Gene detail

Detail information of Am01G011860.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G011860.1	CTP synthase family protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G011860.1	mRNA	Chr01	59060633	59067310	+

Sequences

CDS:

>Am01G011860.1
ATGAAGTACGTTTTGGTAACAGGTGGAGTTGTTAGTGGACTTGGAAAAGGAGTCACTGCCAGCAGCATTGGGGTACTCCTTAAGGCCTGTGGTTTTCGAGTTACCTCTATCAAGATTGATCCCTACCTGAATACCGATGCTGGTACAATGTCTCCTTTTGAGCATGGGGAGGTGTTTGTCTTAGATGATGGTGGGGAGGTTGACCTTGATCTTGGAAACTACGAACGTTTCTTGAATATCAAATTAACTCGTGACAATAATATCACAACTGGAAAAATATATCAGTCTGTTATTGAGAAGGAGAGAAGAGGAGACTATCTGGGAAAAACTGTCCAGGTTGTTCCACACATTACAGATGCCATCCAAGACTGGATAGAACGTGTAGCACAAGTACCAGTTGATGGAAAAGAAGGCCCGGCTGATGTTTGTGTCATTGAATTGGGTGGAACTATAGGGGATATTGAATCTATGCCTTTTATTGAAGCACTTGGGCAATTTTCCTACCGTGTAGGCTCTAGCAACTTCTGTTTGGTTCATGTCAGCCTGGTGCCTGTTCTCAGTGCGGTTGGTGAACAGAAAACAAAACCAACCCAGCACAGTGTCCGTCAACTTAGAGGATTAGGGTTGGTCCCAAATCTTCTTGCTTGTCGCAGTTCAAAGGAACTTGATAACAATGTTAAGGCAAAACTTTCTCAATTTTGTCATATGCCGTTATTGAACATACTTACTCTCTGTGATGTTCCAAATATTTGGCACATTCCTTTGTTGTTAAGAGACCAGAAGGCACACGAGGCAATCCTGAAAACATTAAACCTGCAAGGTGTTGCTACAGAGCCTAATTTCAAGGAGTGGATCACTACAACAAAAGTTTATAACACATTTCATGAATCTGTGGGTTTCTATATTTCTAATATATCATTTGAAAAATTAATAATTGACTGGATATTCAACTCCATGAGTAGTTCCAGTACTGACCTCACATGTTCTTCACAGGTTAGAATTGCAATGGTTGGAAAATATACGGGCCTTTCAGATGCATATCTTTCTGTACTGAAGGCACTTTTGCATGCTTCTGTTGGCTGCAACCGTAAGCTTGTTGTGGATTGGGTTCCTGCAGGGGATCTTGAAGATGAAACATTTAAAGAGGATGCTGATGCCTATGAAGCTGCTTGGAGTCTTTTAAAGGGTGCTGATGGGATTCTAGTTCCTGGAGGTTTTGGTGATAGAGGAGTGCAAGGGAAAATTCTTGCTGCTAAGTATGCTCGAGAAAACAGTGTTCCATATCTGGGCATTTGCTTGGGGATGCAAATTGCTGTCATTGAATTTACAAGATCTGTTCTGGGTCTGCATGATGCTAATAGCACAGAATTTGAGCCTGAAACCAAAAATCCTTGTGTCATATTTATGCCAGAAGGTTCAAAGACTCATATGGGGGGAACTATGCGTCTTGGTTCAAGAAGAACTTACTTCCATGTTGCTGACTGCAAATCAGCCAAGTTGTACGGCAATGCAAGCTTTATTGATGAGCGGCATCGCCATAGATATGAGGTTAATCCTGAGATGATATCACAACTTGAGAGTGCTGGTCTATCTTTTGTTGGCAAAGATGAAACTGGGAGTCGCATGGAGATAATTGAATTGCCTAGTCATCCTTTCTTTATTGGTGCTCAGTTTCACCCTGAGTTCAAGTCGAGACCGGGAAAACCTTCTCCACTGTTCTCAGGATTAATAGCAGCAGCATGTGAGAGGACAGTTGAGCCAGCAACCAAAAGATTAAAGGGAAACTCGCCAATGTCGAAAGCACAAAATGGAAATGGGTTCAAATCTTCTGCTGGTTCCTTAAATGGTGTACAACCCAATGGTAATGGTGTACATGTGGATGAAGACTGTTAA

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G011860.1
CTTACATATTATTATCATCTTAAAATATAAATTAAGAACACTTTTTTCATCTTTTTCATTGTCTCTCACTTATTTAAACTTTTTTCACTTTTTTCTCTCCCTCTCTCTTACTTTTTCAAAAATTTCTTATTTTTTTACCTTTTTCTTACCATTCTCTCTCTCACCCATTTTGCCAAAGTATTAATATTCAGGTTTTTTCTAACAATAAGTTTTTTCCATCTTTAGAAAATTAGAAATATTAATACAATTTTATTTTTTGTCATTATGGGAAATATTACATGTTACTTGCAAAATATTAGGGTCTTAAAATGTAAATTAACACACTTTTTTTCCTACCTTTTCACTCTCTCTCACCCATCTTTCTTTCAATATTTCTTTTTAATAAATTTTGACAAAATTTTAGTATTCTGTTTTTCTCTATCAATAACCTTTTTTTTAATCAAACAGGCTTCATGCCCTAAATTTATTAAAAAAAAGAAAATTTTAAATTTTAATATAATTTTTTTGTTCAAAAGAAAATTTAGTACAATCTTAATACAATTTTGTTGTTCAAACCTTTTTCACTTTTTCACTATCTCTCTCTCACTCACTTTTTTCACACCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCATTTTGACAAAATTTTAATATTCAGATTTTCTCTATCATTAAACTTTTTTTTCTTCTTTGGAAAATTAGATATTTTAACACAATTTTTGTTATTAAAAAAATTAATACAATTTTATTAATATTACATGTTATTTGCATATTATTATCGTCTTAAAATGTAAATTAACACACTTTTTTCCACATTTTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCACTTCTTGAAACCATTCTCACTCTTTCACTTTTTTCACCATCTCTCCCTCTCTCACCCATCTTTTTTTCAATCTTTATTTTTAATTTTTGTTATCTTTTTTCTCTTCCTTTCTTCCTCTAACTCTCTTATTTCTCTTTACTAATTTTTCTATTTTGACAAACTTTTAATATTCAATTTTCTCTATCAATAAGTTTTATTTCGTTTTTTGAAAAGTTTGAAATTTAATACATATTTGTTGTAAAAAAATGTAATACAATTTTGTTTTTTAGTCTTTAGGGAGAATATTATATGCTACTGGCGTAATATTATCGTCCTAAAACGTAAATTAAGACACTTTTTTTCTTTAATTTTATACATTTACGAATCTTTTTTGCTTTTACACTCTCTCACACACTTTGTGAAACCTTTCTAACTTTTTTATTTTTTTCACCCTCTCATGATTTTCACGGGTAATGTTTAAACTAATTAAATTTTATCTAAACTCATTCATAAAAAAACACGAGGGTATTCGTGTGTATATACGGGTATATTTTTTGGGTAAACCCAAGTATCTTCACGGCAACTGTGGAGATTAATCTCTCGAGGTACTGGAATTCACTTAAAATTATCAATTTCTTCCGAAAAAACTTTTCTAGTTTAAGAACTAATAACCGGAGAGGGAATCTTTTTATTTGACTTTTAATTAATAATTAATTATATTAATTATTATATATTAAATAGTTTGTTGTGTGGGGTTTAGCTTGTAGTATAAGTTGAAAGGAGAGGGAGTTAGCTTCATTGTTAACCCGCCGCCTGAAACCACCAACAAGAAGAACTGTGAACTGACAAATCCTAAATCCTAAAATCCAAACCGAAAGGGATTTTTCGATTCAGACAAACCGACGACACTCTCTTTCATTTCTTATATCTACATTGCCTCACATTTCCTTTGATTCAATTCATCGCCACTACCAAAGGTTTCTCATTATTCTCTTCTCTCAATCAATCAATCAATCCCTTTTTTCTTTCTTTCATTGTAAAGTTTTGTTCTTTCTTCTGCATGTAATGTTACTTCAATCTATCTAGTTTATCCTCTTATTCTCATTACTGTTATTGTTTGCGTTTTTGTGTTTGTTGCTACTTTTTGTCTTAGTTTTATGTATCAGAGCATAAAGGTGAGTGAAAGTTGCAAGGTGGATCTCAGAAATAACCATCTTAGGGTCCTTTGTCTGTTTTTTTCTTTTGGAATGAAAAAGTCCCTTTTTTTAATCAAAAGCTTGAAGTTTTTCAAGGCAAAGGAATTTAGTATCTTTTAGGGTACCTTTGGATTGACTCATTTGAGCTTCTTAGCTATTTTCTTCTTATTTTTATAAGGGTAAAGAGCCATTTTTGTATCTAAATGTGTGAGCCATTGTCATTTTAGTTCCTGAATTTGTCAAAATTACAAACACATCTCTGAGCGTCTTTAGTCTTTAATGAGTCATTTTGGTTCTCAAATGTGTCTTTTGATAGTCATTTTGGTCTTTCGATGTGTCTTTTGTTGGTTAACTTTGTCCTTAAAATTACTAGCAAAAGAGACACTTAGGGACATATTGGTAATTTTATTTATTCAAGGACTATAATACAAGTGCCTCACTCATTCATTCTGGGACTAAAATGACTGTTTGTCTATTTTATAAACTCTTATGGATAACTTATGGTTTACATGAACCCAATTTGACTTTATTTTACCTTTTATTATAGAAATAGGTTATACATAAGTACTTATATAATAAGCACTTATGCTTAAATAAGCTGTTTATTCAAACAAAGCCTTAAACTAAAAATAATAACTTATTCAAAAAAAGCTACACTAGAAAATTGTTTTGTTTCTAGCTTAAAAAAGGTGGATGTGGTGATGACACTAAGAGCTTGTTTGATTACTCTTTTTGAGAATAGTTTTCAGTTTTTAAAAGTTAACCAAGAACAAAATTTTGTTCTTAAAATTTTTAAAACAGAAAACTGTTTTTGAAAAGCTAATCAAACACCCTAAATCTTTCTTTCTGCCTTAGTGTGATGCTGTTTTTGTAATGATACTGGTATCTGAGTTTGTGTATGTTGCCTAGGACAAGCTGCAAAAGAGGACTTGTTTCTTCATCCAACATCATTGGAAAAAGCAGAGGAAAA

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF06418.17	CTP_synth_N	2	272	7.80E-124
PF00117.31	GATase	343	578	4.40E-60

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0044210	'de novo' CTP biosynthetic process	Biological Process
GO:0042802	identical protein binding	Molecular Function
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function
GO:0006541	glutamine metabolic process	Biological Process
GO:0019856	pyrimidine nucleobase biosynthetic process	Biological Process

InterPro

InterPro term	Description
IPR027417	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR017926	Glutamine amidotransferase
IPR017456	CTP synthase, N-terminal
IPR033828	CTP synthase GATase domain
IPR004468	CTP synthase
IPR029062	Class I glutamine amidotransferase-like

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A1S2Z8M4	_

SwissProt

SwissProt term	Description
PYRG_DICDI	CTP synthase

KEGG

KO	Description	Enzyme
K01937	CTP synthase	[EC: 6.3.4.2]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT3G12670	CTP synthase family protein
Medicago sativa L.	MsG0880044061.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os01g43020.1	CTP synthase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa018454	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000470s00020962.2	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_24100T	_
Arachis hypogaea L.	AH07G17930.1	CTP synthase like

Expression pattern