Gene detail

Detail information of Am01G012980.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G012980.1	Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G012980.1	mRNA	Chr01	68866835	68881230	-

Sequences

CDS:

>Am01G012980.1
ATGAGTTTCTTCCCTCTATTATTTTCCCTCATTTTGCTCCTCCCTTTCTGCTTTGCTTCATTTGCTCTGGGAGCCGCTACTCTTGAAGAAGATGAAGTGGAAGCTCTGAAAGAGATAGGTAAAAGACTTGGGAAGAAGGATTGGGATTTCAGCGTGGATCCATGTAGCGGTAAGAGTAACTGGATATCATCTAATCAGTCACAGGGATCTGAAAATGCTGTAACATGCAATTGCTCTTTTCGAAACGGTACCATATGCCATGTTGTTAGCGTTGTTCTAAAAGCACAAAATCTTTCTGGTACTCTCCCACCAGATCTTGTCAGGTTGCCTTATCTCCAAGAAATTGACGTCACCCTCAATTACCTTAATGGTACAATTCCTAAACAATGGGCCACGTTAAATCTTGTAAACATTTCTGTCTACGGAAACCGTCTATCGGGTCCAGTTCCAAAGGAGTTTGGAAACATCACTACTCTCAGAAGCTTGGTATTGGAGTTCAACCAATTATCTGGAAATCTTCCTTCAGAACTTGGGAATCTTCCCCAGATTGAAAGACTGCTTCTTTCCTCCAACAACTTTACAGGAGAGTTACCCGCGACATTTGCTAAGCTCGCTACATTGGTGCAATTTCGAATTGGCGACAATCAACTGTCTGGAGCAATACCCAACTTTATACAGAGCTGGATAAATCTTCAGATGCTAATGATCCAAGGGAGTGGTTTGAGTGGGCCAATTCCTTCTGGAATTTCACTTCTGAAGAACCTTACTGAGTTGACTATTGCTGACTTGAATGGATCTGATTCACCTTTTCCACAACTTGATAACATGTCAAAATTGTCAAAATTAGTATTGAGGAGTTGCAATATTATTGGAGAAGTGCCTGAATATCTTGGAAACTTGACTGATCTGAAAGTGATAGACCTCAGCAACAACAAATTAAGTGGACAAATTCCAGAGAGCTTGAATGGTTTACATGACATTTATTTGCTAATTTTATCTCGGAATCGTATGTCTGGCTTGCTGCCTGAGTGGATAGACAAACCAGACTTTGTCGATCTGTCATATAACAACTTCAGCATAACAAGCTTTGAGCAGAAAACTTGTCAACAAGGAAGCGTGAACTTGTTTGCATCCTCTTTGAATGGCAACCGCTTAGGAAATGTTTCATGTTTGGCAGACTATCAGTGTCCTAAAACTTCGTACTCTCTCTATATAAATTGTGGCGGAAAGCGCACAATGGATGGAAATAAGACATATGATGACGATACAAGTGAGATGGGACCAGCAAGGTTTCGTCAAACTGGAACAAACTGGGCACTTATCACTGCTGGTCACTTCTTTGATAGTGGGCGCCCTGACTACTACATATGGTCTAATACAACAAGGCTTGCTGTGCAAAATGATGCTGAGCTTTACATGGATGCACGTGTTTCCCCAAATTCTCTTACCTATTATGGATTTTGCCTTGGAAATGGAAACTACACTGTGAATCTCCATTTTGCAGAAATAATGTTCACTGATGATAAAACATATAGCAGTCTTGGAAGGCGTGTATTTGACATCTACATTCAGGGAAAGTTGGTGGCAGAAGATTTCAATATTGCAAAAGAAGCAAGCGGTGTTGGTAAGGCCGTTGTTAGAAACTTTACTGCTGTTGTGACCGGTAATGCCCTGGAGATCCGCTTATATTGGGCTGGGAAAGGAACAACTACTATCCCATTTGGATCTGTCTATGGTCCGCTTATATCAGCTATTTCTGTTGATCCTGATTTTACACCCCCATTGGAAATGGAAAACAATAGAAGCCTGCCTATAGGGGCTGTGGTTGCAATTGTGGCTGCGGGGGCAATTGTTATCATCTTGGTAATTAGCATACTGTGGTGGAAGGGCTGTTTAAAAATGAAAAGTTTAGGAGCAAGAGAGATAAAAGGTTCACAAACTGGGTCCTATACTTTACGGCAAATCAAAGCAGCAACAAACAACTTTGATGAATCCTTCAAAATTGGTGAAGGGGGTTTTGGTCCTGTTTACAAGGGTGTTCTATCAGATGGCACAATAGTAGCAGTTAAGCAGCTTTCTTCAAAATCAATGCAAGGGACTCGTGAGTTTATTAATGAGATAGGCATGATTTCTGCTTTACAACACCCTAATCTTGTTAAGCTCCATGGCTTCTGTATGGAGGATGATCAATTGTTGTTGGTATATGAATACATGGAAAACAATAACCTTGCTAATGCTTTATTTGCCAAAAAAGAAGACCCTAAAAAACGTCAGTTGAGACTGGAGTGGAAAACAAGGCAGAGGATTTGTGTTGGCATTGCTAAAGGTTTAGCTTACCTTCACGGAGAGTCAAGAGTTAAAATTGTTCATAGGGACATCAAGGCCACCAATATATTGCTGGATAAAGATCTCAACCCAAAGATATCTGATTTTGGTTTGGCCAAGCTCAATGAAGAGGACAAAACCCATATAGACACTAGAGTAGCTGGCACTTATGGGTACATGGCTCCTGAGTATGCTATGCATGGTTATCTTACAGACAAAGCAGATGTTTATAGTTTTGGGATTGTTGCATTGGAAATTGTTACTGGAACCAACAACAACGTTAGCCGTCCTCAGGAAGAATGCTTCTCTCTTCTTGATTGGGTGCGCCACTTGAAAGATAAAGGTAATCTAATGGAACTGGTTGATCGGAGGTTGGGTGAAGACTTCAACAAAGAAGAGGTATTGGTGATGATCAATGTTGCTCTTTTATGCACTACTTTCTCTCCGTCGCTCAGGCCCTCCATGGCTTCGGTGGTAAGCATGCTTGAAGGAAGAACTGTCGTTCAAGAAGTGGTGCTAGACTCAATTCAGGTATTGGATGATAAGAAATATAAGGTGATGCGACAGTACTACCAACAAAGAGGAGAAAATAACATAAGTGAGGTTCAGAGCTCAAGTATCCCAACTGATGAATCATATGCCTTCTTATCTGATACAGATTCCTCTTACTTGGAACCCAGAAATAAGGGAATCTATACCGCTTGA

Protein:

>Am01G012980.1
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Promoter(3k):

>AM01G012980.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	667	936	1.10E-48
PF00069.28	Pkinase	665	868	1.30E-48
PF11721.11	Malectin	402	585	2.30E-42
PF13855.9	LRR_8	278	336	3.90E-12

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.7.2:RLK-Pelle_DLSV

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004674	protein serine/threonine kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0033612	receptor serine/threonine kinase binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR001245	Serine-threonine/tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR021720	Malectin domain
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A396GL03	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y3148_ARATH	Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G14840	Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase
Medicago sativa L.	MsG0280009954.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os09g17630.1	receptor-like protein kinase 2, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa015531	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000793s00026503.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr06_16860T	_
Arachis hypogaea L.	AH07G24340.1	Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 like

Expression pattern