Gene detail

Detail information of Am01G002170.1 Annotation

Gene ID	Annotation
Am01G002170.1	Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein

Network

Network Category	Relationship Type
Global Network	Protein-Protein interaction + Coexpression Positive and Negative
Top300 PCC	Coexpression Positive	Coexpression Negative

Location (JBrowse)

Gene	Type	Chr	Start	End	Strand
Am01G002170.1	mRNA	Chr01	7598784	7603963	+

Sequences

CDS:

>Am01G002170.1
ATGGGAATGTTTCTGCATTTCCTTTTGGTATTGCTTACTAGTATGCTTTTGGTACAAGCTCAAGATCAATCAGGATTCATTAGCATAGATTGTGGTTTACCTGGAAATTCAAGCTATACTGAGAAGACAACTGGCATAAATTACATTTCAGATGCTAAATTCATAGATGTTGGTGTAAGCAAGAGAATATCTGAATCAGAAAATATCACTTATCAACAATTAGGCCATGTGAGGAGTTTTCCTAGTGGAGTGAGAAACTGTTACAAAATAAATGTAACAAGTGGTACAAAATATTTAATCCGAGCTACTTTCTATTATGGAAACTATGATAATCTAAATGACCTCCCACAATTTGATCTTTATCTTGGAGCTAATTTGTGGGCCACAATAGAGTTCTCCATTACCTCAGACATCAAATTCTCTGAGATCATTTACACTCCATCATTAGATTACATACAACCATGTCTAGTTAACACAAACACTGGGACCCCATTCATTTCATCAATTGAATTGAGGAATTTGAGTCGTAAAGCTTATTTCACAGACACAGCCTCAGTAATAAAATTCTTCAAAAGACTTGATTTAGGTTCCATCACCAATTTAAATTACAGGTACAAAGACGATGCTTATGACCGCATTTGGTTTCCCCGTCAACTCAAAAATTGGACAAGTTTGAGCACCTCACTTAACCCTGAAGATCTAATTCAAAATGATTATAAACCACCAGCAATTGTCATGAGCACTGCTTCTACACCAGTTAATGCAAGTGCCCCTATGGAGTTTTCTTTGGGTCCAACTGATGTAAATGATGAATACCACATATACATGCACTTTACTGAGGTTGAAAAGCTGACACCAAATGAAACTAGAGCATTCAATATCACTGTGAATGATGGGTTTTGGTATGGACCTGAGATACCTACATATCACCAAACAAAAACCCTATTTAGCAAACAAGCTTTGACTGGAGCCACAAGTTATCTATTTTCACTTTTTAAGACAGAGATTTCAACCCTTCCACCCATCCTCAATGCCCTTGAGATTTATAAAGTTATAGACTTCTCACAATCAGAAACTGAACAAGATGATGTTGATGCTATCACAAACATCAAGAATGTTTATGGGGTGGCTAGAAATTGGCAAGGAGATCCATGTGTCCCTGTAGAATTCATGTGGGAAGGCCTAAATTGCAGACTAGAGGGAGATTATCCCCCAAATATCACATCCTTGAATTTGTCTTCAAGTGGACTGACAGGGAAAATAACATCTTCCATCTCCAATCTTACTATGTTAAAATACCTGGATTTATCAAACAACAGCTTAAGTGGTCCTATACCTGATTTTCTGGCACAAATGCTGTCACTAAAAGTCTTAAACTTGGGGAAGAATTATCTTACTGGTTTAGTTCCAAATGGACTCCTTGAGAGATCAAAAGGAGGTTCACTATCATTGAGTCTAGCTGATAATCCTGATCTGTGTATGACGGATTCATGCAAAAAGAAGAGATTTGTTGTACCACTTGTTGCATCACTATCAGCTTTAGTTGTAATCCTCTTGATTTCTCTTGGACTTTGGATGTTCAGAAGACAAAAAGGAAGTCAGCCTCAAATCATCACCATCGGAGAGCATAAACAAATGAAACTTGATGAACTACCGCTCTTTGATTTTGATAAGCTTGAAGCTGCTACAAAAAAATTTCACTTTGATAATATGCTCGGGAAAGGAGGTTTTGGTCCAGTATACAAGGGAATATTGGAAGATGGACTAGAAATTGCTGTAAAAAGACTCTCGAAAGCATCTGGACAAGGAATGGAAGAATTCATGAATGAAGTAGTGGTGATTTCTAAACTTCAACATCGTAATCTTGTAAGAATTATTGGTTGTTGCATTCAGCGGAACGAGCAAATGTTGGTTTATGAGTTCATGCCAAATAAGAGTTTGGATACATTTCTCTTTGATCCACTACAAAAGAAAGCTTTAGATTGGAAAATGCGTTTCAATATTATAGAAGGAATAGCTCGAGGTATACTTTATCTTCACAGAGACTCGAGACTAAGGATTATACATAGAGATCTTAAAGCAAGCAACATTTTACTAGACGACAAGATGACTCCAAAAATATCAGACTTTGGTTTAGCTAGAATTTTTAAAGATGAAGAAAATGGTGAAGCCAACACAAAGGGTTGTCGGAACTTATGGTTATATGTCGCCCGAATATGCAATGGAGGGGATATTCTCAGAGAAATCAGATGTCTATAG

Protein:

Promoter(3k):

>AM01G002170.1
TCTTGTTATTGGTGCGTAGTATCCACCTGGCTAGCCACGCGCATACCCGACTTTGTCGGTTCATGTGATTGTCCTGTCCCAACAGAGTTTTTGCCACGCTCAACATTCGAACCGAGACCTTGGGGTGGAATTCGAACCCAATTATCAAAAAAGTTGGTTTTTATGACACAACAAATCACAATGTTATCAACCAACTTGAAGTAATTGCATTATTCGAACTCTCGATGTTACACTGCTGGGCATTTGTAGGATCATGTGTCATTATAGCGAGAGTTGGACACCAATGGGAGTTAGACACTCATCTGCAAGCTTGACCGATGCAAGTGCTAAGTATTTAACCTACTTTTAATTAATATTGTTTTAATAAATGTTAAAAAAGTAATTGAATTTTCATCTAAAAACTAATCTCAACTATTTATTTAACTCTCAAGCATGACGACACGGTAATTTTTCCTACTTTAGTCTGGAGCGTCATCCTCTCACTGTAAAATTTTCGTAAAAAAAAATTAAGTAGGCTAAGACCCATAAATTTTTAGTTTTTTTTATAAGCAAAATTTTTATTGAAAGGTGTACAAGGGGAACTCAACCCAAACACAACTAAGGGGCCTCCTAAAACCTCTTGGGGCCAAACCCAAAGGAAAAAAGACTCAAAAAAGAAAAAGTGTACCCCCGAAAAAACCAGAAAAATTACATAATCAAAGAGCCAATTACACGACATTCAAATAGCTAATTTTTAGTTGAGGTATTTTTTCTTGAAGTGAGAAGCTTTATGTTTGGTATCATTTTCATTATCATGGCCGAATCTACCCATAATTCAAGGGGTGTCAACCGCCCACCTTGAAAAACTAAAATTAGCACCAATACTTTTATTAAAATGGTGGTTGGCGGCGGTGGCCCGAGTGATGGTTAGCGGTGGTTGAAATGGTGGTTGGCGGTGGTCGAAATGCATGGTAATTAGTGGTGGTTAGGTTGATGATAAGAGGTGGGTGAAGTGTTGATCAGCGGTCAGAGTAGTGGTTGGCGGTGGTCGGAGTGGGGGTTGGTGGTGGTCGGAGTGGTGGTTGGTGGTGGTCAAGATGGTGGTTGGAGTAGTGGTCGGGGACTATTGGTGGTGACAGTTGTTTTTTAAAATAAAAACAGAAATTATAAAACCTATTTTTTTGGTTTTGGATTTTGATGGAAAACTCTTTTAAAAATAAGAAAAAAACCAACTCAACCTCATTTTACGCGAACACGTTTTGGTTTCGAAATAGACTTTCAAAACCAAAAACCAGAAACGCATAACCACCCCGAATGGCCCCTTACTCTAATGGTTTTTAAAAACTATAGTGGATGGAAATATAAGGGCAAACATTACGTATAGATGTCCTAATCAATATTTGTAGTTAAAGTAATTTTAAAAAGTAAAATTATTTTTTTATAAATAAATAGTAAAAAAAGTTGTCACAAATTAAGTGGATGGATTAATTAATTCGATCCAATCCGTTAATATTATATTAATTTTATATTTGTTTATGGATGTAATATTAACGGATTGGATCGAATTAATTAATCCATCCACTTAATTTTTGTGGAAAATGTAAAAATTCCCCAACGTGCAATATGTGCCTATGGCTTATGGACATTGATAACTATCTTTATGGTCTCTTCTCTCTTATGGTGGGGAATTCCCCACCATAAGAGAGAAGAGACCATAAAGATAGTTATCAATGTCCATAAGCCATAGGCACATATTGCACGTTGGGGAATTTTTACATTTTCCACAAAAAAGAGAAAATATAACATCAAGTTGTTAATTGACTAGGTTTACTCTGGTCGACCCCTACCTATACGTCGCTGGGCTTTGCCCTTGCTATTCCTAACAATAGTTAAGTGATGCGTAGTCTACACGTAGGACCTTAGCTTGGCTGATGCAAGTGCTGCTATATAAGATCCCAAGTAGGTAGCTCAGTTGACGAACTAAGAGATATCGCAAGAGTGCACCAAATGAGTGCAAGAAGGAGGTCCCGGGTTCAACTTCCAGAAACTAACATTCCGCCACCCCCACTATCATTGCTTATAAAATAAAAGTGCTGCTATATAAGATGTGTATTTAATCTACTTTATATTAGAAAAATATTTTTTATATTCGTTTAATTATTGTTAAAAAACTAATTAAGTTTTTATCTAAAAAAATAATCTCAACTATTTATTTAACTCTTAAGCAGGCCGGCCTTTAAAAAAAAATTCAGCTTTGGTTTGGAGCGTTGTCCCCTCACTCTAAAATTTTTGTAACAAATTTTTTTTTTTAAGCAGGTTAAGACCCATAAATATTTTTTAGTGGATAAGACAATGACCTAATTTTTAGTTGAGGTTATTTCTTGAAGTGAGAAACTTTATGTTTTGTATTTTTGTCATTATTGGGATCGAATATTCTACCATAGTTCAAGGGGGTAAACCGCACACCTTGAAAAAATAAAATTAATTAGCACCAATATTCTTATTAAAAAAAGTGCACACCCTGAAAATATTTTTTTCACCAAAACTCCTAGTTTTGGATCAATCCACGGTCATACAATAACTAATTGAATGGGGATACATGGATGAATGTCTGTCTAGTTACTTTACATTGAGAGGGATGTATTTAATAGAATTGACACTGAGCTCATTATTCAACAATTTCAAAATATGAAAGAGTTTCTACGAAAAAAATCAATGATGCTAGGAATTATTGTCTTTTTTGGTTGCAGTAACATTTTTTGGTTATGATATTATTGGTATAGCGCAATATTTATTAGTTTTTTGAGAACTAATTTATATTGAGGGACCTGACTAATTACGTGTTTACTTGGCTTTTGCTTATTTTAATATTCATGAATGTTTTTTTATTTATATCTGAACAGCAAGTAAAATTGACAAAATTGCAAGGTAAATCAATTGGGAATGTGACGTGTATTAGTATTTAGTATAAATCAATGTCTGACAGTCATCAACATTCATTGTATCCCTAAACAAACATTG

Pfam domain

Pfam accession	Pfam name	Protein start	Protein end	E-value
PF12819.10	Malectin_like	29	351	1.90E-109
PF07714.20	PK_Tyr_Ser-Thr	567	727	2.30E-36
PF00069.28	Pkinase	567	721	1.30E-33

Gene family

Gene family	Subfamily
Protein Kinases Family	PPC:1.7.2:RLK-Pelle_DLSV

Gene Ontology

GO term	Description	Category
GO:0004672	protein kinase activity	Molecular Function
GO:0016020	membrane	Cellular Component
GO:0005524	ATP binding	Molecular Function

InterPro

InterPro term	Description
IPR001245	Serine-threonine/tyrosine-protein kinase, catalytic domain
IPR008271	Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009	Protein kinase-like domain superfamily
IPR000719	Protein kinase domain
IPR024788	Malectin-like domain
IPR032675	Leucine-rich repeat domain superfamily
IPR001611	Leucine-rich repeat

trEMBL

trEMBL term	Description
A0A396GKI3	_

SwissProt

SwissProt term	Description
Y1570_ARATH	Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g05700

KEGG

KO	Description	Enzyme
--	--	--

Orthologous genes

Species	Gene ID	Annotation
Arabidopsis thaliana	AT1G05700	Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase protein
Medicago sativa L.	MsG0880042492.01.T01	_
Oryza sativa L.	LOC_Os05g44990.1	light repressible receptor protein kinase, putative, expressed
Cucumis sativus L.	Csa016541	_
Glycyrrhiza uralensis Fisch.	Glyur000021s00002694.1	_
Codonopsis lanceolata	Cl_chr02_07270T	_
Arachis hypogaea L.	AH19G05770.1	Uncharacterized protein like

Expression pattern