Gene detail

Detail information of Am01G030920.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G030920.1	sucrose phosphate synthase 1F

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G030920.1	mRNA	Chr01	181830274	181837181	-

Sequences

CDS:

>Am01G030920.1
ATGGCCGGAAACGATTGGCTTAACAGCTACCTAGAAGCGATTCTTGACGTTGGCCCTGGCCTCGATGACGCCAAATCCTCCCTGCTTCTCAGAGAAAGAGGTAGGTTCAGCCCTACTCGTTACTTCGTTGAAGAGGTTATCGGTTTCGATGAGACCGATCTCTACCGCTCCTGGGTTCGGGCTTCTTCCTCAAGGAGTCCTCAAGAGAGGAACACCAGATTGGAAAACATGTGTTGGCGGATTTGGAACCTTGCTCGTCAGAAGAAGCAGCTTGAGAATGAGACGGTGCAGAGAGTGATTAAGCGTCGACTTGAACGGGAAAGAGGGCGAAGGGAAGCGACTGCTGATATGTCTGAAGATTTGTCTGAAGGAGAGAAAGAGAAAGGAGATCCGGTGAGTGATGTTTCTGCTCATGGTGGTGATGGTGGTAGAACTAGATTGCCGAGAATTAGTTCCGTTGATGCTATGGAGATGTGGGCTAATAGTCAGAAAGGCAAGAAGCTCTACATTGTACTCATAAGCATTCATGGCCTCATACGAGGTGAGAATATGGAGCTGGGGCGTGATTCTGACACGGGTGGTCAGGTTAAGTATGTCGTGGAACTCGCAAGAGCCTTGGGATCGATGCCGGGAGTTTATCGGGTTGATTTACTGACTAGGCAAGTCTCGGCCCCAGATGTGGATTGGAGTTATGGGGAACCAACGGAAATGTTGGCTCCAAGAAACACGGATGAATTTGGAGATGACATGGGAGAGAGCAGCGGTGCCTATATCATTCGTATTCCCTTTGGTCCAAGAAATAAATATATTCCAAAAGAAAATCTTTGGCCTTACATTCCTGAATTTGTTGATGGAGCGCTTGGCCACATTATACAGATGTCTAAAGCTCTTGGAGAGCAAATTGGCTCTGGGCATGCTGTCTGGCCGGTTGCTGTCCATGGGCATTATGCTGATGCAGGTGACTCCGCTGCTCTTATATCCGGTGCCTTAAATGTTCCGATGCTTTTTACCGGCCACTCACTTGGTCGGGATAAGTTGGAACAACTTTTAAAGCAAGGACGACTATCAAGGGATGAAATAAACACAACTTACAAGATTATGCGTAGGATAGAAGCTGAAGAATTAGCCCTCGATGGTTCTGAAATAGTCATCACAAGCACTAGACAGGAAATAGAAGAACAATGGCGCTTGTATGATGGTTTTGATCCAGTATTGGAGCGTAAACTACGAGCAAGGATTAGGCGTAATGTGAGCTGTTATGGTAGATACATGCCTCGCATGGCGGTAATTCCACCCGGTATGGAGTTCCATCATATTGTTCCACAAGACGGTGATATAGAAGGTGAACCAGAAGGGAATTTGGATCATCCTGCCCCCCAAGATCCACCTATTTGGTCTGAGATAATGCGCTTTTTTACCAACCCTCGCAAGCCTATGATACTTGCTCTTGCTAGACCAGATCCGAAAAAGAACATTACAACATTGGTGAAAGCATTTGGAGAATGCCGTCCTCTTCGAGAGCTCGCTAACCTTACCTTAATTATGGGTAACCGAGATGGAATTGATGAAATGTCAAGCACAAGTGCTTCTGTTCTGCTCTCAGTAATAAAGCTGATTGACAAGTATGATCTATATGGGCAAGTTGCATATCCTAAGCACCACAAACAATCTGACGTTCCCAACATATATCGTCTAGCAGCAAAGACAAAGGGTGTTTTCATTAATCCTGCTTTCATCGAGCCATTTGGTCTTACCTTAATTGAGGCAGCTGCTTATGGTTTGCCAATGGTTGCTACTAAAAATGGAGGTCCTGTTGACATTCACCGGGTACTTGACAATGGTCTGCTTGTAGATCCTCATGATCAGCAGTCTATTGCAGATGCTCTTTTGAAGCTTGTTAGCAATAAGCAACTTTGGGCAAAATGTAGACAGAATGGGTTGAAGAATATTCACTTATTTTCGTGGCCTGAGCATTGTAAGACTTACCTGTCTAAAATAGCCACTTGCAAGCCAAGGCATCCACAATGGCAGCGAAATGAGGATGGTGGTGAAAGCTCAGAATCAGAATCACCTGGTGATTCCTTGAGAGATATACAGGATTTATCTCTTAACCTGAAGTTTTCATTGGATGGAGAGAAGGGTGGCAGTGGTGGAAATGATAATTCTTTGGATTCTGATGGAAATGCGAATGATAGAAGTGCAAGAATAGAGAATGCTGTTTTGTCATGGTCAAAAGGCATTTCTAAGGACATACGCAGGGGTGGAGCTGCTGAAAAATCAGATCAAAATTCAAATGCTGGTAAGTTTCCGCCATTGAGGAGAAGGAGTCATCTATTTGTTATTGCTGTGGACTGTGATACCATTTCAGGTCTTCTTGAAACGACCAAGTTAATCTTTGAGTCTGCTGGAAAAAGGCGAGCTGAAGGCTCTGTAGGGTTCATATTGTCAACATCATTAACAATATCCGAGATACAGTCATTTTTTACCTCAGGTGGCTTGAGTCCCAGTGATTTTGATGCTTATATTTGCAACAGTGGCAGTGATCTTTACTATCCATCCCTCAATTCTGAAGACCGCCCATTTGTAGGCGACTTATATTATCACTCACACATTGAATACCGTTGGGGTGGAGAAGGGTTGAGGAAGACTTTAGTGCGCTGGGCATCTTCAGTCACTAATACAAAAGGTGGGAGTGATGAGCAACTTGTGAGTCCTGTTGAACAGCTTTCTACTGACTACTGTTATACTTTCAAAGTGCGAAAGCCAGGAATGGCTCTCCCTCTGAAGGAGCTTCGTAAGCTATTGAGGATCCAAGCTCTGCGTTGCCATCCTATACATTGTCAAAATGGGACAAGACTGAATGTAATTCCAGTACTGGCATCTCGTTCCCAAGCCCTCAGATACCTATATGTTCGATGGGGTTTTGAACTGTCAAAGATGGTGGTGTTTGTTGGAGAATGCGGTGACACAGATTACGAAGGACTGGTTGGTGGCCTACACACAAGTGTGGTATTGAAGGGAGTTGGAAGCAGTGCAATCAGCCAACTCCATAATAACAGAAGCTATCCTCTTTCAGATGTCGTGCCATTGGACAGCCCCAACATCGTTGAAGCACCTGAGGGGAGTAGTAGTTCTGATATCGAAGCTTTGATGGAAAAAGTAGGATATCTTAAGGGATGA

Protein:

>Am01G030920.1
MAGNDWLNSYLEAILDVGPGLDDAKSSLLLRERGRFSPTRYFVEEVIGFDETDLYRSWVRASSSRSPQERNTRLENMCWRIWNLARQKKQLENETVQRVIKRRLERERGRREATADMSEDLSEGEKEKGDPVSDVSAHGGDGGRTRLPRISSVDAMEMWANSQKGKKLYIVLISIHGLIRGENMELGRDSDTGGQVKYVVELARALGSMPGVYRVDLLTRQVSAPDVDWSYGEPTEMLAPRNTDEFGDDMGESSGAYIIRIPFGPRNKYIPKENLWPYIPEFVDGALGHIIQMSKALGEQIGSGHAVWPVAVHGHYADAGDSAALISGALNVPMLFTGHSLGRDKLEQLLKQGRLSRDEINTTYKIMRRIEAEELALDGSEIVITSTRQEIEEQWRLYDGFDPVLERKLRARIRRNVSCYGRYMPRMAVIPPGMEFHHIVPQDGDIEGEPEGNLDHPAPQDPPIWSEIMRFFTNPRKPMILALARPDPKKNITTLVKAFGECRPLRELANLTLIMGNRDGIDEMSSTSASVLLSVIKLIDKYDLYGQVAYPKHHKQSDVPNIYRLAAKTKGVFINPAFIEPFGLTLIEAAAYGLPMVATKNGGPVDIHRVLDNGLLVDPHDQQSIADALLKLVSNKQLWAKCRQNGLKNIHLFSWPEHCKTYLSKIATCKPRHPQWQRNEDGGESSESESPGDSLRDIQDLSLNLKFSLDGEKGGSGGNDNSLDSDGNANDRSARIENAVLSWSKGISKDIRRGGAAEKSDQNSNAGKFPPLRRRSHLFVIAVDCDTISGLLETTKLIFESAGKRRAEGSVGFILSTSLTISEIQSFFTSGGLSPSDFDAYICNSGSDLYYPSLNSEDRPFVGDLYYHSHIEYRWGGEGLRKTLVRWASSVTNTKGGSDEQLVSPVEQLSTDYCYTFKVRKPGMALPLKELRKLLRIQALRCHPIHCQNGTRLNVIPVLASRSQALRYLYVRWGFELSKMVVFVGECGDTDYEGLVGGLHTSVVLKGVGSSAISQLHNNRSYPLSDVVPLDSPNIVEAPEGSSSSDIEALMEKVGYLKG*

Promoter(3k):

>AM01G030920.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00534.23	Glycos_transf_1	473	647	5.40E-26
PF13692.9	Glyco_trans_1_4	478	635	2.50E-14
PF05116.16	S6PP	808	1004	3.60E-10

Gene family

Gene family	Subfamily
Carbohydrate-Active enzymes Family	GT4

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0016157	sucrose synthase activity	Molecular Function
GO:0071836	nectar secretion	Biological Process
GO:0005247	voltage-gated chloride channel activity	Molecular Function
GO:1902476	chloride transmembrane transport	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR012819	Sucrose-phosphate synthase, plant
IPR035659	Sucrose-phosphate synthase, C-terminal
IPR006380	Sucrose phosphatase-like domain
IPR023214	HAD superfamily
IPR001296	Glycosyl transferase, family 1

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AA86S805	_

SwissProt

SwissProt term	Description
SPSA_VICFA	Probable sucrose-phosphate synthase

KEGG

KO	Description	Enzyme
K00696	sucrose-phosphate synthase	[EC: 2.4.1.14]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G20280	sucrose phosphate synthase 1F
Medicago sativa L.	MsG0880046831.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os08g20660.2	sucrose-phosphate synthase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa021697	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000124s00011937.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr08_35210T	_
Arachis hypogaea L.	AH11G33150.1	Probable sucrose-phosphate synthase like

Expression pattern