Gene detail

Detail information of Am01G031020.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G031020.1	Avirulence induced gene (AIG1) family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G031020.1	mRNA	Chr01	182094114	182099446	-

Sequences

CDS:

>Am01G031020.1
ATGTTGAGTTATATGGAGTTACGAACTTTTCCTTTTATATATTGCAGTAGGATGAAAGGTATTAGAGACTGGGTTTTCTCCCAGATATTGTCCAATTCATTGGTCTCATCCACACCATTATCAGGCAGTAATAGTTTCTATAATGAAGGGAGTCAGTCTGAAGATTTTAATGAGCAAGGTTCAGCTCCCCCAGCAAGTTCAGTAGCATTGCCAATTCCTTCCGACACATCAAACTCTTTGGGTAATCAGAATAATCAGCATAATTCCACCTTGCAGCGAGCTTCAGATGCAGAAATTTTTCAATCTCAACATAATGCCGAAAGAAAACCAAAAGATTCTTTGGCAAAAATTGAGGATCTCCAAGTTAAATTCTTCCGCCTACTCCAGCGCCTCGGCCAGTCACGAGAAAATCTTTTGGTCACAAAGGTTCTTTATCGGATGCACCTCGCAACTTTGATCCGTGCCGAGGAATCAGATCTGAAAAGAGTTAACCTTAGTAGCAGTAGAGCCCGAGCAATAGCAAGCCAGCAAGAGGCAACTGGTATACCCCAATTGGATTTCTCCTGCAGAATACTTGTCCTTGGTAAAACAGGAGTTGGTAAAAGTGCTACCATAAACTCTATATTTGGTCATACAAAAGCCATCACTAATGCTTTTCAACCTGCTACCAATTGCATCCAAGAAATTGTGGGAACTGTCAATGGGCTTAACATAACATTTATTGATACCCCCGGTTTCCTGCCTTCCTCTACCAATAATGTAAAGAGGAATAAGAGGATCATGCGTTCTGTGAAGAGATTCATTAGAAAGTCCCCTCCTGACATTGTTTTGTACTTTGAACGGCTTGATCTTATCAATGCTGGTTATAGTGACTTTCCACTTTTGAAACATATAACCGAAGTATTTGGTGCAGCAATCTGGTTCAACACTATCCTAGTCATGACACATTCTTCCTCAGTTATTCCCGAAGGACCTGATGGGTATATTGTTAACTATGATTCATATACTTCTCAGCGCACTGACTTAATACAACAGTATATACATCAGGCAGTGCTAGATTCGAGGCTTGAAAACCCTGTACTTTTGGTTGAGAACCATCCTCAGTGCCCTAAAAATTTTATGGGGGAGAAAATTCTTCCGAATGGGCAGGTTTGGAGATCTCAACTCTTGTTATTTTGTATTTGTACCAAAGTCCTGGGTGATGTAAGTTCCCTCCTTAAGTTTCAGAACAGTGTAGAATTGGGACCAGCAAATAGTGCCCGAATTCCTTCTCTGCCCCATCTCCTTTCATCTATGTTACGCCATCGCCCTGTATCCAATCAAAATGGAATTGATGATGAAATTGAGAAAATTTTATTTTCCGAAGAGGAAGGAGAAGATGAATATGATCAACTTCCATCCATACGAATCTTGACAAAATCCCAGTTTGAAAAGTTATCCAAGCCACAGAAAGAAGATTATTTGGATGAATTAGAATACAGGGAGACCCTTTACTTAAAGAAACAATTGAAAGAAGATTATCGTAAGCGTAAGGAAAAGTCACTCTTCAAAGAGCAAGAGTTTTCTAATAGTGACGAATCTGATGATCAACAGGCTCCTCCAGAACCCGTTCTGTTACCGGATATGGCTGTTCCTCTAAGTTTTGACTCAGATTGCTCTATACATAGATATCGATGCCTTGTTGCTAATGACCAATGGCTTGTGAGACCTGTTCTTGATCCCCAAGGATGGGATCATGATGTGGGTTTTGACGGTATAAACTTGGAGACAGCTACCGAAATAAAGAAGGATGTTTATGCCTCGATTGTGGGACAAATGCAGAAGAATAAGCATGATTTCAATATTCAATCCGAGTGTGCTGCAGCTTATGTTAATCCGCGGGGTCCTACGTATTCTATCGGTGTTGATGTTCAATCTTCTGGTAAAGATCTGGTTTGTACTGTTCATAGCAACACAAAATTGAAAAACATAAAACATAATATTGCTGACTGTGGTGTTTCTTTGACATCTTTTGGAAACAAGTACTATGTGGGTGCAAAACTAGAGGATACCTTGCTAGTTGGGAAGAGATTAAAATTTGTCATGAATGGTGGCCGCCTGGAAGGTCATGGAAAAGGAGCATATGGTGGGAGTTTTGAAGCTTGTTTACGAGGAGAAGACTATCCTGTAAGAAATGACAATTTAAGTCTGACAATGACAGTCCTCTCATTCAATAAAGAGATGGTGTTGAGTGGAGGTTTACAATCCGAGTTCAAGTTAAGTCGAAACCTGAGAGCGTCTGTTAGTGCTAATCTAAATAGTCGCAAAATGGGTCAAATATGTATAAAGACGAGTAGCTCTGAGCATTTACAAATTGCCTTGGTTGCAGTTTTCTCAGTTTTGAAGGCTCTATCACGTAGAAAGGAAACTTAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G031020.1
CTATGTGCTATGTATTTTTTTTATTTTGTGAATAACTTGGTTTTTTATCAACGAATCCTAGACGTATCGTATCCTATGTTTCTCAAGGAAGTTCGTATCGCCGTATCGAATTCGCATCGTATCCGATACTCATATCGTATTCGTGCATCATAGACCCGAGTGTGTTGTTGCCCAACCATATGGCCTAACACAATGGGTTTGCACTCTCGACAAACTATCGAGGTGATCGTTAGACTTTGCAGATTCATCCCCTACCCTTTGTCCCTCAGTAAGTTACCTCACCCACGTAAACTTCTCTTCTCTGTCTCACGGCCATAGGAGCTCGGCGGTAAACCCCGTCTCACAGCCAAGCCTCTTAACCACTTACAATCACTACTCAAGCGTGAAATGCCATCTCGTTCTCATATATTTCTTATGGCATAGAGCTCGCAGGTGCCCACAATCGCTAGTTTGAGCTTATCGTCTCAAAGCCCTAATTAGTCGCTCTATTTGAATCGAATTAGTGCATTGTTGCCAAAATAGCGCCATTGCACCTCTGTTTCAAGTCTCCGACATTGTCGTTGTTCCATTCCCACACACAGACCTCCGGATAAACAATTTCCCATGAGTTCTTCTAACTATTGGTAAGTGGTTAAAAAAGGACTTCATAATAAATAAGAGTAAATATAGAAATAAAATAAGACTTTGTTTCTTATGTATAGGACAAAACCAACATATTTGGTATTTTTTATATTTAAGAGTGAATGATGTAAAGTTATCTTATCGAGCAAATTGTATTTTAGCTTAAAATAGTTTAACATTGTACCACTTCCTCTATCCTTTTCACAATGTCATTTTAAGATTATTTGTACATAAAAATAAAACTAATAAATTTTGTTACTTTTTATAAAGTTATTTATCTGTTTTCTATAATATCCTTAATTATTTATTATTTCATTCTAAATATTTCTCTCTATGCGATAAATAGTTAAGGGTATTATTGACAAAACAAGAGTTAGTATTGCATTGGACTTTGAAATCGACAAGTAAAATGAAACAAATATTATTAAAAACTGACATGAATTGTGCAACAGAGAGAATACTTATTAATTTTTTTTGCCTAGATGTCTTCGACCCTGCTCCGGTATTGTGAGGAAAGGGGCCCTGACTAATTTGTAGTTCGATCGAGAAATAAGTAATAGTCAAGTTCATCTCTTTAAATTAAATCTAATCCTGACTTTAGGATCATTTAGAGTTACTTTACTCTTAAAATGACATGGGATTTTATAATATTTATTGTTGTTAATCTTCTTTCAAATAAATGCCTTGGTAAGAGGTCTTTCACGCTACTTCAATATTTAGAGGAAAGAGATCCGAATTAATTTGGAGTTCGGTCAGGTTGATAAGTGAAGTTCAACTTTAATTCATCTTATTGTTTTTTTTTCTGTGGATGTAATAGCAAATGTCACTTGAAACTGAAACTCACACACACAACTGTGAAGTCTCAAGTTCGAATCCGAGACAAATAATATCTCAACATTTTCACCATTTAGCTAGACATTAAATATACTATTTTTTCTTCTAGTATATGGTTTGGTGGAAGAACCTGCGCGGTACATAAAAGCAAAATAAGTTAATCTCCGTTCATTCATCTTAAAATATACATCCTAAGGGTGTGTGACATCATCAATGAGGTGGGCTCTCCCCCTATTTTGGCTCCAACTTACCCCCCTCCCTCCCCCCTTTGGCGCCAAACCTCCTACCCCCCCTCCCCCCTCCCCCTCCCCCCCACCCCCATTCGATGCTAAGTAGTGTGTTTTTTTTTTTTATAATTTATTGTTCGTAAAAAATATTCATCTATTCAAATATGTTTTCGTAAAAAAAAGTAACCGTTAAAATGCTCAACGTTCAGTGCTCAATATCGAAAGAAAAAAAATTATCTGTCTGAATGCGCAAAATTTGTATTGGTGAAAAAAAAATCAAGACAAAATATGTAAACTTCGATACTAAGTAGTGTGTTTTTTTATAATTTAGTGTTCGTAAAAAATATTCATCTATTCAAATATGTTATGTAGAGTGTTGTTGTCTGAGATCTTATGTAATGTGATAATGCGTTAAACTAAAGTTATTTGATTATCATTTGTTGTCTATATTTTAATGGATCAATTTCATTTGTGTGCTGATTTTTAAAAAAAATTTAACTGTTTGAATTACTTATGTTTGAATTATAATTTCTTATGCTACCCTATTTTCATGGACTATTAATTATGTTTGAATTATAAATTTCCGTTAATTTGTGTGCATCAAATTTTAATATCTCAACAATGGTAAAACTTTGACCCCGTGCATCACACGGTCCCGCGGTGGTTGTTAATATTGACCCGTGAGACTACAACACCCGCGTCGTCGTTGTCATCGTCTCTTTCTGTCTTATCTCGAAAGTAATCTCTATCTACCAATACCATTTTTCTTCTTCACCGCATCCTCTCATACTCTTTCCCCCTTCACATTCACCTTCGGTTCCTCTTTTCTCCGCTGTTTCCCATTCATCGTGTTTTGACTTCGCTACTTGTTCCTTTTCTCAAGATTAGGGTTCTTTGGCACGCACCTTCCTTCACTCATTCTCGAGAATCTGGTTTCCGTAATCATCTATCCTTGTCGGTTGAGTAGACCGCAAAATGCTTCTTGGGATTTGATTTGAGTCTCCCAAACTTGTTCCGCTGCCGCTGCCTTCCTTGAACTTGATGCCTAATTCTCAAAGTGAGCGCCTCTAACAATTTCATATATTTGCTGAACTCCTTCCTCGTTTTTAATTGCGTTTTTTTTAATATTCTTAGTTGAATTAGAATAATTGCTGTAATTTGCTTTGTGATTATCTCTGTTTCATAGGTTTACTTAGTCCTTTCGAAAATGGAAATTCAATTGAGCATCCCTTAATAAAAATCTTGTTTTTTTGGCTATAGTATGTTTTGAGGGTGTTATTTTCACTCCAAGGAAAACTAAAAATGTCAATTTGGCTCA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF11886.11	TOC159_MAD	535	800	4.10E-122
PF04548.19	AIG1	189	331	1.60E-24
PF01926.26	MMR_HSR1	190	278	6.40E-11

Gene family

Gene family	Subfamily
Transporter family	CEPT

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0003924	GTPase activity	Molecular Function
GO:0005525	GTP binding	Molecular Function
GO:0015031	protein transport	Biological Process
GO:0046872	metal ion binding	Molecular Function
GO:0098772	molecular function regulator activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR005690	Translocase of chloroplast Toc86/159
IPR024283	Translocase of chloroplast 159/132, membrane anchor domain
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR045058	GTPase GIMA/IAN/Toc
IPR006703	AIG1-type guanine nucleotide-binding (G) domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A3Q7YGK5	_

SwissProt

SwissProt term	Description
TOC90_ARATH	Translocase of chloroplast 90, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G20300	Avirulence induced gene (AIG1) family protein
Medicago sativa L.	MsG0880046838.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os12g09570.2	GTP binding protein, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa006839	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur004653s00043123.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr08_28370T	_
Arachis hypogaea L.	AH01G24790.1	Translocase of chloroplast 90, chloroplastic like

Expression pattern