGCATTCATATCTCTCCCTCCTGCTTATCACTCCTCTCTGTTTCCTATATCATGGTTGGTTGGGAGAAAATAGAGGACAAAAATAAAAATCGGTGTCGGGATGTCAGATTTGATTCTCCACAAATAAATACAAAAAAATCTCAAAGTATCCGAAACTTCATTCAATTTTGTTTGGGTGGGTAGAACTTCAATCATTTGATACAGTGTCAATTATTTACACTCAAAATTGACAGTTTTGGAACTCAAACCAAGTTAACCATAGCAATATTTTTGTCATAATCAAAACCCCACAATTTCTTTCTTCTAAGTCTAGGTGTAAAAAGTTAATTAGGGTCCACTTTGAAATCTCCTAATCATAAAACCCCTTAACTAATTCCCTTCACAGTATTTCACATTTGCTATGTATAAAATATGTGAGGGTTGTAATTAATTATATTTTCATTTGATTCCTTTCACAAAATATATAAATAGTATAGTGAGTCAGAAGGAGAAATTGGGGTCCCCGTCACGATCAGAAAGTGGCCCAATTGTAACAATGAGCTAGGCTGTGACGTTGGTGGGATTCAATTAAAATACAAATTTGAGAACACATTTCAAAATTTTAATTATTAATTAATCATTTATAGATAAACCTGGAGAGACTCAAATCGCCTTCACCAGATTGAGCCATTTCTGGAACTGCATAAAATATTGTAATGTTAATGCTACACAGCATATGATGTGAAAGCGATTGATGAGGGTTATATAAGATTGCTTCTTGAGTATATATGGTTAATTTACACCAGGTCTAACAATATTTATTTTATTATATTTTTTTGAAAGAAGGGTCTAATATATATTGATGATACATAGTTGTTTTATAGGGTGATGCCTAGGGTGGGGATGTTTTTACGCGGTCTATGATGGTTCAATTCTTAAAAGTTGCTCGAAACCCTATTGATGACCGAACCACGCGCAAGTCATTGTCCTCCATGTCCTCAAGGCTGAGACGATGACCTGATTGGTGTCGATTCGACAAAAACAAAAGCAATATAAGTTGAGTTTTGAGGTAGTCATTTATAAGGACGTATTTAAAAATCTATTGAAAGAGGGAAAAAAGTTAAATAATAAAACGGAAAAATGACTTATAAGTCATTTATCTTAATTTAAAATTTTACTTTGGTCTTTAATTTTTTGTTTGTGTCAAAGATGTCATTTATCTTAACTTAAAATGATACTATTAGATTTAACCTGACTTTCCATGCATCACCGTTACACAAATGCGTGTGTGACTATTACCTCGCATACTTATGTGCTTTATTTTTTCATCATCTTTTTCCTTTAAAACAAAATGTAGAGAAGAATTCAAGTTTCTGTATTCTAAAAAACCCTTTTCTTCAATTTTGCATCATGATTTCAAAAGAGAATTAATAATATTGAAATGTCATCTCCAATAGTAAATAGTAAAATAAAACACATAAGCATGTCACATAACGCACACATGCATTAGGAAGAGTGTGAACTTCTACTTCTCGATCACCAAAAACCACACGAGACATTTTCCCACTTAAGAAGCCGCCGAATTTACTAACCCAATATTTGTAAATATTTATTTAGAAATATGGGTGTATTTTTCCTAATTTGTTGTCATAAAAATTGTTTTATTATTAGACCCTTTTAACTAATTTCAGAATCTTAAAATGGAAGTTTCTTCGATTTATCAATCATAAAAACCAATTGTGTTGCACACACAGATTGAAATCTTGTACTAAATATCACATCTTTGTAACTATATATCTTTCAAGAAGCTTGTATGAAGTTATTCACATGTTGGTCACATGCATCTTTACCAAACCTTGCATTTGGATTGGACACTTACTAACCCAACATTAACTAATCATGGCCGTACCCTAGTTAACTACGTACCAGATTAGAAATAATTAATTAATACATCTTACTCAAGTTAGTTAATAACCATTATTAAATTAATAGACCTTGGTTTACAATGCATGAAACTTATCTTAATATTCCATTCACACCAAAATTAAAATAACTATATATATAATAATCATATTAACCTACTATATATACAACTACTCCTCTATACCCCAAGTTCAAACC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00010.29	HLH	147	189	3.50E-09

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0006355	regulation of DNA-templated transcription	Biological Process
GO:0043565	sequence-specific DNA binding	Molecular Function
GO:0003700	DNA-binding transcription factor activity	Molecular Function
GO:0034756	regulation of iron ion transport	Biological Process
GO:0010039	response to iron ion	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR011598	Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638	Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9Q500	_

SwissProt

SwissProt term	Description
FIT_ARATH	Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR

KEGG

KO	Description	Enzyme
K26214	transcription factor FER-LIKE IRON

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G28160	FER-like regulator of iron uptake
Medicago sativa L.	MsG0480020709.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g31290.1	helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
Cucumis sativus L.	Csa015217	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000664s00026058.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_13440T	_
Arachis hypogaea L.	AH18G04980.1	Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR like

Expression pattern