Gene detail

Detail information of Am01G026860.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G026860.1	Transducin family protein / WD-40 repeat family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G026860.1	mRNA	Chr01	169180614	169190311	-

Sequences

CDS:

>Am01G026860.1
ATGGAGTCCCTTCGGTTGAAAACAAACTACCGTCATGTTCCGGCTCTACAACAGTTCTACACTGGTGGCCCCTTCGCCGTCTCATCCGACGGCTCCTTCATAGCCTGCGCATGCGGCGATTCAATCAAAATCGTCGATTCGGCCAACTCATCCATCAAATCCACCCTCGAAGGCGACTCCGAACAAGTCACGGCCTTGGCTCTTAGCCCCGACGACAAACTTCTCTTCTCTTCTAGCCACAGCCGCCAAATTAGAGTGTGGGATTTGTCCACGCTCAAATGTGTGCGCTCATGGAAGGGTCATGAGGGTCCGGTTATGTGTATGGCTTCTGATCCTTCTGGAGGGTTACTTGCTACTGGAGGAGCTGATAGGAAGGTCCTTGTCTGGGATATTGATGGTGGCTACTGCACTCACTACTTTAAAGGTCACGGTGGAGTTGTTTCTTGTGTTATGTTCCATCCTGATCCGGAGAAACAGCTTCTTTTTTCTGGTAGTGATGATGGTGGTGATAATGCAACTGTAAGGGTTTGGGACATTTCGAAGACCAAGAGAAAGAACTGCATTGCAACACTAGATAATCATCGCTCAGCAGTGACTTCCATCGCAATATCCGAAGATGGATGGACATTGCTCAGTGCTGGAAGAGATAAGGTTGTAACAATTTGGAATCTTCATGATTATAGCAACAAGAAGACTGTCATCACAAATGAAGCAGTAGAAGCTGTTTGTGTAATTGGTGCTGGGAGTCCTTTTGCTTCATCTCTGGATTCATATCGGCGAAGTTCAAAAAAACATGCTGGTACCCAAGCACTGTATTTTGCTACAGTTGGTGAAAGAGGCATTGTTCGTGTATGGAATTCTGAAGGTGCAGTTTGCATGTTTGAGCAAAAGGCTTCAGATGTTACTGCCAGCATAGATGATGATGGCTCACGGAGGGGTTTCACTTCTGCTGTTATGCTTGGCTCAGATCAAGGATTGCTTTGTGTGACTGCAGATCAGCAGTTTCTGTTTTACTCTCTGAACTTCACTGAAGAGTTGTTGCAACTAAATCTAACCAAACGATTGGTGGGATATAATGAGGAGGTTGTAGATATGAAGTTTATTGGGGATGATGAAAAATTTCTTGCTCTTGCTACAAATCTTGAACAGGTTCGAGTTTATGACCTTGCATCTATGTCATGTTCTTACGTCTTATCTGGTCATACTGAAATCGTTCTATGCCTTGACACCTGTGTTTCAAGTTGTGGGAGAACACTAATTGTAACTGGAAGTAAAGACAACACTGTTAGATTGTGGGAATCAGAAAGTACAAGCTGCATTGGAGTTGGTATAGGTCACATGGGAGCTGTTGGAGCCGTTGCCTTTTCAAAAAGAAAGAGGGACTTTTTTGTTAGTGGCAGTAGTGATCATACTCTTAAGGTCTGGAGTTTGGATGGTCTCTCGGACAATATGACAGCTCCAATTAATTTAAAAGCAAAAGCTGTTGTGGCAGCTCATGATAAAGATATCAATTCTGTAGCTATTGCTCCAAATGATAGTTTAGTATGTAGTGGTTCTCAGGATCGTACTGCTTGTGTTTGGAGACTTCCGGATCTAGTATCAGTAGTTGTATTAAAAGGGCATAAAAGAGGAATTTGGTCTGTAGAATTTTCTCCTGTTGATCAATGTATCATTACAGCATCTGGTGACAAGACAATAAGGATATGGGCTATATCTGATGGCTCATGTTTGAAGACATTTGAAGGACACACTTCAAGTGTGTTAAGAGCACTGTTTATTACCCGTGGAACACAAATTGTTTCTTGTGGTGCTGATGGCTTAGTAAAACTATGGACTGTAAAATCTAATGAATGTGTTGCCACATATGATCATCATGAAGACAAGGTTTGGGCCTTGGCTGTAGGCAGGAAAACAGAAATGCTTGCAACTGGTGGCAGTGATGCTGTTGTCAATCTATGGTTTGATTCCTCCGCAGATGACAAAGAAGAAGCTTTCCGTAAAGAGGAAGAAGGGGTTTTGAAAGGTCAAGAGCTAGAGAATGCTGTCACAGAAGCTGACTATACTAAGGCAATCCAAATTGCATTTGAACTGCGCAGACCCCACAGGCTTTTGAAGCTATTTGCAGAACTTTGCAGGAAGAGTGAGGGTGAAAACCATATTGACAGAGCAATTAAGGCTTTCGGCGATGAAGAGCTTCGTTTATTATTTAGCTACATTCGAGAATGGAATGCTAAACCAAAGCACTGTTATGTTTCACAGTTTGTGCTTTTCAGAGTTTTCAACGTCTTTCCTCCGACAGATATTGTTCAGATTAAAGGAATTGGTGAACTTCTTGAAGGCCTTATCCCATATAGTCAGAGGCACTTTGGCAGGATAGATAGACTTGTCAGAAGCACATTTTTGTTAGACTACATACTATCAGGAATGTCAGTTATTGAACCAGCAATTCAACAGACGGAACCAAAGGCCGAGTTTCTATTGCAGTCGAAAATGGATGTTCCAGAAGACGAAAATGGGATTGAGGAGAAAGAGCGCACACTTGAAAATAATACCCCATCGAAGAAAAGGAAATCAAACAAATCAAGACACGGTTCCCATAAGAAAGTCAAGGATGTAGCTTACAACAAAGTGGAATCTATACAATTACAAGCATAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G026860.1
CTTTACAAAACGGATTTATCTAATTAATATATAAATCCGTACGTACACAATTACAAAACAGAAGTACCTTGTTAATAGATAAATCCGCTACCTTACATTGCTAAAAACGGATTTATCTAATAACAACTTACATCCGTTTCGTAAATTTAACAAAACAGATGTAAGTTTCTCCAACTGCTTCCGTAACAAAAGTAATTGTCAAAACATACTTCCGTTTTTAGATTTATTTACAAACAGATTTACCGGTAAAACAGGTAAATCCGTTAAATTTAAATTTTCAGGGGTATTTTGGGATTATCAAAAATTGTGGGGGTATAACTTGATAAGGTGGGGGTACAAAAAAAAACCCAAACAATAATAGTATAGATAAACACTTGAGGTCCTACTCACCTGTAAGAGCTTAACATTGTATCCCCAATGTGCTAAGTTTGAATATCCTTGGGGACATTTGTAAAATGACCATTAGTGCTACATTGAGAAATAAAAATTTCTCCTTTACCAATTTTTAAAATAAAAAATAAAAAAATAGTATATATAAGGCAAAATGTAGTTCATTAGGAGCATGGGTTCAATAAACAATACTCCACTCTCCTTTCCCATTCCCCACTCCCTACTCTTTTTATTAAGGCTTTGTTTGATATTTTAATTTAATTTGACCGAAGTGGAGTGCAATGAAATCTTAAGGATATAGATCTTAGGGAGTCTCCTACTCCACTTTCTCTCCAAAACTCCCACCCCCTACCCCCCACCCCCTACCCACCTTCCCCCCTCCTTTTGTTTCATATTTTTATTTAAAAAAATTAGAACTATAAATTAATGAATATGAAAATTAATTTTGTGATAAATTACGTAAAGTGTGATGCTAGTCAGTGTATTTTGGGGTACTTTAGAGTCCAGAAAAAACTCAACGGTTCAAATACACAAAGTTTGCTCATCGATAACCAATTTCGTTAAAAATAATTGATTTTGTACCAAAATATGTAAAGTGTGGCGCTAAACAGTATGTTTTGGGGTAGTTTAGATTTCAAAAAAAAAATTAGATGTACAAATACATGAAGATCGTTCGTCAATCTAAAAATTAATTTCATGGAAAATACGTAATGTGCGATATTAAACCGGTTTAAAAAATTTTGAACTGTTCAAATATGCAAAGTTTATTCCTCAATAACTGGTTTAATGAAAGAAAATAAAAATTTTGTAATAAAATACGTAAAGTGTAATATTAAGCTGTGTGCTTTTGGGTACTTTATCGGTCGAAAAAAATTTGAACTGTTCAAATACGCAAAGTTTGTTCCTCATTAACCGGTTTGGTGGAAAAATAATTATATGACAAAATAAGTAAAGTATGATGCTAAGTGGTGTGTTTTTAGATGTTTTAGTGTTCCTAATAAAGTTTGTGCCTCAATAGCCGGTTTGGTGAAAAAAAATATAATTTCGTAACAAAATACGTAAAGTGTGATGTTAAGCAGCGTGTTTTGGGGTACTTTAGTGTTCGGGAAAATTTTCAACCGTTCAAATACTCAAAGTTAATTTCTCAACCGATTTGTTAAAACAAATAATAATTTCGTGACAAAAATGTAAAGTGTGATACTAAGCAATGTGTTTTGGGGTACTTTAGCATTCAGAATTCTTTAAACTTGTCATATACTCAAAGTTCATTCCTCAATGACCGATTTGGTAAAAAAAATTTAATTTCATGACACAGACCCATGCGACTTACCCTTTTAGTGATTCCACCACTTTAAAAAATCAATTTTTTTATACTTCTTCTCTTTATATTTTTAAGACCATATTTTTCCGAATCTTTAAAAAATTAATTTATTTTATACTTCTTCTCATTATCTTTCTGAAATCGAAATATTTATTAAAATCATTTAATTCAGTCACCACCAATTCATTTATTGAATTCATTTCTTCTTTGTATCTATGGATAGCCAATTTCAATTTTATAATCTTCTTATTTGATTTATAGTTATAATTTAATTTTTTTTCACATATATTAAACTATTTATTTTATAAACCAATATTGATACTATGGATTATGTGTATGGAACAATTGTCTGAATTATATCTATACACACTCTATTTTAGGTTTTAAGTTCACAATTACTTTTTATTACACACTTTCTTTTAATTCATACTTACCTTCAATTTAGACAAGGTTTTTTCATGTTGCAATTTAAGAAACAATTTTTACCCAACAACAACACTATATTAACTAGAGTTTTTACCCTCTGCAACGCACGGGTCAAGCCGCTAGTGAAATAAAATGACGTGGAGTGAAATTAATTTTTTATTCTTGAAATAGAATTAGTTTGAAGTTGAATTGATTCCTATACACCCCAAATTGGAGGGAGACAAAGGAGAAAAACTAGCTATAGAAATGCAACGTAATTTGTGGGCAGGGTGACCGAGTAAATCAAATCACTCAGTTGGCGAGTTAAGGGATATCGAAGGAATGCGCCAAATGAGTGCAAGTAAGAGGTCCCGGGTAAAAAAAATCTCTCACTAGTGAATCAATAAAATTGACCGCATGATATTGTATAAAATGTTATGAGTGGTTAAGATTGAATCAACCAGTATTAATTCTCAATCGTTGATGAATTTTTATACTACATCCTACCGTCATATTTAATGGTTCACATGGATTTGATTTGCTCATTCACTCTAAAAGCACCCGTAATTTGACTATTTTTTAAATTCAAAATAATAATGGAACCTCATTTTTTTTGGACAAAAAAGGAACCTCATTTATACCACTCAATTCCACCGTATTCCATTTCCAAAACAGAAGTTTAAGGAAGAAACCCAAAATAAATAGAGATGATAAGAAACAATAAAAAGTGTTTTTTTGGAAAAATATGAATATTATATTTTGTTGGAAAAAAGAATAAAAAATAAAAATCCAAAACCCTGGTCCTTAAACCCTCACTATCTTCCTCAGCGGGTAGAATAACCCTAACAAATTTTGATTCACAGACACAGTTGCCGCAACACCAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00400.35	WD40	93	130	5.10E-58
PF08625.14	Utp13	676	809	1.50E-41

Gene family

Gene family	Subfamily
Ubiquitin Family	DWD

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0016905	myosin heavy chain kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0009793	embryo development ending in seed dormancy	Biological Process
GO:0009880	embryonic pattern specification	Biological Process
GO:0051301	cell division	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR036322	WD40-repeat-containing domain superfamily
IPR015943	WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
IPR019775	WD40 repeat, conserved site
IPR001680	WD40 repeat
IPR013934	U3 small nucleolar RNA-associated protein 13, C-terminal
IPR020472	G-protein beta WD-40 repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A072UQ77	_

SwissProt

SwissProt term	Description
TOZ_ARATH	Protein TORMOZ EMBRYO DEFECTIVE

KEGG

KO	Description	Enzyme
K14555	U3 small nucleolar RNA-associated protein 13

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT5G16750	Transducin family protein / WD-40 repeat family protein
Medicago sativa L.	MsG0880046328.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g50660.1	WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
Cucumis sativus L.	Csa001601	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000198s00008745.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_08290T	_
Arachis hypogaea L.	AH01G19460.1	Transducin beta-like protein 3 like

Expression pattern