Gene detail

Detail information of Am01G024160.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G024160.1	Protein kinase superfamily protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G024160.1	mRNA	Chr01	158740239	158743402	+

Sequences

CDS:

>Am01G024160.1
ATGGAAGAGCGATATGAGCCATTAAAGGACCTTGGTTCTGGCAATTTTGGAGTTGCTAGGTTGGCTAAAGACAAGAAGACTGGGGAACTTGTTGCTGTCAAATACATAGAGAGGGGCAAAAAGATTGATGAGAATGTCCAGAGGGAGATAATTAATCACCGATCATTAAGGCATCCAAATATTATCAGGTTCAAAGAGGTGTTGCTGACCCCTACTCATTTAGCTATTGTCTTGGAGTATGCTTCAGGTGGTGAGCTCTTTGAGAGGATATGCACTGCTGGTCGATTTAGTGAAGATGAGGCAAGATATTTCTTTCAACAGCTGATATCTGGAGTTAGCTACTGTCATTCAATGGAAATTTGTCATAGAGATCTGAAATTGGAAAACACTCTCTTGGACGGAAATCCATCCCCTCGGCTTAAAATTTGCGACTTTGGTTACTCCAAGTCTGCTATACTGCACTCTCAACCAAAATCAACAGTTGGAACTCCTGCATACATTGCCCCAGAGGTTCTATCGCGAAAGGAGTATGATGGAAAGATTGCAGATGTTTGGTCTTGTGGTGTGACTCTTTATGTCATGTTAGTTGGTGCATACCCATTTGAAGATCCAGAAGATCCTAGAAATTTCAGAAAGACTATTGGGAGAATAATAGGTGTTCAGTACTCCATACCCGACTATGTACGTGTTTCTGCAGAGTGTAGGAATCTTCTTTCTCATATCTTTGTTGCAGATCCTGCCAAGAGGATCACTCTCCCAGAGATAAAAAAGTACCCTTGGTTTTTGAAGAGTTTGCCTAAAGAGATCATTGAAGCTGAGAAAAAAGGTTATGTGGAAACAAAGAAAGACCAACTAAGCCAGAGTGTAGAAGAAATCATGAGGATCATACAAGAGGCAAGGATACCAGGACAAGGATCTAAAGCTGGTGATGGTGGCCAAGCTGGCACTGGGTCATTGGAAGTTGATGATGATGATGAAATTGATGTCAGTGGTGACTATGAACATGTGTGA

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G024160.1
GAAACTTGGATGAGTCTCGCTGAAGAAGATAAAATTGTTTTTCCTAATTTAATGAAAAAAATAATACTTTTTTATTTTAAAATTCATCCTAGCAGTCCTGCGTGTCATCCACATAGGATTAATGAGCCAAAAGCTAGTAAAATGTTTGCAGGGGCTGTAATTTTTGCATGAGCTTAAACCAAAACACACTATATTTGCAGGGGCCTAAAACATATTTAAGCCTAAAATGTTTGACCAAATTAGGGAGGGACATTGATTTTATAAATTGGGAAAATGAGGGGCTAAATTCGTGGGAAAAAAATTTTGAGGACTAAAATCGTGAATTGGTTAAAATTGGACGTCCAAAATTGTAATTAAACCTAAATGAATAAAATAGGAAAAGTAATCCTAAAATATAAATCCGGGGGAGTCTTGGCGCCAGCTCTCCCGCCAAGCCCCCTCCCTCCCTTTTTTTCCATTCTTTTTTTTTCTTTTATCCTATGCCCTTTTTCTTCGTTTTTTTTTTAATATTTTTTAGGTAATTCTGAGTCTAGAAAAAACTTAAATTATTTAAATACGCGAAGTTTGTTTGTTCATAACTAGATTTGTGAAAAGGAAAATTAAATTCGTGGCAAATTACGTAAAGTGTGATGCTAGACAGTGTGTTTTAAGGTATTTTAAGATATGGAAAAAAAATTAATTGTTCAAATACGTGAAGTTTGTTCCTACATAATCGAATTCGTCGAAAAGGAAATTAATTTCGTGACAAATTGTGTGAAGTGTGACGTTAGACAGTATGGTTTGGGGTACTTTAAGATTCGGAAAAAAATTAATTGTTTAAGTACGCAAAGTTTGTTACTCGATAATTAATTTTATTAAAAAAATAATAATTTTGTAATAAAATATGATGCTAAGTGTTTGACAAAAAAATTTTTTAGGTAAAGTTCAAATACATGGAGTTCGTTCCACAACAATTGGTTTGGTCATACCAAAAATTAATTTCATGGTGTGTTTTGGGTTACCTTAGTAACAAAATACGTAAAGTGTGATGCTAAGTAGTGTGTTTGTGGGTACTTTTGCGTTCGAAAAAATTACTGTTCAAATACTAGAAGTTTGTTCCTCGATAACTGATTTAAAAATTAATTTATTTTTTATTTCTTCTCTTTATATTCTTTAGGACCATATTTTTCTGGATTTTAAAAAATAATTTAAAGATGCTTCGGAAAAAAGAATTTAAAGACCATATTCCTTCAACTTTGTATAATTGCTTTCATTTTATTGGTGATTCTCAACCAACCCTACATGATACCCACGTTTTTCACTTTCTAATTGTGTTGTCTTTTTTTCTTTCTAATTGCTTCCATTTCAATGTGTTTGTTAATTAAAAATGATACTTTTAATTATGATTTACATTGTCACACACTTCTAGAATATATAATTGATTTTATCTTCACTCATACAATGTTACAATATTTACGTATTAAATGAAGCTTTTGTCACCCCCCCCCCCCCACCTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCATATTCTCATTTTCACCCCCCTTTTTTTCTTCATATTTTCATTTTTAAGAGTACATTAAAATTTAGGTGAAGTTTGTGCTAAGTAGTGAAGATGAAAATACATAAATTATATATTGTAACATTCAAATATACAAAGTTTGTGCCTCAGTAATCGATTTGGTTAGGTGAAAAAAATATAATTTCGTGACAAAATATGTAAAGTGTGATGCTAAATAGTGTGTTTTGAAATACTTTAGTGTTGGAAAAAATTAATCGTTTAAATGTTCAACGTTCAGTCCTCAATATCGAAAAAAATTAGCTATTTGAATGCGCAAAATTTGTTTTGGTGAAAAAAATAATCAAAAAAATAATCGTCGATTTTCTTGTAGTGACAAAACATGTAAAGTCTGATGCTAAATAGTGTGTTGTTTTATACTTTAGTGTTCACAAAAAAAGTTAACCGTTCAAATGCTCAACGTTCGGTGCTCAATATCAAAAAAAAATATTAATTATATGAATGCGCAAAATTTGTTTCGGTGAAAACAAAGTCAAAACAAAATATGTGAAGTTCAATGCTAAGTAGTGTGTTTTGTTATACTTTAGTGTTCGTAAAAAAAATTCATCTATTCAAATATGTTATGTAGTGTGTTGTTCTGTGAGATCTTATGTAATGTCATAATGCGTTAAACTAAAGTTATTTGATTATCATTTGTTGTCTATATTTTAATGGATCAATTTCATTTGTGTGTTGATTTTAAAAAAAAATAACTGTTTGAATTACTTATGTTTGAATTATAAATTACTATGCTACTTTATTTTCATGGACTATTACTTATGTTTAAATTATAAATTCCCGTTAATTTGTGTGCTGATTTTTAGTTTATCCATCAAATTTTAATATCGCGACAATTAAGTACTCGTTAAAGCTTTGGGGCCCGTGCATCGCACGTTCCCCGCACTGGTGTGAATAATCTCCACCTACGTATATCTACAAACTACAATTATCACCTCCTCCTTTTTCTTATTGCCCCCTTTGTGTTTCAACGGTTTCTATACGGTACTTTACGTCATTTATGTTTTTAAAATATACATGAAAGCAACTCATGCTATTAAAATACCATTCCGTACCAAACTTTCAAAGTTAAAACACATAAAAAAATACCAAAACTTGTTGAGATATGATTTTCTAGGAGGAGGAAGGTGAGCTATTCAGCTCCCTTATGATGAGTATTGAGACTCCTCCTGTGTGTGGGTCACTTTTGATTCCCTTTTAATTATTAAAATAAATATTATACTTATTCCTTTGCTTGCGTCTCCCTCTTTATATTAAAATTAAAATTAAATTAAATTAAATTAAATTACATTAGCCAGTAGCCACCTTCAATTTTATTTTATTTTGTAGACATATTCTTATATGGGGTCCTCTCTGTGTCTGCCATTTATCTCATTTTGTCTTAGAAGTTTTAGAGGTGGTTGGTTGTAGCTTTTGTGAGGGTTGAC

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00069.28	Pkinase	5	261	1.70E-70
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	9	256	5.70E-33

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:4.2.4:CAMK_OST1L

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004674	protein serine/threonine kinase activity	Molecular Function
GO:0035556	intracellular signal transduction	Biological Process
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0106310	protein serine kinase activity	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR017441	Protein kinase, ATP binding site
IPR000719	Protein kinase domain

trEMBL

trEMBL term	Description
A0AAN9L7D9	_

SwissProt

SwissProt term	Description
SAPK3_ORYSJ	Serine/threonine-protein kinase SAPK3

KEGG

KO	Description	Enzyme
K14498	serine/threonine-protein kinase SRK2	[EC: 2.7.11.1]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT4G33950	Protein kinase superfamily protein
Medicago sativa L.	MsG0880046094.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os10g41490.1	CAMK_CAMK_like.41 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed
Cucumis sativus L.	Csa017087	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000067s00006374.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_C02924_unscaffolded_00060T	_
Arachis hypogaea L.	AH11G14350.1	Serine/threonine-protein kinase SAPK3 like

Expression pattern