Gene detail

Detail information of Am01G009330.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G009330.1	dihydrodipicolinate synthase

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G009330.1	mRNA	Chr01	38201887	38205028	-

Sequences

CDS:

>Am01G009330.1
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Protein:

Promoter(3k):

>AM01G009330.1
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Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF00701.25	DHDPS	64	337	9.70E-83

Gene family

Gene family	Subfamily
--	--

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0008840	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase activity	Molecular Function
GO:0019877	diaminopimelate biosynthetic process	Biological Process
GO:0009089	lysine biosynthetic process via diaminopimelate	Biological Process
GO:0008270	zinc ion binding	Molecular Function
GO:0003676	nucleic acid binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR020624	Schiff base-forming aldolase, conserved site
IPR020625	Schiff base-forming aldolase, active site
IPR002220	DapA-like
IPR013785	Aldolase-type TIM barrel
IPR005263	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, DapA

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A396GFV3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
DAPA_TOBAC	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic

KEGG

KO	Description	Enzyme
K01714	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase	[EC: 4.3.3.7]

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT2G45440	dihydrodipicolinate synthase
Medicago sativa L.	MsG0880043457.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os04g18200.1	dihydrodipicolinate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa000290	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000040s00007369.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr05_25920T	_
Arachis hypogaea L.	AH02G26000.1	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase, chloroplastic like

Expression pattern